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| 1 | 植物AUX/IAA基因家族研究进展显示文摘AUX/IAA是生长素早期响应基因家族,其编码的蛋白质能通过与生长素响应因子特异性结合来调控生长素响应基因的表达,在整个植物生长素信号转导过程中具有重要作用。为了深入研究生长素信号转导分子机制,本研究介绍了AUX/IAA基因家族的基因克隆、结构特征和组织表达特异性,概括了AUX/IAA基因家族的分子调控机制,总结了AUX/IAA基因的功能。最后对AUX/IAA基因家族未来的研究方向做了探讨。 | 李俊男 燕晓杰 李枢航 张荣沭 | 2018 | 中国农学通报2018，34，15： | 12 |
| 2 | 黄瓜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析显示文摘Aux/IAA基因家族是一个典型的被生长素诱导而表达的基因家族,可以被生长素快速诱导表达。采用生物信息学方法在黄瓜基因组中确定了28个Aux/IAA基因,除4号染色体外,其他6条染色体均有分布,编码蛋白序列在70~427个氨基酸残基之间,22个黄瓜Aux/IAA蛋白具有完整的4个保守结构域,进化方式多样化。该研究结果有助于黄瓜生长素信号转导途径的解析。 | 王垒 陈劲枫 贾利 | 2010 | 中国瓜菜2010，23，6： | 8 |
| 3 | 江苏高粱发展前景分析显示文摘高粱是中国第五大粮食作物,是典型的耐旱、耐盐碱作物,是中国主要适合的酿造作物。江苏酒厂众多,对高粱需求量大。同时又有大量的海边滩涂和内地丘陵等边际土地发展高粱种植。为了江苏高粱产业的快速、健康发展,本文分析了江苏省发展高粱产业的前景及存在的问题,探讨了拓宽高粱利用的可能方向。 | 郭士伟 | 2015 | 中国农学通报2015，31，21： | 7 |
| 4 | 农作物Pht1家族磷转运体蛋白的生物信息学分析显示文摘以AtPT1所编码的氨基酸序列做为检索序列,通过对GenBank NR数据库以及EMBI、DDBJ、PDB数据库进行检索,发现小麦、大麦、玉米、水稻和番茄等植物中具全长cDNA的33个Pht1家族磷转运体基因,包括马铃薯1个,苜蓿5个,辣椒3个,茄子2个,烟草2个,番茄2个,菜豆1个,玉米4个,大麦2个,小麦1个,水稻7个,大豆2个和木薯1个。利用生物信息学分析,首次将Pht1家族磷转运体基因保守特征序列确定为GGDYPLSATIMSE。对检索到的33个Pht1家族磷转运体蛋白进化关系分析表明,与AtPT1亲缘关系较近的双子叶植物磷转运体蛋白是木薯MePT1和GmPT2,关系较近的单子叶植物磷转运体蛋白是OsPHT8和OsPHT12。 | 李立芹 | 2011 | 作物杂志2011，，3： | 6 |
| 5 | 百子莲2个ARF基因与2个Aux/IAA基因的全长克隆与序列分析显示文摘采用不同浓度外源生长素类调节物质毒莠定(PIC)对百子莲(Agapanthus praecox ssp. orientalis)进行继代培养,并对其胚性愈伤组织进行比较转录组学研究,获得了百子莲生长素信号转导途径中的2个ARF和2个Aux/IAA家族基因,推测其为体胚发生过程中生长素信号传导途径相关的重要调控因子。采用RACE技术获得Ap ARF1、Ap ARF2、Ap Aux/IAA2与Ap Aux/IAA3的c DNA全长,分别为2 343、2 888、1 034和821 bp,开放阅读框(ORF)长度分别为1 770、2 349、480和549 bp,分别编码589、782、159和182个氨基酸残基。生物学分析表明,Ap ARF1与Ap ARF2蛋白均具有ARF家族的典型结构,Ap Aux/IAA2蛋白结构域Ⅳ不完整,Ap Aux/IAA3结构域Ⅱ部分缺失,但仍具有Aux/IAA蛋白的典型功能。转基因实验表明,Ap Aux/IAA过表达植株表现出生长延缓及发育受阻的表型,Ap ARF过表达植株表现出生长促进、花期提前的表型,验证了百子莲Ap ARF和Ap Aux/IAA家族蛋白对植物生长发育的调控作用。 | 杨舟 吕可 吕珊 王俊杰 张荻 | 2019 | 浙江农业学报2019，31，1： | 6 |
