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| 1 | 基于SSR标记贵州古茶树资源的遗传多样性分析及指纹图谱构建显示文摘为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据,采用EST-SSR标记对40份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明:20个SSR标记在40份资源中共检测到76个等位基因,平均每个标记3.8个,PIC和Shannon信息指数平均值分别为0.462和0.936,多态性适中。76个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大,变异范围为1.32%-89.74%。参试材料的Nei's遗传距离(D)为0.075-0.875,当D≈0.160时,40份古茶树资源可聚为6类,包括3个单独聚类和3个复合聚类。利用4个核心标记即可鉴定40份古茶树资源,并根据等位基因带型,获得18位数的分子指纹图谱号码,构建每份资源的分子指纹图谱。 | 郭燕 刘声传 曹雨 赵华富 魏杰 鄢东海 周富裕 | 2016 | 西南农业学报2016，29，3： | 35 |
| 2 | 基于SSR标记的黔南茶树种质资源DNA指纹图谱构建显示文摘以黔南60个野生茶树种质资源为材料,使用15对引物,通过SSR技术进行了DNA指纹数据库的构建。结果显示,所采用的15对引物共扩增出147个等位基因,有较好的多态性。位点的期望杂合度和多态性信息含量的变化范围分别为0.128~0.939和0.124~0.927,平均值分别为0.602和0.572。综合各项指标筛选出6对引物QNSSR01、QNSSR02、QNSSR04、QNSSR06、QNSSR18、QNSSR23上的23个等位基因用于黔南茶树种质资源DNA指纹图谱构建,60个茶树种质资源的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各材料特定的图谱。研究结果为黔南茶树种质资源保护和品种创新利用奠定了基础。 | 陈世军 张明泽 姚玉仙 谢维斌 | 2017 | 植物遗传资源学报2017，18，1： | 30 |
| 3 | 茶树PVP申请品种的SSR分子标记鉴定和系谱关系分析显示文摘利用30对SSR引物,对26个植物新品种保护(PVP)申请茶树品种及其13个近似品种与亲本进行了分子鉴定和系谱关系分析,探讨SSR分子标记在茶树新品种保护工作和DUS测试中的应用。研究结果显示,30对SSR引物共检测到131个等位基因,每对引物检测的等位基因数为3~7个,平均4.4个。平均Shannon信息指数(I)和多态信息含量(PIC)分别为1.04和0.51。39个参试品种的遗传距离在0.03~0.70之间。在遗传距离为0.15时,可将39个品种划分为7类,其中地理来源一致或遗传背景相似的材料基本上聚为一类。30对引物的品种鉴定能力差异较大,每对引物能鉴定的品种数为3~16个。通过4对核心引物的组合可以鉴定全部39个参试品种,并依此构建了SSR指纹图谱。 | 黄丹娟 马建强 陈亮 | 2016 | 茶叶科学2016，36，1： | 17 |
| 4 | 茶树DNA分子指纹图谱研究进展显示文摘分子指纹图谱直接反映生物个体在DNA水平上的差异,可有效鉴别茶树品种,保护品种权。本文概述了指纹图谱的分类、概念和特点,近年来国内外7种分子指纹图谱方法在茶树中的研究进展,以及指纹图谱在茶树种质资源与育种研究中的应用,探讨了我国茶树分子指纹图谱研究中存在的一些问题,并由此提出构建茶树标准指纹图谱的设想。 | 黄丹娟 马建强 陈亮 | 2015 | 茶叶科学2015，35，6： | 15 |
