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| 1 | 福建省HIV-1流行毒株基因分型与流行特征分析显示文摘目的了解HIV-1流行株在福建省感染人群中的基因亚型分布及流行特征。方法随机抽取福建省2003-2005年发现的70例HIV感染者血样,提取前病毒DNA进行体外扩增,获得核心蛋白(gag)、包膜蛋白(env)及pol区基因的核酸片段,并对各基因区核苷酸序列进行测定和序列分析。结果选取46份流行病学资料以及不同基因区域序列资料完整的样本进入亚型分析,结果显示目标人群中存在B、C2种亚型以及CRF07-BC、CRF08-BC、CRF01-AE3种流行重组型,以及国内未见报道的B/F重组毒株、A1/D重组毒株等,其中以CRF01-AE重组毒株为主,占69.56%。基因亚型的流行特征分析显示,本省感染的HIV患者中以CRF01-AE重组型占多数,可能的新型重组型全部分布于境外感染者中;在性接触传播的感染者(71.74%)中呈现多种亚型分布的特征;随着时间变化福建省HIV感染者的亚型分布发生变化。结论福建省HIV-1亚型分布众多,各亚型在不同感染地分布不平衡,性乱人群中的亚型分布较为复杂,从总的亚型流行特征来看,HIV-1在我省有流行加快的趋势。 | 刘建芳 严延生 林勋 黄海龙 颜苹苹 陈舸 郑健 | 2006 | 中国人兽共患病学报2006，22，7： | 20 |
| 2 | 浙江省HIV-I流行毒株GAG基因序列测定和亚型分析显示文摘〔目的〕利用分子生物学方法了解浙江省境内HIV -I流行毒株的亚型。〔方法〕采集 14份浙江省检出的HIV -I抗体阳性者的抗凝全血 ,从中提取前病毒DNA作为PCR扩增的模板 ,设计特异性引物对gag基因区进行扩增并测定其序列。所得序列与国际标准或参考序列进行比较 ,确定亚型。〔结果〕14份样本中有 9份扩增阳性并得到相应序列 ,扩增率为 6 4 .3%。经过离散率计算和系统树分析后证实 4份样本为A/E流行重组模式 ,3份样本为B亚型 ,1份样本为B/C流行重组模式 ,1份样本为G亚型。〔结论〕目前浙江省境内有多种亚型的HIV -I毒株存在。迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预措施以阻断HIV/AIDS的流行和传播。 | 姚亚萍 梁浩 杨介者 魏民 郭志宏 潘晓红 邢辉 邵一鸣 | 2004 | 中国卫生检验杂志2004，14，6： | 18 |
| 3 | 河南省HIV流行毒株env膜蛋白基因C_2-V_3区序列特征和亚型研究显示文摘目的 了解河南省内艾滋病病毒Ⅰ型 (HIV 1)流行株的亚型及序列变异特征。方法 用套式聚合酶链反应 (nested PCR) ,对河南省内 2 8份HIV 1感染者外周血单个核细胞 (PBMc)中前病毒脱氧核糖核酸 (DNA)的膜蛋白基因进行扩增 ,并对C2 V3 及其邻区 35 0~ 4 5 0个核苷酸序列进行测定和分析。结果 2 8份样品间的基因离散率为 5 72 % ,与流行于云南省的 (泰国B)毒株基因距离为 5 80 % ,与欧美B亚型基因距离为 18 0 5 % ,而与其它A、C、D、F、G、H、J、O等亚型的基因距离均在 2 4 %以上。系统树分析显示 ,2 8份样本与泰国B亚型聚在一起而远离其它国际亚型。对于其V3 环四肽序列的分析表明 ,具有泰国B亚型基因型GPGQ的 8例 ,占 2 8 5 7% ;具有欧美B亚型基因型GPGR的 13例 ,占 4 6 4 %。结论 河南省流行的HIV株属B′亚型 ,其毒株来自与泰国接壤的云南省 ,在河南省流行的时间约在 6~ 10年 ,其V3 环顶端四肽序列特征以GPGR为主。 | 崔为国 邢辉 王哲 黄海龙 李宏 马鹏飞 薛晓玲 魏民 朱新朋 邵一鸣 | 2004 | 中国艾滋病性病2004，10，6： | 14 |