| 6 | 拟南芥泛素家族的全基因组分析显示文摘泛素家族是一类含有保守性泛素结构域的蛋白质统称,主要通过ATP依赖性的泛素-蛋白水解酶复合体通路选择性降解细胞蛋白的各种生理活动。本研究基于HMM模型,已知泛素氨基酸序列作为训练集,搜索拟南芥信息资源数据库并鉴定AtUBQ家族成员,然后对这些基因编码的蛋白质序列进行基因结构分析、染色体定位、多序列联配、系统发育树构建和组织差异表达分析。结果表明,AtUBQ家族中共有13个推定的AtUBQ基因,命名为AtUBQ01~AtUBQ13,均属无内含子基因且结构基本相同,非均匀分布于拟南芥5条染色体;AtUBQ家族可划分为A、B和C3个亚家族,其中76.92%的基因编码蛋白质属于A亚家族;EST搜索发现除AtUBQ02和AtUBQ07基因无EST数据支持外,余下的AtUBQ基因在拟南芥根、芽和叶等7个组织中呈现差异表达,仅见AtUBQ08和AtUBQ10基因在上述7个组织中均表达,而AtUBQ03基因仅表达于叶中。本研究结果可为进一步开展该家族的生物学功能和分子进化机制的研究提供基础资料。 | 强承魁 凤舞剑 王胜永 赵虎 苏新林 周保亚 | 2010 | 基因组学与应用生物学2010，29，5： | 5 |
| 7 | 芸薹属大白菜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析显示文摘Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的3类基因家族之一。现主要从基因组水平研究白菜Aux/IAA基因的分布及特征。结果表明:从BRAD共检测到59条白菜Aux/IAA基因,不均等分布在白菜的全部10条染色体上。通过多重比对和基序探测结果显示,40条白菜Aux/IAA基因具有4个保守基序,其它基因的保守基序则有不同程度的分化。系统进化分析表明,Aux/IAA基因家族可分为7个亚家族。通过表达模式预测发现,白菜Aux/IAA基因家族表达模式也有较大差异。 | 郑小敏 赵敬会 李荣冲 王瑞雪 张涛 | 2012 | 北方园艺2012，，14： | 5 |
| 8 | 大豆ZF-HD蛋白家族的全基因组序列特征分析显示文摘同源异形盒基因家族的同源域蛋白在植物、动物和真菌发育过程中作为转录因子起着重要的作用[1]。自从1993年Schinder首次发现植物同源结构域(PHD,Plant home-odomain)以来,还发现在拟南芥蛋白HAT3.1和HOXIA内含有一段富含半胱氨酸的保守序列,此序列与金属离子结合结构域(Metal-binding domains)非常相似[2]。 | 张大勇 王长彪 易金鑫 徐照龙 何晓兰 朱虹润 马鸿翔 | 2011 | 江苏农业学报2011，27，3： | 4 |
| 9 | 辣椒Aux/IAA基因家族的鉴定与表达分析显示文摘采用生物信息学的方法,共鉴定出22个辣椒Aux/IAA基因,经聚类分析,将其分为A、B、C、D、E、F、G 7个亚族。这些基因非均匀地分布在辣椒7条染色体上,其中第3条染色体上分布最多,有8个Aux/IAA基因。这些基因在辣椒的根、茎、叶、花、花蕾以及果实各个发育时期的表达模式显示:Capana03g000310在每个组织的各个发育时期都能检测到表达,且表达量较高,呈现出明显的组成型表达模式。Capana00g002758只在根和茎中检测到表达,Capana03g000311和Capana06g001465只在花和果实中检测到有较高表达量,呈现出明显的特异型表达模式。以辣椒6421高世代自交系为试验材料,用30μmol/L脱落酸处理幼叶,采用qRT–PCR进行分析,结果表明:辣椒Capana00g002644和Capana01g001423的相对表达量高于对照,而Capana09g001096、Capana06g001308、Capana03g004455、Capana00g000845、Capana03g004568、Capana03g000244和Capana03g000310的相对表达量均低于对照,说明脱落酸胁迫可以对辣椒Aux/IAA部分基因产生明显的正向或负向诱导。 | 张帆 马艳青 李雪峰 杨博智 郑井元 邹学校 谢玲玲 刘峰 | 2018 | 湖南农业大学学报(自然科学版)2018，44，6： | 4 |
