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| 1 | 植物非生物胁迫诱导启动子顺式元件及转录因子研究进展显示文摘顺式作用元件(cis-acting element)是与结构基因串联的特定DNA序列,是转录因子的结合位点,它们通过与转录因子结合调控基因转录的精确起始和转录效率,在植物基因表达调控过程中起着重要的作用。非生物胁迫诱导基因的表达受其上游启动子顺式作用元件及转录因子的调控,目前已发现了多种与非生物胁迫相关的顺势作用元件及转录因子,如DRE元件及DREB类转录因子、MYB元件及MYB类转录因子、GT-1元件及GT-1类转录因子等。顺式作用元件及转录因子的研究对研究植物非生物胁迫相关基因的表达调控具有重要意义,综述植物非生物胁迫诱导启动子功能元件及转录因子的研究进展。 | 郭晋艳 郑晓瑜 邹翠霞 李秋莉 | 2011 | 生物技术通报2011,27,4: | 53 |
| 2 | 高等植物启动子的研究进展显示文摘启动子是基因表达调控的重要顺式元件,综述了高等植物启动子的构成,包括转录起始位点、TATA框和上游启动子元件。并着重从组成型、组织特异型和诱导型启动子3个方面介绍了其结构特征、功能,以及它们在植物基因工程中的应用和研究进展,简述了双向启动子、可变启动子和串联启动子的研究情况,提出植物启动子研究中存在的问题与展望。 | 王颖 麦维军 梁承邺 张明永 | 2003 | 西北植物学报2003,23,11: | 54 |
| 3 | 肝内和肝外胆管癌肿瘤抑制基因启动子甲基化分析显示文摘目的 探讨胆管癌的表遗传学改变。方法 用甲基化特异PCR(MSP)法 ,检测了 12个候选肿瘤抑制基因 (APGE cad herin/CDH1,MGMT ,RASSF1A ,GSTP ,RAR β ,p14 ARF,p15 INK4b,p16INK4a,p73 ,hMLH1,DAPK)启动子在 72例胆管癌中的甲基化情况 ,其中肝内和肝外胆管癌各 3 6例 ,10例良性胆管上皮作为对照。结果 85 %的胆管癌至少有一个肿瘤抑制基因的甲基化 ,在胆管癌中 ,肿瘤抑制基因的甲基化顺序是 :RASSF1A(65 %) ,p15 INK4b(5 0 %) ,p16INK4a(5 0 %) ,APC(4 6%) ,E cadherin/CDH1(4 3 %) ,p14 ARF(3 8%) ,p73 (3 6%) ,MGMT(3 3 %) ,hMHL1(2 5 %) ,GSTP(14 %) ,RAR β(14 %)和DAPK(3 %)。虽然单个肿瘤抑制基因的甲基化可见于良性胆管上皮 ,但是多个肿瘤抑制基因的甲基化只见于胆管癌。约 70 %(5 0 /72 )的胆管癌有 3个或 3个以上的肿瘤抑制基因的甲基化 ,5 2 %(3 8/72 )有 4个或 4个以上肿瘤抑制基因的甲基化。多个肿瘤抑制基因的协同甲基化 ,和RASSF1A ,p15 INK4b,p16INK4a和 /或hMHL1密切相关。RASSF1A的甲基化在肝外胆管癌 (83 %)较肝内胆管癌更常见 (4 7%) (P =0 . 0 0 3 ) ,而GSTP更多见于肝内胆管癌(肝内 3 1%,肝外 6%,P =0 . 0 12 ) ,本研究提示肿瘤抑制基因启动子CpG岛的甲基化在胆管癌中是一? | YANG Bin Michael G.House GUO Mingzhou James G.Herman Douglas P.Clark | 2005 | 胃肠病学和肝病学杂志2005,14,1: | 46 |
| 4 | 高等植物启动子的研究进展显示文摘从高等植物启动子的基本结构、启动子克隆方法入手,着重介绍了组成型、组织特异性及诱导型启动子的研究进展及其在植物基因工程方面的应用情况,提出了植物启动子研究中存在的问题与展望。 | 李杰 张福城 王文泉 黄丽云 | 2006 | 生物技术通讯2006,17,4: | 43 |
| 5 | 高等植物启动子研究进展显示文摘简述了高等植物来源启动子的多种保守顺式调控元件如TATA盒、转录起始位点、G盒等,以及双向启动子和可变启动子。着重介绍了受环境包括激素、光、创伤、真菌、逆境等因子诱导表达的植物启动子以及显示出植物发育特异性表达的启动子。 | 李一琨 王金发 | 1998 | 植物学通报1998,15,A00: | 41 |
| 6 | 启动子克隆概述显示文摘启动子是基因表达调控的重要顺式元件 ,也是基因工程表达载体的一个重要元件。笔者阐述了启动子的结构、分类、克隆方法及其意义 。 | 孙晓红 陈明杰 潘迎捷 | 2002 | 食用菌学报2002,9,3: | 43 |
