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| 1 | 2000-2012年中国HIV基因亚型时空分布的系统综述显示文摘目的了解2000年以来我国艾滋病病毒(human immunodeficiency virus,HIV)基因亚型的时间和空间分布特征。方法计算机检索中国知网期刊全文数据库和PubMed数据库,按纳入和排除标准选取文献,提取资料,描述分析HIV亚型在不同时间、不同地区和不同传播途径感染人群中的分布。结果纳入78篇文献,涵盖我国20个省、直辖市和特区。研究结果显示:我国目前存在A、B、B’、C、D、E、G、K、CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、CRF02_AG、CRF03_AB、CRF12_BF、CRF14_BG、CRF02_AG/CRF01_AE、CRF08_BC/B、CRF07_BC/CRF01_AE、G/CRF12_BF、A/CRF10_CD、CRF01_AE/B’、U/CRF01_AE、B/C、U/G等多种亚型,其中CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B’、B为主要流行亚型;HIV的基因亚型与传播途径相关,近年来,我国流行的重组毒株增多且出现多种独特重组型。结论过去10年,随着HIV流行形势的变化,我国HIV基因亚型分布特征发生变化并日趋多样化,必须予以高度重视。 | 陶艳琳 赵雪涛 汤宇帆 何纳 | 2013 | 中华疾病控制杂志2013，17，12： | 28 |
| 2 | 我国艾滋病流行近况分析显示文摘获得性免疫缺陷综合征(AIDS)及其病原体——人类免疫缺陷病毒(HIV),在不同的国家、地区有不同的流行特征。了解HIV-l基因亚型的流行特点及其地域分布,对HIV-1的传播及其流行模式、病毒耐药研究和疫苗研发均具有重要意义。本文综述了近年来HIV/AIDS及HIV-1各亚型在我国的流行状况,为进一步研究HIV-1分子流行病学及HIV/AIDS的防治提供依据。 | 孔衍琳 蒋就喜 | 2014 | 热带医学杂志2014，14，12： | 27 |
| 3 | 艾滋病病毒1型CRF01_AE毒株的过去、现在和将来显示文摘CRF01_AE是我国目前流行的主要HIV-1毒株,具有独特的流行病学特征。本文从该毒株的发现起源与命名、在国内外的流行过程、参与形成的重组毒株以及致病性等方面进行介绍,并讨论了与流行病学特征密切相关的社会和生物学因素。 | 李敬云 | 2016 | 中华流行病学杂志2016，37，4： | 14 |
| 4 | 广东省HIV-1分子流行病学分析显示文摘目的分析广东省HIV感染者HIV-1基因亚型、感染途径、地区分布等流行病学特点。方法收集门诊2009年HIV感染者相关临床资料和外周静脉血标本,通过分离血浆和外周血单个核细胞(PBMC)、PBMC核酸抽提及CD4+T细胞培养等方法,提取病毒核酸,并采用PCR扩增pol及env基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,经过比对分析确定基因亚型,结合临床资料进行流行病学特点分析。结果 192例标本扩增基因序列并经比对后确定基因亚型,124例(64.6%)为CRF01-AE;26例(13.5%)为CRF07-BC,另外CRF08-BC重组亚型(2.1%)、C亚型(0.5%)、B亚型(2.6%)、B'亚型(4.7%)及CRF02-AG(1.0%),其中有10例标本的pol为CRF01,而env为B型。广东省HIV感染者多为无固定职业、农民或工人,年龄集中于21~50岁的青壮年,主要分布于广州、云浮、阳江、佛山、江门等。168例有传播途径的资料,发现异性传播99例(58.9%),静脉吸毒34例(20.2%),其余为输血(6.0%)、男男同性行为(1.2%)、母婴(1.2%)。结论广东省HIV感染者以青壮年为主,主要经异性性接触感染,HIV-1流行株仍以CRF01-AE亚型为主,并首次发现CRF02-AG亚型,也存在CRF07-BC重组亚型、CRF08-BC重组亚型、C亚型及B亚型(包括B和B')。 | 何浩岚 许飞龙 蔡卫平 陈谐捷 卢葳 何金洋 聂静敏 贾卫东 | 2012 | 广东医学2012，33，22： | 12 |