| 4 | 山东省HIV-1感染者分子流行病学研究显示文摘目的 了解流行于山东省境内艾滋病病毒 (HIV 1)毒株的亚型及各种亚型的分布特点。方法 对 93例HIV感染者进行详细的流行病学调查 ,并采集外周静脉防凝血 ,提取前病毒DNA进行体外扩增 ,获得包膜蛋白 (env)、核心蛋白 (gag)、tat区基因的核酸片段 ,并对各基因区核苷酸进行测定和分析。结果 发现在所有目标人群中共存在B、B’、C 3种亚型以及CRF0 7 BC、CRF0 8 BC、CRF0 2 AG和CRF0 1 AE 4种重组毒株 ,B’亚型在人群和地域上分布最广 ,涉及献血员、受血者、二者的配偶和性乱人群 ,分布在山东省 10个地市 ;CRF0 7 BC、CRF0 8 BC亚型以吸毒人群为主 ,分布在 5个地市 ;CRF0 1 AE和其他亚型则主要为性乱人群 ,集中在几个经济发达的城市。结论 山东省HIV 1亚型众多 ,各亚型在我省高危人群和地域分布不平衡 ,各有特点 ,从总的亚型流行特征来看 ,HIV 1在我省有流行加快的趋势。 | 傅继华 李盛长 张静 刘学真 黄涛 邢辉 邵一鸣 | 2005 | 中华流行病学杂志2005，26，2： | 14 |
| 5 | 有偿供血者HIV感染分子流行病学研究显示文摘目的:了解河北省有偿献血员中HIV-1基因亚型特点和传播途径。方法:采集HIV感染者的全血样品,分离外周血单核细胞(PBMC),提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应(nested-PCR),扩增HIV-1的env基因的C2-V3区并进行序列测定和亚型分析。结果:对7份HIV-1感染者的样品,扩增得到了7份HIV-1 env C2-V3基因片段,经序列测定和基因分析7份样品均为B′亚型。组内基因离散率8.83%±4.01%(n=7),基因序列与云南瑞丽株rl42(泰国B亚型)相近。V3环顶端四肽存在3种类型:GPGQ(4/7)、GPGR(2/7)以及GPGK(1/7)。结论:在河北省有偿献血员中B′亚型仍是主要的流行亚型,可能来源于云南吸毒人群。V3环顶端四肽以GPGQ为主。 | 赵翠英 赵宏儒 李保军 白广义 邢辉 路新利 李巧敏 张玉琪 陈素良 | 2010 | 中国卫生检验杂志2010，20，12： | 5 |
| 6 | 河南省艾滋病毒I型膜蛋白基因序列特征和亚型研究显示文摘目的 了解在河南省流行的人类免疫缺陷病毒(HIV)毒株的流行情况及亚型特征。方法 用套式聚合酶反应(nested -PCR)对28份河南省内的HIV-1感染者外周血单个核细胞(PBMc)中的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区350 -450个核苷序列进行测定和分析。结果 28份样品间的基因离散率为5.72%,与流行于云南的(泰国B)毒株基因离散率 为5.80%,与其它国际亚型,欧美B、A、C、D、F、G、H、J、O亚型基因离散率均在18.05%以上。系统树分析显示,28份毒株与 泰国B亚型聚在一起而远离其它国际亚型。其毒株V3环四肽序列泰国B亚型基因型GPGQ8例占28.57%,欧美B亚型基 因型GPGR13例占46.43%.结论 河南省流行的HIV株属B′亚型,其毒株来自与泰国接壤的云南,在河南流行的时间约在 6~10年,其V3环顶端四肽序列特征以GPGR为主。 | 崔为国 邢辉 王哲 黄海龙 李宏 薛晓玲 朱新朋 邵一鸣 | 2005 | 河南预防医学杂志2005，16，1： | 5 |
| 7 | 贵州省新发现HIV-1毒株亚型特征研究显示文摘目的分析研究贵州省HIV-1亚型毒株分布及流行特征,为艾滋病防治及疫苗研制提供科学依据。方法 用套式基因扩增方法(PCR)扩增HIV-1毒株gag基因和env基因并测序分析。结果 128例样本扩增、测序成功119例,其中CRF01-AE亚型62例,CRF07-BC重组亚型49例,CRF08-BC重组亚型2例,B亚型6例。结论 本次研究贵州省HIV-1毒株以新发现的CRF01-AE重组亚型流行为主,CRF07-BC重组亚型次之,多亚型并存;分析结果提示贵州省HIV-1毒株亚型向性传播转变。 | 孙显光 何翔 李志坚 张信辉 申莉梅 | 2011 | 重庆医学2011，40，29： | 4 |