| 7 | 玉米C_4型pepc基因的分子克隆及其在小麦的转基因研究显示文摘通过LA-PCR方法,从玉米材料中获得了完整的C4型pepc基因.与GenBank中玉米C4型磷酸烯醇式丙酮酸竣化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)基因序列进行同源性分析,结果表明,DNA序列的同源性达98.96%,mRNA同源性达99.38%,蛋白质的氧基酸推测序列同源性为99.38%,在DNA水平,两者之间有49处碱基差异,18处发生在内含子区,18处发生在外显子处.在mRNA水平,两者之间有15处差异,但是这些差异在蛋白质水平上仅导致了4个非连续排列的氨基酸差异,进一步构建了该基因包括5’启动子、3’非编码区以及内含子在内的完整序列(6.7kb)和以CaMV 35S启动子驱动的bar基因为选择标记的表达载体pBAC214(12kb).通过PDS1000/He基因枪转化法,获得了该基因的转基因小麦植株.对转基因小麦进行Southern鉴定,结果表明来自玉米的pepc基因完全整合到了小麦基因组中.通过对转基因小麦叶片的可溶性蛋白质SDS-PAGE电泳分析,表明该基因在小麦中获得了正确的转录、剪接和翻译.通过对转基因小麦叶片中PEPC酶活性的初步测定,发现部分转基因植株叶片中PEPC酶活性提高了3~5倍,与玉米叶片中的PEPC酶活性相当,对转基因小麦旗叶光合生理指标进行测定,发现部分转基因植株光合速率有所提高,并且气孔的开放程度与叶片中的PEPC活性紧密相关,说明完整的玉米C4型pepc基因在小麦中可以正确表达,并起到一定的生理作用. | 陈绪清 张晓东 梁荣奇 张立全 杨凤萍 曹鸣庆 | 2004 | 科学通报2004,49,19: | 34 |
| 8 | SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like Transcription Factors:Star Players for Plant Growth and Development显示文摘SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL) genes encode plantspecific transcription factors that play important roles in plant phase transition,flower and fruit development,plant architecture,gibberellins signaling,sporogenesis,and response to copper and fungal toxins.In Arabidopsis,many SPL genes are post-transcriptionally regulated by the microRNA (miRNA) miR156,among which AtSPL9 in turn positively regulates the expression of the second miRNA miR172.This miR156AtSPL9-miR172 regulatory pathway plays critical roles during juvenile to adult leaf development and the miR156-SPLs feedback interaction persists all through the plant development,which may be conserved in other plants.In the present paper,we provide a concise review on the most recent progress in the regulatory mechanisms associated with plant SPL transcription factors,especially in relation to miRNAs.The potential application of these discoveries in agriculture is briefly discussed. | Xiaobo Chen Zenglin Zhang Danmei Liu Kai Zhang Aili Li Long Mao | 2010 | Journal of Integrative Plant Biology2010,52,11: | 31 |
| 9 | 斑马鱼Mylz2启动子的克隆与转绿色荧光蛋白基因鱼的构建显示文摘为获得能在肌肉表达绿色荧光蛋白的转基因斑马鱼(Brachydaniorerio),采用PCR方法,从斑马鱼基因组DNA中分离了肌球蛋白轻链2启动子,序列分析表明,该启动子与国外文献报道的斑马鱼肌球蛋白轻链2启动子序列的相似性为98.6%。将改造后的启动子插入绿色荧光蛋白基因载体,构建成肌肉特异性表达载体。通过显微注射,将线性化的表达载体注入斑马鱼的受精卵,获得了转绿色荧光蛋白基因的斑马鱼。绿色荧光蛋白在胚胎期开始表达,随着鱼体的生长表达量有增加的趋势,成鱼在紫外灯下用肉眼即可观察到绿色荧光。转基因鱼绿色荧光蛋白的表达具有明显的肌肉特异性。本研究为下一步特定基因的表达研究和获得有特色的转基因观赏鱼奠定了基础。 | 简清 白俊杰 叶星 夏仕玲 梁旭方 罗建仁 | 2004 | 中国水产科学2004,11,5: | 30 |