| 5 | HIV-1CRF07_BC重组毒株的起源和分子流行病学研究进展显示文摘CRF07 BC是中国特有的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)重组毒株,首先在四川和新疆静脉吸毒人群中检出,并成为中国静脉吸毒人群中主要的流行毒株。从发现至今,CRF07 BC在中国流行时间超过十年,其流行呈逐步扩大的态势。对CRF07 BC的现场流行病学和分子流行病学研究也逾十年,积累了大量的现场流行病学数据和实验室数据。特别是2006年在中国台湾静脉吸毒人群中爆发了CRF07 BC流行,CRF07 BC的起源和传播路线等成了众所关注的焦点。该文对CRF07 BC的起源、分子流行病学研究等方面进行综述,希望对该毒株的预防控制、流行趋势和起源推测以及传播路线确立等研究提供依据。 | 辛若雷 何翔 邵一鸣 | 2009 | 中国艾滋病性病2009，15，2： | 12 |
| 6 | 福建省HIV-1新近感染者流行毒株基因亚型及其流行特征分析显示文摘目的:了解福建省HIV-1新近感染者流行毒株的亚型分布和流行特征。方法随机抽取福建省2011-2012年使用BED捕获酶免疫试验检出的104例新近感染者血样标本,采用反转录巢式PCR扩增gag、pol和env基因片段,并测定和分析核酸序列。结果目标人群中存在B亚型和01_AE、07_BC、08_BC、55_01B四种流行重组型,其中以01_AE和07_BC流行重组型为主,分别占45.68%和35.80%。基因亚型的流行特征分析显示,亚型分布中01_AE所占比例下降,07_BC所占比例上升;性传播是主要感染途径,其中同性传播比例明显上升。结论福建省HIV-1流行毒株亚型分布众多,随着时间推移,亚型构成和传播途径已发生改变,应加强对HIV-1感染的分子流行病学趋势动态监测。 | 邓永岳 张春阳 严延生 颜苹苹 吴守丽 | 2014 | 中华流行病学杂志2014，35，6： | 9 |
| 7 | HIV-1亚型分析与研究综述显示文摘 | 韦启后 | 2008 | 中国热带医学2008，8，2： | 8 |
| 8 | 浙江省HIV-1 CRF01_AE流行株的分子特征分析显示文摘目的分析艾滋病病毒1型(HIV-1)CRF01AE重组毒株在浙江省的分子流行特征。方法提取234例HIV-1感染者基因组DNA用巢式聚合酶链反应(nPCR)方法扩增gag部分基因片段,测定序列以后分析核苷酸和氨基酸序列。结果在扩增阳性并成功测序的192个序列中HIV-1CRF01AE有81个,占42%,是浙江省HIV主要的流行毒株之一。系统进化树中存在3个bootstrap值〉60的分支簇,其中MIX组包括47个序列,内部基因离散率为2.4%±0.7%,与参考株CM240的基因离散率为3.4%±0.5%;SEX组包括7个样本,组内基因离散率为3.0%±1.2%,与参考株的基因离散率为3.9%±1.0%;MSM组包括12个样本,组内基因离散率为2.8%±1.1%,与参考株的基因离散率为4.9%±0.6%,三者差别有统计学意义。特征性氨基酸分析表明MIX组、SEX组、MSN组共享序列与国际参考株共享序列之间分别存在2个、4个和8个位点的差异。结论浙江省内HIV-1CRF01AE流行株中主要存在三个进化簇,其中两个簇与广西来源株密切相关。CRF01AE毒株在浙江省内主要以异性性途径和注射吸毒形式传播。 | 姚亚萍 辛若雷 何翔 孟哲峰 潘晓红 郭志宏 杨介者 徐云 邢辉 | 2008 | 中华流行病学杂志2008，29，2： | 7 |
| 9 | 合肥市HIV-1感染者基因亚型和耐药性突变调查与研究显示文摘目的了解合肥地区艾滋病病毒Ⅰ型(human immundeficiency virus 1,HIV-1)基因亚型及耐药性HIV-1的流行情况,为制定防治措施提供科学依据。方法应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 POL区聚合酶基因,经DNA测序后进行进化系统树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与国际耐药数据库比对,辨别耐药性突变位点,结合流行病学资料进行分析。结果收集93例合肥地区HIV-1感染者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列77例,基因分型以CRF01_AE重组亚型为主,有46例(59.7%);其次是CRF07_BC亚型23例(29.9%)、B亚型6例(7.8%)和CRF08_BC亚型2例(2.6%)。耐药分析结果表明,在65例未治疗人群中,发现1例(1.5%)蛋白酶抑制剂(PIs)主要耐药基因突变,2例(3.1%)反转录酶抑制剂(RTIs)耐药基因突变。抗病毒治疗组出现耐药突变位点6例(50.0%)高于非治疗组3例(4.6%)(2=20.21,P<0.001)。结论本研究分析了合肥地区HIV-1基因亚型和耐药突变的流行情况,初步了解合肥地区的HIV-1遗传变异多样性并建立耐药检测体系,对合肥地区的艾滋病预防和控制工作有一定指导意义。 | 钱玉春 类延花 沈月兰 王晓辉 李钰 姚晖 | 2012 | 中华疾病控制杂志2012，16，6： | 5 |
