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| 1 | 利用SSR分子指纹和商品信息构建水稻品种身份证显示文摘为方便水稻种子质量的追溯和管理,提出基于SSR分子指纹和商品信息构建水稻品种身份证的新思路。在前期研究基础上,进一步确定了由12个水稻SSR标记构成的核心标记组(每条染色体1个),对127份安徽省审定(或主推)水稻品种进行荧光标记分析,构建供试水稻品种分子指纹,在此基础上,再与品种基本商品信息相结合,并进行数字化编码,构建了127份水稻的品种身份证。该身份证号码组成的第1部分为商品码,代表品种的基本商品信息,包括品种类别、品种选育(或审定)的区域和时间等;第2部分为指纹码,代表水稻品种的分子指纹信息;第3部分为补充码(或特异基因识别码),代表品种的特异基因信息。还对127份水稻品种身份证进行了条码表述(一维码和二维码),以便水稻品种种子的身份标识和溯源管理。 | 陆徐忠 倪金龙 李莉 汪秀峰 马卉 张小娟 杨剑波 | 2014 | 作物学报2014，40，5： | 68 |
| 2 | 利用SSR标记构建萝卜种质资源分子身份证显示文摘为了保护我国特有的优异萝卜资源,促进资源的有效区分和合理利用,保障我国萝卜产业发展,目前需积极开展萝卜种质资源的特异性鉴定和种质识别技术研究。本研究基于SSR分子标记、信息处理和图像处理技术,筛选出22对SSR引物对75份来源和特征不同的代表性萝卜种质进行鉴定,共扩增出153条带,其中多态性条带为87条,平均多态性位点百分率为55.49%,平均每对引物可扩增出6.95条带和3.95条多态性带,有效地显示出每份萝卜种质的特异性。基于最少引物鉴定最多种质的原则,利用MATLAB程序筛选出8对SSR引物,依据8对引物的扩增数据,经过多态性谱带的有序编码转换,构建出75份萝卜种质分子身份证。结果显示利用SSR标记构建萝卜种质分子身份证进行种质资源的鉴定和保护是可行的。 | 邱杨 李锡香 李清霞 陈亦辰 沈镝 王海平 宋江萍 | 2014 | 植物遗传资源学报2014，15，3： | 36 |
| 3 | 130份甘蓝型油菜种质分子身份证的构建显示文摘为准确区别油菜种质,从分布于油菜19个连锁群上的463对SSR引物中,筛选出33对扩增清晰、稳定的多态性引物,并用其分析国内外130份甘蓝型油菜材料,共检测到191个等位变异,每对引物的等位变异数变幅为3~9个,平均为5.787 9;有效等位变异数(Ne)变幅为1.906 8~7.479 0,平均为4.730 7;多样性指数(He)变幅为0.773 8~2.045 1,平均为1.551 5;引物个体识别能力(DP值)变幅为0.389 2~0.862 9,平均为0.742 8;多态信息含量(PIC值)变幅为0.475 6~0.866 3,平均为0.764 0。主坐标分析表明:33对核心引物可以将供试材料明确区分,并按照遗传相似性归为3类。通过逐级筛选,最终确定7对引物(BrGMS075、Na14E08、BrAS084、CB10545、Na14G10、CN57和Ra2E04),将每对引物的扩增产物进行数字标识,构建了130份甘蓝型油菜的品种分子身份证,达到用最少的引物组合区分不同品种的目的。 | 马琳 刘海珍 陆徐忠 倪金龙 张小娟 杨剑波 | 2013 | 中国油料作物学报2013，35，3： | 33 |
| 4 | 基于SSR标记的白化和黄化茶树品种遗传多样性分析及指纹图谱构建显示文摘利用62对SSR引物对16个白化、黄化茶树品种资源的遗传多样性进行了分析,初步明确了不同白化、黄化品种的遗传结构,以及SSR标记在白化、黄化品种鉴定上的适用性,为此类茶树品种资源的鉴定评价提供了理论依据。经过对引物筛选和扩增条带的分析,结果显示:具有多态性的55对引物中,共检测出169个等位基因,每对引物检测出的等位基因数为2~5个,平均为3.07个;多态信息含量(PIC)和Shannon信息指数(I)的平均值分别是0.40和0.79;169个等位基因出现频率在3.12%~96.88%之间;16个参试品种的遗传距离在0.086~0.532,品种间遗传结构差异明显;当D≈0.18时,可将16个品种划分为3类,其中大部分亲缘关系相近或地理位置一致的品种聚为一类。此外,笔者根据不同引物的等位基因带型构建了16个白化和黄化茶树品种的分子指纹图谱,并筛选出3对核心引物(TM156、TM508、MSG0380)用于不同白化、黄化茶树品种的鉴定。 | 王松琳 马春雷 黄丹娟 马建强 金基强 姚明哲 陈亮 | 2018 | 茶叶科学2018，38，1： | 32 |