| 10 | 高等植物启动子功能和结构研究进展显示文摘启动子是控制植物基因表达的重要DNA序列结构,文章简述了启动子的定义、分类和启动子的研究策略。并着重从组成型启动子、组织特异型启动子和诱导型启动子3个方面介绍了它们的功能和结构的研究现状。提出了植物基因工程中启动子研究存在的问题与展望。 | 夏江东 程在全 吴渝生 季鹏章 | 2006 | 云南农业大学学报2006,21,1: | 29 |
| 11 | Gilbert's syndrome: High frequency of the (TA)_7 TAA allele in India and its interaction with a novel CAT insertion in promoter of the gene for bilirubin UDP-glucuronosyltransferase 1 gene显示文摘瞄准:在吉伯的症候群(GS ) 在 UDP-glucuronosyltransferase 1 (UGT1A1 ) 基因识别变体并且在印度在正常控制之中在 TA 插入和它的影响的印度,以及频率为 TA 插入和 GS 估计在纯合性之间的协会。方法:95 个 GS 盒子和 95 正常控制被选择。肝工作,另外的测试被做。倡导者和 UGT1A1 基因的所有 5 前 ons 被重新定序。对新奇 trinucleotide 插入的功能的评价被做由在 silico 分析并且由估计 UGT1A1,倡导者活动在 Hep G2 由适当构造的酶记者试金执行了房间线。结果:在 GS 病人之中, 80% 为 TA 插入是同型结合的,它比从另外的种族组的报告高好几倍。吝啬的 UCB 水平与仅仅这插入的一个拷贝在个人之中被提高,它不与有二个拷贝的那些显著地不同。在 UGT1A1 基因的许多新 DNA 变体被发现,包括在倡导者的插入在 GS 病人的一个子集(10%) 发现了的 trinucleotide (猫) ,然而并非在正常之中控制。In-silico 分析证明在倡导者和功能的分析的合拢 DNA 的显著变化在 UGT1A1 基因源于这插入的抄写效率显示出 20 褶层减小,显著地从而提高 UCB 水平。结论:GS 的基因传染病学越过种族组是可变的,在 UGT1A1 倡导者变体之中的上位相互作用调制胆红素 glucuronidation。 | Shabana Farheen Sanghamitra Sengupta Amal Santra Suparna Pal Gopal Krishna Dhali Meenakshi Chakravorty Partha P Majumder Abhijit Chowdhury | 2006 | World Journal of Gastroenterology2006,12,14: | 29 |
| 12 | 转Zm13-Barnase基因玉米的获得及其花粉育性研究显示文摘研究了Z31×Q31、H×Z3、A188×B73三种玉米 (ZeamaysL .)基因型的愈伤组织对除草剂Bialaphos的耐性 ,从而确定 5mg·L-1为适宜的选择压。用基因枪将Zm13_Barnase基因转化玉米Q31×Z3、Z31×Q31的胚性愈伤组织 ,经 6轮的除草剂筛选获得 32块抗性愈伤组织 ,再生得到 2 4个植株。经PCR检测 ,18个植株PCR反应呈阳性。I_KI染色和花粉离体萌发观察发现 ,5个植株的花粉为部分不育。Southernblot分析证明 ,这 5个植株中整合有Bar nase基因。 | 刘大文 王守才 谢友菊 戴景瑞 | 2000 | Acta Botanica Sinica2000,42,6: | 30 |
| 13 | 真核生物启动子研究概述显示文摘启动子是调控基因表达的重要基因元件,它的调控作用是多层次多因素共同作用的结果。通过启动子的调控能够控制基因表达的水平、部位及方式。深入研究启动子对于了解生物的生长发育、防御系统、疾病等都有非常重要的意义。本文综述了启动子克隆、生物信息学分析和预测的方法,比较了两种启动子分析方法,介绍了启动子甲基化、多态性和合成启动子的研究进展,以期能够为启动子的研究提供参考。 | 李圣彦 郎志宏 黄大昉 | 2014 | 生物技术进展2014,4,3: | 27 |
