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1ISSR及其在果树上的应用显示文摘ISSR是一种基于微卫星序列发展起来的新的分子标记,具有简便、稳定、DNA多态性高等优点。ISSR标记呈孟德尔式遗传,大部分ISSR标记为显性标记。综合有关文献就ISSR的原理、操作及其在果树种质鉴定、遗传多样性检测、亲缘关系分析和遗传图谱构建等方面的应用和进展进行简要的阐述。张青林 罗正荣 2004果树学报2004,21,1:108
2正交设计优化不结球白菜ISSR反应体系研究显示文摘利用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物、甘油4种因素3个水平,对不结球白菜ISSR反应体系进行优化,确立了适合不结球白菜的ISSR反应体系:在20μL反应体系中,含1×PCRbuffer,1.5mmol·L-1MgCl2,200μmol·L-1dNTP,0.5μmol·L-1引物,1%甘油,30ng模板DNA,1UTaqDNA聚合酶.通过梯度PCR测验,确定了适宜的退火温度.王彦华 侯喜林 徐明宇 2004西北植物学报2004,24,5:113
3杏ISSR反应体系的优化和指纹图谱的构建显示文摘以杏品种清密沙为试材,用引物UBC825〔序列为(AC)8T〕研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响。结果表明:Primer、Mg2+、Taq酶浓度对扩增效果有明显影响,而模板DNA和dNTPs含量对扩增结果影响不大。优化的反应体系为:20μL的反应体系中含10ng模板DNA、0.1mmol/LdNTP、0.25μmol/LPrimer、2.5mmol/LMg2+,0.5UTaqPolymerase。适宜退火温度为50-52.1℃。用引物UBC825和UBC868〔序列为(GAA)5〕在优化的反应条件下建立了5个种12份杏材料的ISSR指纹图谱。刘威生 冯晨静 杨建民 刘冬成 张爱民 李绍华 2005果树学报2005,22,6:59
4怀区地黄遗传多样性的ISSR鉴定显示文摘目的利用ISSR标记技术对怀区地黄的8个品种和2个茎尖培养脱毒系进行了遗传多样性分析。方法用44条ISSR引物进行初选,然后用其中适合的10个ISSR引物进行ISSR分析。结果10条ISSR引物共扩增出110条带。基于这些条带,用SPSS10.0软件分析,建立了遗传Jaccard相关系数矩阵,构建了分子树状图,将怀区地黄的8个品种和2个组培系分为2类:其中一类群含有6个材料,包括组培85.5、大田85.5、组培9302、大田9302、金状元和金白地黄;另一类群含有4个材料,包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄。而且主成分分析结果支持上述的聚类分析结果;用POPGENE32软件分析知,多态性指数为0.3775,有效等位基因数为1.4037,多态性比率为71.82%;用一个ISSR6引物建立了10个供试地黄样品的DNA指纹图谱并且能将其彼此区分出来。结论ISSR标记适合于构建怀区地黄的DNA指纹图谱、品种鉴定和遗传多样性分析。周延清 景建洲 李振勇 张宝华 王天亮 贾敬芬 2005中草药2005,36,2:47
5我国杨梅研究现状与发展趋势显示文摘综述了中国杨梅的资源现状和科研发展现状,指出我国作为全球最重要的杨梅产区存在品种高度类同、不耐贮藏、销售季节集中、产品卖难等问题,从科研角度,尤其是种质创新方面提出建立以浙江为龙头的中国杨梅生物学研究协同创新中心等对策,旨在探索杨梅科研发展,从而提高产品竞争力,以求科研与产业发展同步。陈方永 2012中国南方果树2012,41,5:44