| 5 | 基于EST-SSR标记的云南大叶茶资源遗传多样性分析显示文摘丰富的遗传变异对提高作物的环境适应性和加快遗传改良进度至关重要。为进一步了解云南大叶茶种质资源的遗传多样性,利用28对SSR引物对94份大叶茶种质材料进行遗传多样性分析,结果共检测到等位基因128个,平均每个位点为4.57个;Shannon信息指数(I)在0.91~1.66之间,最小为5087位点0.91,最大为1696位点1.66,平均每个位点为1.30;多态性信息含量(PIC)数值在0.476~0.753之间,最小为5087位点0.476,最大为1696位点0.753,平均值为0.64;平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.71、0.70。通过对94份供试材料来源地遗传分化分析和聚类分析表明,材料的遗传变异主要存在于不同来源地之间而非同一来源地内。并且多数同一来源的材料分散在不同类群中,材料来源地间遗传距离与地理距离不存在显著的相关性。研究认为,聚类结果与多态性信息含量等参数值分析结果一致,表现出丰富的遗传多样性。这可为云南茶树资源的育种和创新利用提供研究基础。 | 尚卫琼 段志芬 杨毅坚 李友勇 成浩 刘杰 杨兴荣 杨盛美 矣兵 刘本英 毕晓清 | 2018 | 山东农业科学2018，50，1： | 15 |
| 6 | 福建15个茶树品种SSR遗传差异分析与指纹图谱建立显示文摘以本课题组选育的10个审(鉴)定品种为材料,选用福建5个具有代表性品种为参照,利用 SSR 分子标记分析其遗传差异并建立分子指纹图谱,结果表明,从105对 SSR 引物中筛选出的6对核心引物具有较高的多态性;15个参试品种遗传相似系数变幅较大(0.35~0.91),其中8个选育品种及闽北闽南的4个参照种,相互间的遗传相似系数一般都达到均值以上(≥0.65),高者达0.80~0.91,证明其遗传差异小或较小;进行聚类分析,在相似系数为0.77处,可将参试材料分为8组,在相似系数为0.66处,可将参试材料分为6组;选用3对核心引物组合 W08、D07、L11建立15个参试品种的分子指纹图谱,特征条带大小210~630bp,可将每个品种逐一鉴别,效果较好。 | 王让剑 杨军 孔祥瑞 郭吉春 | 2014 | 福建农业学报2014，29，10： | 12 |
| 7 | 基于SSR荧光标记的MCID快速鉴定13个湖北茶树品种显示文摘【目的】通过人工绘制品种鉴别图(Manual cultivar identification diagram,MCID)快速区分鉴别湖北茶树品种,为湖北茶树种质资源评价、品种保护及苗木纯度早期鉴定提供技术支持。【方法】以湖北省13个优良茶树品种为材料,利用30对均匀分布于遗传连锁图谱上的SSR荧光引物进行PCR扩增,并用荧光标记毛细管电泳检测扩增产物以筛选出核心引物,利用MCID法构建CID图谱。【结果】30对SSR引物共扩增出145个等位基因,各引物等位基因数为3~9个,平均每对引物为4.83个;共检测到194个基因型,各引物检测出的基因型为3~12个,平均每对引物6.47个;多态性信息量(PIC)为0.29~0.85,平均为0.58。13个茶树品种的Nei’s遗传距离为0.19~0.44。基于Nei’s遗传距离,采用Neighbor-Joining(NJ)法可将13个品种分为三大类(Nei’s遗传距离为0.16),结果表明地理来源相同的品种可能因为具有相似的遗传背景而聚在一起,也可能因为亲本来源不同而存在明显的遗传差异。利用筛选出的3对核心引物(TM547、TM552和TM107)可快速鉴别所有参试品种,通过MCID法构建的CID图谱可直观看出各参试茶树品种鉴定所需要的引物及其对应的基因型。【结论】基于SSR荧光标记的茶树品种MCID鉴定方法具有快速、准确、高效的特点,可用于湖北茶树良种知识产权保护、苗期鉴定及品种区分。 | 黄丹娟 马建强 马春雷 王松琳 陈亮 毛迎新 陈勋 | 2018 | 南方农业学报2018，49，6： | 11 |
| 8 | 云南白莺山地区茶树遗传多样性研究显示文摘云南省云县白莺山地区是大理茶(Camellia taliensis)、阿萨姆茶(C.sinensis var.assamica)及中间过渡形态茶树广泛分布的区域。本研究利用30个SSR核心标记分析了130份白莺山地区茶树种质资源的遗传多样性,共检测到202个等位基因,平均每个位点的等位基因数(A)为6.73,期望杂合度(HE)为0.6135,近交系数(Fis)为-0.1745,多态信息含量(PIC)为0.5652,基因多样性(H)为0.6112。通过模拟不同样本数量,计算遗传多样性参数与样本量变化的回归曲线,发现样本量在40个时,能较好地反映白莺山茶树资源的遗传多样性。研究白莺山地区茶树的遗传多样性及取样策略,对茶树种质资源的保护与利用具有积极意义。 | 毛娟 江鸿键 李崇兴 马建强 陈亮 | 2018 | 茶叶科学2018，38，1： | 10 |
