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| 1 | 植物RNA提取方法的研究进展显示文摘高质量的RNA是进行植物分子生物学研究的重要前提,由于植物组织细胞内组成成分的复杂多样性,使得植物组织RNA的提取方法具有多样性。现对已报道的异硫氰酸胍法、苯酚-SDS法、CTAB法、改良CTAB法、Trizol法等RNA提取方法在各种植物组织中的研究结果进行概括,旨在为进一步开展RNA提取工作提供参考。 | 张晓丽 代红军 | 2014 | 北方园艺2014,,8: | 20 |
| 2 | 百合鳞片总RNA提取方法的比较显示文摘为了筛选出适合百合鳞片的总RNA的提取方法,本研究以东方百合品种Siberia的鳞片为材料,比较了Trizol法、改良Trizol法、RNA提取试剂盒以及改良CTAB法提取RNA的效果。结果表明:Trizol法、改良Trizol法及RNA plant plus Reagent提取试剂盒均不能提取到完整的RNA;离心柱型植物总RNA提取试剂盒存在DNA污染;改良CTAB法能有效去除多糖,28S条带的荧光亮度是18S条带的1.5~2倍,D260/D280值都在1.9~2.1之间,D260/D230值大于2,两个样品的平均得率分别为103.57μg/g和119.21μg/g,说明此方法适合百合鳞片RNA的提取。RT-PCR结果扩增出了特异性条带,说明改良CTAB法从百合鳞片中提取的RNA质量高、完整性好、产率高,完全可以用于后续的分子生物学实验。 | 杜运鹏 李双 何恒斌 杨爽 贾桂霞 | 2010 | 分子植物育种2010,8,4: | 18 |
| 3 | 缺刻缘绿藻总RNA提取方法的比较研究显示文摘为了获得高质量的缺刻缘绿藻总RNA,采用CTAB法、TRIzol法和RNAplant法3种方法对该藻总RNA的提取效果进行比较分析。结果表明,采用CTAB法提取获得的总RNA产率最高,但因可能含有较多的蛋白质、多糖等杂质使得纯度最低;TRIzol法提取的总RNA纯度较CTAB法稍高,但产率最低,且仍含有DNA带;RNAplant法提取的总RNA电泳图清晰,OD260nm/OD280nm值为2.0,高于前2种方法,产率在2种方法之间,表明RNAplant法更适于缺刻缘绿藻总RNA的提取。对后者提取的总RNA,经反转录合成的cDNA产物大小在500 bp^2 kb,并能通过RT-PCR获得18 SrRNA基因的特异性片段,进一步说明利用RNAplant法可为基因克隆、表达分析等后续研究提供高质量的RNA。 | 杜道海 周志刚 | 2008 | 华北农学报2008,23,B10: | 15 |
| 4 | 红麻叶片高质量RNA提取方法比较分析显示文摘红麻叶片中富含多糖、多酚和其他次生代谢物质,影响其RNA的产量和质量.本研究应用CTAB法、热硼酸法、SDS法、Trizol法和商品化试剂盒5种方法提取福红992幼嫩叶片总RNA,并对各方法提取效果进行比较.结果表明,热硼酸法效果最佳,其次是CTAB法和SDS法,而Trizol法、试剂盒提取效果不理想.采用热硼酸法提取的红麻叶片总RNA能够成功进行反转录和制备cDNA. | 陈美霞 陈富成 颜克伟 刘晓倩 徐建堂 陶爱芬 祁建民 | 2011 | 福建农林大学学报(自然科学版)2011,40,6: | 10 |