| 14 | 茉莉花香气相关基因JsDXS及其启动子的克隆与表达分析显示文摘以双瓣茉莉花瓣为材料,采用RT-PCR和RACE技术相结合的方法,获得茉莉花香气形成限速酶即5–磷酸脱氧木酮糖合成酶(Deoxyoxylulose-5-phosphate synthase,DXS)基因(命名为JsDXS);采用染色体步移技术获得该基因的启动子序列;采用实时荧光定量PCR技术检测该基因在花瓣发育过程中的表达动态。结果表明,JsDXS全长cDNA为2 505 bp,其中ORF(Open Reading Frame)为2 145 bp,编码714个氨基酸,含有TPP-DXS、TPP-PYR-DXS-TK-like和Transketolase C等保守功能结构域;分离得到JsDXS基因上游调控序列745 bp,其含启动子核心元件TATA-box及T/GBOXATPIN2(茉莉酮酸酯相关元件)、CIACADIANLELHC(生物钟相关元件)、MYCCONSENSUSAT(低温相关元件)等与花香形成相关的重要顺式作用元件;荧光定量PCR分析表明,该基因在18:00时表达量较低,随着时间的推移逐渐上调,到夜间22:00时表达量达到最高,逐渐又出现下调的趋势,直至凌晨2:00时表达量降到最低,说明该基因的表达受生物钟的控制。 | 孙君 陈桂信 叶乃兴 吕恃衡 刘志钦 黄玮 林志达 | 2014 | 园艺学报2014,41,6: | 27 |
| 15 | 人类polⅡ启动子的识别显示文摘依据基因启动子区和非启动子区碱基分布的特征,应用基于多样性增量的二次判别分析(IDQD),对人类polⅡ启动子进行识别,识别精度达到90%以上的水平,优于其他已发表的(包括SVM分类器等)识别算法.使用IDQD算法也能对转录起始位点(TSS)进行较准确的预测,10-fold交叉检验结果的敏感性和特异性分别为86%和91%.这些结果表明IDQD是一个有效的分类器. | 吕军 罗辽复 | 2005 | 生物化学与生物物理进展2005,32,12: | 26 |
| 16 | 植物诱导型启动子及相关顺式作用元件研究进展显示文摘启动子是基因表达调控的重要元件,而启动子能正确调控基因的表达需要核心启动子以及上下游的顺式作用元件协同作用。诱导型启动子的应用减少了外源基因表达时产生的大量异源蛋白等代谢产物的积累和植物能量的浪费。综合近几年关于诱导型启动子的研究,从其启动子的结构及功能、分类、应用及相关顺式作用元件等方面进行概述,提出了在研究过程中存在的问题及展望。 | 李濯雪 陈信波 | 2015 | 生物技术通报2015,31,10: | 25 |
| 17 | 乙型肝炎病毒基因组中前前-S-编码基因启动子序列的确定及转录活性的鉴定显示文摘为了解前 前 S编码区ORF上游是否具有启动子活性 ,选取其起始密码子ATG上游 2 77bp的DNA序列 ,将其克隆至报告基因表达载体pCAT3中 ,构建pCAT3 前 前 S promoter表达载体 ,以该质粒转染HepG2细胞 ,用酶联免疫吸附法 (ELISA)检测氯霉素乙酰转移酶 (CAT)的表达活性。结果发现 ,质粒pCAT3 前 前 S promoter能够激活CAT的表达 ,吸光度 (A值 )是pCAT3 basic的 10倍 ,说明pCAT3 前 前 S promoter具有启动子活性 ,为在HBV基因组DNA序列中界定、研究新的前 前 SORF提供了直接的实验依据。 | 杨倩 董菁 成军 刘妍 洪源 王建军 张树林 | 2003 | 解放军医学杂志2003,28,9: | 25 |
| 18 | Promoter hypermethylation of CDH1, FHIT, MTAP and PLAGL1 in gastric adenocarcinoma in individuals from Northern Brazil显示文摘AIM: To evaluate the methylation status of CDH1, FHIT, MTAP and PLAGL1 promoters and the association of these findings with clinico-pathological characteristics. METHODS: Methylation-specific PCR (MSP) assay was performed in 13 nonneoplastic gastric adenocarcinoma, 30 intestinal-type gastric adenocarcinoma and 35 diffuse- type gastric adenocarcinoma samples from individuals in Northern Brazil. Statistical analyses were performed using the chi-square or Fisher’s exact test to assess associations between methylation status and clinico- pathological characteristics. RESULTS: Hypermethylation frequencies of CDH1, FHIT, MTAP and PLAGL1 promoter were 98.7%, 53.9%, 23.1% and 29.5%, respectively. Hypermethylation of three or four genes revealed a significant association with diffuse-type