| 9 | 基于茶树EST-SNP的CAPS标记开发显示文摘为了促进SNP技术在茶树遗传育种中的应用,本文探讨了将茶树SNPs转化成CAPS标记进行检测的可行性。首先,对从茶树ESTs中挖掘的候选SNPs进行重测序验证;然后,对确证的SNPs进行限制性内切酶识别位点分析,筛选出引起酶切识别位点改变的SNPs;使用相应的引物从茶树基因组中扩增这些SNPs所在的片段,然后对扩增产物进行酶切和电泳检测,将SNPs转化为CAPS标记;最后,随机选择了14个CAPS标记,在25个茶树品种中进行多态性分析,以验证标记的可用性。结果,经重测序验证,在8个茶树品种中共检测到162个SNPs;将39个SNPs成功转化为CAPS标记;在14个随机选择的CAPS标记中有13个在25个品种中表现出多态性,多态性信息含量(PIC)介于0.043和0.497之间,平均0.311;另外1个标记在25个品种中均为杂合。结果表明,本文构建的将茶树SNPs转化为CAPS标记的方法,可以方便地用于茶树SNPs的检测;该方法能够促进SNP技术在茶树遗传育种研究中的应用;同时,本文报道的39个CAPS标记可以用于茶树遗传多态性检测和茶树遗传图谱构建等方面的研究。 | 张成才 王丽鸳 韦康 成浩 | 2013 | 分子植物育种2013，11，6： | 10 |
| 10 | 基于EST-SSR标记的云南大茶树遗传多样性分析显示文摘应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究。结果表明:43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88%。多态性信息量PIC值为0.05~0.74,平均为0.469。基因多样性指数平均值为0.53,Shannon指数平均值为0.81,均高于0.5。遗传相似系数0.41~0.91,平均值为0.65,显示云南大茶树的遗传基础相对比较宽,具有较高的遗传多样性水平。SSR聚类分析表明,大茶树的遗传距离和亲缘关系与地理分布有一定的关系,在分子水平上显示了部分云南大茶树的亲缘关系,有助于今后野生大茶树的保护及利用研究。 | 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英 | 2013 | 华北农学报2013，28，S1： | 9 |
| 11 | 43个福建省茶树品种指纹图谱构建及遗传多样性分析显示文摘为了解福建省茶树品种的遗传多样性,从38对SSR引物中筛选出扩增条带清晰,多态性较好的引物23对,对43个茶树品种的遗传多样性进行了分析,并选取扩增条带少、多态性较高的7对SSR引物构建茶树品种指纹图谱。聚类结果表明,43个茶树品种可聚成10个类群,遗传距离最远的品种是‘八仙茶’,距离最近的品种是‘福鼎大毫茶’与‘九龙大白茶’;福建省选育的乌龙茶品种比绿茶品种的遗传多样性丰富;同时来源于共同亲本的品种表现出较高的相似系数,聚为一类;来源地相同的品种也因有较高的相似系数而聚为一类;地理距离越远的品种,遗传距离也越大。这为茶叶生产选种和茶树遗传改良提供参考依据。 | 陈志辉 单睿阳 游小妹 林郑和 钟秋生 陈常颂 | 2017 | 热带亚热带植物学报2017，25，6： | 9 |
| 12 | 基于EST-SSR标记的西双版纳苦茶资源遗传多样性分析显示文摘丰富的遗传变异对提高作物的环境适应性和遗传改良进度至关重要。为了进一步了解西双版纳境内苦茶种质资源的遗传多样性,通过应用28对SSR引物对西双版纳傣族自治州境内的50份苦茶资源材料进行遗传多样性分析。结果表明,共检测到127个等位基因,平均每个位点为4.53;Shannon信息指数在0.92~1.70,最小为SSR01位点(0.92),最大为SSR09位点(1.70),平均每个位点为1.25;多态性信息含量在0.444~0.777,最小为SSR01位点(0.444),最大为SSR09位点(0.777),每个位点平均值为0.614。聚类分析结果显示,50份供试材料分成4个大类和多个亚群,其中有2个大类只有2份资源材料,其余46份材料分布在另2个大类多个亚群中。聚类结果与多态性信息含量和Shannon信息指数分析结果一致,表现出丰富的遗传多样性。研究结果可为西双版纳苦茶资源的育种和创新利用提供研究基础。 | 尚卫琼 李友勇 刘悦 段志芬 杨盛美 李慧 许燕 刘本英 | 2020 | 山西农业科学2020，48，2： | 9 |
