|
|
|
题名
|
作者
|
年代
|
出处
|
被引量
|
| 1 | Dynamic transcriptomic m^6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism显示文摘 | Ying Yang Phillip J. Hsu Yu-Sheng Chen Yun-Gui Yang | 2018 | Cell Research2018，28，6： | 99 |
| 2 | RNA N^6-methyladenosine modification in cancers: current status and perspectives显示文摘 | Xiaolan Deng Rui Su Hengyou Weng Huilin Huang Zejuan Li Jianjun Chen | 2018 | Cell Research2018，28，5： | 55 |
| 3 | mRNA表观修饰方式及m^6A功能研究进展显示文摘mRNA上能发生100多种化学修饰,其中N^6-腺嘌呤(m^6A)是mRNA修饰中最广泛的表观修饰方式之一。在细胞分化、胚胎发育和应激等生物学过程中,特定的mRNA会发生包括N^1-腺嘌呤甲基化、N^5-胞嘧啶甲基化、假尿嘧啶以及N`6-腺嘌呤甲基化等修饰,它们共同形成了mRNA转录后调控的表观修饰转录组,实现对mRNA翻译成蛋白质过程的精确时空调控,特别是m^6A修饰能通过调控mRNA的代谢和翻译等进而调控细胞的一系列生物学过程。文中主要综述mRNA的表观修饰类型和特点,特别是m^6A修饰参与调控mRNA和细胞生物学功能的最新研究进展,并展望了将来m^6A表观修饰的研究重点和方向。 | 甘海丽 洪岭 杨凤莲 柳定凤 金莉萍 郑青亮 | 2019 | 生物工程学报2019，35，5： | 13 |
| 4 | m^6A-dependent biogenesis of circular RNAs in male germ cells显示文摘The majority of circular RNAs(circRNAs)spliced from coding genes contain open reading frames(ORFs)and thus,have protein coding potential.However,it remains unknown what regulates the biogenesis of these ORF-containing circRNAs,whether they are actually translated into proteins and what functions they play in specific physiological contexts.Here,we report that a large number of circRNAs are synthesized with increasing abundance when late pachytene spermatocytes develop into round and then elongating spermatids during murine spermatogenesis.For a subset of circRNAs,the back splicing appears to occur mostly at m^6A-enriched sites,which are usually located around the start and stop codons in linear mRNAs.Consequently,approximately a half of these male germ cell circRNAs contain large ORFs with m^6A-modified start codons in their junctions,features that have been recently shown to be associated with protein-coding potential.Hundreds of peptides encoded by the junction sequences of these circRNAs were detected using liquid chromatography coupled with mass spectrometry,suggesting that these circRNAs can indeed be translated into proteins in both developing(spermatocytes and spermatids)and mature(spermatozoa)male germ cells.The present study discovered not only a novel role of m^6A in the biogenesis of coding circRNAs,but also a potential mechanism to ensure stable and long-lasting protein production in the absence of linear mRNAs,i.e.,through production of circRNAs containing large ORFs and m^6A-modified start codons in junction sequences. | Chong Tang Yeming Xie Tian Yu Na Liu Zhuqing Wang Rebekah J.Woolsey Yunge Tang Xinzong Zhang Weibing Qin Ying Zhang Ge Song Weiwei Zheng Juan Wang Weitian Chen Xiongyi Wei Zhe Xie Rachel Klukovich Huili Zheng David R.Quilici Wei Yan | 2020 | Cell Research2020，30，3： | 12 |