| 5 | 灰绿藜RNA提取方法及在cDNA文库构建中的应用显示文摘目的:为分离灰绿藜耐盐相关新基因,构建叶片cDNA文库,探索从盐生植物中提取高质量RNA的方法。方法:以灰绿藜叶片为材料,应用RNAPlant Reagent法(Tiangen)、Plant RNA purification Reagent法(Invitrogen)、UNIQ柱式总RNA试剂盒提取法(Sangon)、SDS-LiCl法、TRIZOL试剂法(Invitrogen)等进行总RNA的提取,并构建其全长cDNA文库和抑制消减文库。结果:RNA Plant Reagent法、Plant RNA purification Reagent法和UNIQ柱式总RNA试剂盒提取法获得的RNA完整性均不好;SDS-LiCl法提取的RNA完整性好(28S条带亮度是18S的2倍、条带锐利清晰)、纯度高(A280/A260为1.89±0.03,A260/A230为2.23±0.02),适合用于直接反转录及构建全长cDNA文库,并获得成功;TRIZOL试剂法简单快捷,产率高(2724±82μg/g),完整性较好,可经mRNA纯化后用于抑制消减文库的构建并获得成功。结论:建立了用于构建高质量cDNA文库的灰绿藜RNA的制备方法。 | 姚世响 谷丽丽 张霞 李秀明 油天钰 兰海燕 张富春 | 2008 | 生物技术2008,18,6: | 10 |
| 6 | 桃总RNA提取方法研究显示文摘以桃叶片为试材,比较SDS-苯酚法、优化SDS-苯酚法、LiCl沉淀法、凯基Trizol试剂法的提取效果及叶片存放时间对RNA质量的影响。结果表明,凯基Trizol试剂法效果较好,产量较高,提取周期最短,RT-PCR得到的条带与目的片段大小一致;而LiCl沉淀法提取的RNA产量较少;SDS-苯酚法产量高,但有较多DNA残留;优化SDS-苯酚法的DNA残留较少。不同存放时间的叶片提取效果表明,60 d以内提取的RNA产量和质量都较高,而超过60 d,随着存放时间的延长,RNA产量减少,质量变差,说明低温存放较长时间对RNA提取有一定的影响。 | 蔡志翔 马瑞娟 沈志军 张妤艳 宋宏峰 许建兰 | 2008 | 江苏农业科学2008,36,6: | 10 |
| 7 | 红景天属植物叶片RNA高效提取的方法显示文摘为建立高效提取几种红景天属植物叶片RNA的方法,试验以采自西藏林芝色季拉山的大花红景天为材料,分析了CTAB法,Trizol法,SDS法,尿素法提取叶片RNA的可行性,并利用Nano Drop 1 000、RTPCR和q RT-PCR等手段分析了该方法获得RNA的质量.结果显示,SDS法和CTAB-异丙醇均可得到完整的RNA条带,但是相比于SDS法,后者所提取的RNA产率较高,质量完整,条带清晰.随后对9种不同产地,不同品种的红景天进行RNA的提取,并用Nano Drop 1 000、RT-PCR分析结果.结果显示,所提取RNA的浓度均在200 ng/μL之上,A260/A280均在2.0-2.2之间,A260/A230均大于1.8.此外利用q RT-PCR获得18S内参基因的标准曲线相关系数为0.983.因此证明所提取的RNA的纯度、完整性和产率较高,蛋白、多糖及多酚类物质去除干净.所以CTAB-异丙醇法可以适用于红景天属叶片RNA的提取,为红景天的分子生物学研究奠定了基础. | 张力鹏 张银兴 宋文芹 陈成彬 | 2017 | 南开大学学报(自然科学版)2017,50,6: | 10 |
| 8 | 枣果实β-半乳糖苷酶基因的克隆及表达分析显示文摘采用3-′RACE技术获得了梨枣果实β-半乳糖苷酶(-βGal)基因的部分cDNA片段,并运用实时荧光定量PCR技术和PNPG反应比色法,研究了梨枣不同生长期及采后常温贮藏过程中ZJGAL基因的相对表达量和β-Gal活性的变化,以探索β-半乳糖苷酶在枣(Ziziphus jujubaMill.)果实生长及采后软化中的分子调控机制.结果表明,克隆的-βGal基因序列长2 584 bp(GenBank登录号HQ827769),其中包含2 193 bp的最大阅读框,编码730个氨基酸,将该基因命名为ZJGAL.Blastn和Blastp序列比对分析发现,该ZJGAL基因与已登录的其他物种的β-Gal基因相似性达到60%~80%.随着果实的生长、成熟及采后衰老,ZJGAL基因的表达量和-βGal活性在果实采收前后均呈先上升后下降的趋势,两者的采前高峰均在幼果膨大期,但是采后贮藏过程中虽然基因的表达量较高,但是-βGal活性一直较低. | 吕燕荣 任小林 周会玲 | 2011 | 西北植物学报2011,31,7: | 9 |
