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| 1 | 基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构显示文摘【目的】选择有代表性的材料进行遗传多样性与群体结构的解析是进行等位基因发掘、复杂性状关联分析、研究,及作物育种实践的重要基础。【方法】利用覆盖玉米全基因组的40个核心SSR标记,采用基于测序的基因型鉴定技术对820份代表中国玉米育种资源种质基础的自交系进行全基因组扫描,通过PowerMarker V3.25与Structure V2.3.3等软件揭示其基因多样性与群体结构。【结果】在820份自交系中,40个SSR标记所检测到的等位变异为10—72个,平均36.87个/位点;基因多样性为0.46—0.9458,平均0.8430;PIC为0.43—0.94,平均0.83。聚类分析表明,K=5时,△K值最大,即这些自交系可以划分成5个类群,依次为兰卡斯特、旅大红骨、塘四平头、瑞德与P群,各类群内平均等位变异与遗传多样性分别为24.23个/位点与0.8145、22个/位点与0.8398、11.8个/位点与0.7054、17.45个/位点与0.7686以及14.65个/位点与0.7495。【结论】中国玉米自交系在育种实践中形成了相对独立的优势类群,蕴含了比较丰富的遗传变异,显示出了较高水平的基因多样性。不同类群之间的遗传多样性水平存在一定的差异,在划分的5个类群中,兰卡斯特与旅大红骨类群的遗传变异相对较丰富,基因多样性相对较高,其次为瑞德与P群,塘四平头相对较低。 | 刘志斋 吴迅 刘海利 李永祥 李清超 王凤格 石云素 宋燕春 宋伟彬 赵久然 赖锦盛 黎裕 王天宇 | 2012 | 中国农业科学2012，45，11： | 86 |
| 2 | 建立小麦品种DNA指纹的方法研究显示文摘建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多样性。从而,在提出采用SSR标记与AFLP-SCAR标记构建小麦品种DNA指纹的技术路线的基础上,建立了构建DNA指纹的方法模式。按此方法获得的品种指纹代码可以经条形码软件转换为条形码,使为每个品种建立身份证的设想成为可能。 | 王立新 李云伏 常利芳 黄岚 李宏博 葛玲玲 刘丽华 姚骥 赵昌平 | 2007 | 作物学报2007，33，10： | 66 |
| 3 | 利用SSR分子指纹和商品信息构建水稻品种身份证显示文摘为方便水稻种子质量的追溯和管理,提出基于SSR分子指纹和商品信息构建水稻品种身份证的新思路。在前期研究基础上,进一步确定了由12个水稻SSR标记构成的核心标记组(每条染色体1个),对127份安徽省审定(或主推)水稻品种进行荧光标记分析,构建供试水稻品种分子指纹,在此基础上,再与品种基本商品信息相结合,并进行数字化编码,构建了127份水稻的品种身份证。该身份证号码组成的第1部分为商品码,代表品种的基本商品信息,包括品种类别、品种选育(或审定)的区域和时间等;第2部分为指纹码,代表水稻品种的分子指纹信息;第3部分为补充码(或特异基因识别码),代表品种的特异基因信息。还对127份水稻品种身份证进行了条码表述(一维码和二维码),以便水稻品种种子的身份标识和溯源管理。 | 陆徐忠 倪金龙 李莉 汪秀峰 马卉 张小娟 杨剑波 | 2014 | 作物学报2014，40，5： | 68 |
| 4 | 比较三种DNA指纹分析方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用显示文摘本项研究归纳出三种DNA指纹分析方法 ,即特征谱带法、引物组合法和核心引物组合法 ,并比较了这三种方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用价值。在玉米基因组上均匀选取 6 2对SSR引物对 6 0个玉米自交系进行分析。 6 2对SSR引物共检测到 2 38个等位基因变异 ,平均每个位点的等位基因数4 0 8个 ,平均多态性信息量 (PIC) 0 6 12 ,平均标记索引系数 (MI) 2 5 8,评估引物多态性的三个指标并不完全一致。三种方法的比较研究表明 ,特征谱带法仅在固定的材料范围内有效 ,当扩大范围后 ,原来具有特征带的样品往往不再具有特征带 ,且需要筛选大量的引物 ,效率很低 ;引物组合法通过不同引物的有限组合 ,完全可以区分全部材料 ,避免了筛选大量引物的工作 ;核心引物组合法是引物组合法的扩展 ,不同实验室通过使用固定的一套核心引物组合 ,其指纹图谱可以相互比较和整合 ,为玉米DNA指纹图谱分析的标准化奠定基础。 | 王凤格 赵久然 郭景伦 佘花娣 陈刚 | 2003 | 分子植物育种2003，1，5： | 62 |