| 5 | m6A RNA甲基化在肿瘤发生发展中的作用显示文摘m6A 甲基化是于1974 年首次被发现的一种RNA 分子上的甲基化修饰,近年来已成为生命科学领域的研究热点。m6A 修饰在哺乳动物细胞中是动态可逆的,是类似于DNA 和组蛋白修饰的另一种表观遗传调控。这种RNA 化学标记是由m6A“Writers”的蛋白质产生,可以被m6A“Erasers”(即去甲基酶)逆转。此外,“Readers”可以识别含m6A 的mRNA,并相应地调节下游基因的表达。m6A RNA 甲基化参与了RNA 生命周期的各个阶段,从RNA 加工、核输出、翻译调控到RNA 降解,表明m6A 具有影响RNA 代谢相关多方面的功能。最近的研究表明,在不同的组织、细胞系和时空模型中,m6A 的修饰是一个复杂的调控网络,m6A 甲基化与肿瘤的发生和发展密切相关。主要围绕m6A 的分子调控机制、生理意义及其在几种人类肿瘤中的研究进展进行综述,旨在为癌症的早期临床诊断和靶向治疗提供新的思路。 | 龙文林 郭辉 盛杰 宋如晦 徐瑶 | 2019 | 生物技术通报2019，35，6： | 8 |
| 6 | m6A识别蛋白Ythdf1在精子发生中的作用研究显示文摘目的:构建YTH N6甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1,Ythdf1)的基因敲除小鼠,研究其在小鼠精子发生中的作用。方法:利用CRISPR/Cas9敲除技术及原核注射技术构建Ythdf1基因敲除小鼠模型,通过免疫荧光、HE染色对敲除小鼠睾丸及附睾进行形态学分析,通过交配实验进行生殖力测试,研究Ythdf1基因对雄性小鼠精子发生的影响。结果:RT-PCR结果显示,Ythdf1在1~8周龄雄鼠睾丸中均有表达;成功构建Ythdf1基因敲除小鼠;成年敲除小鼠精子发生、附睾及生育力均无异常。结论:在正常饲养情况下,敲除Ythdf1基因对雄性小鼠精子发生无影响。 | 刘媛媛 宋小玲 王仿竹 齐美杰 沈彬 | 2019 | 南京医科大学学报(自然科学版)2019，39，2： | 6 |
| 7 | 炼油废水深度净化与回用的试验研究显示文摘某炼油厂的生产废水经处理后虽然已达标排放 ,但由于水资源的严重缺乏 ,要求必须进行废水的深度处理以便回用。为此 ,该文提出了采用厌氧陶粒滤池、陶粒填料生物接触氧化池与陶粒滤料过滤池相串联的废水深度处理工艺并进行试验研究。结果表明 ,该工艺处理效率高、运行稳定 ,二级气浮出水中的COD、油类、悬浮物与酚类的去除率高达 90 %~ 1 0 0 % ,水质清澈透明、无色无味 。 | 耿土锁 | 2000 | 江苏环境科技2000，13，1： | 6 |
| 8 | RNA甲基化修饰m^6A在动物中的研究进展显示文摘DNA、RNA和蛋白质的化学修饰都是表观遗传学重要的研究内容,近年来,随着科学技术的快速发展,基于DNA和蛋白质修饰研究基础,RNA甲基化研究在表观遗传领域已成为前沿的研究热点。在150余种RNA化学修饰中,RNA甲基化修饰约占60%以上,广泛分布于各种类型的RNA中,各种甲基化修饰在细胞内行使着不同的生物学功能,其中RNA甲基化修饰m^6A是最常见、最丰富的真核生物mRNA转录后修饰。m^6A的形成过程是由甲基转移酶复合体(METTL3、METTL14和WTAP等组成)、去甲基酶(FTO和ALKBH5)以及结合蛋白(YTHDF1/2/3、YTHDC1)动态调控,与基因表达调控密切相关。其次,m^6A可能参与了mRNA转录、选择性剪切、出核转运、翻译及降解等过程,从而导致RNA功能紊乱,进而影响一系列的动物生命活动。因此RNA甲基化修饰m6A介导的表观遗传学调控对动物繁殖以及生长发育有着重要的意义。本文重点根据在动物方面相关研究对m6A的动态调控及由调控过程所产生的影响进行归纳总结。 | 何波 周小枫 蒋瑶 曹浩男 袁晓龙 张哲 张豪 李加琪 | 2020 | 畜牧与兽医2020，52，3： | 5 |
| 9 | m6A识别蛋白Ythdf3在精子发生中的作用研究显示文摘目的:通过基因敲除模型研究N6-甲基腺嘌呤(m6A)识别蛋白Ythdf3在小鼠精子发生过程的调控作用。方法:利用CRISPR/Cas9技术构建Ythdf3基因敲除小鼠,通过免疫荧光和HE染色对敲除小鼠进行表型分析,研究Ythdf3在调控小鼠精子发生过程中的作用。结果:免疫组化染色显示Ythdf3在精原及各级生精细胞核中均有表达;成功构建Ythdf3基因敲除小鼠模型;HE染色显示Ythdf3敲除小鼠睾丸各级生精时相及附睾尾精子与对照相比无明显异常。结论:在正常生理条件下,敲除Ythdf3不影响雄性小鼠精子发生。 | 宋小玲 刘媛媛 王仿竹 沈彬 | 2019 | 南京医科大学学报(自然科学版)2019，39，6： | 5 |