| 10 | 合肥市HIV/AIDS未治疗人群的耐药基因及亚型分析显示文摘目的了解合肥地区HIV/AIDS未治疗人群基因亚型和原发性耐药情况。方法应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 pol区聚合酶基因,经DNA测序后进行系统进化树分析和耐药性分析。结果收集79例合肥地区HIV/AIDS未治疗者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列65例,基因分型以CRF01-AE重组亚型最多39例(60.0%);其次依次是CRF07-BC 21例(32.3%)、B亚型4例(6.2%)和CRF08-BC1例(1.5%)。1例蛋白酶抑制剂(PIs)主要耐药基因突变,2例反转录酶抑制剂(RTIs)耐药基因突变。总耐药突变率为4.6%(3/65)。结论当前合肥市主要的HIV-1流行亚型是CRF01-AE和CRF07-BC,HIV原发性耐药的发生率在国内处于较低水平。 | 钱玉春 类延花 沈月兰 王晓辉 李钰 姚晖 | 2013 | 安徽预防医学杂志2013，19，5： | 5 |
| 11 | 新余市HIV-1流行毒株基因分型及其流行特征分析显示文摘目的了解新余市HIV-1的流行亚型、遗传多样性及其分子流行病学特征,为艾滋病的治疗与预防提供实验室数据。方法随机收集49份血清抗-HⅣ阳性者的血浆标本并提取RNA,逆转录为模版DNA后采用巢式PCR法扩增基因e聊及gag,并对扩增产物进行测序,Blast比对确定基因亚型,构建系统进化树,分析其流行病学特征。结果 49份标本中,扩增出env及gag基因片段18份(36.73%),共发现2种基因型,其中CRF01-AE亚型16份(88.89%)、CRF07-BC亚型2份(11.11%)。两基因构建的系统进化树高度一致,主要是CRF01-AE、CRF07-BC流行。结论新余市至少有2种HⅣ-1基因亚型在流行,都为重组型,其中CRF01-AE为主要亚型。新余市应更加重视HIV-1基因亚型和变异的监测。 | 潘虹 刘芳宇 毛尚根 晏火兰 | 2015 | 中国卫生检验杂志2015，25，8： | 4 |
| 12 | 桂林市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析显示文摘为了解桂林市HIV-1感染者中HIV-1流行毒株亚型的分子流行病学特征,采集桂林市HIV-1感染者的抗凝全血样品42份,分离PBMC并提取DNA,用巢氏PCR方法扩增病毒env基因,并进行序列测定和亚型分析。系统进化分析表明,桂林市HIV-1感染者样品分别属于4亚型:重组型CRF01-AE亚型4份、重组型CRF08-BC亚型15份、重组型CRF07-BC亚型8份和01C亚型3份。可见,桂林市HIV-1感染者中流行毒株主要为CRF-BC,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时制定新的防治策略。 | 蒋就喜 李赫伟 周方 骆安德 徐茹 曾思恩 | 2010 | 广西师范大学学报(自然科学版)2010，28，2： | 4 |
| 13 | 来宾市艾滋病分子流行病学调查显示文摘目的对来宾市HIV-1感染者进行分子流行病学调查,为来宾市艾滋病的防治工作提供实验依据。方法将流行病学方法与分子生物学方法相结合,对来宾市HIV株进行序列测定和亚型分析,总结其传播途径,分析流行毒株特点及各个流行毒株间的关系。结果来宾市HIV感染者以性传播为主,流行毒株存在B、01-AE、CRF-BC3种亚型,其中以CRF-BC流行毒株为主。结论来宾市艾滋病流行形势严峻,HIV-1感染者中以流行重组型亚型CRF-BC为主,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,积极进行行为干预,及时制定新的防治策略。 | 周方 骆安德 蒋就喜 陶田秀 黄甲清 胡婷婷 李赫伟 | 2011 | 热带医学杂志2011，11，4： | 3 |