6桂花品种的ISSR-PCR分析显示文摘利用ISSR—PCR方法对桂花的54个品种进行了基因组多态性分析,从70个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增,共扩增出90条DNA片段,其中多态性DNA带79条,占总扩增片段的87.8%,平均每个引物扩增的DNA带的数目为6.92条。依据扩增结果,应用RAPD Distans软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果表明:ISSR分析中产生了一些品种特有的指纹图谱,因此ISSR技术在桂花品种和品种群(品系)的鉴定和阐明遗传关系中有很大的应用潜力。利用DNA扩增结果进行聚类分析,把供试桂花的54个品种分为7个大类,并对品种进行了处理及种下品种群的遗传关系进行了探讨。胡绍庆 邱英雄 吴光洪 宣子灿 2004南京林业大学学报(自然科学版)2004,28,z1:37
7用ISSR标记技术分析山药品种遗传多样性显示文摘利用ISSR标记技术对28个山药品种的遗传多样性进行分析。结果表明,从44条ISSR引物中可筛选出7条能够扩增出清晰、稳定条带的引物;这7条ISSR引物对28个山药品种扩增条带间存在较大差异,多态性条带比率为83.01%,Shannon多样性指数为0.3191;构建的分子树状图将28个山药品种划分为4组:第一组含有日本白、花山药和日本园3个品种;第二组为小叶山药;第三组为嵩野1号;其余23个品种归入第四组。而且主成分分析结果支持上述的聚类分析结果。这为利用ISSR标记技术鉴定山药品种,为有效地利用山药种质资源提供了依据。周延清 景建洲 李振勇 浩健 贾敬芬 张宝华 郝建国 2005实验生物学报2005,38,4:40
8正交设计优化黄瓜ISSR体系显示文摘黄瓜是一种重要的蔬菜作物,品种资源较为丰富,利用分子标记进行黄瓜资源鉴定和分类、构建分子遗传图谱和基因定位方面已取得一定进展,目前应用的分子标记主要包括RAPD、AFLP和SSR,尚未见有关于ISSR标记在黄瓜上的研究报道。ISSR主要是由单一引物且以重复序列为主要引物序列的PCR标记,其反应条件受模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+、dNTPs和引物等因素的影响。正交试验设计能明确各因素间的互作效应,建立最优化的反应体系。本研究利用这一方法,从Taq酶、dNTPs、引物、Mg2+4种因素各3个水平来优化黄瓜ISSR反应体系。通过实验,在25μl反应体系中初步确定各反应成分为:1×PCRbuffer,1.5mmol/LMg2+,25ng黄瓜模板DNA,ddH2O,1UTaq酶,200μmol/LdNTPs,0.75μmol/L引物。这一体系的建立为今后利用ISSR技术进行黄瓜种质资源分类、遗传图谱构建和基因定位奠定了技术基础。王佳 梁国华 缪旻珉 陈学好 2006分子植物育种2006,4,3:40
9ISSR标记的研究与应用显示文摘简单序列重复区间扩增多态性(Inter-simple sequence repeat,简称ISSR)是一种新型的分子标记。它直接对基因组DNA进行分析,不受任何环境条件影响,在遗传上多为共显性。在不同的发育阶段,同一个个体的任何体细胞所得的带型或指纹都是一样的,并且符合孟德尔遗传规律。本文对ISSR在品种鉴定、遗传关系及遗传多样性分析、基因标签、植物基因组作图、指纹图谱的建立等方面作了简要概述。朴红梅 李万良 穆楠 尹航 2007吉林农业科学2007,32,5:40
10ISSR分子标记及其在树木遗传育种研究中的应用显示文摘在比较ISSR和其它分子标记的原理和特点的基础上,综述了ISSR分子标记在树木遗传多样性研究、亲缘关系及系谱分析、优良种质和品种鉴定及遗传连锁图谱的构建等领域的研究进展,指出了目前ISSR分子标记在树木遗传改良和辅助育种等研究领域存在的问题,并提出今后的研究方向。杨玉玲 马祥庆 张木清 2006亚热带农业研究2006,2,1:31
11怀地黄ISSR扩增条件优化的研究(英文)显示文摘用CTAB法提取怀地黄嫩叶DNA,进行简单重复间序列标记 ISSR 分析.通过单因子实验分别研究了退火温度、Taq酶单位、Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度和模板DNA浓度对ISSR-PCR反应的影响,找出各自的合适条件,而且每一个合适条件确定以后都被作为后续研究的一个条件.通过各个因子的组合研究建立了适宜于怀地黄ISSR分析的扩增体系:25μLPCR反应体积,1×TaqDNA酶缓冲液 10mmol/LTris-HCl,50mmol/LKCl,0.1%TrionX-100,pH9.0 ,2.5mmol/LMgCl2,1.5~1.0UTaq酶,60ng模板DNA,0.4μmmol/L引物,各0.4mmol/L的dATP、dGTP、dCTP和dTTP.合适的退火温度为53~55℃.为用ISSR技术分析鉴定怀地黄种质资源奠定了良好的基础.周延清 景建洲 李振勇 浩健 贾敬芬 2004西北植物学报2004,24,1:34