| 10 | 广西麻鸡m6A甲基转移酶基因表达与肌纤维类型及成肌分化的关系显示文摘【目的】肌纤维类型及其转化的调节是改善肉质的重要途径,最新研究表明,m6A RNA甲基化修饰在肌肉的分化中发挥着重要作用。以优良的地方品种--广西麻鸡作为研究对象,研究其性成熟日龄不同部位肌纤维类型的组成差异,探究m6A甲基化转移酶相关基因甲基化转移酶样蛋白3/14(methyltransferase like 3/14,METTL3/14)、Wilm肿瘤1-相关蛋白(Wilms’tumor 1-associating protein,WTAP)和病毒样m6A甲基转化酶(vir like m6A methyltransferase associated,VIRMA,也称KIAA1429)在不同部位肌肉组织和成肌细胞分化前后的表达差异,为阐明肌纤维类型组成及转换的调控机理提供参考。【方法】采用ATPase染色法比较广西麻鸡胸部、腿部和背部肌肉群7个部位肌纤维类型、直径和密度等肌纤维性状差异,采用比色法检测成肌细胞分化前后不同时间点内源性m6A甲基化水平,采用实时荧光定量PCR方法检测上述4个基因在广西麻鸡7个部位肌肉以及成肌细胞分化前后的表达差异,并将其与肌纤维性状和m6A甲基化水平进行相关性分析。【结果】广西麻鸡性成熟日龄胸部肌肉群的胸大肌和胸小肌全部由白肌纤维组成,腿部肌肉群的耻坐骨肌内侧头、腓肠肌内侧头和缝匠肌均以红肌纤维为主,而髂胫外侧肌以白肌纤维为主,背部肌肉群的背阔肌则以红肌纤维为主;总体上,红肌纤维比例多的肌肉肌纤维密度显著高于白肌纤维比例多的肌肉。METTL3、METTL14、WTAP和KIAA1429基因表达存在显著的组织和时间特异性,总体上,在红肌纤维为主的肌肉中的表达量高于白肌纤维为主的肌肉,在分化期成肌细胞中的表达量要显著高于增殖期成肌细胞。肌肉中METTL3、METTL14和WTAP具有相似的表达模式,均在背阔肌中表达量最高,显著高于其他肌肉组织;在耻坐骨肌内侧头和腓肠肌内侧头的表达量次之,显著高于缝匠肌、胸大肌、胸小肌和髂胫外侧肌。KIAA1429基因在腓肠肌内侧头的表达量最高,显著高于其他组织;在背阔肌中的表达量次之,显著高于耻坐骨肌内侧头、缝匠肌、胸大肌、胸小肌和髂胫外侧肌;在胸大肌中表达量最低,但与在胸小肌和髂胫外侧肌中的表达量差异不显著。在鸡成肌细胞中,METTL3和METTL14基因表达变化趋势较为一致,均表现出先持续升高后下降的趋势,在刚分离0 h细胞中的表达量最低,在诱导分化后2 d(D2)细胞中的表达量最高,显著的高于增殖期和诱导分化当天(D0)细胞中的表达量。WTAP和KIAA1429基因表达变化趋势也较为一致,均呈现持续上升的趋势,在刚分离细胞中的表达量最低,显著低于其他时间点,至19 h显著上升,D0天略有增加,接着显著上升至D5天达到高峰。同时发现,随着成肌细胞的分化,内源性RNA m6A甲基化水平逐步上升,分化期的水平显著高于增殖期,在D2天甲基化水平最高,显著高于其他各时间点,随后在D5天显著下降,但略高于D0天。肌肉和成肌细胞中,METTL3、METTL14、WTAP和KIAA1429基因的表达两两之间均表现出极显著的正相关关系;肌肉中4个基因的表达与红肌纤维比例存在显著的正相关关系,与白肌纤维比例则呈显著的负相关关系;成肌细胞中4个基因的表达与m6A甲基化水平之间也存在正相关关系。【结论】广西麻鸡不同部位肌肉肌纤维类型组成存在差异,所研究的m6A甲基化转移酶4个基因之间协同表达,并可能对鸡肌纤维类型组成、维持及成肌细胞分化具有一定的调控作用。 | 束婧婷 单艳菊 姬改革 章明 屠云洁 刘一帆 巨晓军 盛中伟 唐燕飞 李华 邹剑敏 | 2022 | 中国农业科学2022，55，3： | 5 |
| 11 | 基于CRISPR/Cas9技术的基因敲入/敲除策略显示文摘成簇的规律间隔性短回文序列(CRISPR)基因编辑系统,因其设计简单操作方便和无种属限制,已成为一种广泛应用的基因组定点编辑工具,在复杂的基因组编辑,例如基因的人源化改造以及条件等位基因的构建中有所应用。在自然界中,CRISPR系统拥有多种类别。其中,CRISPR/Cas9系统是研究最深入、应用最成熟的一种。本文针对CRISPR/Cas9系统,分别从基因敲入/敲除片段的大小、同源臂长短、构型即递送方式等技术环节进行综述,阐述不同设计及操作条件下由CRISPR/Cas9系统介导的基因敲入/敲除的效率差异。 | 张雪梅 高旭 马宁 | 2019 | 中国生物化学与分子生物学报2019，35，1： | 5 |
| 12 | 精子发生研究进展显示文摘精子发生(spermatogenesis)是遗传信息传递和物种延续的重要环节,受诸多因素的调控。精子发生作为组织胚胎学、分子生物学、遗传学等多学科的交叉领域,是生殖生物学的研究热点之一。本文评述了精子发生相关研究的最新进展,介绍了生精细胞的分子调控、睾丸细胞对精子发生的影响以及精子发生重建技术的应用,以期为探索精子发生机制提供新的思路。 | 朱文倩 蔡宁宁 杨蕊 石建忠 张学明 | 2020 | 生命科学2020，32，10： | 4 |