| 8 | 深圳地区艾滋病患者HIV-1毒株膜蛋白V3环的氨基酸变异分析显示文摘目的了解深圳地区艾滋病患者体内不同HIV-1亚型膜蛋白V3环的氨基酸序列特征及变异特点。方法采用逆转录套式聚合酶链反应(RT-nested-PCR)对艾滋病患者血浆HIV RNA进行扩增,对扩增产物直接测序并进行序列对比、翻译和分析。结果深圳地区艾滋病患者感染HIV病毒分属B与CRF01-AE亚型,病毒V3顶端的四肽特征主要为:GPGQ 48%、GPGR 36%、其他形式16%;其中AE亚型GPGQ百分比为76.9%,B亚型GPGR百分比为75%;还发现DQDR、DQGQ等少见V3环顶端四肽组成形式。V3环发生与SI表型有关的氨基酸突变形式高达80%。结论深圳地区艾滋病患者感染病毒V3环顶端四肽主要为GPGQ与GPGR,V3环序列高度变异,出现一些少见的V3环顶端四肽组成形式值得进一步研究。 | 王辉 陆坚 胡毅文 李丽雄 王火生 周伯平 | 2005 | 中华传染病杂志2005，23，5： | 4 |
| 9 | HIV分离株基因分型及分布特点显示文摘艾滋病(AIDS)是由人类免疫缺陷病毒(HIV)感染所导致的一种病死率极高的慢性传染病。据统计截至2010年底,全球共有3 400万名艾滋病病毒感染者,较2001年增长17%[1]其中南非是世界上艾滋病毒携带者最多的国家,估计有560万人。 | 石西南 秦苑 张迪 吴世木 | 2013 | 贵州医药2013，37，2： | 4 |
| 10 | 深圳地区HIV-1主要流行亚型Env基因V3环氨基酸变异分析显示文摘目的了解深圳市HIV-1主要流行亚型Env基因V3环氨基酸序列变异特征。方法采用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增HIV-1Env区,对扩增产物进行基因测序,应用MEGA软件对序列进行整理和分析。结果深圳市HIV-1主要基因亚型为01-AE亚型179例(54.41%),07-BC亚型86例(26.14%)。共发现8种V3环顶端四肽类型,其中主要类型为GPGQ和GPGR;07-BC、08-BC和C亚型顶端四肽全部为GPGQ,01-AE和B亚型顶端四肽具有多种形态且两亚型间的分布有统计学差异;GPGQ和GPGR在01-AE和C亚型的分布情况与全国相符,在B亚型中分布与全国相比有统计学差异;01-AE、B亚型V3区基因离散率明显高于其他亚型;B亚型V3区11和25位单独和同时被带正电荷氨基酸替代达19例和3例,而01_AE亚型有7例11位单独被正电荷取代,07-BC、08-BC、C亚型仅有1例11位单独被正电荷氨基酸取代。结论 2009年深圳市HIV-1毒株主要呈巨噬细胞嗜性,只有极少部分毒株转变为T细胞嗜性;B亚型相对其他亚型V3区具更大变异性。 | 刘佳 王晓辉 鲍毅 陈琳 杨峥嵘 王国庆 | 2012 | 现代预防医学2012，39，23： | 3 |
| 11 | 山东省HIV-1流行株多基因区亚型分析显示文摘目的了解流行于山东省境内HIV-1毒株的亚型,尤其是流行重组型毒株的种类及变异情况,分析其来源并推测其流行趋势。方法采集93份HIV-1感染者的外周静脉防凝血,提取前病毒DNA进行体外扩增,获得包膜蛋白(env)、核心蛋白(gag)、tat区基因的核酸片段,并对各基因区核苷酸进行测定和分析。结果发现在所有目标人群中共存在B、B′、C3种亚型以及CRF07-BC、CRF08-BC、CRF01-AG和CRF01-AE4种重组毒株,其中B′亚型数量最大71株(占77.2%),CRF01-AE9株(占9.8%),CRF07-BC、CRF0B-BC各3株(均占3.3%),B、C和CRF02-AG各2株(占2.2%)。3个基因区env区变异最大,gag和tat相对保守。3种优势亚型中,A/E变异最大,B'次之,B'/C最保守。结论山东省HIV-1流行毒株亚型众多,各优势毒株发生了不同程度的变异,在山东省有流行加快的趋势,应加强防控。 | 张静 傅继华 王同展 刘学真 苏生利 黄涛 邢辉 | 2006 | 公共卫生与预防医学2006，17，5： | 3 |