| 14 | 湖州市不同感染人群HIV-1流行毒株亚型分析显示文摘目的了解湖州市HIV-1型流行毒株的基因型分布情况,为艾滋病防治工作提供科学依据。方法采集204份HIV-1型抗体阳性的全血标本,从样本中提取病毒RNA,采用巢式PCR方法扩增病毒gag基因,对PCR产物进行核苷酸序列测定。应用Clustal W软件对测序结果和HIV分型参考株序列进行多序列比对和分析;使用MEGA 4.0软件进行系统进化分析。结果 204份标本有138份样品扩增出HIV-1的gag基因片段,共存在4种HIV-1亚型和重组型。其中CRF07_BC重组亚型74株(53.62%)、CRF01_AE重组亚型40株(28.99%)、B亚型12株(8.69%)、CRF08_BC重组亚型12株(8.69%)。异性、同性性传播以CRF07_BC和CRF01_AE为主;注射吸毒传播以CRF07_BC为主。结论湖州市不同感染人群中主要存在4种基因亚型,CRF07_BC已成为湖州市不同感染人群中HIV主要流行亚型,重组型毒株占优势,应加强对HIV-1流行毒株亚型变异的监测,及时调整防控策略。 | 吴晓芳 查赟峰 纪蕾 金玫华 董正全 杨中荣 | 2015 | 中国卫生检验杂志2015，25，4： | 3 |
| 15 | 宁夏HIV/AIDS抗病毒治疗人群HIV病毒基因亚型及耐药研究显示文摘目的 调查分析宁夏地区接受抗病毒治疗的艾滋病病人HIV病毒基因亚型和耐药突变流行情况,指导抗病毒药物的选择.方法 收集宁夏地区接受抗病毒治疗的人群中HIV-1感染者的血浆,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和套式聚合酶链反应(Nested-PCR)方法,扩增蛋白酶(PR)基因区和反转录酶(RT)基因区,并对扩增片断进行序列测定和分析,用Mega等软件构建进化树、亚型及耐药研究.结果 共获得17例HIV-1完整的PR和RT基因序列,10例产生15个耐药位点致使7例AIDS耐药,总耐药率为8.3%,其中1份样本产生了核苷类抑制剂(NRTI)和非核苷类抑制剂(NNRTI)耐药性突变,1份样本产生蛋白酶抑制剂(PI)主要耐药突变,4份样本产生PI次要耐药突变;1份样本产生了NRTI耐药性突变,5份样本产生了NNRTI耐药性突变.非核苷类耐药性突变、核苷类耐药性突变和PI次要耐药突变位点分别以V179E、Y181C、V179D、K101E、G190A和M46LM、L10LV、A71 AT为主.结论 宁夏已经出现了针对蛋白酶抑制剂耐药的毒株、核苷类抑制剂和非核苷类抑制剂双重耐药的毒株,有必要对未进行抗病毒治疗的感染者进行耐药监测. | 吴忠兰 杨东智 关光玉 马学旻 陈慧 张蕴惠 詹军 赵伟明 | 2014 | 国际病毒学杂志2014，21，2： | 3 |
| 16 | 福建省MSM哨点监测HIV新近感染影响因素及分子流行特征研究显示文摘目的了解福建省MSM人群HIV新近感染状况,探讨其分子流行特征和相关影响因素,为制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法对福建省2019年MSM哨点监测人群HIV抗体阳性样本采用HIV-1限制性抗原亲和力酶联免疫法(简称LAg-Avidity EIA)进行新近感染检测,用多因素Logistic回归分析其影响因素,通过RT-PCR扩增pol和gag区,利用系统进化树和HIV db Program软件对序列进行基因亚型和耐药突变分析。结果福建省2019年哨点监测MSM人群863人,其中总的HIV抗体阳性率为12.17%(105/863),HIV新近感染率为11.97%;Logistic回归分析显示,样本来源和最近6个月内同性肛交安全套使用频率是新近感染的影响因素;基因亚型以CRF07_BC(47.61%)和CRF01_AE(38.10%)为主,其次为CRF55-01B(9.52%)、B亚型(4.76%);HIV-1耐药率为6.67%(1/15),其中15例对蛋白酶类抑制剂、核苷类逆转录抑制剂均敏感;1例对非核苷类逆转录酶抑制剂efavirenz(EFV)和nevirapine(NVP)产生高度耐药,1例为潜在耐药。结论福建省2019年哨点监测MSM人群HIV新近感染率处于较高水平,多种亚型并存,发现原发耐药株传播,应加强对HIV新近感染者的分子流行特征变化趋势以及原发耐药传播的动态监测,及时调整防控策略,有效控制福建省艾滋病感染与传播。 | 吴守丽 白玛央宗 张春阳 林勋 卢晓丽 王征桦 谢美榕 颜苹苹 陈亮 | 2022 | 中国人兽共患病学报2022，38，5： | 2 |