gastric cancer compared with nonneoplastic cancer. A higher hypermethylation frequency wassignificantly associated with H pylori infection in gastric cancers, especially with diffuse-type. Cancer samples without lymph node metastasis showed a higher FHIT hypermethylation frequency. MTAP hypermethylation was associated with H pylori in gastric cancer samples, as well as with diffuse-type compared with intestinal-type. In diffuse-type, MTAP hypermethylation was associated with female gender. CONCLUSION: Our findings show differential gene methylation in tumoral tissue, which allows us to conclude that hypermethylation is associated with gastric carcinogenesis. MTAP promoter hypermethylation can be characterized as a marker of diffuse-type gastric cancer, especially in women and may help in diagnosis, prognosis and therapies. The H pylori infectious agent was present in 44.9% of the samples. This infection may be correlated with the carcinogenic process through the gene promoter hypermethylation, especially the MTAP promoter in diffuse-type. A higher H pylori infection in diffuse-type may be due to greater genetic predisposition. | Mariana Ferreira Leal Eleonidas Moura Lima Patrícia Natália Oliveira Silva Paulo Pimentel Assumpo Danielle Queiroz Calcagno Spencer Luiz Marques Payo Rommel Rodríguez Burbano Marília de Arruda Cardoso Smith | 2007 | World Journal of Gastroenterology2007,13,18: | 24 |
| 19 | 肥大细胞源性外来体参与构建针刺穴位效应启动小网络的探讨显示文摘外来体是由细胞分泌的囊泡小体,是囊泡运输的常见形式,参与细胞间信息交流。国内外现有研究和本课题组前期工作表明,针刺效应的产生与穴位局部神经、肥大细胞及相关信号分子等因素相关。外来体参与神经细胞信息传递、肥大细胞功能活动、信号分子释放等生理功能。基于外来体与神经、肥大细胞、信号分子的密切关系,我们认为针刺引起穴位局部肥大细胞释放的外来体是针刺穴位初始效应的关键因素之一,在神经-肥大细胞-信号分子的网络联系中具有信使作用。 | 陈波 李明月 郭义 赵雪 刘阳阳 | 2015 | 针刺研究2015,40,1: | 24 |
| 20 | 真核生物启动子TATA-box·GC-box和CAAT-box的分析显示文摘下载了已经通过试验证实的2541条真核生物启动子序列,运用生物信息学方法分析了TAT—box、GC—box和CAAT—box的数量及其在启动子中的分布情况。结果表明,有23.85%真核生物启动子序列中至少有1个TAT—box,且TATA—box主要分布在转录起始位点前24~36bp的区域内;有47.30%真核生物启动子序列中至少有1个GC—box,且GC—box在转录起始位点前23~128bp的区域内分布比较集中;有42.35%真核生物启动子序列中至少有1个CAAT—box,且CAAT—box在转录起始位点前51~159bp的区域内分布比较集中。这说明TAT-box在真核生物启动子中的位置比较固定,对基因转录的正确起始可能起着重要的作用;而GC—box和CAAT-box分布区域较广,数量也明显多于TAT—box。 | 张小辉 祁艳霞 | 2008 | 安徽农业科学2008,36,4: | 22 |