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| 1 | 福建山药种质资源遗传多样性的RAPD分析显示文摘山药(Dioscorea polystachya Turcz.)具有重要的药用价值,了解其遗传多样性对山药引种育种、资源研究等都具有十分重要的意义。本研究利用RAPD-PCR技术对来自福建不同地区的34份山药资源进行遗传多样性分析。从200多条RAPD随机引物中筛选出24条引物,共扩增出182条带,其中多态性条带数为161,多态性比例为88.5%。应用DPS统计数据软件进行差异条带的遗传距离系数分析,构建遗传距离系数矩阵,然后用非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,构建聚类分析图。聚类分析结果表明,当遗传相似系数为0.66时,可将34份资源分成4类:普通山药、田薯、扁山药和福建大薯。当遗传相似系数为0.68时,可将普通山药分为长山药和棒山药2个亚类,这与经典的园艺学分类相符,在分子水平上支持了按园艺学薯块类型对山药资源进行分类的观点。 | 华树妹 涂前程 雷伏贵 | 2009 | 植物遗传资源学报2009,10,2: | 32 |
| 2 | 淮山药种质资源主要农艺性状遗传多样性分析显示文摘【目的】探讨我国不同地区淮山药种质资源农艺性状的遗传多样性、亲缘关系及分类特征,为淮山药品种选育及生产利用提供参考。【方法】对收集的44份淮山药种质资源的19个农艺性状进行调查,通过遗传多样性分析、聚类分析与主成分分析,探讨其遗传多样性、亲缘关系及分类特征。【结果】44份淮山药种质资源形态性状间具有较高的多样性。在12个质量性状中,遗传多样性指数最高的是叶形(1.53),其次是薯皮颜色(1.51);薯形的频率分布最高(93.18%),其次为薯肉颜色(90.91%)和茎蔓形状(81.82%)。在7个数量性状中,多样性指数最高的是薯块长度(1.89),其次是生育期(1.84)和薯块径粗(1.77);变异系数最大的是单株产量(79.25%),其次为薯块径粗(42.21%)和单株结薯数(35.62%),最小的为生育期(17.57%)。根据各农艺性状的遗传差异,可将44份淮山药种质聚为四大类群;第Ⅰ类群种质均来源于广西,可作为有增产潜力的加工型亲本材料;第Ⅱ类群种质主要来源于广西,可作为高产选育目标亲本;第Ⅲ类群种质主要来自南方地区,均是人工栽培的野生类型品种,为一般性亲本;第Ⅳ类群种质主要来源于北方省区的种质,可作为一般性早熟选育亲本。主成分分析结果表明,前6个主成分累计贡献率达83.73%,第一主成分反映高产株型综合因子,第二主成分反映加工株型因子,第三主成分反映植株结薯因子,第四、五、六主成分分别反映薯块、薯皮颜色和茎蔓颜色因子。【结论】我国淮山药主要地方栽培种质资源间农艺性状差异明显,具有丰富的遗传多样性,其亲缘关系呈现一定地域生态环境规律;南方地区在品种选育中应注重对第一、第二主成分的选择。 | 覃维治 韦本辉 甘秀芹 韦民政 唐秀桦 | 2014 | 南方农业学报2014,45,10: | 33 |