12羊蹄甲属3种园艺树种分子鉴定及亲缘关系的ISSR分析显示文摘利用ISSRPCR方法对香港羊蹄甲属(Bauhinia)中最常见3种园艺树种:红花羊蹄甲(B.purpurea)、宫粉羊蹄甲(B.variegate)和洋紫荆(B.blakeana)的遗传变异进行了研究,从74个ISSR引物中筛选出9个多态性引物用于正式扩增,共扩增出80条DNA带,平均每个引物扩增的DNA带的数目为8.88条,多态性条带数目为55条,占总条带数的68.8%。其中,有8个引物扩增出差异条带和特异条带,并分别能准确地鉴定羊蹄甲属3个园艺树种。本研究的结果表明,ISSR-PCR的DNA电泳谱带在检测香港羊蹄甲(B.blakeana)品种的真实性方面非常有用。同时,通过对3个种扩增条带的叠加性进行分析,证实了洋紫荆杂交起源的父母本为红花羊蹄甲和宫粉羊蹄甲。罗瑜萍 龚维 邱英雄 Yuk Sing Gibert Chan 2006园艺学报2006,33,2:30
13苎麻总DNA提取的CTAB法优化方案显示文摘根据苎麻组织自身含有较多的酚类、粘状物及黄酮类等次生代谢物质的特点,对CTAB法进行优化后用于提取苎麻组织总DNA.在研磨过程中加入抗氧化剂PVP,提取缓冲液中加入终浓度6%的PVP和4%的β-巯基乙醇,可防止整个提取过程中溶液变褐;在第2次用氯仿/异戊醇抽提时,加入10%的CTAB和4%的N aC l高盐溶液,以除去多糖.经几种改良方案提取总DNA的ISSR-PCR扩增结果验证,以同时加入抗氧化剂和高盐溶液的CTAB-4法效果最好.侯思名 段继强 梁雪妮 丁小维 肖伏 刘飞虎 2005西北植物学报2005,25,11:27
14几种新型DNA分子标记及其在食用菌研究中的应用显示文摘综述了新型分子标记SCAR、ISSR、SRAP和TRAP的原理与特点,以及这些技术在食用菌研究中的应用现状和前景。边银丙 宋小亚 2006食用菌学报2006,13,1:28
1514份杏种质的ISSR分析显示文摘以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL的反应体系中,模板DNA含量在10~80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而引物、Mg2+的最适浓度分别为0.25 μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5~4 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50~52.1℃范围内均能得到清晰的条带;并在此基础上建立了杏ISSR反应体系.当相似系数在0.444~0.452之间时,将12份杏材料划分为3类:①普通杏(Amentaca vulgaris),西伯利亚杏(A.sibirica),辽杏(A.mandshurica),藏杏(A.holosericea)类型;②仁用杏品种一窝蜂;③紫杏(A. dasycarpa).冯晨静 张元慧 徐秀英 师国洪 刘威生 孟庆瑞 杨建民 2005河北农业大学学报2005,28,5:26
16毛白杨ISSR反应体系的建立及优化显示文摘为应用ISSR技术开展毛白杨遗传变异分析、辅助育种、品种鉴定、系统进化等研究,以(GTG)6为引物,通过单因子实验分别研究了退火温度、引物浓度d、NTP浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量对毛白杨ISSR-PCR反应的影响,建立并优化了适宜于毛白杨ISSR分析的扩增体系:20μL PCR反应体系,1×Taq DNA酶缓冲液(10 mmol/L Tris--HCl,50 mmol/L KCl,0.1%Trion X-100,pH 9.0),1.5 mmol/L MgCl2,1.0 U Taq酶,10 ng模板DNA,0.2μmol/L引物,0.2 mmol/L dNTP.引物(GTG)6的最适退火温度为61℃.冯夏莲 何承忠 张志毅 安新民 杨凯 张有慧 2006北京林业大学学报2006,28,3:25