| 17 | 福建省HIV-1新型独特重组毒株的鉴定分析显示文摘目的了解福建省1型艾滋病病毒(HIV-1)新型重组毒株的出现和传播情况,为艾滋病防治提供有针对性的科学依据。方法对2015年福建省HIV-1分子流行病学调查发现的未明确分型样本进行流行病学特征分析,分三段nested-聚合酶链反应扩增,获得HIV-1近全长基因片段序列。利用MEGA构建系统进化树,Simplot进行重组断点分析,最后通过Recombinant Drawing工具绘制重组镶嵌模式图。结果福建省56份未明确分型样本主要来自沿海经济较发达地区,且集中在文化程度较低的青壮年男性人群,主要以性传播为主。亚型分析显示,其中38份为CRF01-AE/CRF07-BC混合亚型,9份为01B/01-AE/07-BC混合亚型,9份为CRF55-01B/CRF07-BC混合亚型。对3株HIV-1近全长基因序列进行重组分析显示:XM03025是以CRF07-BC为骨架,在1916-2186bp、2786-5526bp、8726-8776bp、9216-9366bp处分别插入4个CRF01-AE的片段;XM03050是以CRF07-BC为骨架,在4916-6256bp处插入1个CRF01-AE片段;而XM06004是以CRF01-AE为骨架,在6490-6680bp、6920-8290bp、8950-9190bp处分别插入3个CRF07-BC片段。经鉴定该三株为新的独特重组型毒株。结论福建省已出现新的独特型重组毒株,并有可能在局部传播流行;应密切监测其流行趋势变化,并积极采取精准干预加以防控。 | 吴守丽 陈艾凡 颜苹苹 严延生 | 2019 | 中国艾滋病性病2019，25，5： | 1 |
| 18 | 龙岩市HIV-1流行株基因亚型流行状况显示文摘目的了解龙岩市HIV-1流行株的亚型分布和传播特点,为HIV疫情防控和AIDS临床诊疗提供依据。方法收集龙岩市2016年1月至2017年6月新发感染HIV患者122例个案信息及血样样本,用描述流行病学方法分析个案信息,并对其血样用巢式PCR法分别对pol区和env区基因片段进行扩增,利用HIV BLAST亚型分析工具对序列进行初步分型。结果122例的亚型样本115例HIV/AIDS中,男88例、女27例,性别比3.3∶1;年龄40~59岁占41.7%(48/115);感染途径主要是性传播;122份样本分别获得合格pol基因序列99份,6种亚型;env基因序列99份,4种亚型,以CRF07_BC和CRF01_AE亚型为主,且以CRF07_BC亚型(55.7%)为优势。结论龙岩市HIV感染者中存在多种重组亚型,AIDS防治工作面临新的挑战,应加大HIV-1基因亚型和重组体的检测和分析力度,及早发现HIV-1流行的基因背景情况,有针对性地采取相应干预措施,以降低HIV的传播率。 | 廖文兰 廖琳虹 张彦锋 阙金财 郑禄祥 陈前进 邢辉 胡靖 | 2020 | 海峡预防医学杂志2020，26，1： | 0 |
| 19 | 艾滋病病毒分子生物学检测技术进展显示文摘目的对艾滋病病毒分子生物学检测技术的进展进行分析探讨。方法在查看了有关文献的基础上,对HIV的生物学特性进行了分析,并对艾滋病病毒分子生物学检测技术的进展进行了总结。结果和结论在HIV感染者中应用分子生物学检测技术,能够及早发现疾病的存在,进而进行及时的治疗,也对治疗艾滋病药物的疗效测评、预测与监测疾病的进程有重要的意义,值得在临床上推广应用。 | 陈恺 何媛媛 | 2016 | 世界最新医学信息文摘2016，0，70： | 0 |
| 20 | HIV-1基因亚型研究进展显示文摘HIV的典型遗传特征之一是高度的遗传多样性,这一特征为艾滋病患者的抗病毒治疗和HIV疫苗的研制带来了困难,然而也为研究人群中病毒的传播和进化提供了有利条件。根据HIV基因序列和氨基酸序列的特征,HIV-1可分为多种亚型。对HIV-1基因亚型的分析,可敏感地提示HIV的流行信息,及早发现新的HW亚型毒株的传播,预测HIV流行趋势,为艾滋病诊断试剂的更新换代、HIV疫苗的研制提供依据,还可用于估计疾病进展及抗病毒药物治疗的敏感性与耐药性,在预防和控制艾滋病方面发挥重要作用。 | 卓丽 唐小平 | 2008 | 国际流行病学传染病学杂志2008，35，5： | 0 |
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