| 3 | 应用SRAP标记构建山药种质资源DNA指纹图谱显示文摘利用30对多态性良好的SRAP引物对90份山药种质资源进行PCR扩增,构建扩增图谱,共扩增到722个位点,多态性位点581个,多态性比例为80.47%,每对引物组合检测多态性位点3~30个,每对引物能鉴别6~51份山药种质资源;采用DNA数据分析软件对扩增出的多态性位点进行分析,构建山药种质资源方框指纹图谱,该图谱清晰地反映出每对引物能扩增的多态位点数、鉴别资源份数及资源具体编号,资源在该引物组合下所能检测得到的多态位点数及所处的具体位置等信息;从10对SRAP引物组合中挑选出的21个多态性位点,根据谱带的有无转化成的1/0字符串编码,形成山药种质资源DNA数字指纹图谱,该图谱可鉴别区分90份山药种质资源中的82份资源。同时这些指纹图谱可为下一步的山药品种鉴定,种质资源评价、利用,分子标记辅助育种及品种权保护提供技术支撑。 | 华树妹 贺佩珍 陈芝华 雷伏贵 曹奕鸯 黄玉仙 黄姗 | 2014 | 植物遗传资源学报2014,15,3: | 25 |
| 4 | 桔梗栽培及野生种质遗传多样性的RAPD分析显示文摘为了解桔梗栽培种质、野生种质的遗传背景,为桔梗育种及道地药材研究提供依据,采用RAPD方法分析了桔梗20份栽培种质、3份野生种种质及5份遗传材料共92个样品的遗传多样性。从264个随机引物中筛选出多态性较好的6个引物进行全部样品PCR扩增,得到多态性条带58条。所有种质的多态性位点比率(P)为66.67%,Nei's基因多样性指数Ht为0.2099,栽培种质的Ht和P值AT>AB>NC>SZ,野生和遗传材料中各份种质的Ht和P值很低,但总体值仍高;UPGMA聚类和SPSS聚类可以将各种不同来源的种质很好地区分开来。结论:桔梗栽培种质在遗传背景来上为混杂群体,纯系材料遗传背景均一,不同栽培产区桔梗种质已出现明显遗传分化。 | 魏建和 杨成民 陈士林 程惠珍 黄璐琦 | 2006 | 世界科学技术-中医药现代化2006,8,3: | 22 |
| 5 | 人参农家类型遗传多样性的ISSR分析显示文摘目的探讨人参农家类型的遗传多样性和亲缘关系,为人参的栽培和选育种提供遗传学依据。方法采用ISSR分子标记分析5种人参农家类型7个居群120个样本的遗传多样性。结果人参农家类型有较丰富的遗传多样性,平均多态位点百分率为48.85%;不同农家类型的遗传多样性水平有差异,和其他农家类型相比,长脖和竹节芦的遗传变异较小,且两者之间的相似性系数高达97%;不同产地的同一人参农家类型间也存在很大的遗传差异。结论研究表明人参农家类型的遗传差异主要存在于各类型内部,而且可能更多地存在于同一类型的不同居群内部。为促进人参新品种的选育,有必要在现有的栽培群体中补充不同产地的同一类型的种质资源。 | 李靖 程舟 杨晓伶 李珊 顾然其 万树文 张文驹 | 2007 | 中草药2007,38,9: | 22 |
| 6 | 基于SRAP标记的山药种质资源遗传多样性分析显示文摘目的:研究我国山药种质资源遗传多样性,为合理利用资源和开展选育种工作提供理论依据。方法:以国内94份山药种质资源为材料,采用SRAP标记并通过NTSYS2.10软件进行SHAN聚类分析、PROJECTION主成分分析;利用POPGENE软件估算遗传多样性参数。结果:从49对SRAP引物中筛选出30对能产生稳定清晰可辨的扩增产物的引物,共扩增出754条DNA带,其中多态性条带616条,占总条带的81.7%。聚类结果表明:当遗传相似系数(GS)为0.822时,可将94份资源分为5类:第Ⅰ类20份、第Ⅱ类43份、第Ⅲ类7份、第Ⅳ类3份、第Ⅴ类21份。第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ类分别为薯蓣、褐苞薯蓣、山薯和参薯。主成分分析结果显示:第一与第二主成分可解释88.34%(82.10%和6.24%)的遗传总变异。遗传多样性参数分析表明:比较5个遗传多样性参数值,5个群体的遗传多样性水平表现为Ⅰ>Ⅴ>Ⅲ>Ⅱ>Ⅳ,第Ⅰ类(薯蓣)遗传多样性水平高;山药遗传群体间遗传分化系数为51.88%,大部分差异存在于群体之间,群体间遗传分化高。结论:山药种质资源丰富且群体遗传分化高,有利于山药新品种的选育。SRAP标记可有效应用于山药种质资源的鉴别和遗传多样性分析。通过DNA指纹鉴定技术鉴别山药品种具有重要性与紧迫性。 | 黄玉仙 黄姗 梁康迳 马红勃 雷伏贵 华树妹 许旭明 | 2011 | 中国野生植物资源2011,30,6: | 21 |