| 5 | 利用DNA指纹图谱辅助植物新品种保护的可能性显示文摘随着分子生物学技术的发展,植物品种分子指纹图谱的建设逐渐成为当前的重要应用领域。综述了DNA指纹数据库建设及辅助植物新品种保护DUS测试进展,综合分析了DNA指纹图谱和分子标记应用于植物新品种保护的优越性和存在的问题,以便更好地服务于新品种DUS测试工作。 | 滕海涛 吕波 赵久然 徐岩 王凤格 堵苑苑 杨坤 唐浩 李祥羽 | 2009 | 生物技术通报2009，25，1： | 57 |
| 6 | 云南甘蔗自育品种DNA指纹身份证构建显示文摘以云南27份甘蔗自育品种为材料,从国际微卫星协会提供的120对SSR引物中筛选出8对多态性丰富、品种聚类区分率高、易统计的引物组成核心引物。8对SSR引物共产生129条带,123个为多态带,多态条带比例为95.35%,多态信息量平均为0.9445,品种相似性系数在0.269~0.767之间,其中引物SMC1047HA,MSSCIR21不仅多态性丰富,而且单个引物就可区分所有品种,是最有效的核心引物。8对核心引物两两组合的效率分析表明,MSSCIR36/MSSCIR2、MSSCIR16/MSSCIR36和MSSCIR36/SMC336BS是高效引物组合,可以完全有效区分所有品种,且品种相似性系数较低;同时使用蔗区种植面积较大的10个主栽品种验证3个高效引物组合,结果表明,MSSCIR16/MSSCIR36是最佳引物组合,不仅能有效区分所有云南甘蔗自育品种,而且能将云南甘蔗自育品种与10个主栽品种最有效地区分开。使用品种的国圃号、国家地区代码、育种单位英文缩写、核心引物名称和分子数据组成云南甘蔗自育品种的DNA指纹身份证,不仅包含了品种的重要信息,而且其中的分子数据可用于品种的真伪鉴定和遗传关系分析,为品种的知识产权保护提供有效的科学依据。 | 刘新龙 马丽 陈学宽 应雄美 蔡青 刘家勇 吴才文 | 2010 | 作物学报2010，36，2： | 57 |
| 7 | 中国玉米新品种标准DNA指纹库构建研究的几点思考显示文摘概述了中国玉米新品种DNA指纹库构建研究中的五个主要问题,即选用哪些品种材料、选用什么标记方法、SSR标记存在哪些问题、选用哪些SSR引物及如何提高建库效率等,并提出了相应的解决方案,对其应用前景及主要应用领域进行了探讨。 | 王凤格 赵久然 郭景伦 孙世贤 | 2005 | 植物学通报2005，22，1： | 46 |
| 8 | SRAP和SSR标记构建的甘蓝型油菜品种指纹图谱比较显示文摘利用SRAP(sequence-related amp lified polymorph ism)和SSR标记构建了甘蓝型油菜品种指纹图谱,并对两种标记方法进行了比较。结果表明:(1)每对SRAP引物扩增出20.36个条带,其中4.44个是清晰、易于辩认的多态性带;每对SSR引物扩增出3.88个条带,均为多态性条带。(2)采用25对SRAP和SSR引物分别构建40个和75个品种的特异指纹图谱,SRAP指纹中具有特异图谱的比例(82.5%和50.7%)高于SSR指纹图谱的结果(60.0%和44.4%)。品种数越多具有特异指纹的品种越少。(3)运用引物组合法构建品种指纹图谱,大大地提高了指纹图谱的特异性。25对SSR引物组合扩增97个多态性谱带,两个不同的品种具有相同谱带的概率只有6.3108×10-30。组合指纹图谱比组合数码图谱更直观。与SRAP标记相比,SSR标记以其扩增谱带少、易于识别和统计而更适合用于引物组合法构建品种指纹图谱。 | 文雁成 王汉中 沈金雄 刘贵华 | 2006 | 中国油料作物学报2006，28，3： | 46 |