| 5 | 利用InDel标记鉴定水稻育种材料的籼粳属性显示文摘准确高效鉴定水稻材料的籼粳属性对于开展水稻籼粳亚种间杂种优势利用有着重要意义。利用19对基于籼稻(9311)和粳稻(日本晴)全基因组DNA序列比对获得的差异片段而设计的特异插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)引物,对48份育种上常用的籼稻、粳稻和中间型材料(品种)进行了InDel标记的籼粳属性分析,利用DNA样品在这19对InDel位点上的籼型或粳型基因频率,结合聚类分析和主成分分析,确定了这些材料的籼粳属性,通过比对程氏指数法的籼粳鉴定结果检验了InDel分子标记法在水稻籼粳属性鉴定上的有效性。结果表明,InDel分子标记法与传统的程氏指数法的总体吻合率为89.58%,在典型籼稻或典型粳稻材料上两者的吻合率为100%;在具有复杂遗传背景的中间型材料上,InDel分子标记法比程氏指数法具有更高的准确性。因此,InDel分子标记法是真正鉴定籼粳的特异方法,比传统方法具有更高的灵敏性和准确度,可以用于籼粳属性鉴定及遗传分化研究。 | 王林友 张礼霞 勾晓霞 祁永斌 金庆生 王建军 | 2013 | 核农学报2013，27，7： | 28 |
| 6 | 我国冬瓜和节瓜种质资源的研究现状及建议显示文摘冬瓜及其变种节瓜原产我国南部地区,是我国传统的重要菜药兼用型蔬菜品种,现广泛分布于亚洲的热带、亚热带和温带地区。目前我国国家种质资源库中保存的冬瓜和节瓜种质资源分别只有299份和69份,且仅对几个种质特征进行了简单描述,许多重要的种质特征信息尚为空白,种质资源的遗传多样性也众说不一。建议今后我国冬瓜和节瓜种质资源研究应重点开展以下几个内容:(1)搜集与抢救散落在民间的大量冬瓜、节瓜种质资源,扩充国家种质资源库;(2)系统、完整地对冬瓜、节瓜种质资源的特征特性进行鉴定;(3)创建我国冬瓜、节瓜种质资源的分子身份证产权保护系统;(4)鉴别和区分冬瓜种质资源中的同名异物或同物异名资源,构建核心冬瓜、节瓜种质资源库。 | 周胜军 陈新娟 朱育强 陈丽萍 张鹏 | 2014 | 植物遗传资源学报2014，15，1： | 21 |
| 7 | 分子标记技术在农作物品种鉴定上的研究进展及未来展望显示文摘概述了以AFLP、ISSR、SRAP以及SSR等4种主要的分子标记技术在农作物品种鉴定上的研究进展,提出了SSR将是未来利用分子标记技术鉴定品种纯度以及品种DUS测试的首选分子标记技术。同时介绍了在快速鉴定品种纯度上的研究进展,并预测未来利用互联网技术将分子标记指纹图谱和农作物品种形态学特征相结合实现品种快速检索、不同品种之间数字指纹比对以及比对信息快速输出以实现品种的快速鉴定,实现在农作物任何生长期均可达到快速鉴定品种纯度和真实性的目的,促进农作物品种权的保护以及中国种业的健康发展。 | 吴则东 江伟 马龙彪 | 2015 | 中国农学通报2015，31，33： | 17 |
| 8 | 吉林省新育成大豆品种SSR指纹图谱身份证的构建显示文摘为快速鉴定和准确评价大豆新品种,以吉林省98个大豆品种为材料,从大豆20个连锁群上均匀分布的320对SSR标记引物中初筛出12对扩增稳定、条带清晰、多态性高的引物,为以最少引物组合有效区分品种,揭示参试材料间丰富的遗传多样性,又进一步依据每对引物多样性指数的高低,复筛出了由7个SSR标记构成的核心引物组合,并最终以此构建吉林省近年育成大豆品种的SSR指纹图谱身份证。结果表明:98个参试大豆品种都有唯一的指纹图谱身份证代码,说明所选用的7个SSR核心标记可靠且有效;此外,以SSR标记扩增的整体带型作为编码依据能够有效提高大豆品种指纹图谱身份证构建的准确性。本研究完善了大豆品种指纹图谱身份证技术体系,能够满足当前吉林省乃至全国大豆品种分子鉴定的需求。 | 陈亮 郑宇宏 范旭红 孟凡凡 孙星邈 张云峰 王明亮 王曙明 | 2016 | 大豆科学2016，35，6： | 16 |