| 13 | The m6A methylation regulates gonadal sex differentiation in chicken embryo显示文摘Background:As a ubiquitous reversible epigenetic RNA modification,N6-methyladenosine(m6A)plays crucial regulatory roles in multiple biological pathways.However,its functional mechanisms in sex determination and differentiation during gonadal development of chicken embryos are not clear.Therefore,we established a transcriptome-wide m6A map in the female and male chicken left gonads of embryonic day 7(E7)by methylated RNA immunoprecipitation sequencing(MeRIP-seq)to offer insight into the landscape of m6A methylation and investigate the post-transcriptional modification underlying gonadal differentiation.Results:The chicken embryonic gonadal transcriptome was extensively methylated.We found 15,191 and 16,111 m6A peaks in the female and male left gonads,respectively,which were mainly enriched in the coding sequence(CDS)and stop codon.Among these m6A peaks,we identified that 1013 and 751 were hypermethylated in females and males,respectively.These differential peaks covered 281 and 327 genes,such as BMP2,SMAD2,SOX9 and CYP19A1,which were primarily associated with development,morphogenesis and sex differentiation by functional enrichment.Further analysis revealed that the m6A methylation level was positively correlated with gene expression abundance.Furthermore,we found that YTHDC2 could regulate the expression of sex-related genes,especially HEMGN and SOX9,in male mesonephros/gonad mingle cells,which was verified by in vitro experiments,suggesting a regulatory role of m6A methylation in chicken gonad differentiation.Conclusions:This work provided a comprehensive m6A methylation profile of chicken embryonic gonads and revealed YTHDC2 as a key regulator responsible for sex differentiation.Our results contribute to a better understanding of epigenetic factors involved in chicken sex determination and differentiation and to promoting the future development of sex manipulation in poultry industry. | Jianbo Li Xiuan Zhang Xiqiong Wang Congjiao Sun Jiangxia Zheng Junying Li Guoqiang Yi Ning Yang | 2022 | Journal of Animal Science and Biotechnology2022，13，6： | 4 |
| 14 | Meclofenamic acid represses spermatogonial proliferation through modulating m^6A RNA modification显示文摘Background: N6-Methyladenosine(m^6A), the most prevalent modification in mammalian m RNA, plays important roles in numerous biological processes. Several m^6A associated proteins such as methyltransferase like 3(METTL3),methyltransferase like 14(METTL14), α-ketoglutarate-dependent dioxygenase Alk B homolog 5(ALKBH5) and YTH domain