| 9 | 植物新品种保护与DUS测试的发展现状显示文摘介绍了UPOV、世界各国植物新品种保护制度及审查方式的建立与发展现状;概述了DUS测试指南研制及测试技术研究现状,并重点阐述了分子标记技术在其中的应用;论述了我国植物新品种保护体系的建立与发展,并分析了我国植物新品种的申请授权情况;最后对我国植物新品种保护和DUS测试的发展提出了4点建议。即加快立法进程,为加入UPOV1991年文本奠定法律基础;提高审查与测试方式的灵活性;加快DUS测试指南的研制和已知品种数据库的构建;积极开展国际合作与交流。 | 张肖娟 孙振元 | 2011 | 林业科学研究2011，24，2： | 43 |
| 10 | 玉米DUS测试标准品种的SSR分子指纹图谱的构建显示文摘研究了39个玉米DUS测试标准品种的SSR分子指纹图谱的构建方法。结果显示:①用改良CTAB法得到的玉米DNA的A260/A280为1.82,A260/A230为2.02,其条带清晰,降解少,质量明显优于SDS法;②从所用的国内外63对核心引物中筛选出PIC值高、条带清晰、稳定性好的20对玉米SSR核心引物;③用8%聚丙烯酰胺电泳在20对引物扩增产物中检测出了171个位点,PIC值为0.855 4,远远高于3%琼脂糖电泳,更适合DUS测试;④建立了DUS标准品种SSR分子指纹图谱,为DNA检测方法在玉米新品种DUS测试中的运用奠定了基础。 | 张金渝 张建华 杨晓洪 金航 米艳华 肖植文 孔令明 肖卿 | 2006 | 玉米科学2006，14，4： | 35 |
| 11 | 适合棉花品种鉴定的SSR核心引物的筛选显示文摘本研究利用来自Cotton Marker Database(CMD)数据库中的2000个引物对32份审定棉花品种基因组DNA进行了PCR扩增,筛选出26个多态性核心引物,其中11个引物被推荐为棉花品种鉴定的首选核心引物,同时提出了核心引物理论上可区分的最大品种数的计算公式:N=G1×…×Gn,理论推测结果表明:利用11个首选核心引物进行棉花品种鉴定是可行的。建立在SSR指纹数据基础上的不同组合品种(系)间聚类分析以及对25份区试品系和A品种的真实性鉴定,结果表明:所有参试品种(系)遗传基础狭窄,32份审定品种间DNA水平上的差异与品种来源的系谱分析结果基本吻合,首选核心引物不仅可以对品种(系)的真实性做出鉴定,而且对遗传距离狭窄的品种(系)具有很好的鉴别力。 | 刘峰 冯雪梅 钟文 刘玉栋 阴祖军 韩秀兰 徐子初 沈法富 | 2009 | 分子植物育种2009，7，6： | 38 |
| 12 | 用SSR标记划分云南糯玉米地方品种资源遗传类群的研究显示文摘利用SSR标记对37个云南糯玉米地方品种遗传多样性和遗传关系进行研究,和5个国内主要自交系进行优势群的划分。结果表明:从国内外所用的63对核心引物中筛选出PIC值高、稳定的20对玉米核心SSR引物扩增出225个等位基因,平均多态信息量PIC值为0.87、标记索引系数MI值9.91、Shannon多样性指数I为0.54;37个云南糯玉米地方品种可划分为5大类群13个小类群;少数的云南糯玉米种质资源与常见的5大杂种优势群的遗传距离较近,而大多数资源则较远,可形成多个单独的类群,云南糯玉米地方种质资源具有广泛的遗传基础;来自不同地区或来自同一地区不同云南糯玉米资源与5大优势群之间的遗传相似度均有很大差异。 | 张金渝 张建华 杨晓洪 金航 王波 肖植文 孔令明 米艳华 华秋瑾 | 2007 | 玉米科学2007，15，1： | 33 |
| 13 | 基于SSR标记的福建省若干水稻品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析显示文摘以24份杂交稻品种和18份杂交稻亲本为材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。24对引物在研究材料中共检测到74个多态性片段,平均每对引物的多态性片段为3.1个。基于24个SSR标记的扩增结果,利用NTSYS2.10e软件计算Dice遗传相似系数,并建立UPGMA聚类图,结果表明:42份材料之间的相似系数变化范围为0.60~1.00,在遗传相似系数0.68处可以将42份材料分为6个类群,较好地反映了供试材料的亲缘关系,可为水稻育种中亲本选择提供参考。同时建立了42份材料×12个SSR标记的指纹图谱,为杂交水稻品种纯度和真伪鉴定提供科学数据。 | 马红勃 许旭明 韦新宇 杨旺兴 邹文广 | 2010 | 福建农业学报2010，25，1： | 32 |