| 13 | 豫南茶区茶品质相关性状与EST-SSR标记的关联分析显示文摘种质资源研究是育种工作的基础,关联分析为植物数量性状的研究提供了有力手段。本研究利用67对EST-SSR标记,对115份茶树(Camellia sinensis)资源进行茶品质相关性状与EST-SSR标记的关联分析。基因间的连锁不平衡是关联分析的基础,67对EST-SSR组成的共2 211对成对位点组合中,均存在一定程度的连锁不平衡,由群体结构分析发现,当群体数目K=4时,模型后验概率Ln P(D)最大,该群体被分为4个亚群。将各个材料的Q值作为协变量,分别进行4种目标性状的变异与EST-SSR标记变异的回归分析。由结果得知,与水浸出物、茶多酚、氨基酸和咖啡碱关联的标记共19个,其中与水浸出物关联的标记有5个,TM066对其解释率最高,为13.32%;与茶多酚关联的标记有5个,TM092对其解释率最高,为13.68%;与氨基酸关联的标记有6个,TM083对其解释率最高,为7.6%;与咖啡碱关联的标记有3个,TM111对其解释率最高,为7.8%。其中TM066、TM092和TM074-2与水浸出物和茶多酚同时关联;TM086-1与茶多酚和氨基酸同时关联;TM088、TM111和TM124与氨基酸和咖啡碱同时关联。这些研究结果可进一步用于相关性状位点的深入研究,为茶树的早期鉴定和茶叶品质的改良等提供一定的理论参考。 | 苏会 刘建军 贺巍 温贝贝 李美凤 冯建灿 | 2016 | 农业生物技术学报2016，24，9： | 8 |
| 14 | 应用ISSR指纹图谱鉴定铁观音茶树显示文摘为鉴别纯种铁观音和发生表型性状变化的铁观音茶树,本研究应用筛选出的11条ISSR引物对13份茶树样本进行分子标记分析。结果显示,11条引物共产生91个扩增位点,其中45个为多态性位点,多态性比率为49.45%。13份供试样本的遗传相似性系数分布在0.687~0.986之间,平均值0.805,聚类分析显示发生性状变化的铁观音茶树基本聚为一类,区别于纯种铁观音类群。依据扩增位点的特异性从中筛选出5条核心引物,对其扩增谱带编码后进行连锁组合构建了安溪铁观音茶树分子指纹图谱,依据图谱差异可鉴定性状不同的铁观音茶树。 | 陈志丹 孙威江 项丽慧 林志坤 | 2015 | 分子植物育种2015，13，12： | 7 |
| 15 | 云南茶树种质资源研究60年显示文摘茶树[Camellia sinensis(L.)O.Kuntze]种质资源是保障茶产业高质量发展的战略性资源,是茶科技原始创新、品种选育和特色新产品研发的物质基础。茶树种质资源研究对推动茶树种业创新和茶产业绿色健康发展具有十分重要的价值和意义。云南地处中国西南部,悠久的种茶历史与低纬高原独特的气候和地理条件孕育了丰富的茶树种质资源,分布有众多的野生型、栽培型古茶树资源,是世界茶树起源中心和中国茶组植物种类最多、数量最大、分布最广的省份。经过60年的研究,在广大科技工作者的辛勤耕耘和有关部门的大力支持下,云南茶树种质资源在考察收集、保存编目、鉴定评价与创新利用等方面取得了丰硕成果,获得了一系列重大进展。本文系统阐述了60年来云南茶树种质资源研究取得的主要进展以及存在的问题,并对云南茶树种质资源未来的发展方向进行了探讨和展望,以期为茶树种质资源学科研究提供参考。 | 宁功伟 杨盛美 宋维希 李友勇 唐一春 赵红艳 刘本英 | 2023 | 植物遗传资源学报2023，24，3： | 3 |