containing 2(YTHDC2) are involved in the regulation of spermatogenesis and oogenesis. However, the role of the first detected m^6A demethylase, fat mass and obesity associate protein(FTO), in germ cells remains elusive.Elucidation of FTO roles in the regulation of germ cell fate will provide novel insights into the mammalian reproduction.Methods: Mouse GC-1 spg cells were treated with the ester form of meclofenamic acid(MA2) to inhibit the demethylase activity of FTO. The cellular m^6A and m^6Amlevel were analyzed through high performance liquid chromatography combined with tandem mass spectrometry(HPLC/MS-MS). The cell apoptosis was detected via TUNEL and flow cytometry. The cell proliferation was detected through Ed U and western blot. The m RNA level of core cyclin dependent kinases(CDKs) was quantified via q-PCR. RNA decay assay were performed to detect RNA stability. Dual fluorescence assay was conducted to study whether MA2 affects the expression of CDK2 dependent on the m^6A modification at 3’UTR.Results: MA2 significantly increased the cellular m^6A level and down-regulated the expression of CDK1, CDK2, CDK6 and Cd C25 a, resulting in arrest of G1/S transition and decrease of cell proliferation. MA2 downregulated CDK2 m RNA stability. Additionally, mutation of the predicted m^6A sites in the Cdk2–3’UTR could mitigated the degradation of CDK2 m RNA after MA2 treatment.Conclusion: MA2 affected CDKs expression through the m^6A-dependent m RNA degradation pathway, and thus repressed spermatogonial proliferation. | Tao Huang Jiayin Guo Yinghua Lv Yi Zheng Tongying Feng Qiang Gao Wenxian Zeng | 2019 | Journal of Animal Science and Biotechnology2019，10，4： | 4 |
| 15 | RNA N6-甲基腺嘌呤异常修饰影响肿瘤干细胞促进恶性肿瘤发生、发展的研究进展显示文摘RNA N6-甲基腺嘌呤(N^6-methyladenosine,m6A)修饰是RNA较常见的表观遗传修饰形式,受到甲基化酶、去甲基化酶以及多种识别蛋白调节,与基因的表达调控密切相关。近年来研究发现RNA m^6A异常修饰在恶性肿瘤发生、进展及转移中起到重要作用。深入研究提示RNA m^6A异常修饰可能诱导肿瘤干细胞形成,提高肿瘤细胞对治疗后损伤的抗性,促进恶性肿瘤放射治疗和化学治疗抵抗的产生,从而导致恶性肿瘤进展或复发。该文回顾RNA m^6A修饰的调节机制,及其在恶性肿瘤进展、复发中的作用机制研究进展,同时结合肿瘤干细胞对放射治疗和化学治疗产生抵抗的机制,以探讨RNA m^6A异常修饰通过影响肿瘤干细胞促进肿瘤进展的可能机制。 | 朱正阳 王成 姜辰一 赵福军 | 2020 | 上海交通大学学报(医学版)2020，40，3： | 4 |
| 16 | RNA m^6A甲基化修饰概述显示文摘RNA上存在多种修饰形式,如6-甲基腺嘌呤(m^6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、1-甲基腺嘌呤(m1A)和假尿嘧啶等。m^6A是真核生物m RNA中丰度最高的甲基化修饰形式,也是目前研究最为透彻的一种RNA修饰类型。随着m^6A修饰检测和测序技术的发展以及单碱基分辨率等新兴技术的兴起,多种m^6A修饰相关的调控蛋白被鉴定,其调控的生物学功能也得到了更深入的解析。该文主要介绍了m^6A甲基化修饰的调控蛋白、分布特征及规律、检测技术、生物学功能及其与肿瘤的关联,并对目前该研究领域面临的主要机遇与挑战进行了讨论。 | 张丽媛 杨运桂 | 2019 | 中国细胞生物学学报2019，0，5： | 4 |
