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1基于高通量测序的肝癌circRNA-miRNA-mRNA调控网络构建及功能富集分析显示文摘目的本研究基于肝癌相关非编码RNA高通量测序数据,构建互作网络及功能富集分析,筛选可能通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制参与肝癌发生发展的环状RNA(circRNA)。方法 利用GEO数据库中的肝癌非编码RNA高通量测序数据,依据ceRNA理论构建circRNA-miRNA-mRNA网络。随后,进行了基因本体论分析(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,用于具有ceRNA潜在功能的circRNA的探索及功能注释。结果 从GEO数据库中最终筛选了9个共表达circRNAs、20个共表达miRNAs以及153个共表达mRNAs,成功构建肝癌相关circRNA-miRNA-mRNA网络。GO分析结果揭示了90个生物过程,其主要涉及12个功能簇,主要包括肝细胞分化、细胞周期相变调节、转录因子活性负调控等功能,KEGG分析表明这些共表达circRNAs还参与p53、PI3K-Akt信号通路。结论 本研究为circRNA通过ceRNA机制介导肝癌发生发展提供了新的见解。赵静 杨兴武 李京涛 王旗 王亮 王国泰 2019临床肝胆病杂志2019,35,8:6
2非小细胞肺癌患者射频消融治疗后血清miR-28-3p表达量变化及意义显示文摘目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者射频消融(RFA)治疗后血清miR-28-3p表达量变化及意义。方法选取2013年7月至2015年7月治疗的73例NSCLC患者为研究对象。采用RT-qPCR法检测患者治疗前后血清miR-28-3p相对表达量。分析血清miR-28-3p相对表达量与NSCLC患者预后的关系。结果NSCLC患者RFA治疗前血清miR-28-3p相对表达量为(12.62±2.51),经RFA治疗后血清miR-28-3p相对表达量降低[(10.46±2.10),P<0.05]。73例NSCLC患者3年生存率为61.6%(45/73)。NSCLC生存组患者血清miR-28-3p相对表达量明显低于死亡组患者(P<0.05)。血清miR-28-3p评估NSCLC患者生存预后的曲线下面积(AUC)为0.782。血清miR-28-3p≥11.05的NSCLC患者3年平均总生存时间为27.78(95%CI为24.30~31.27)个月,明显低于血清miR-28-3p<11.05的NSCLC患者3年总生存时间33.19(95%CI为30.84~35.55)个月,差异有统计学意义(P<0.05)。COX单因素及多因素回归分析显示年龄、TNM分期、肿瘤直径、淋巴结转移、miR-28-3p与NSCLC患者RFA后生存时间密切相关。结论NSCLC患者RFA后血清miR-28-3p相对表达量明显降低。血清miR-28-3p与RFA治疗后NSCLC患者生存预后密切相关。唐钢琴 赵振华 梁晓超 2019介入放射学杂志2019,28,9:2
3microRNA在肝细胞癌有氧糖酵解中的调控作用显示文摘葡萄糖代谢重组是肝细胞癌(HCC)一个重要标志,癌细胞能迅速地将其能量来源从线粒体氧化磷酸化调整到糖酵解代谢,满足其在低氧环境下的高效增殖。近年来,越来越多的证据表明,microRNA(miRNA)的转录后调控在精细调节代谢重编程发挥关键作用,与HCC的临床病理特征及发生发展密切相关。影响糖酵解的因素有很多,系统的总结了miRNA在HCC中异常表达对有氧糖酵解的直接和间接调控的作用,为HCC的早期诊断、靶向治疗及预后检测提供理论依据。牛亚倩 常钰玲 刘芳 赵川 陈彻 2019临床肝胆病杂志2019,35,9:1
4lncRNA SCAMP1靶向miR-197-3p对肝癌SNU-449细胞增殖和侵袭的影响显示文摘目的:研究lncRNA SCAMP1靶向miR-197-3p对肝癌SNU-449细胞增殖和侵袭的影响。方法:qRT-PCR方法测定肝癌组织及细胞内SCAMP1表达变化。肝癌SNU-449细胞分成Control组、si-NC组(转染siRNA control)、si-SCAMP1组(转染SCAMP1 siRNA)组,CCK-8实验检测细胞增殖能力的变化,克隆形成实验测定各组细胞克隆能力的变化,Transwell小室检测各组细胞迁移和侵袭能力的变化,Western blot检测各组细胞中N-cadherin、E-cadherin蛋白表达水平的变化。在线靶基因软件预测SCAMP1的靶基因可能是miR-197-3p,经双荧光素酶报告系统鉴定两者之间的靶向关系。在肝癌SNU-449细胞中分别把SCAMP1 siRNA、miR-197-3p inhibitor共转染,利用上述方法检测细胞增殖、克隆、侵袭、迁移能力。结果:肝癌组织中SCAMP1表达水平高于癌旁组织,肝癌细胞内SCAMP1表达水平高于正常肝细胞,差异均有统计学意义(P<0.05)。与Control组、si-NC组比较,si-SCAMP1组肝癌SNU-449细胞增殖、克隆、侵袭、迁移能力均降低,细胞中N-cadherin蛋白表达水平降低,E-cadherin蛋白表达水平升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。下调SCAMP1靶向促进miR-197-3p表达,差异有统计学意义(P<0.05)。miR-197-3p inhibitor能够逆转SCAMP1 siRNA对肝癌SNU-449细胞增殖、克隆、迁移和侵袭的抑制作用,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:下调SCAMP1靶向促进miR-197-3p降低肝癌SNU-449细胞增殖、克隆、迁移和侵袭能力。杜全顺 李少华 马成云 贾振飞 王现兵 王嘉毅 2022中国现代普通外科进展2022,25,3:0
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