| 10 | 基于Perl脚本的大豆核苷酸序列高通量提取显示文摘自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量分析,还可用于某个基因在全基因组中的所有序列分析。本研究分别对大豆第4染色体Glyma04g00930.1~Glyma04g01740.1区间的基因序列和水通道蛋白基因家族成员TIP(液泡膜水通道蛋白)序列进行提取。结果发现:Glyma04g00930.1~Glyma04g01740.1区间共含有112个基因序列;大豆全基因组共有91个TIP基因,在20条染色体上均有分布,且在第12染色体上分布最多,多达10个,暗示该染色体可能对大豆的水分利用效率起着重要作用,基因所含内含子数为1~8个。序列提取所用的2个脚本程序可以从http://gffzz137e79eaf7404082hn5wobwf90nbv650v.ffgz.tsg.suse.edu.cn/sxbi/soybean_strict.rar下载。 | 张大勇 王长彪 易金鑫 何晓兰 马鸿翔 | 2012 | 南京农业大学学报2012，35，1： | 3 |
| 11 | 柚AUX/IAA基因族的基因注释分析显示文摘以De novo转录组学方法分析柚Citrus grandis Osbeck cv.生长素/吲哚乙酸蛋白(auxin/indoleacetic acids protein,AUX/IAA)基因家族的基因。以特早熟龙柚(变异型)和琯溪蜜柚(参照型)嫩果和叶片为材料,经过RNA提取、反转录、测序、组装得到Unigene序列。Unigene序列在Nr、Swiss-Prot、KEGG和COG四大数据库中进行比对,获得AUX/IAA家族基因注释结果。采用数字基因表达标签(digital gene expression tag,DGE)技术,对样本中基因转录丰度以RPKM值表示,比较处理组和对照组的RPKM值,以倍性变化≥2确定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。从特早熟龙柚和琯溪蜜柚嫩果和叶片中,总共注释到17个AUX/IAA基因家族基因,它们都在特早熟龙柚和琯溪蜜柚嫩果和叶片中表达。其中在龙柚嫩果(FE)和蜜柚嫩果(FL)中有1个差异表达基因(序号:035781);在龙柚叶片(LE)和蜜柚叶片(LL)中有1个差异表达基因(序号:001808)。注释到的17个AUX/IAA基因家族基因各有14个在克莱门特柚Citrus clementina和中国甜橙Citrus sinensis报道过。 | 张敬虎 潘一山 王少峰 邹金美 陈羡德 朱阳 蔡文燕 蓝炎阳 | 2015 | 福建热作科技2015，40，4： | 1 |
| 12 | 油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析显示文摘Aux/IAA基因家族是植物激素生长素(Auxin)早期反应的三大家族之一,研究Aux/IAA基因家族有利于深入探讨生长素信号转导分子机制,而油棕Aux/IAA基因家族的全基因组分析尚无报道。本研究利用生物信息学方法在油棕中鉴定到55个Aux/IAA家族基因,染色体定位分析表明其中50个分布在油棕的除第5、第13、第14、第15染色体外的不同染色体上;聚类分析将油棕Aux/IAA分为A、B两大类群,8个亚族;分析油棕Aux/IAA基因的表达模式,表明其Aux/IAA基因家族不同亚族基因的表达模式存在较大差异,其中一些基因可能与油棕的授粉受精过程相关。本研究将为油棕Aux/IAA基因家族各基因的具体功能研究提供一定的理论依据,并对油棕育种研究和高产栽培提供一定的参考。 | 杨蒙迪 金龙飞 周丽霞 窦雅静 曹红星 李新国 | 2021 | 分子植物育种2021，19，5： | 1 |