| 9 | 小麦SSR指纹图谱及品种身份证的构建——基于毛细管电泳分析显示文摘为解决小麦品种区分难的问题,以黄淮海和长江中下游地区160个小麦主栽品种为试验材料,经初筛和复筛,从分布于小麦21个连锁群的105对SSR引物中,筛选出21对稳定、多态性高的引物(每条染色体上各选取1对)。对供试小麦品种进行SSR荧光标记的毛细管电泳分析,获取其SSR分子指纹信息,并与品种基本商品信息结合,进行数字化编码,构建了160个小麦的品种身份证,实现小麦品种信息唯一性、通用性、可识别性和可追溯性的统一,为小麦种子的质量追溯和管理提供便利,同时为种子市场的知识产权保护提供科学依据。 | 秦瑞英 许学 张立平 李莉 方钰 汪秀峰 倪金龙 陆徐忠 杨剑波 | 2017 | 中国农学通报2017，33，34： | 15 |
| 10 | 东南亚62个籼型水稻亲本SSR遗传多样性分析显示文摘为探讨东南亚水稻亲本间的遗传多样性,以东南亚62份籼型水稻亲本为材料,选择29对水稻功能基因标记以及平均分布于12条染色体、多态性较高和条带清晰的72对SSR引物进行遗传多样性和聚类分析。结果表明,32对多态性引物在62份水稻材料中检测到201个等位基因,每个位点等位基因数(Na)变异范围为2-12,平均为6.281;有效等位基因数(Ne)变异范围为1.067-5.399,平均为2.867;多态信息含量(PIC)变异范围为0.061-0.789,平均为0.515;平均Shannon信息指数(I)为1.176,变幅为0.143-1.908;观察杂合度(Ho)为0.977,范围为0.936-1.000;期望杂合度(He)为0.439,范围为0.179-0.937;固定指数(Fis)的范围为0.882-1.000;基因流(Nm)的范围为0-0.0157。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.805处,东南亚水稻亲本被分为6大类,同一国家大多数品种聚为一类。相对于普通分子标记,功能基因标记的平均等位基因数不高,其遗传多样性参数也低于普通分子标记,东南亚各国水稻品种间的亲缘关系较近,遗传多样性程度较低。研究结果为水稻育种亲本选配、新种质资源的创制以及杂种优势利用等提供了科学依据。 | 从夕汉 施伏芝 阮新民 张效忠 罗志祥 | 2016 | 核农学报2016，30，5： | 14 |
| 11 | 大豆SSR指纹图谱身份证的研究进展与展望显示文摘随着新育成大豆品种数量的不断增加以及分子生物学技术的发展,指纹图谱身份证的构建逐渐成为当今品种鉴定的重要技术手段。文中综述了SSR指纹图谱身份证技术在大豆品种鉴定方面的应用进展;综合分析了当前SSR指纹图谱身份证构建技术存在的问题,并提出相应的改进方向,以期为科学快速准确地鉴定大豆品种,评价种质资源和解决品种产权纠纷提供参考依据。 | 陈亮 郑宇宏 范旭红 孟凡凡 孙星邈 张云峰 王明亮 王曙明 | 2015 | 大豆科技2015，，2： | 13 |
| 12 | 2012年北方春大豆国家区试大豆品种纯度鉴定、分子ID构建及遗传多样性分析显示文摘为了鉴定北方春大豆组国家区域试验大豆品种的纯度、构建参试大豆品种的分子ID及品种间遗传关系分析,从而有效地指导中国北方春大豆新品种的选育和推广。通过对参加2012年北方春大豆国家区试的94份大豆材料用分布在大豆基因组8个连锁群的13对SSR标记进行分析。结果表明:94份参试大豆品种纯度分布范围为53.85%-100%,平均纯度为99.02%;利用Satt231、Satt288、Satt160、Satt193和Sat-092这5对引物可以将94份参试大豆品种区分开,并获得唯一的分子ID;94个参试大豆品种间遗传相似系数为0-0.846,平均相似系数为0.2783,说明参试大豆品种间遗传差异性较大。通过SSR标记分析,可以有效地鉴定参试大豆品种的纯度、建立参试大豆品种的分子ID及实现品种间遗传关系分析。 | 何琳 何艳琴 刘业丽 邱强 栾怀海 韩雪 胡国华 | 2014 | 中国农学通报2014，30，18： | 9 |