| 9 | 富含多酚类植物RNA提取的研究进展显示文摘植物体内广泛存在多糖、多酚等次生代谢物,由于其易被氧化,且难以与核酸分离,导致了RNA提取困难。针对植物多酚类化合物的结构及生物学特性进行分析,将现有的RNA提取方法进行分类,并对它们的原理及优劣进行了论述与评价。 | 刘芳 官春云 | 2015 | 作物研究2015,29,1: | 9 |
| 10 | 龙眼组织总RNA提取与纯化方法的研究显示文摘针对龙眼组织富含多糖、单宁、色素及酚类物质的特点,采用改良的SDS法和CTAB法进行龙眼顶芽、叶片和茎皮3种组织总RNA的提取与纯化研究。结果表明。两种方法提取的总RNA均具有28、18、5S3条清晰、完整的条带,且无降解现象;A260/A280均介于1.8-2.0之间。A260/A230均大于2.0。说明改良的SDS法和CTAB法提取的总RNA具有很高的纯度。可以满足后续分子生物学研究的要求。 | 叶开玉 卢美英 于萍 陈殿余 | 2008 | 西南农业学报2008,21,3: | 9 |
| 11 | 血红鸡爪槭叶片总RNA提取方法的比较研究显示文摘血红鸡爪槭叶片中富含多糖、多酚物质,严重影响了RNA提取纯度和质量。为了获得适宜血红鸡爪槭叶片总RNA提取的方法,采用柱式植物RNAout法、TRIZOL法和改良CTAB法3种提取方法对其叶片总RNA提取效果进行比较分析。结果显示,采用柱子法提取获得的总RNA产率最高,但是有DNA污染;TRIZOL法提取的总RNAOD260/OD280为1.65,可能有多糖和酚类物质的污染,并且产率最低;改良CTAB法提取的总RNA纯度很高,OD260/OD280平均值在2.0左右,产率在上述2种方法之间,电泳图清晰,而且改良CTAB法提取的总RNA,经RT-PCR获得了清晰的特异性条带。表明改良CTAB法提取的总RNA纯度和产率高,完全可以满足进一步分子生物学研究的需要,是血红鸡爪槭叶片总RNA提取的适宜方法。 | 张琰 安龙杰 史宝胜 卓丽环 | 2011 | 中国农学通报2011,27,2: | 8 |
| 12 | 枣RNA提取方法的比较显示文摘为给在分子水平上对枣进行研究提供参考,通过采用分光光度法和琼脂糖凝胶电泳法检测提取样品,比较CTAB-异丙醇法、CTAB-LiCl法、Trizol-异丙醇法和Trizol-LiCl法等4种RNA提取方法对枣RNA提取的影响。结果表明,CTAB-异丙醇法提取的枣RNA纯度和完整度均较高,杂质较少,DNA残留少,降解不明显,可以用在枣枝条韧皮部、果实、嫩叶和老叶等器官和组织的RNA提取上,应用该方法所提取的RNA可以作为cDNA合成和基因克隆的模板。 | 李继东 武应霞 冯建灿 毕会涛 梁启伟 寇首道 | 2010 | 经济林研究2010,28,4: | 8 |
| 13 | 苹果ACO1基因及转录因子MdHB-1基因的表达模式显示文摘研究苹果Md ACO1基因及转录因子Md HB-1基因在不同器官和不同发育阶段的表达量及其对外源乙烯的反应,以期探讨两基因之间的可能关系。以苹果品种'皇家嘎拉'为试材,利用实时荧光定量聚合酶链式反应技术分析不同器官和果实不同发育阶段基因的表达,以及乙烯利处理果实对基因表达的影响。在不同组织器官中,Md HB-1在花瓣中表达量较高,而Md ACO1在成熟果中表达量较高。在果实不同发育阶段中Md HB-1在未成熟果中(盛花期40 d后)表达量最高,Md ACO1在成熟果中尤其是花后100 d表达量最高。外源乙烯利(500?mg/L)处理的果实放置0~1 d时抑制Md HB-1的表达,但在7 d后其表达量增高;Md ACO1表达量在外源乙烯利处理后迅速升高,并随着放置时间的延长而大幅度增高。转录因子Md HB-1可能参与了苹果幼嫩果实和花器官中其他相关基因表达的调控,这一过程似与Md ACO1无关。Md ACO1参与了果实的成熟过程,但并无受Md HB-1调控的迹象。外源乙烯会诱导成熟果实ACO1基因的过量表达,这一反馈调节过程似与Md HB-1无关。 | 朱敏 尹明安 叶红红 任小林 | 2014 | 食品科学2014,35,23: | 6 |