| 14 | 甘蓝型油菜SSR核心引物研究显示文摘为了确定一组适用于品种纯度鉴定和遗传多样性分析的SSR核心引物,以100份具有代表性的甘蓝型油菜品种(系)为研究材料对746对SSR引物进行筛选,综合考虑PIC(平均多态信息量)值大小、引物重复性、扩增带型清晰度、连锁群分布等因素,确定44对引物为甘蓝型油菜核心引物,其中20对引物为首选核心引物,24对引物为备选核心引物。20对首选核心引物每对可检测到3~9个多态性位点,PIC值介于0.56~0.80,共检测到102个位点,分布于11个连锁群上。随机抽取1对核心引物对一个杂交组合大田制种F1纯度进行鉴定,其鉴定结果与田间自然鉴定结果一致,并可同时鉴别出来源于父本及外来的混杂单株。将44对核心引物应用于品种的系谱分析和100份品种遗传多样性聚类分析,同样得到了很好的验证结果。该套SSR核心引物适用于甘蓝型油菜品种鉴定及遗传多样性研究。 | 李海渤 杨军 吕泽文 易斌 文静 傅廷栋 涂金星 马朝芝 沈金雄 | 2010 | 中国油料作物学报2010，32，3： | 31 |
| 15 | 130份甘蓝型油菜种质分子身份证的构建显示文摘为准确区别油菜种质,从分布于油菜19个连锁群上的463对SSR引物中,筛选出33对扩增清晰、稳定的多态性引物,并用其分析国内外130份甘蓝型油菜材料,共检测到191个等位变异,每对引物的等位变异数变幅为3~9个,平均为5.787 9;有效等位变异数(Ne)变幅为1.906 8~7.479 0,平均为4.730 7;多样性指数(He)变幅为0.773 8~2.045 1,平均为1.551 5;引物个体识别能力(DP值)变幅为0.389 2~0.862 9,平均为0.742 8;多态信息含量(PIC值)变幅为0.475 6~0.866 3,平均为0.764 0。主坐标分析表明:33对核心引物可以将供试材料明确区分,并按照遗传相似性归为3类。通过逐级筛选,最终确定7对引物(BrGMS075、Na14E08、BrAS084、CB10545、Na14G10、CN57和Ra2E04),将每对引物的扩增产物进行数字标识,构建了130份甘蓝型油菜的品种分子身份证,达到用最少的引物组合区分不同品种的目的。 | 马琳 刘海珍 陆徐忠 倪金龙 张小娟 杨剑波 | 2013 | 中国油料作物学报2013，35，3： | 33 |
| 16 | SSR标记鉴定浙江省主要无性系茶树品种的研究显示文摘为促进浙江省茶树育种的发展,利用SSR引物对浙江省茶树育成品种的遗传多样性进行了研究,筛选出可用于鉴别浙江省茶树品种的核心鉴定引物和标准品种,并进一步应用于未知茶苗身份鉴定。首先,利用35对SSR引物研究了36个茶树育成品种,并进行聚类分析;然后,根据电泳谱带和基因型筛选出核心鉴定引物和标准品种;最后,对4株未知茶苗进行了身份鉴定。结果表明:共有34对引物表现出多态性,各品种基本按遗传背景聚类,重复样本间遗传距离介于0-0.094;有10对引物确定为核心鉴定引物,8个品种为标准品种;4株未知身份茶苗中,NH-01属于乌牛早品种,另外3株并非浙江现有品种。本研究认为,核心鉴定引物在两个浙江育成品种间差异引物对≥2时,应判定为不同品种;差异引物对≤1时,应判定为相同品种或极相似品种,必要时应引入其余24对引物计算遗传距离进一步验证,遗传距离〉0.140判定为不同品种,遗传距离≤0.140判定为同一品种。 | 张成才 刘园 姜燕华 吴立赟 王丽鸳 韦康 成浩 | 2014 | 植物遗传资源学报2014，15，5： | 30 |
