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1Trizol试剂法快速高效提取3种作物不同组织总RNA显示文摘【目的】建立适用于禾本科作物不同组织总RNA的快速、高效提取方法,为进行后续的分子生物学研究奠定基础。【方法】采用Trizol试剂法,通过改变抽提上清液吸取量、沉淀方法及沉淀漂洗次数,对甘蔗、玉米和水稻的叶片、茎尖和根尖的总RNA提取方法进行优化。【结果】与吸取0.4mL上清液相比,吸取0.2mL上清液的总RNA OD260/OD280、OD260/OD230值分别在1.95~2.00和2.11~2.44,所获得的总RNA纯度较高。沉淀漂洗两次的OD260/OD230值(2.11~2.47)明显高于沉淀漂洗1次的总RNA OD260/OD230值(1.01~1.61),总RNA纯度较高。经异丙醇沉淀所得的各材料的总RNA28S、18S和5S谱带清晰,无拖尾现象,总RNA完整性较好;LiCl沉淀法的RNA条带较模糊粘连,5S条带明显弥散,总RNA产率相对较低。以Trizol-异丙醇法提取的甘蔗总RNA为模板进行GAPDH基因片段扩增,所获甘蔗的叶片、茎尖和根尖的GAPDH基因表达丰度很强,无特异扩增,目的片段长度为153bp。【结论】改良Trizol-异丙醇法提取甘蔗、玉米和水稻不同组织的总RNA带型清晰、完整性好、纯度和产率高,适用于快速、高效提取禾本科植物不同组织总RNA。吴凯朝 黄诚梅 李杨瑞 杨丽涛 吴建明 2012南方农业学报2012,43,12:34
2适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选显示文摘为获得适用于转录组测序的枣花、结果枝和果实的总RNA提取方法,以中秋酥脆枣为材料,比较分析了Ambiogen和Autolab 2种总RNA提取试剂盒和基于Autolab试剂盒改良的CTAB法的总RNA的提取效果。结果表明:3种方法提取RNA的OD260/OD280差别不大,但用2种试剂盒提取的RNA有降解,其中Ambiogen试剂盒提取的花、结果枝和果实3个器官的RNA质量浓度分别为126、284和222 ng/μL;Autolab试剂盒提取的RNA质量浓度分别为307、402和266 ng/μL;基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取的RNA质量浓度分别为401、417和296 ng/μL。与2种试剂盒相比,基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取出来的RNA完整性好、纯度和浓度高,能够满足转录组测序的要求。魏琦琦 冯延芝 林青 贾宝光 张琳 2015经济林研究2015,33,2:12
3一种高效提取杨树发病树皮总RNA的方法及应用显示文摘对杨树发病树皮总RNA的高效提取是开展杨树抗溃疡病基因表达调控的基础,为了探讨杨树发病树皮RNA的高效提取方法,本研究以欧美杨细菌性溃疡病菌侵染后的‘中林46’杨为材料,比较了包括本研究提出的RNA提取新方法(RNA试剂盒改良法)在内的6种方法提取的总RNA的质量和浓度。结果显示,通过RNA试剂盒改良法提取的总RNA 28S rRNA条带亮度约为18S rRNA条带亮度的2倍且浓度高,表明该方法更适合感染欧美杨细菌性溃疡病的‘中林46’杨发病树皮总RNA的提取。为了验证RNA试剂盒改良法对健康杨树树皮及不同胁迫处理、组织RNA提取的适用性,进一步用该方法提取了‘中林46’杨、‘107’杨、‘北京’杨健康树皮,低氮、低磷处理的毛白杨组培苗以及白玉兰花的总RNA。结果表明,用RNA试剂盒改良法均能获取高质量的总RNA。所提取的总RNA已成功用于感染欧美杨细菌性溃疡病的杨树树皮转录组测序,以及低氮处理的毛白杨组培苗RT-PCR和荧光定量PCR实验,表明用RNA试剂盒改良法提取的总RNA可以用于后续分子实验。侯佳 孙丰硕 吴秋明 杨玉巧 贺伟 王延伟 2014植物生理学报2014,50,2:9