| 7 | 8个山荆子居群遗传多样性的ISSR分析显示文摘采用ISSR标记对中国北方地区的8个山荆子居群进行了遗传多样性分析,以探讨山荆子在苹果属植物演化过程中的作用.结果显示:(1)从55个ISSR引物中,筛选出11个多态性引物,共扩增出71个位点,其中多态性位点69个,多态位点达97.47%.(2)在物种水平上,有效等位基因数Ne=1.4670,Neis基因多样性(H)为0.2846,Shannon信息指数(I)为0.4399,多态位点百分率(PPB)=80.22;基因流(Nm)为1.6591,居群间基因分化系数(Gst)为0.2316,Φst值为0.2360.(3)聚类分析结果显示,在遗传距离为0.1555、0.1369、0.1258处8个山荆子居群分别聚为两大类、三亚类、四小类,但居群聚类位置与地理位置无明显的相关性.(4)山荆子的居群内遗传多样性贡献率占76.40%,而居群间的贡献率占23.60%,说明山荆子的遗传多样性主要分布在居群内,但居群间的遗传分化程度也较高.由此推测,山荆子的起源中心在华北和东北范围内,其中灵空山(山西)和塞罕坝(河北)居群可近似为核心居群;ISSR标记与花部的一些性状可能有连锁关系. | 王雷宏 郑玉红 汤庚国 | 2010 | 西北植物学报2010,30,7: | 21 |
| 8 | 金线莲遗传多样性的ISSR分析显示文摘目的研究金线莲Anoectochilus roxburghii种质资源及其伪品的遗传多样性。方法采用ISSR方法,对24份试验材料进行PCR扩增,对扩增结果进行电泳检测。对条带进行'0'、'1'矩阵标记后,应用NTSYSpc软件,计算材料间的遗传距离,按照UPGMA法进行聚类分析,构建聚类图。结果采用ISSR技术可以鉴别出台湾金线莲、福建金线莲和公石松。地理分布和形态差异较大的福建金线莲具有相近的遗传关系。结论金线莲野生种质资源间存在较丰富的遗传多样性,为金线莲的品种选育带来巨大空间。 | 黄颖桢 陈菁瑛 赵云青 刘保财 苏海兰 | 2014 | 中草药2014,45,15: | 19 |
| 9 | 广西山药种质资源聚类分析显示文摘对收集到的12份广西山药种质资源材料进行田间种植和生物学性状观察,并根据种质资源的主要生物学性状,应用聚类分析方法,可将它们分为4个或者2个类群;同时,结合形态学与生态学特征,又可将它们分成4个类群:北方山药、南方山药、野生山药、田薯型。 | 梁任繁 王军民 覃芳 何龙飞 韦本辉 | 2009 | 中国蔬菜2009,,4: | 18 |
| 10 | 山药组织总RNA提取方法的比较与分析显示文摘采用异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法、Trizol法和CTAB-LiCl法等3种方法,分别对山药叶片和块茎进行总RNA提取效果进行了比较。结果表明,Trizol法难以提取RNA,异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法提取RNA效果不理想,存在DNA污染,这2种方法不适合于富含多糖类物质的山药组织总RNA的提取;CTAB-LiCl法提取叶片和块茎组织总RNA质量高、完整性好、成功率高,可作为山药类植物总RNA提取的首选方法。 | 覃芳 王军民 何海旺 何龙飞 李创珍 韦本辉 何虎翼 甘秀芹 | 2009 | 基因组学与应用生物学2009,28,4: | 18 |