| 12 | 逆转录聚合酶链反应在艾滋病患者HIV-1毒株env基因的序列测定和亚型分析中的应用显示文摘目的了解深圳地区艾滋病患者中Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)毒株各亚型的感染情况,及其不同亚型对患者疾病进程的影响。方法采用巢式逆转录聚合酶链反应(RTPCR)法对26例艾滋病患者血浆中的HIV-1毒株的env基因片段进行扩增,并对扩增片段进行序列测定和分析,同时检测其CD4+细胞计数与血浆病毒载量。结果基因系统树显示深圳地区26例艾滋病患者的HIV-1毒株env基因序列,B亚型12例,其中1例与欧美B亚型序列十分接近,11例与中国云南B亚型序列十分接近;循环重组亚型AE(CRF01AE)13例,均与泰国AE亚型序列十分接近。比较B、AE亚型感染患者的CD4细胞计数与病毒载量之间的差异无统计学意义。结论深圳地区艾滋病患者中以HIV-1毒株以B亚型和循环重组亚型AE最常见,尚未观察到B、AE亚型对艾滋病进展的影响。 | 王辉 李兵 徐六妹 陆坚 李丽雄 胡毅文 周伯平 | 2005 | 中华检验医学杂志2005，28，4： | 3 |
| 13 | 黑龙江省17例HIV/AIDS患者的病毒亚型及基因序列特征分析显示文摘目的了解黑龙江省内部分人免疫缺陷病毒1型(HIV-I)的亚型及基因序列特征。方法用巢式聚合酶链反应(nested-PCR),对黑龙江省内17份HIV-1感染者外周血单个核细胞(PBMC)中前病毒脱氧核糖核酸的膜蛋白(e(?))基因进行扩增,并对C2-V3的核苷酸序列进行测定和分析。结果系统树分析显示,17份样本中病毒与HIV泰国B(B′)亚型聚在一起,基因离散率为(6.194±1.01)%,与欧美B亚型基因离散率为(12.94±2.19)%,与其他亚型的离散率大于20%。对于其V3环四肽序列的分析表明,具有GPGQ的8例,占47.06%;具有GPGR的7例,占41.18%;1例为GQGR;1例为GPGH。通过序列分析预测,大部分利用CCR5辅助受体。结论所检测的黑龙江省17例HIV- 1均为B′亚型,提示黑龙江省的HIV-1流行株可能以B′亚型为主,其V3环顶端四肽序列特征以GPGQ和GPGR为主。 | 周慧 王福祥 凌虹 周海舟 刘卫华 刘彦成 王开利 马英骥 | 2007 | 中华微生物学和免疫学杂志2007，27，7： | 2 |
| 14 | 山东省部分HIV-1流行株的亚型分析和序列特征研究显示文摘目的 对山东省HIV 1流行毒株进行亚型分析 ,并研究其变异特征。方法 采集 2 6份HIV 1感染者的外周静脉抗凝血 ,提取前病毒DNA进行体外扩增 ,获得包膜蛋白 (env)基因的核酸片段 ,并对其C2 V3及邻区的核苷酸进行测定和分析。结果 基因和氨基酸序列分析表明 ,2 6份标本中存在 4种亚型和重组毒株 (B′、C、A、A/E) ,其中B′ 17株 ,其组内基因距离为 11.6 9± 4 .19。V3环顶端四肽有 6种形式 ,最多的是GPGQ(15株 )、GPGR(6株 )。V3环第 11、2 5位氨基酸出现变异 ,并有 1株呈电荷双阳性。结论 山东省HIV 1流行株亚型较多 ,有重组毒株出现的可能 ,基因发生较大变异 ,HIV 1传播在山东省有加快的趋势。 | 张静 于修平 梁浩 傅继华 刘学真 黄涛 苏生利 王玫 康殿民 刑辉 | 2003 | 中华微生物学和免疫学杂志2003，23，5： | 2 |
| 15 | 浙江省HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析显示文摘目的 利用脱氧核糖核酸 (DNA)序列分析浙江省境内艾滋病病毒 1型 (HIV 1)流行毒株的亚型 ,为艾滋病预防控制工作提供参考。方法 采取 14份浙江省HIV 1抗体阳性者的全血 ,提取前病毒DNA作为扩增模板 ,设计引物对env基因的C2 V3 区进行聚合酶链反应 (PCR)扩增并测定其序列。所得序列用Wisconsin公司的GCG软件包进行分析 ,确定亚型。结果 14份标本中有 9份扩增阳性并得到相应序列 ,扩增率为 6 4 3%。经过离散率计算和系统树分析后证实 :4份标本为E亚型的A/E流行重组模式 ,3份标本为B亚型 ,1份标本为C亚型的B/C流行重组模式 ,1份标本为G亚型。结论 目前浙江省境内有多种亚型的HIV 1毒株存在 ,流行形势严峻。迫切需要深入调查研究 ,并在高危人群中开展行为干预措施。 | 姚亚萍 梁浩 魏民 关琪 杨介者 郭志宏 潘晓红 邢辉 赵全壁 邵一鸣 | 2004 | 中国艾滋病性病2004，10，1： | 2 |
