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| 1 | 大豆ZF-HD转录因子GmZHD1的克隆及表达分析显示文摘为了揭示大豆ZF-HD基因的生物学功能,通过PCR的方法,从大豆栽培豆科丰1号中克隆了ZF-HD转录因子Glyma.02g040100,命名为GmZHD1。生物信息学分析表明,该基因的c DNA全长为888 bp,编码295个氨基酸,GmZHD1蛋白分子量约为32.64 k Da,等电点为7.69;序列分析表明,GmZHD1含有ZF-HD家族保守的锌指结构域和同源异形盒结构域,GmZHD1与Ft HB2蛋白序列一致性最高,为44.4%;亚细胞定位结果显示GmZHD1定位于细胞核;荧光定量PCR结果表明,GmZHD1在大豆不同组织中都有表达,其中,花、种子和叶片中表达较高。此外,将GmZHD1基因连接到植物过表达载体p BA002上,为进一步研究大豆GmZHD1基因的功能奠定了基础。 | 张晋玉 晁毛妮 杜弘杨 喻德跃 黄方 | 2017 | 华北农学报2017，32，2： | 7 |
| 2 | 椰子ZF-HD基因家族的鉴定及生物信息学分析显示文摘ZF-HD蛋白是一类只存在于植物体内且含有锌指结构域的转录因子家族,其不仅能够调节植物的生长发育,且在植物响应逆境过程中也起着重要的作用。本研究通过比对已开发的椰子基因组数据,共鉴定出20个椰子ZF-HD蛋白。采用生物信息学的方法,对其基因结构、蛋白理化性质、蛋白质保守结构域、超二级结构、系统进化树及表达谱进行分析。结果显示:椰子ZF-HD蛋白多为碱性蛋白,且主要定位于细胞核、叶绿体及线粒体中。椰子ZF-HD基因家族可分为6个亚族,每个亚家族都具有相似的结构域和超二级结构。motif搜索分析显示,CoMIF亚族只含有锌指结构域保守序列,其他亚族均含有锌指结构域序列与同源异形盒结构域序列。表达谱分析显示,CoZHD18、CoZHD20在测序的各组织中表达较少,其他家族成员在各组织中的表达量具有差异性。 | 孙熹微 范海阔 弓淑芳 刘蕊 纠凤凤 肖勇 | 2020 | 热带作物学报2020，41，2： | 4 |
| 3 | 陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析显示文摘ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用。利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况。TM-1中共有35个Gh ZHD蛋白成员,且大部分成员定位到细胞核内;分布在20条染色体和2条Scaffold上,且具有11对直系同源基因;进化树分析表明,TM-1基因组中的ZF-HD蛋白大致分为6个小组,每个小组成员间具有类似的基序类型和排列顺序;大部分Gh ZHD基因在胚珠和纤维组织中表达,还有部分基因在根、茎、花、蕾和分生区中表达,在叶和愈伤组织中表达的基因最少。 | 倪万潮 徐珍珍 沈新莲 | 2016 | 棉花学报2016，28，6： | 4 |
| 4 | 烟草bZIP基因家族的生物信息学分析显示文摘碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子主要参与植物的生长发育及响应生物和非生物胁迫应答等过程。本研究利用生物信息学手段,通过烟草基因组数据库,鉴定分析烟草bZIP基因家族成员,并对其在在理化分析、系统进化、蛋白二级与三级结构、保守基序以及亚细胞定位等方面进行了系统分析。结果表明,烟草至少存在20个bZIP基因家族。理化性质分析表明,烟草bZIP基因家族的氨基酸数目在135-8111aa之间,等电点范围为4.84-9.76,大部分bZIP蛋白为酸性蛋白质。通过亚细胞定位发现其主要存在于细胞核内,少部分存在于细胞质中。通过二级、三级结构分析,发现bZIP蛋白主要通过α-螺旋、延伸链、β-折叠和无规则卷曲四种主要结构单元维持自身结构。,对bZIP蛋白进行系统进化分析可将其分为7个亚族。它们的序列具有高度保守性,共包括10个保守基序。研究结果为烟草bZIP基因家族的逆境胁迫应答反应调控机制研究奠定了基础。 | 项孙寰 | 2020 | 农村科学实验2020，，5： | 1 |
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