| 13 | 内源激素及其合成相关基因表达量对毕克齐山药块茎生长的影响显示文摘【目的】分析毕克齐山药中内源激素含量与淀粉含量、可溶性总糖含量和还原糖含量的关系,以及与其相关合成基因表达量的相关性,探究毕克齐山药块茎膨大的机理。【方法】以毕克齐山药5个不同生长期块茎为材料,采用酶联免疫吸附法分别测定脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)、生长素(IAA)、茉莉酸(JA)、玉米素(ZR)、异戊烯基腺苷(IPA)等6种内源激素含量,采用高效液相色谱仪测定方法测定水杨酸(SA)含量。【结果】IAA、ZR、ABA、JA和SA含量与山药块茎形态指标正相关;GA3、IPA含量与形态指标负相关;IAA含量与山药块茎周长和块茎直径显著正相关;GA3含量与块茎长度显著负相关;与IAA相关的基因与内源激素IAA含量显著负相关。【结论】内源激素IAA、ZR、ABA、JA和SA促进山药块茎膨大;GA3、IPA抑制山药块茎生长;IAA促进山药增粗;GA3抑制其伸长生长;与IAA相关的基因的下调表达对IAA的合成有促进作用,即正调控IAA含量。 | 敖兰吉亚 季祥 邵盈 赵令敏 张艳芳 霍秀文 | 2020 | 福建农业学报2020，35，9： | 1 |
| 14 | 大豆PIN-Like(PILS)基因家族的鉴定、表达分析及在根瘤共生固氮过程中的功能显示文摘植物激素生长素在植物的生长发育过程中发挥了至关重要的作用,它的稳态和浓度梯度建立控制了几乎所有器官的极性建成。生长素在特定细胞中合成、运输、感知以及代谢降解建立了符合器官发育的生长素浓度梯度。在豆科植物中,根与土壤微生物互作形成了根瘤这一特殊的器官,进行生物固氮。然而,生长素稳态控制生物固氮的功能还未知。拟南芥中的研究表明,PIN-Like (PILS)蛋白协助调节的细胞内生长素稳态,并介导下游细胞核内的生长素信号传递。本研究以大豆作为研究模型,在大豆基因组中鉴定获得19个PILS家族基因(GmPILS),不均匀分布于大豆10条染色体上。GmPILS在大豆9种组织部位中表现出多种表达模式,且具有明显的组织表达特异性。GmPILS1e和GmPILS1f在根瘤菌体区域富集表达,使用人工微RNA沉默(artificialmicro RNA interference,amiRNAi)下调GmPILS1e和GmPILS1f在根瘤的表达,导致根瘤的固氮酶活性上升,而过量表达GmPILS1f导致根瘤的固氮酶活性下降,因此GmPILS1e和GmPILS1f可能参与大豆固氮酶活性的调节。这些结果为进一步解析大豆GmPILS家族基因的功能和作用机制奠定了基础,同时也为结瘤固氮在农业育种中的应用提供了有价值的基因资源。 | 董衍坤 黄定全 高震 陈栩 | 2022 | 作物学报2022，48，2： | 1 |
| 15 | 利用人工miRNA沉默StIAA22对马铃薯根系构型的影响显示文摘通过检测26个StIAA家族基因在马铃薯根系发育过程中的表达发现:18个StIAA基因在根系成熟后的表达量比发育初期显著上调,8个StIAA基因变化不显著。利用人工microRNA(artificial microRNA,amiRNA)技术对上调表达最为显著的StIAA22做进一步的功能研究:构建干扰表达载体pBI121-amiRIAA,通过根癌农杆菌介导法转入马铃薯栽培品种‘Dèsirèe’。经定量PCR检测,StIAA22在所有转基因株系中的表达均受到明显抑制;其根系形态构型与非转基因植株差异明显,根系生长受到抑制,根长明显变短,侧根数量增加,根系生物量减少。以上结果表明StIAA22在调节马铃薯根系形态建成中起关键作用。 | 杨江伟 段小琴 张飞燕 张丽 邓玉荣 王晓凤 郑智勇 张宁 司怀军 | 2023 | 园艺学报2023，50，10： | 0 |
| 16 | 花生生长素原初响应基因PNIAAs的表达模式分析显示文摘Aux/IAA基因能够在生长素诱导的早期做出响应。本研究通过筛选花生未成熟种子的cDNA文库,分离并获得了4个可能的Aux/IAA基因,分别命名为PNIAA1、PNIAA2、PNIAA3和PNIAA4。RT-PCR对表达模式的研究显示,四个基因在花生各组织中为组成型表达,且具有不同的时空表达模式和特征,PNIAA1、PNIAA2和PNIAA4主要在叶中表达,而PNIAA3在种子中表达量较高,推测其可能在种子发育过程中行使功能;IAA对花生诱导表达模式分析显示,四个基因经IAA诱导后在根部的表达模式均有变化,其中PNIAA1、PNIAA2和PNIAA3能被生长素迅速诱导。 | 任怡怡 戴绍军 刘炜 | 2012 | 中国油料作物学报2012，34，5： | 0 |
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