| 17 | COPII mitigates ER stress by promoting formation of ER whorls显示文摘Cells mitigate ER stress through the unfolded protein response(UPR).Here,we report formation of ER whorls as an effector mechanism of the ER stress response.We found that strong ER stress induces formation of ER whorls,which contain ER-resident proteins such as the Sec61 complex and PKR-like ER kinase(PERK).ER whorl formation is dependent on PERK kinase activity and is mediated by COPII machinery,which facilitates ER membrane budding to form tubular-vesicular ER whorl precursors.ER whorl precursors then go through Sec22b-mediated fusion to form ER whorls.We further show that ER whorls contribute to ER stressinduced translational inhibition by possibly modulating PERK activity and by sequestering translocons in a ribosome-free environment.We propose that formation of ER whorls reflects a new type of ER stress response that controls inhibition of protein translation. | Fang Xu Wanqing Du Qin Zou Yuting Wang Xin Zhang Xudong Xing Ying Li Dachuan Zhang Huimin Wang Wenhao Zhang Xinyao Hu Xin Liu Xiaoling Liu Shaojin Zhang Jinqiang Yu Jianhuo Fang Fajin Li Ying Zhou Tieqiang Yue Na Mi Haiteng Deng Peng Zou Xiaowei Chen Xuerui Yang Li Yu | 2021 | Cell Research2021，31，2： | 4 |
| 18 | RNA甲基化修饰与病理效应显示文摘RNA甲基化修饰是表观转录组学重要的研究内容。在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,6-甲基腺嘌呤(m^6A)是m RNA上最丰富的内部修饰。RNA甲基化修饰受到甲基转移酶、去甲基化酶以及m^6A识别蛋白质的动态调控,与基因表达调控密切相关。RNA甲基化修饰失调可导致RNA功能紊乱,甚至一系列病理效应。现主要介绍几种较为常见的RNA甲基化修饰,并对其与病理效应的相关性进行归纳总结。 | 王蓬宇 杨财广 | 2018 | 生命科学2018，30，4： | 3 |
| 19 | 家禽m6A修饰研究进展显示文摘N6-甲基腺嘌呤(m6A)作为一种重要的RNA表观遗传修饰方式,在真核生物基因组中广泛分布,已被证实在细胞分化、配子发生、脂肪沉积及肿瘤发生等生命过程中发挥重要作用。随着高通量检测技术和单碱基检测技术的快速发展,大量的m6A修饰调控蛋白被鉴定出来,相应的调控机理也得到了更深入的解析。文章综述了m6A的发现和特征、调控酶系统、检测技术、主要生物学功能及在家禽方面的研究进展,以期为后续对家禽m6A修饰的研究及应用提供理论支撑。 | 庞立川 刘一帆 章明 单艳菊 屠云洁 姬改革 巨晓军 束婧婷 邹剑敏 | 2022 | 黑龙江畜牧兽医2022，，13： | 3 |
| 20 | 基于mRNA的m6A修饰角度探讨恐伤肾致胎损机制的可行性显示文摘中医'恐伤肾致胎损'的经典理论和现代疾病的'胎源学说'都认为孕期恐应激对子代远近期发育均造成不良影响,但其机制仍是尚待突破的瓶颈。mRNA甲基化修饰尤其N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰的发现说明mRNA不仅是信息传递者,也是信息翻译的调控者,mRNA上的m6A修饰及其生物学效应为探索恐伤肾致胎损的机制提供了一条新的思路。研究发现,恐应激可以诱发m6A的异常修饰,而m6A的修饰水平与生长发育高度相关。鉴此,文章主要就不同种类的应激对m6A修饰的影响及异常修饰使子代产生畸形发育等国内外研究现状进行综述,以期为从mRNA的m6A修饰角度探讨恐伤肾致胎损机制提供借鉴。 | 王启阳 潘明敏 杨丽萍 | 2021 | 中华中医药杂志2021，36，4： | 2 |
您所在的机构暂未开通此部分的功能，请联系管理员