| 14 | 角倍总RNA提取方法建立及ACTIN基因片段克隆显示文摘角倍总RNA的提取是研究角倍蚜虫瘿形成分子机制的基础。本研究针对其多酚、多糖含量高的特点,从各类试剂盒及常规方法改良中优选出CTAB(异丙醇)沉淀方法,较为简单、经济、有效地提取角倍总RNA,其得率可达60.16μg·(100 mg)-1。利用该方法提取的RNA,通过RT-PCR克隆肌动蛋白基因ACTIN片段,碱基序列长度为934 bp,编码311个氨基酸,该序列与GenBank中已登录的ACTIN基因序列比对显示与芒果同源性最高,相似性达到95%,与其它肌动蛋白的氨基酸序列同源性达到86%以上。角倍总RNA的提取及看家基因ACTIN的克隆可为盐肤木和其他蚜虫虫瘿的分子克隆及基因表达分析奠定基础。 | 阮桢媛 陈晓鸣 杨子祥 | 2012 | 林业科学研究2012,25,5: | 6 |
| 15 | 光皮桦总RNA的提取及Actin基因的克隆显示文摘以光皮桦(Betula luminifera)的嫩叶为材料,针对光皮桦组织中富含多糖多酚等特点,改进了CTAB法,采用β-巯基乙醇和PVP去除酚类,无水乙醇去除多糖,LiCl沉淀过夜。运用该方法提取得到的RNA,条带整齐、清晰,证明得到的RNA纯度、完整性和产率均较高,蛋白、多糖及酚类等去除较彻底。在此基础上,通过逆转录、PCR和RACE实验从光皮桦中克隆得到Actin基因。 | 王钰 童再康 黄华宏 林二培 | 2010 | 浙江林业科技2010,30,4: | 6 |
| 16 | 草莓果实总RNA提取方法的比较显示文摘为建立草莓果实总RNA的提取方法,针对草莓成熟果实中富含多糖、多酚和色素等次级代谢物质,总RNA提取难度大的特点,比较改良的EASYspin植物RNA提取试剂盒法和改良的CTAB法提取草莓果实中总RNA的质量。通过琼脂糖凝胶电泳和核酸蛋白测定仪(Nano Drop 2000)检测2种方法提取总RNA的浓度、纯度及完整性等。改良的EASYspin植物RNA提取试剂盒法和改良的CTAB法都能够完成草莓果实总RNA的提取,电泳检测在28S和18S处呈2条清晰的条带,OD260/OD280值和OD260/OD230值均在2.0左右;改良的EASYspin植物RNA提取试剂盒法成本较高,且提取总RNA质量劣于改良的CTAB法,但是EASYspin植物RNA提取试剂盒法操作简便,安全可靠,节省时间。通过RT-PCR验证,2种方法所获得的草莓果实总RNA质量较好,可达到分子生物学试验对RNA质量的要求。 | 张卿 刘帅 邢宇 曹庆芹 秦岭 | 2015 | 中国农学通报2015,31,31: | 6 |
| 17 | 枣木葡聚糖转移酶基因的表达分析显示文摘为研究木葡聚糖内糖基转移酶(XTH)与枣果实生长及成熟软化的关系,采用普通PCR及3’RACE扩增技术,从鲜枣品种梨枣和沾化冬枣中均克隆到XTH基因的部分序列;同时,利用实时荧光定量PCR技术,研究了2个鲜枣品种的不同生长期其采后常温贮藏过程中XTH基因的相对表达量的变化。结果表明,从梨枣和沾化冬枣中克隆的XTH基因片段均为776 bp,包含636 bp的开放阅读框,编码212个氨基酸,分别命名为ZjXTH1和ZjXTH2(登录号分别为:HQ896312和HQ896313)。通过Blastn和Blastp对序列同源性进行比对分析,ZjXTH基因与已登录的其他物种的XTH基因相似性在68%~78%。实时定量PCR表达分析表明,ZjXTH基因的表达从盛花后51 d开始积累,并且在枣果实成熟软化过程中的表达量显著高于果实的生长期。梨枣ZjXTH1基因在采后贮藏中呈现'上升-下降-上升'的变化规律,在果实转为全红以及后期迅速软化时表达量均较高。沾化冬枣ZjXTH2基因在采后贮藏中呈现先上升后下降的趋势,在果实转为全红时表达量最高。研究结果说明,XTH基因在枣果实的成熟软化中可能起着一定的促进作用。 | 吕燕荣 任小林 | 2011 | 果树学报2011,28,6: | 5 |
