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1启动子序列克隆和功能分析方法的研究进展显示文摘综述了启动子序列克隆和功能研究方法的研究进展。启动子克隆的主要方法有基因组文库筛选法、探针载体筛选法、常规PCR法、反向PCR法、锅柄PCR法、序列特异性引物PCR法、热不对称交错PCR法和Y型接头扩增法。其中,热不对称交错PCR法因操作简便、特异性较高而最有效。启动子功能分析方法有生物信息学分析法和实验分析法,前者主要依托数据库初步预测启动子序列;后者确定启动子的顺式元件及其功能,具体策略有点突变分析、凝胶阻滞分析、瞬间表达分析、转化分析和酵母单杂交分析。可为启动子功能的研究提供参考。杨晓娜 赵昶灵 李云 李会容 苏丽 周燕琼 2010云南农业大学学报(自然科学版)2010,25,2:17
2植物非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件的研究方法显示文摘非生物胁迫严重影响植物生长发育,降低作物产量。植物通过各种途径忍受或抵抗非生物胁迫,主要表现是各种抗非生物胁迫基因的表达。基因表达受其上游启动子及转录因子的调控,目前对抗非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件及转录因子的研究成为热点。本文综述了植物非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件及转录因子的研究方法,并展望了顺式作用元件及转录因子研究的方向及前景。郑晓瑜 郭晋艳 张毅 李秋莉 2011植物生理学报2011,47,2:17
3杨树葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)基因启动子的克隆与分析显示文摘葡萄糖-6-磷酸脱氢酶是磷酸戊糖途径的关键性调控限速酶,其主要功能是为脂肪酸合成、氮还原和谷胱甘肽等生物分子合成提供还原力NADPH,也为核酸合成提供戊糖;此外,还参加非生物逆境胁迫应答反应。因此,G6PDH对植物的生长发育起着非常重要的作用。本文利用甜杨G6PDH基因和毛果杨基因组序列,通过PCR获得了甜杨G6PDH基因上游1400bp的序列。序列分析结果表明,该序列具有启动子的基本元件TATA-box、CAAT-box。此外,还包含多个胁迫诱导元件,如低温诱导元件LTR,盐诱导元件GT-1,抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件MYB和MYC,以及光响应元件L-box、G-box、3AF-1、TC丰富区等。林元震 张志毅 郭海 刘纯鑫 陈晓阳 2009基因组学与应用生物学2009,28,3:15
4组织特异性启动子在作物基因工程中的研究进展显示文摘作物基因工程中常使用组成型启动子驱动外源基因在转基因作物中高效表达,但组成型启动子不能从时间上和空间上调控外源基因的表达。可以采用组织特异性启动子,在特定器官或组织中表达外源基因,从而减轻组成型启动子对转基因作物的不良影响,使目标基因的表达产物在特定部位积累。本研究通过对组织特异性启动子的特征进行了简要阐述,重点归纳了组织特异性启动子的分类,分析了其在作物基因工程中的最新研究进展,并探讨了其在作物基因工程应用中存在的问题与前景。贺红霞 陈亮 林春晶 柳青 2014中国农学通报2014,30,9:15
5植物诱导型启动子的研究进展显示文摘为实现目的基因的高效表达,诱导型启动子的开发和应用成为植物基因工程中的研究热点。在特定生物及非生物环境胁迫下,诱导型启动子能够驱动外源基因实现高效表达,其诱导型是由其上存在的正负调控元件相互作用而决定的。综述了诱导型启动子的种类、启动子序列内部调控元件的类型以及适用于诱导型启动子的研究方法,并对其在植物基因工程中的应用前景进行了展望。王志新 赵琳 李文滨 2011大豆科技2011,,3:12
6植物诱导型启动子研究进展显示文摘启动子是控制目的基因表达的关键元件,而诱导型启动子的出现为精确、灵活调控外源基因在植物中的表达提供了可能,目前已经成为植物基因工程研究和开发的热点之一。该文主要就环境胁迫诱导型、光诱导型、激素诱导型等各种常见的诱导启动子的特点进行了综述,并对诱导型启动子的未来研究和应用方向进行了展望。孙芳芳 宋洪元 2014南方园艺2014,25,2:10