| 17 | 新陆早棉花品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析显示文摘以新疆2013年前审定的51个新陆早常规棉花品种为材料,从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且定位在棉花26条染色体上(每条染色体上选择2-3对)的75对核心引物,检测到多态性位点226个,每个标记检测到的基因型位点数在2-12之间,平均为3.01个;引物多态信息量(PIC)值介于0.0799-0.8752之间,平均值为0.6624。结果显示,在51份新陆早棉花常规品种中,可利用特征引物将21份品种一次性区分开。利用40对引物可以完全区分开新陆早51份常规品种,并构建供试品种的指纹图谱。同时利用NTSYS-pc V2.10软件聚类分析表明,51个新陆早棉花品种遗传相似系数变化范围为0.4269-0.9873,平均值为0.7071,说明新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭窄;遗传相似系数矩阵和聚类分析将51个新陆早品种分为4大类型,与原品种选育系谱高度吻合。 | 聂新辉 尤春源 李晓方 秦江鸿 黄聪 郭欢乐 王夏青 赵文霞 林忠旭 | 2014 | 作物学报2014，40，12： | 28 |
| 18 | SSR鉴定SC704玉米亲本及杂交种纯度的研究显示文摘从30对SSR随机引物中筛选确定了能够清楚、稳定、准确的鉴别SC704亲本和杂交种的2对引物。用引物之一phi053对人为混杂有SC704亲本的杂交种进行纯度鉴定,结果准确无误。探讨并建立了一套应用分子标记SSR技术鉴定SC704玉米亲本及杂交种纯度的方法。与田间种植鉴定相比较,SSR技术用于检验玉米品种的纯度是可靠可行的。 | 刘龙洲 赵久燃 曲延英 王风格 | 2003 | 西北农业学报2003，12，4： | 24 |
| 19 | 基于EST-SSR标记的云南无性系茶树良种遗传多样性分析及指纹图谱构建显示文摘分析茶树品种遗传多样性和构建茶树品种分子指纹图谱对茶树育种、品种鉴别、品种权益保护、苗木纯度检测等具有重要意义。利用SSR标记对28份无性系茶树品种遗传多样性和指纹图谱进行了研究。22对引物共检测到等位位点56个,平均每对引物产生2.55个;共检测到97个基因型,平均每对引物所扩增的基因型有4.41个,遗传多态性信息含量为0.279-0.709,平均0.527,表明SSR标记具有较高的多态性。品种间的遗传相似系数为0.642-0.973之间,平均为0.797,表明品种间的遗传差异较小,遗传多样性较低,遗传基础较窄。根据SSR标记特点,将SSR引物扩增统计的“0”、“1”转换成基因型,通过不同基因型组合,构建了云南无性系茶树品种的分子指纹图谱,使每个品种都获得了1个22位数的指纹图谱号码,进而可将不同品种完全区分鉴别。 | 刘本英 孙雪梅 李友勇 黄安平 汪云刚 成浩 宋维希 陈林波 段志芬 马玲 | 2012 | 茶叶科学2012，32，3： | 22 |
| 20 | SSR荧光标记毛细管电泳法与国家冬油菜区试指纹鉴定平台的构建显示文摘为了油菜品种指纹检测的精确性及未来构建大规模油菜新品种指纹数据库,应用SSR荧光标记毛细管电泳检测法构建国家冬油菜区试指纹鉴定平台。以40对荧光引物对2012-2013年度163份国家冬油菜区试参试品种(系)进行分析。结果共检测到42个等位位点和131个等位变异。其中A基因组(n1~n10)检测位点25个,C基因组(n11~n19)检测位点17个。每个位点等位变异数从2到6不等,平均为3.02。42个检测位点的PIC值变化范围在0.10~0.69之间,平均值为0.36。其中引物BRGMS171的杂合度、PIC值分别高达0.67、0.70,可考虑作为以后区试杂交种纯度鉴定的核心标记。SSR位点的纯合度分析得出本年度18份常规种平均纯合度为81.9%,145份杂交种为57.9%。以131个等位变异计算品种(系)间DICE相似系数,163份品种(系)间平均遗传相似系数变幅为0.607~0.765,变幅最大的为品种(系)FC03(0.438~0.879),变幅最小为品种(系)宜油21(0.611~0.806)。 | 许鲲 李锋 吴金锋 谷铁城 陈碧云 高桂珍 闫贵欣 李俊 乔江伟 汪念 伍晓明 | 2014 | 中国油料作物学报2014，36，2： | 21 |
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