| 18 | 苹果ACO1转录因子MdHB-1基因的克隆及其真核表达载体的构建显示文摘【目的】通过生物信息学分析,将苹果的一段EST序列初步定性为转录因子MdHB-1基因,对该基因进行克隆和真核表达载体构建,为进一步研究其分子生物学功能奠定基础。【方法】根据番茄LeACO1转录因子LeHB-1的基因序列,对苹果EST库进行Blast,获得一段EST序列,根据该EST序列设计1对特异性引物,以'皇家嘎啦'苹果花器总RNA为材料,经RT-PCR得到1条长约1 000bp的cDNA片段,T/A克隆后进行序列测定及分析。将基因MdHB-1与真核表达载体pPICZA连接,构建真核表达载体pPICZA-MdHB-1,并导入毕赤酵母菌种GS115,通过PCR鉴定该载体的导入情况。【结果】克隆到苹果MdHB-1基因(GenBank登录号为JQ678788),其开放阅读框为1 011bp,编码336个氨基酸。Blastn和Blastp序列比对分析发现,MdHB-1与已登录的其他物种的HB-1基因相似性达50%~60%。该基因编码的氨基酸中存在保守序列HD-Zip结构域,该保守序列与已经报道的番茄LeHB-1、拟南芥AtHB-1的保守序列的同源性均大于85%。重组表达载体PICZA-MdHB-1构建正确并已成功导入酵母基因组中。【结论】成功克隆了苹果转录因子MdHB-1基因全长,并正确构建了其真核表达载体。 | 于巧平 尹明安 任小林 姜永华 | 2012 | 西北农林科技大学学报(自然科学版)2012,40,10: | 4 |
| 19 | 不同提取方法在橡胶树总RNA提取中的应用研究显示文摘总RNA的纯度和完整性对橡胶树分子生物学实验至关重要。为探索更适合橡胶树总RNA的提取方法,本文以巴西橡胶树无性系热研7-33-97叶片为试材,利用凝胶电泳、紫外吸光值测定、RT-PCR检测等方法对CTAB-LiCl法和CTAB-NaAc法提取的总RNA进行比较。结果显示:CTAB-LiCl法提取RNA不仅耗时产率低,且RNA溶液中的Li+和Cl-影响反转录效率。CTAB-NaAc法提取叶片的总RNA经DNaseⅠ处理后凝胶电泳条带完整,产率高,无DNA污染;A260/A280比值为2.03,A260/A230比值为1.96;反转录的cDNA经PCR检测质量较好。另用CTAB-NaAc法对橡胶树的花、树皮、胚、根进行总RNA的提取,均能得到较高质量的总RNA。 | 孙芳 安泽伟 王其同 李玉婷 华玉伟 黄华孙 | 2012 | 热带农业科学2012,32,3: | 4 |
| 20 | 核桃内果皮RNA提取方法研究显示文摘以核桃果壳硬化期的内果皮为试材,针对核桃内果皮木质化程度高且富含多酚多糖的特点,比较CTAB法Ⅰ、CTAB法Ⅱ和试剂盒3种方法提取核桃内果皮RNA的效果。结果表明:3种方法提取的RNA均可见3条带。CTAB法Ⅰ提取的RNA略微拖带,OD_(260)/OD_(280)为1.540,RNA产率为75.9μg/g,RNA完整性差,质量低;CTAB法Ⅱ的RNA图谱较完整,但亮度较弱,OD_(260)/OD_(280)为1.801,产率为86.1μg/g,但RNA提取过程耗时太长;试剂盒法提取的RNAOD_(260)/OD_(280)为2.055,RNA产率96.4μg/g,RNA图谱清晰、稳定、明亮,证明得到的RNA多糖及酚类等去除较彻底,纯度、完整性和产率均较高。因此,应用复杂植物总RNA提取试剂的试剂盒法可获得高质量与高产率的核桃内果皮总RNA,完全满足后续分子生物学研究。 | 唐燕 徐龙 王新建 张锐 | 2012 | 北方园艺2012,,12: | 4 |