7启动子结构、功能预测和验证方法的研究进展显示文摘本综述总结了启动子结构、功能预测和验证的主要方法及其选用的研究进展。已知或克隆到靶基因的5'端上游序列后,应首先用生物信息学方法预测序列中的启动子,分析、预测其结构元件及其功能,再用实验方法验证元件的功能。生物信息学分析、预测是指单独或结合选用若干软件以及真核生物启动子、植物DNA顺式作用调控元件、植物顺式作用调控元件、Plant Prom、转录因子和转录调控区数据库;实验方法验证是指在综合考虑特定方法的原理、目标内涵和操作流程等多方面优劣势的基础上合理选用表达分析、染色质免疫共沉淀法、DNaseⅠ足迹法、电泳迁移率变动分析法和酵母单杂交法,但是,各方法均在运用中被不断改进,且目前使用最广泛的是表达分析法。启动子结构、功能预测和验证常选用两个或两个以上软件、数据库和方法,但可能会涉及到对不同数据库和方法产生的不一致或矛盾结果的甄别,将来应研发新的、更有效的研究DNA-蛋白互作的技术,与上述经典实验方法结合、用于启动子的功能研究。本综述可为启动子结构和功能的研究提供方法学参考。曾晓玲 赵昶灵 文国松 丁灿 张洪玲 徐率 古朝山 2018分子植物育种2018,16,12:9
8植物Ⅱ型启动子功能研究的常用方法及其进展显示文摘启动子是基因的一个重要组成部分,控制基因转录水平的表达,对其功能的研究成为基因表达调控研究的重要内容。简述了启动子的基本结构和功能分类,着重介绍了启动子功能研究的方法,包括利用生物信息学的预测、利用报告基因表达系统确定启动子的调控区或顺式调控元件以及利用调控蛋白与顺式调控元件结合的特性进行分析的技术,并提出了目前启动子研究存在的问题。赵学彬 唐桂英 单雷 2013生命科学2013,25,6:9
9中国荷斯坦牛TLR1基因启动子区SNP多态与乳房炎抗性和泌乳性状的关联分析显示文摘Toll样受体1(Toll like receptor 1,TLR1)基因是牛(Bos taurus)重要的免疫基因之一,在免疫识别、炎症反应等方面有重要作用。为探讨TLR1启动子区SNP突变与中国荷斯坦牛乳中体细胞评分(somatic cell score,SCS)、临床乳房炎(clinical mastitis,CM)和泌乳性状的相关性,本研究根据TLR1基因启动子区序列,利用PCR-直接测序法对低SCS和高SCS各20个样本进行SNP筛查,将筛选到的TLR1-245 G>T利用飞行质谱法对866头中国荷斯坦牛进行检测,同时收集所检测牛只临床乳房炎发生情况、SCS和泌乳性状等信息,利用多因素方差分析SNP位点突变对相应指标的影响。结果表明,TLR1基因启动子区700 bp范围内只发现TLR1-245 G>T 1个SNP突变;TLR1-245 G>T与中国荷斯坦牛日产奶量及SCS极显著相关(P<0.01),与乳脂率、乳蛋白率、乳糖、总固体以及尿素氮含量无显著相关(P>0.05),GG型个体日产量及SCS均显著低于GT和TT型个体(P<0.05)。TLR1-245 G>T与奶牛患临床乳房炎次数显著相关(P<0.05),TT型个体患临床乳房炎次数显著低于GG和GT型个体(P<0.05)。研究结果为提高中国荷斯坦牛产奶量和控制乳中体细胞数的分子标记选择提供了参考资料。王梦琦 倪炜 张慧敏 杨章平 王西朴 蒋彦森 毛永江 2017农业生物技术学报2017,25,3:8
10水稻Rubisco小亚基启动子的克隆及光诱导表达载体的构建显示文摘高效特异表达的启动子往往是转基因研究的关键因素。Rubisco小亚基启动子具有光诱导性、组织特异性和高表达的特性,可利用该启动子为转基因研究服务。本文以水稻(Oryza sativa)中花11叶片为材料,根据GenBank所报道的水稻Rubisco小亚基启动子序列,设计特异引物从水稻基因组DNA中扩增得到长度约1600bp的DNA片段,将该片段连接至T载体pMD18-TSimple,测序结果表明该片段序列与GenBank报道序列一致为100%。Plant CARE序列分析表明,该启动子具有12个与光诱导表达相关的元件。为构建光诱导表达载体,将该启动子和植物表达载体pCactF分别以KpnⅠ和XbaⅠ酶切后连接。光诱导表达载体的构建为进一步研究基因功能及利用光诱导表达载体改良作物品质奠定基础。胥华伟 史国安 范丙友 侯典云 2012基因组学与应用生物学2012,31,5:7