| 11 | 用ISSR标记分析不同地区紫茎泽兰种群的遗传变异显示文摘利用ISSR标记技术分析了我国32个紫茎泽兰地理种群的遗传多样性,结果表明入侵我国的紫茎泽兰具有较大的遗传多样性,物种水平上的Nei's基因多样性为0.235,shannon's指数为0.372。种群间的遗传分化研究表明,大部分变异存在于种群内,总体遗传多样性中仅34.5%来源于种群之间。紫茎泽兰种群间的遗传距离矩阵和空间距离矩阵之间呈轻度正相关(r=0.542,P<0.001),说明地理隔离可能是阻碍紫茎泽兰种群间基因交流的原因之一。不同海拔高度紫茎泽兰种群的遗传多样性水平呈现随海拔升高而降低的趋势(r=0.368,P<0.001),各海拔区域种群的平均ISSR标记Nei's基因多样性和Shannon's指数均随海拔升高而有所降低。 | 桂富荣 郭建英 万方浩 | 2007 | 分子细胞生物学报2007,40,1: | 16 |
| 12 | 山药种质资源的ISSR分析及初级核心种质库的构建显示文摘采用ISSR分子标记技术对中国不同产地的35份山药种质资源进行遗传多样性分析,并用最小遗传距离逐步抽样法构建核心种质库。结果表明:(1)筛选出12个有效引物共扩增出142个位点,多态性比率为97.18%,平均Shannon’s信息指数(I)为0.4230,平均Nei’s基因多样性指数(h)为0.269 4,平均有效等位基因数(Ne)为1.427 1,平均等位基因数(Na)为1.971 8,说明35份山药种质遗传多样性很丰富。(2)聚类分析表明,种质间的遗传相似系数介于0.54-0.97之间,其中来源地不同的个别种质间的遗传相似系数也很高。(3)经6次逐步抽样,随着抽取种质数目的减少,种质库遗传多样性参数变化不明显,而多态性比率在其中5次逐步抽样中呈现下降趋势;但抽样4在抽样数是抽样前的31%时,多态位点率仍可达到抽样前的97.8%,说明抽样4所构建的山药核心种质库最具代表性。 | 刘向宇 霍秀文 杨明 王东 周翼虎 赵智宏 邰丽华 | 2015 | 西北植物学报2015,35,5: | 14 |
| 13 | 薯蓣属植物种质资源形态变异的数量分析显示文摘目的:通过对不同来源地区的薯蓣属种质资源的植物学性状观测、统计和分析,为薯蓣种质资源的鉴定、分类和遗传改良提供依据。方法:采用大田栽培的方法,对薯蓣植株的24个性状分别进行定性观察或定量测定,分别进行主成分分析和聚类分析,对薯蓣种质的遗传形态变异进行研究。结果:94份薯蓣种质在24个测定的性状上变异非常丰富,叶片大小和根茎变异均较大。24个性状中前7个性状特征值的累积贡献率达80.957%。聚类分析把94份薯蓣属植物分为4个类群,分别属于薯蓣、褐苞薯蓣、山薯和参薯。结论:薯蓣种质间存在较大的形态变异。种质鉴定要重点关注叶片大小和根茎的性状。 | 黄玉仙 王丰青 杜家方 华树妹 雷伏贵 许旭明 梁康迳 张重义 | 2013 | 中国中药杂志2013,38,3: | 13 |