| 13 | 新疆早熟陆地棉SSR标记遗传多样性分析及指纹图谱构建显示文摘采用SSR分子标记对41份北疆地区早熟陆地棉品种进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。最终100对引物筛选出8对多态性较好引物,共检测50条带,其中多态性33条,多态性比率66%,每对引物平均扩增到6.25条条带。多态信息含量(PIC)为0.568 0~0.784 6,平均值为0.646 2。聚类分析表明,供试材料在遗传距离为0.42时可划分为3类,第3大类又可以划分为2大亚类,多数品种属于第3大类。利用其中7个特异性标记引物获得的数据构建供试材料的分子指纹图谱。新陆早系列在选育过程中亲本的来源较为广泛,遗传背景较复杂,获得的SSR分子指纹图谱能够用于新疆早熟陆地棉品种及相关材料的鉴定。 | 叶春秀 李全胜 李有忠 庄振刚 谢宗铭 | 2015 | 西北农业学报2015，24，2： | 8 |
| 14 | 基于InDel分子标记的20个水稻品种的籼粳属性分析显示文摘水稻品种的籼粳属性分析是培育高产优质杂交水稻亲本选择的重要依据之一。本研究以93-11与日本晴分别为籼粳稻参考标准,利用均匀分布于水稻基因组12条染色体并具有较高籼粳特异性的37对In Del分子标记,对20份水稻育种材料进行In Del标记的籼粳属性分析。结果表明:所选取的20份水稻材料中,有8份为典型籼稻,3份为典型粳稻,4份为偏籼类型,另有5份为偏粳类型。NTsys聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.43处,20份水稻材料被分为两大类群;在遗传相似数为0.70处,所有水稻材料则被分为4个类群。 | 孙惠敏 夏米 陈清玲 张凯歌 司二杰 郑卓 | 2016 | 井冈山大学学报(自然科学版)2016，37，6： | 8 |
| 15 | SSR标记对甜瓜杂交种‘众天翠雪’纯度的鉴定显示文摘旨在筛选能够用于甜瓜杂交种纯度和真实性鉴定的SSR引物。利用公认的18对多态性较好的甜瓜SSR(Simple Sequence Repeats)引物对甜瓜杂交种'众天翠雪'及其亲本进行多态性筛选,并在杂交群体中进行验证。13对引物在亲本间具有多态性条带,经过多次重复,筛选到2对引物在亲本间具有多态性、子代中兼具双亲条带,并且在子代群体中检测结果与田间形态鉴定结果一致。引物RF151和RF144能够作为‘众天翠雪’杂交种纯度鉴定的特异引物进行纯度检测。作为共显性标记特性的SSR分子标记可以作为杂交种纯度鉴定的重要工具。 | 赵光伟 欧点点 贺玉花 徐志红 孔维虎 张健 王平勇 徐永阳 | 2017 | 中国农学通报2017，33，9： | 8 |
| 16 | 基于SSR标记的葡萄品种鉴别和指纹图谱构建显示文摘本研究基于SSR标记技术,对山西省农业科学院果树研究所自育葡萄品种及其亲本进行分子鉴别,并建立其对应的指纹图谱。供试材料为山西省农业科学院果树研究所9个自育葡萄品种及其7个亲本,采用国际通用的SSR荧光标记引物进行扩增,毛细管电泳进行基因分型,品种鉴别及构建指纹图谱。从44对SSR引物中筛选出15对特异性引物用于随后的SSR扩增,共扩增出56条条带,其中多态性条带51条,多态性百分率为94.4%。SSR扩增结果分析表明,16份葡萄种质遗传距离的变异范围为0.068 7~0.919 1。UPGMA聚类分析表明,15对SSR标记不仅可用于不同亲本、不同种群、不同亚属间的亲缘关系鉴定,更可用于相同亲本近缘姊妹系品种及其亲本间的鉴别。该SSR指纹图谱的建立,可为中国葡萄品种的种质资源数据库的完善,近缘品种鉴别以及品种保护提供参考依据。 | 董志刚 李晓梅 谭伟 赵旗峰 王敏 黄丽萍 刘伟 马小河 杨兆亮 唐晓萍 王兰 | 2018 | 分子植物育种2018，16，11： | 8 |