11大豆GmWRI1a基因启动子克隆及其功能分析显示文摘为了探究大豆种子油脂合成与储存基因GmWRI1a的调节,分析其启动子功能,从大豆品种东农50基因组中扩增获得GmWRI1a基因转录起始位点上游1669bp的启动子序列,转化拟南芥。GUS染色确定了启动子的有效性,继而根据顺式作用元件的分布,分别扩增得到4个启动子5'端缺失片段1138bp,1087bp,690bp和437bp。4个启动子缺失片段分别转化拟南芥后,通过GUS组织染色结果发现,这些启动子片段能够驱动下游GUS基因表达。GUS酶活表明,启动子存在乙烯、茉莉酸、赤霉素3种激素响应元件,其中乙烯、茉莉酸和赤霉素的响应元件分别分布在-1138^-1087bp、-1087^-690bp和-690^-437bp。邵宇鹏 杨明明 包格格 孙英楠 杨强 李文滨 王志坤 2019中国油料作物学报2019,41,4:6
12紫花苜蓿高温诱导启动子pMsMBF1c的克隆与功能分析显示文摘植物耐热性受复杂而精细的调控。热诱导启动子能经济、高效的激活或关闭耐热调节途径关键基因的表达,在植物功能基因组研究与现代分子育种技术中起十分重要的作用。以紫花苜蓿耐热候选基因MsMBF1c的编码序列为基础,采用酶切连接的方法分离获得了其上游1748bp序列,生物信息学分析发现该区域具有HSE与GATA结合位点等2个与植物耐热调节相关的保守模体,此外还有5个ABA应答元件(ABRE、MYB2、MIC2、CBF与DPBF)和2个MYB蛋白结合位点,说明MsMBF1c除了参与植物耐热性调节外,还可能参与其他抗逆性调节。构建pBI121-MsMBF1c::GUS双元载体转化野生型拟南芥,荧光定量分析热诱导后的转基因植物中GUS与AtMBF1c基因的表达发现其分别上调了5.4与4.8倍,并且高温诱导下转基因植株的组织化学染色分析同样证明MsMBF1c启动子显著受高温诱导。分离获得紫花苜蓿MsMBF1c启动子序列并转化拟南芥,并且从生物信息学、组织化学染色与基因表达等方面验证该序列能显著被高温诱导,为探讨紫花苜蓿耐热调控机制及通过分子生物技术改善紫花苜蓿耐热性提供理论支撑,最终为培育适应南方高温气候条件的紫花苜蓿新品种提供技术储备。李小冬 莫本田 牟琼 娄芬 陈文贵 陈光吉 张瑜 韩永芬 2019草业学报2019,28,1:3
13糙皮侧耳Pleurotus ostreatus子实体凝集素基因polectin2及其启动子的克隆及功能鉴定显示文摘凝集素在食用菌的生长发育、抗病虫等逆境及抗肿瘤等方面发挥着重要的作用,但是关于糙皮侧耳凝集素基因的抗逆功能研究还比较薄弱。因此,本文利用PCR技术克隆得到糙皮侧耳子实体凝集素polectin2基因及其启动子序列,测序和生物信息学结果显示该基因不含内含子,完整开放阅读框为408bp,编码136个氨基酸,预测蛋白分子量15.3k Da;启动子polectinpro序列长度为927bp,生物数据库PLACE分析结果表明polectinpro含有低温、干旱胁迫诱导和病程相关等抗逆元件。然后,构建含有GFP融合蛋白的重组植物表达载体pCAMBIA1302-polectinpro-gfp,并进行烟草遗传转化,结果证明该启动子能够在低温诱导下驱动gfp基因表达。同时成功构建了含有polectin2的重组植物表达载体pCAMBIA1301-polectin2并进行了烟草遗传转化;对阳性转化植株T1代和野生型种子进行低温胁迫实验,结果表明转基因种子萌发率明显高于野生型。综上所述,推测polectin2基因具有耐低温功能,且其启动子具有低温诱导活性。上述结果为进一步利用子实体凝集素polectin2基因提高食用菌的耐低温等抗逆功能提供了理论依据和技术支持。苏文英 盛立柱 代月婷 宋冰 付永平 李玉 2017菌物学报2017,36,8:3
14山羊卵巢维持基因FOXL2启动子活性及调控区域分析显示文摘旨在研究山羊卵巢维持基因FOXL2启动子活性以及探究该基因的调控机理。从NCBI数据库调取FOXL2基因启动子序列,用生物信息学软件对其核心启动子和转录因子进行预测分析。使用PCR技术克隆FOXL2基因启动子序列,并构建一系列缺失载体,瞬时转染293T和A375细胞,利用双荧光素酶基因检测仪测定相对荧光素酶活性值。结果表明,该基因启动子区域存在两个典型的CpG岛,分别位于(-920/+51(972bp))和(+125/+555(430bp))区域;经KpnⅠ和HindⅢ双酶切鉴定表明,重组载体质粒构建正确;在细胞中插入不同长度的FOXL2基因启动子片段,随着启动子5′端截短,荧光素酶转录活性先升高再逐渐降低。(-934/+324)区域存在转录活性,(-32/+324)区段包含了转录的基本元件;(-934/-456)区域在转录过程中对FOXL2基因起负调控作用,(-456/-192)区域为正调控区域。耿立英 张宇 李祥龙 周荣艳 李兰会 王志刚 2015畜牧兽医学报2015,46,12:2