4枣不同组织提取RNA方法的比较及优化显示文摘为了获得高质量的枣RNA,本研究从所得RNA的纯度与浓度、操作时间和成本等方面比较了Trizol试剂法、传统CTAB法、热硼酸法、试剂盒法以及改良CTAB法5种方法提取枣不同组织总RNA的效果,并筛选出了最适合提取枣不同组织样品RNA的具体方法。结果表明:(1)在本研究试验的5种提取方法中,枣不同的组织RNA提取需要不同的方法。枣组培苗RNA提取的最佳方法是热硼酸法,枣芽和幼叶是试剂盒法,花和果实需要用改良CTAB法。(2)通过正交试验,得出枣树花和果实RNA提取适宜的改良CTAB法为在原有CTAB法的基础上水浴20 min、加入Na Ac的p H值为4.8、加入2倍体积的异丙醇。(3)枣RNA提取过程中的其他条件包括:RNA储存液保存的材料提取出的RNA质量最高,使用TBE缓冲液替代TAE进行电泳可以提高RNA的电泳亮度,4℃低温离心更有利于组培苗和芽的总RNA的提取,而叶片、花以及果实的RNA提取室温即可。康亚璇 陈武 庞晓明 李颖岳 2015分子植物育种2015,13,12:8
5枣花蕾总RNA提取方法的比较显示文摘为了探究枣花蕾总RNA提取的最优方法,以沾化冬枣的花蕾为材料,利用改良CTAB法、Trizol法和2种RNA提取试剂盒(PureLinkTMRNA小提试剂盒和北京奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒)分别提取花蕾的总RNA,并对RNA浓度和电泳图谱进行比较分析,利用奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒法可提取到纯度较高,完整性好的总RNA,并可用于Northern杂交、cDNA文库构建和半定量RT-PCR等分子生物学试验。冯延芝 袁德义 张琳 龙洪旭 许靖诗 刘敏 2012经济林研究2012,30,2:5
6不同方法提取淡色库蚊总RNA的定量比较分析显示文摘采用异硫氰酸胍法、Trizol法、Trizol改良法、CTAB法及Trizol+CTAB 5种方法提取的淡色库蚊总RNA,以期得到最优方法。提取总RNA并用电泳及紫外分光光度计检测,经过Dnase I消化后反转录成cDNA,以此为模板,用CYP6F1引物作定量表达分析。结果表明,与其他几种方法相比,CTAB法提取的效果最好,提取的样品纯度高,完整性好,杂质较少,DNA残留少,降解不明显。CTAB法提取的RNA可以作为cDNA合成和基因克隆的模板,能够满足后续研究的需要。温雪梅 段晓雷 刘虎岐 2012西北农业学报2012,21,2:3
7枣树幼叶总RNA提取方法的比较研究显示文摘以枣树幼嫩叶片为试材,分别采用DEPC水法、SDS抽提法、CTAB-LiCl和异硫氰酸胍法4种方法进行总RNA的提取试验,并对其进行了紫外、变性琼脂糖凝胶电泳及RT-PCR检测。结果表明:4种提取方法中DEPC水法提取的总RNA质量最好,SDS抽提法和CTAB-LiCl法次之,异硫氰酸胍法效果最差。陈国梁 陈宗礼 孙萍 杨清湖 刘咪咪 2012北方园艺2012,,19:2
8啤酒花潜隐类病毒RNA提取方法及检测技术的研究显示文摘本研究采用纳米磁珠提取法(Magnetic Nanoparticles,MNP)、改良的Li Cl沉淀法、CTAB法、TRIzol法和RNeasy Plant M ini Kit 5种方法提取感染啤酒花潜隐类病毒(Hop latent viroid,HLVd)的啤酒花叶片总RNA,结果显示Li Cl沉淀法、CTAB法和M NP法提取的RNA的质量较好,而M NP法具有提取时间短、操作简便,环境友好和批量提取的优势,适用于啤酒花潜隐类病毒RNA的快速提取。体外转录制备HLVd RNA标准品,利用实时荧光定量RT-PCR绘制标准曲线,并对其特异性、灵敏度进行评估。应用纳米磁珠提取啤酒花总RNA,结合实时荧光RT-PCR技术,建立了HLVd的快速、高效的M NP-RT-q PCR定量检测方法。连海燕 李建光 赵晓丽 吕玉峰 孙宁 邓丛良 许志春 2015植物病理学报2015,45,3:1
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