| 16 | 茶树新品种“湘波绿2号”父本的SSR标记鉴定显示文摘为在分子水平上鉴定“湘波绿2号”的父本,本研究采用SSR标记对其母本和5个可能父本进行了分析。结果表明,筛选的29对引物共检测到83个等位位点,每个引物1~4个,平均2.86个。湘波绿2号与福鼎大白茶及5个可能父本的相同位点数分别占其扩增总位点数的71.93%、64.91%、94.74%、66.67%、52.63%和70.18%,最多的为湘波绿,最少的为云大72-04。7份供试材料间相似系数变幅为0.45~0.80,平均0.55,其中湘波绿2号与湘波绿的相似系数最大(0.80)。根据相似系数UPGMA聚类,在相似系数0.55处将参试7份材料分为5类。参试材料的相似系数和亲缘关系树状图在分子水平上显示了湘波绿与湘波绿2号的亲缘关系最近,可能为湘波绿2号的父本。 | 刘振 赵洋 杨培迪 成杨 杨阳 | 2014 | 茶叶通讯2014，41，1： | 3 |
| 17 | SSR分子标记及其在茶树DNA指纹图谱上的应用显示文摘本文综述了SSR分子标记、DNA指纹图谱原理及SSR分子标记在茶树指纹图谱上的应用,提出SSR分子标记在茶树指纹图谱构建过程中存在的问题并给出建议,旨在为豫南茶树种质资源DNA指纹图谱构建提供一定的借鉴和指导。 | 蔡一鸣 吕未 吴淑平 赵丰华 吕立哲 | 2019 | 天津农业科学2019，25，3： | 3 |
| 18 | 皱皮木瓜品种的遗传多样性和SSR指纹图谱分析显示文摘为研究山东省皱皮木瓜品种间的亲缘关系远近,本研究利用PCR结合毛细管电泳法对60份皱皮木瓜种质资源进行遗传多样性分析及指纹图谱构建。所选用的10对多态性高、带型稳定的引物共扩增出55个多态性位点;观测杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.392和0.590;Shannon信息指数和Nei’s遗传多样性指数的平均值分别为1.184和0.585;PIC值在0.238~0.819之间,平均值为0.547;聚类分析结果显示,遗传相似系数变幅为0.55~0.96,说明60份皱皮木瓜品种具有较为丰富的遗传多样性。在遗传相似性系数0.662处可将所有供试材料分为3大类。对60个皱皮木瓜品种进行指纹分析,发现具有特征谱带的品种共19个;采用6对引物组合(Nak2,Nak3,Nak5,Nak6,Nak7和Nak10)的方式构建了能够有效区分60个皱皮木瓜品种的指纹图谱。引物Nak5具有较强的鉴别力,在进行图谱构建及分子鉴定中可优先采用。本研究可为皱皮木瓜的遗传资源管理、良种鉴定提供理论基础,同时为品种选育提供参考依据。 | 李慧 徐瑞瑞 刘东超 李圣波 刘忠华 | 2021 | 分子植物育种2021，19，22： | 2 |
| 19 | 7个福建茶树品种的遗传多样性分析及其分子指纹图谱构建显示文摘基于SSR分子标记技术,对来自福建省的7个供试茶树品种的遗传多样性水平进行分析,并构建其分子指纹图谱.结果表明:初步筛选的14个SSR分子标记均为多态性标记,其多态性信息含量较丰富,可以较好地区分7个供试茶树品种;福云六号与福云七号供试茶树品种之间的遗传相似性系数最高,为8.06,亲缘关系最近;以扩增条带较少、多态性较高的3个SSR分子标记引物(PS3,PS15,PS19)相组合而构建的分子指纹图谱,可有效鉴别7个供试茶树品种,实现以最少的分子标记引物鉴定所有品种的目的. | 张俊杰 郭晨 彭姗姗 宋玉婷 尚益民 李硕 饶耿慧 傅天龙 | 2020 | 轻工学报2020，35，3： | 2 |
| 20 | 铁观音及黄棪半同胞系种质遗传多样性的ISSR分析显示文摘铁观音和黄棪是乌龙茶茶树育种的骨干亲本,以这2份品种及其为亲本选育出的新种质及不同地域种质的铁观音茶树为研究材料,采用ISSR分子标记技术,利用筛选出的9个多态性较好、扩增条带较清晰的ISSR引物,分别对24份茶树品种(系)进行扩增,分析其遗传多样性和亲缘关系。结果表明:9个ISSR引物共扩增出73条稳定的谱带,其中47条具有多态性,多态性比率为64.4%,平均每个引物扩增出5.2条谱带;遗传相似性分析显示24份供试种质的遗传相似系数0.544~0.889,平均为0.727,表明供试种质的遗传基础较窄,亲缘关系较近。 | 陈志丹 王安莉 孙威江 | 2016 | 福建农业学报2016，31，10： | 1 |
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