17黄连ISSR反应条件优化的研究显示文摘以黄连(味连,Coptis ChinensisFranch.)基因组DNA为模板,通过单因子、双因子实验研究了ISSR反应体系中主要成分(Mg2+、dNTP、引物、模板、TaqDNA聚合酶)以及热循环参数(退火温度、循环数、变性时间、退火时间、延伸时间)对扩增结果的影响,并找出各自的最适条件,建立了适合黄连ISSR分析的反应体系和扩增程序,即在25μL反应体系中,内含1×PCR buffer、1.5mmol.L-1Mg2+、200μmol.L-1dNTP、0.3μmol.L-1引物、40ng模板、1UTaqDNA聚合酶。扩增程序为94℃预变性5min,然后进行35个循环:94℃变性30s,(据不同引物的退火温度)复性1min,72℃延伸1.5min,循环结束后72℃延伸7min,-4℃保存。这一优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术进行黄连鉴定及种质遗传多样性分析提供了一个标准化程序。陈大霞 李隆云 鲁成 钟国跃 瞿显友 彭锐 2007植物研究2007,27,1:25
18广西野生杨梅资源遗传多样性的ISSR分析显示文摘广西杨梅资源十分丰富。为了准确了解和掌握广西野生杨梅资源类型,利用ISSR技术对广西野生杨梅资源的分类和遗传多样性进行了探讨。从116条ISSR引物中筛选出12条引物,对40份杨梅样品进行ISSR-PCR分析。结果显示,共扩增出154条DNA条带,其中多态性条带113条,占73.38%,表明广西杨梅资源遗传多样性非常丰富。用NTYS-PC2.1软件进行UPGMA聚类分析,可将供试杨梅样品分为4大类:它们分别代表杨梅、大叶青杨梅、毛杨梅、青杨梅,其中大叶青杨梅的形态分类和ISSR分子分类存在很大的差异。潘鸿 何新华 李一伟 郭永泽 黄桂香 2008果树学报2008,25,3:26
1922份柑桔资源的ISSR分析显示文摘对富民枳(Poncirus polyandraS.Q.D ing et al.)、枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]、枳橙(Poncirus trifoliata×C itrus sinensis)和甜橙[C itrus sinenses(L.)Osbeck]等22份柑桔资源进行了ISSR分析,并对所得结果进行了讨论。14个引物对22个材料PCR扩增得243条谱带,从遗传距离、多态性比较和聚类结果看:各材料之间具有不同的遗传距离,以D=0.25,将22份供试材料划分为6个类群类:第Ⅰ类群为甜橙(雪柑和小叶先锋橙);第Ⅱ类群为卡里佐(肯特桔);第Ⅲ类群为杂种枳;第Ⅳ类群为富民枳;第Ⅴ类群为枳橙(C35和枳橙);第Ⅵ类群为枳的不同类型。从分类(亲缘)关系看:富民枳与枳橙(0.407)的亲缘关系更近,而与甜橙(0.414)、枳(0.415)的亲缘关系稍远一些,与杂种枳(0.424)之间的亲缘关系更远。采用ISSR技术可作为品种鉴别、亲缘关系和分类的手段之一。吴兴恩 范眸天 龚洵 杨杨 2006云南农业大学学报2006,21,1:24
20杨树品种的SSR分析及鉴定显示文摘利用SSR-PCR方法对杨树(Populus)的10个品种进行了基因组多态性分析,选用10对引物扩增出122个DNA片段,其中114个片段呈现多态性,占总扩增片段的93.44%。平均每对引物得到12.2个位点。依据扩增结果进行遗传距离分析,构建了分子树状图。研究结果表明:SSR分析中产生了一些品种特有的指纹图谱。利用DNA扩增结果进行聚类分析,把供试杨树的10个品种分为3类,并对基本品种及种下品种群的遗传关系进行了探讨。梁海永 刘彩霞 刘兴菊 杨敏生 2005河北农业大学学报2005,28,4:21
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