15产气肠杆菌组成型启动子的筛选及其活性测定显示文摘目的:从产气肠杆菌基因组中筛选组成型启动子,并检测其活性。方法用Sau3 AⅠ限制性内切酶将产气杆菌的基因组酶切到500 bp大小,连接到pCMR8 a载体上,转化DH5α感受态后涂布氯霉素和卡那抗生素的双抗平板上筛选启动子,经SDS-PAGE分析启动子的蛋白表达能力,筛选较强启动子并对其进行截短和顺反性实验,最后利用截短启动子表达不同的蛋白。结果成功筛选到了5个启动子序列,获得到了表达能力最强启动子的截短核心序列,验证了其具有反向启动外源蛋白表达的能力,成功表达了其他外源蛋白。结论本实验通过大肠埃希菌表达系统成功的筛选并验证了产气杆菌的一种组成型启动子,具有较强的启动外源蛋白表达能力,对工业上蛋白的生产及实验室表达某种蛋白具有重要意义。苑荣亮 仉秋实 汪玉婷 岳风先 刘志成 张成 井敏敏 毛小琴 井申荣 2016医学分子生物学杂志2016,13,4:2
16西瓜果实AGPL1基因启动子的序列分析显示文摘利用PCR技术从西瓜嫩叶中扩增出1.2 kb AGPL1基因启动子,通过Plant CARE和PLACE数据库对启动子序列进行生物信息学分析。结果表明,AGPL1启动子具有多个典型的TATA-Box和CAAT-Box等基本元件,以及高水平转录顺式作用元件5UTR Py-rich stretch,光响应元件ACE、ATCC-motif、Box 4、I-Box、Sp1、TCCC-motif、GAG-motif、MNF1,2个赤霉素响应元件GARE-motif、P-box,参与蛋白代谢调节的顺式作用元件O2-site,参与水杨酸反应的顺式作用元件TCA-element,厌氧诱导所需的顺式作用元件ARE、逆境胁迫响应元件TC-rich repeats、生理昼夜节律控制元件circadian等,为研究外源基因在果实中的特异表达提供参考。周丽英 卜璐璐 杨春雷 高婷 田甜 杨正安 2016亚热带植物科学2016,45,2:2
17藻类基因启动子结构与功能研究进展显示文摘启动子是基因表达调控重要的顺式元件,其结构与功能的研究成为分子生物学的研究热点之一。本文介绍了植物基因启动子的研究方法与概况,重点综述了藻类基因启动子的研究现状,以及本实验室对节旋藻藻蓝蛋白基因启动子的研究情况,并就启动子研究在基因工程中的应用价值和存在问题进行了讨论。张学成 郭楠 宋晓金 2008中国海洋大学学报(自然科学版)2008,38,3:2
18陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列分析显示文摘为了筛选棉花抗逆转基因育种的候选启动子,根据陆地棉脱水素基因GhDHN1的cDNA序列和陆地棉基因组序列,利用生物信息学分析方法,获得棉花陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列。结果表明,该启动子上多个位点含有启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box,并含有非生物逆境胁迫响应元件、响应植物激素顺式作用元件、多种光调控相关的顺式作用元件以及胚乳表达顺式调控元件等。推测GhDHN1基因的启动子受光诱导,同时受低温和干旱胁迫等非生物逆境的诱导,参与棉花的生长发育。王俊娟 王德龙 王帅 阴祖军 王晓歌 樊伟莉 郭丽雪 郭晓宁 叶武威 2017中国棉花2017,44,5:2
19杨树基因启动子的克隆及功能研究进展显示文摘启动子是基因调控的重要元件,研究启动子的功能对于基因的表达调控有重要意义。本文从杨树启动子的克隆方法入手,着重介绍了杨树启动子的功能研究进展,并展望了今后的研究前景。姚叶 唐琪 李江艳 郎洪岩 杜希华 2012山东林业科技2012,42,5:2
20高等植物ACC氧化酶基因启动子研究进展显示文摘启动子是控制植物基因表达的重要DNA序列结构,本文从高等植物ACO基因启动子克隆、顺式作用元件分析及GUS基因表达等方面着眼,综述该领域的研究进展。吴健 侯和胜 2014天津农业科学2014,20,4:2
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