| 14 | 江西山药种质资源遗传多样性及其组培苗遗传稳定性的RAPD检测显示文摘目的对来自江西的11份山药种质资源进行遗传多样性分析,并对其组培苗的遗传稳定性进行检测。方法采用RAPD-PCR技术。结果试验筛选出20条引物,共扩增出238个条带,其中234个为多态性带,平均每个引物扩增出多态性带11.7条,多态性条带比率为98.32%,材料间遗传相似系数为0.575 6~0.970 6,平均相似系数为0.723 1。根据UPGMA聚类分析结果,可在0.634 8的遗传相似系数上,将11份山药种质资源聚成5大类群(类群I^V)。其中第I类群只包含黄独;第II类群只包含瑞昌山药;第III类群包括南城淮山药1、千金薯、信州山药、永丰淮山药和铁棍山药,说明南城淮山药1、千金薯、信州山药、永丰淮山药与来源于河南焦作市温县的铁棍山药亲缘关系较近;第IV类包括南城山药、南城淮山药2、广丰药薯;第V类只包括泰和竹篙薯。这个结果表明江西山药种质资源遗传多样性还是比较丰富的。同时,江西山药带芽茎段连续继代6次后的组培苗(处理组)及其微型块茎实生苗(对照组)的RAPD分析结果也表明,11份山药品种均扩出126~179条可辨认的条带,每个品种的处理组和对照组均出现了5~18条变异条带数,表明江西山药各个品种带芽茎段连续继代6次后的组培苗存在着一定的体细胞无性系变异,但它们与微型块茎萌发实生苗的遗传相似系数还是比较高,说明它们的遗传性状还是比较稳定的,并未影响到其基因型。结论本实验结果可为江西山药引种育种、资源改良、品种鉴定、种质保存及其种苗培育提供可靠依据。 | 尹明华 徐志坚 黄玮 何霖森 刘根华 洪森荣 | 2016 | 中草药2016,47,19: | 13 |
| 15 | 河南栽培大豆的RAPD品种鉴定和聚类分析显示文摘用CTAB法提取了10个大豆品种总DNA,使用RAPD技术对其进行了品种鉴定和聚类分析。从73条随机引物中筛选出12条扩增出较稳定DNA条带的引物扩增这些品种总DNA,共扩增出67条带,大小0.2-5 kb,每种引物扩增出4-9条带;多态性条带共51条,多态性比例为76.12%。利用SPSS11.0软件所做的统计分析和聚类分析结果表明,10个品种间的相似系数在0.528-0.776之间,平均相似系数为0.641 6;可聚成3类:豫豆24号、周豆11号、周豆 12号、豫豆11号、周豆13号、豫豆6号,可聚为A类;中作98-3和豫豆15号可聚为B类;豫豆26号和豫豆22号聚为 C类。同一类品种间体现了一定的相关性。 | 周延清 田苗苗 鲍丹 苑保军 杨青春 方思霞 牛敬媛 李敏 景建州 | 2006 | 华北农学报2006,21,2: | 12 |
| 16 | 参薯种质遗传多样性的ISSR分析显示文摘目的:研究参薯亲缘关系和遗传多样性。方法:收集20个样品并对其原植物进行鉴定,样品进行ISSR分析,NTSYS-pc计算遗传相似系数,UPGMA方法聚类。结果:20个样品被鉴定为参薯、褐苞薯蓣、山薯。参薯与褐苞薯蓣、山薯存在明细的遗传差异,且其种内差异十分显著,遗传相似性系数为0.672 9~0.990 7。UPGMA聚类显示参薯种内16个样品可划分为4组,对照样品原植物表型特征,可见断面颜色及块茎支根数是评价参薯种质亲缘关系的重要依据。结论:参薯种内遗传多样性水平高,研究为山药区分提供了分子生物学依据,也为参薯新品种选育奠定了基础。 | 吴志刚 冷春鸿 陶正明 魏余煌 姜程曦 | 2009 | 中国中药杂志2009,34,23: | 11 |
| 17 | 桔梗种质资源农艺性状的主成分及聚类分析显示文摘目的探讨桔梗种质的遗传差异性,为桔梗品种选育和引种栽培提供依据。方法采用主成分分析和聚类分析方法,分析了来自10个省份的17份种质的开花日期、株高、主茎叶片数、最大叶长、最大叶宽、分支数、花冠直径、结实果率、果长、果宽、千粒重、每果粒数等12个农艺性状。结果筛选出特征根累计贡献率86.32%的5个主成分;对选出的品种中主成分进行系统聚类分析,在离差平方和的水平上将其划分为5大类群。结论桔梗种质的分布呈现出一定的地域相似性。 | 单成钢 王志芬 苏学合 闫树林 | 2008 | 现代中药研究与实践2008,22,1: | 10 |