| 16 | 沈阳市人类免疫缺陷病毒的基因序列分析显示文摘从10份沈阳地区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)血浆标本中提取核糖核酸(RNA),经逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和套式聚合酶链反应(nest-PCR)扩增HIV-1的p17与p24交界部分的基因片断并进行测序。将所测序列与各亚型国际参考株及亚洲流行参考序列进行比对,确定被检标本的亚型,并进行基因序列分析。同时将所得亚型结果与经过亚型特异性引物的复合套氏PCR鉴定基因亚型的方法所获结果进行比较。结果表明,10份HIV-1病毒株分属B′、CRF07-BC和CRF01-AE3种基因亚型。本文所研究样本的p17区段的ks/ka值小于1,而p24区段的ks/ka值大于1;p24部分的基因同源性高于p17部分,即我国HIV-1B′、CRF07-BC和CRF01-AE3种亚型毒株的p17区段的基因变异较大,而p24区段相对较为保守。提示上述3种亚型HIV-1病毒株的p24区段更适合于HIV-1疫苗的研制。 | 关琪 王素芬 马晓光 黎明新 王艳 | 2005 | 中国病毒学2005，20，4： | 2 |
| 17 | 贵州省HIV-1毒株亚型分布研究显示文摘目的揭示贵州省HIV-1亚型毒株分布特点。方法用套式PCR扩增HIV-1毒株外膜蛋白并基因测序分析。结果62例样本扩增测序成功52例,其中B亚型3例,B’亚型4例,C亚型2例,E亚型2例,BC重组亚型41例。结论贵州省HIV-1病毒以BC重组亚型流行为主,多亚型并存;提示亚型分布复杂,来源广泛,防治难度大。 | 孙显光 雷世光 邢辉 邵一鸣 | 2007 | 贵州医药2007，31，7： | 1 |
| 18 | 深圳地区人类免疫缺陷病毒-1型AE重组毒株的分子流行病学研究显示文摘HIV的一个重要生物学特征是基因的高度变异。目前,世界上已发现的HIV可分为HIV-1和HIV-2两型,HIV-1型又可分为M(Main)组、O(the Outline)组和N(NOil—M,Non—O)组。M组是全球主要流行的病毒株,又可分为A、B、C、D、F、G、H、J和K共9个亚型。 | 赵广录 冯铁建 赵锦 王晓辉 石向东 杨峥嵘 张燕 甘永霞 罗贤如 陈琳 | 2010 | 中华传染病杂志2010，，2： | 1 |
| 19 | 九江市HIV-流行毒株基因序列测定和亚型分析显示文摘目的:了解九江市H IV-1流行毒株的亚型分布情况。方法:对采集的6份九江市H IV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得GAG基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果:在6份样品中发现B′亚型H IV-1毒株四株,B亚型和A/E重组亚型H IV-1毒株各一株。结论:H IV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。 | 张红波 邢辉 肖云 杨泽民 马鹏飞 卫星 刘羽真 吴光中 | 2005 | 中国卫生检验杂志2005，15，12： | 1 |
| 20 | 九江市HIV-1流行毒株基因序列测定和亚型分析显示文摘目的了解九江市艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株的亚型分布情况。方法对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得gag基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株4株,B亚型和A/E重组亚型HIV-1毒株各1株。结论HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。 | 张红波 邢辉 肖云 杨泽民 马鹏飞 卫星 刘羽真 吴光中 | 2006 | 中国艾滋病性病2006，12，2： | 0 |
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