| 18 | 相关系列扩增多态性分子标记分析部分山药品种遗传多样性显示文摘目的评价山药资源的多样性,为山药品种鉴定及亲缘关系的研究提供科学依据。方法以8个山药栽培居群中的21个山药品种为试材,进行相关系列扩增多态性(SRAP)分析,Popgene 1.32软件计算遗传参数,UPGMA方法构建亲缘关系聚类图。结果相关系列扩增多态性引物共检测到309条清晰条带,其中多态性条带289条;Nei基因多样性指数(H)为0.288 1、Shannon信息指数为(I)0.441 6、居群间基因多样性(Ht)为0.289 1,阐明了山药居群间具有很高的多样性;居群内以河南温县薯蓣居群多样性最高,PPB为35.92%,而福建三明(FJSM)和浙江高楼(ZJRG)山薯居群多样性最低(PPB=0%);居群间基因分化系数Gst为0.865 8、基因流(Nm)为0.077 5,揭示山药居群间遗传变异大于居群内遗传变异;8个居群间的遗传距离在0.049 8~0.487 9,因栽培物种的不同被聚为4类;相关系列扩增多态性标记可将21个山药品种分别归属到薯蓣、参薯、褐苞薯蓣、山薯种内。结论山药品种呈现较高遗传多样性,4种基原山药种间遗传差异较大,相关系列扩增多态性是鉴别我国山药品种的有效方法。 | 吴志刚 李小侠 范传颖 陶正明 | 2013 | 中国药学杂志2013,48,9: | 9 |
| 19 | ISSR和SRAP在山药遗传多样性分析上的应用比较显示文摘以90份山药种质资源为材料,从多态性检测水平、遗传多样性检测水平、遗传距离分析和聚类分析4个方面对ISSR与SRAP揭示山药种质资源遗传多样性的差异进行分析。结果表明:SRAP标记的扩增谱带总数、平均扩增谱带数、平均多态性谱带数都远高于ISSR标记,遗传距离范围也比ISSR标记更广,但多态性比率差异不大;2种标记在检测遗传多样性和种群间的分化程度方面较为相似,二者结果均表明山药种质资源总的遗传变异中约有52%变异存在于种群间,约48%的变异存在于种群内;从聚类分析的结果上看,ISSR标记在以遗传距离为0.13时将山药资源分为4个类群,而SRAP标记以遗传距离为0.18时将其分为5个类群。综合4个方面比较结果及SRAP标记和ISSR标记自身的特点,认为SRAP标记更适合用于山药遗传多样性分析。 | 李齐向 华树妹 雷伏贵 陈芝华 贺佩珍 曹奕鸯 周建金 | 2013 | 福建农业学报2013,28,9: | 9 |
| 20 | 山药种质资源亲缘关系的ISSR分析显示文摘采用ISSR标记技术,分析了94份山药种质资源的遗传多样性及亲缘关系。从100条引物中优选出24条引物,共扩增出352条清晰条带,其中多态性带344条,多态性百分率为97.7%。聚类分析结果将94份山药资源分为4类,第Ⅰ类为薯蓣群、第Ⅱ类参薯群、第Ⅲ类为山薯群、第Ⅳ类褐苞薯蓣群,各种类群的遗传距离依次为:0.053 8~0.088 4,0.035 3~0.068 2,0.053 3~0.138 2,0.054 2~0.126 6,说明4个类群内各资源间亲缘关系由远到近的顺序为:参薯>山薯>薯蓣>褐苞薯蓣。以遗传相似性为标准,以种群为单位,参薯群与山薯群亲缘关系最近;与薯蓣群亲缘关系次之;与褐苞薯蓣群亲缘关系最远。 | 雷伏贵 华树妹 涂前程 贺佩珍 李齐向 曹奕鸯 | 2013 | 福建农业学报2013,28,1: | 9 |