| 17 | 基于SSR标记构建中国芍药品种资源分子身份证显示文摘【目的】利用SSR标记区分中国芍药品种,为芍药资源的保护与合理利用奠定基础。【方法】对山东菏泽和河南洛阳2个主要芍药栽培地的品种进行调查,明确中国芍药品种资源数量,在此基础上,提取各品种叶片DNA,利用21对SSR荧光引物进行PCR扩增,用四重荧光毛细管电泳技术检测扩增片段长度。利用Microsatellite和Toolkit GenALEx 6.41软件,分析数据中的等位基因数、多态性信息含量(PIC)和遗传多样性参数。采用数字与大小写字母结合的方法,对不同长度的扩增片段进行赋值,构建中国芍药品种分子身份证。【结果】山东菏泽和河南洛阳目前共有芍药品种268个,用21对引物在这些品种中共扩增条带613条,多态信息含量0.508~0.846,平均为0.707;有效等位基因数(Ne)为4.324±0.315,观测杂合度(Ho)为0.593±0.047,期望杂合度(He)为0.741±0.020。采用21对SSR引物可将所有268个芍药品种区分开。【结论】采用21对引物通过SSR标记建立了山东菏泽和河南洛阳268个芍药品种的分子身份证,有助于芍药品种鉴别、新品种培育及防止资源流失。 | 万映伶 张嘉 刘爱青 张孔英 刘燕 | 2018 | 西北农林科技大学学报(自然科学版)2018，46，12： | 7 |
| 18 | 长江流域片国家区试大豆品种分子ID构建及遗传多样性分析显示文摘以长江流域片国家区域试验的45份大豆品种为材料,选择分布在大豆基因组8个连锁群的13对SSR标记进行分子ID构建及遗传多样性分析。结果表明:利用Satt138、Satt514、Satt231、Satt380、Satt442和Satt369这6对引物可以将45个参试大豆品种区分开,并获得唯一的分子ID;参试大豆品种间遗传相似系数为0~1.00,平均相似系数为0.4424,结果说明长江流域片国家区试大豆品种间遗传同源性较小,差异性较大。 | 何琳 何艳琴 刘业丽 杨中路 栾怀海 韩雪 蒋洪蔚 刘春燕 胡国华 | 2014 | 黑龙江八一农垦大学学报2014，26，3： | 6 |
| 19 | 基于DNA指纹建立农作物品种身份证的方法探析显示文摘为解决种子生产、经营和知识产权保护中存在的突出问题,本文提出了构建农作物品种身份证及建立品种身份证制度。在借鉴人类身份证建立模式基础上,将品种的商品信息、指纹信息及特异基因信息相结合,构建农作物的品种身份证。农作物品种身份证由3部分构成:第1部分称为商品码,反映作物及品种类别、品种选育(或审定)的区域和时间等,预设14位阿拉伯数字(或字母);第2部分称为指纹码,反映品种的DNA指纹信息,依据作物类型不同预设20~40位阿拉伯数字(或字母);第3部分称为补充码(特异基因识别码),反映品种的特异基因信息,设计为字母"T"(转基因育种)、"S"(分子育种)和"M"(诱变育种)等,加上被导入、渗入或诱变的基因名称;身份证总位数约50位。采用本方法编码的农作物品种身份证,具有准确性高、通用性强及可追溯性等特点,对我国农作物品种的科学识别和管理具有十分积极的意义。 | 陆徐忠 马琳 倪金龙 张小娟 杨剑波 | 2014 | 中国农学通报2014，30，9： | 6 |
| 20 | 部分常用水稻品种的指纹图谱构建和遗传多样性分析显示文摘以不同类型的90份常用水稻品种为材料,利用筛选的19对SSR多态性引物构建了其指纹图谱,并分析了其遗传多样性。结果表明,19对SSR引物在90份水稻材料中共扩增出71个多态性片段,每个SSR位点可检测到2~7个等位基因,平均为3.74个;多态信息含量(PIC)值在0.228 3~0.790 6之间,平均值为0.542 1;Shannon信息指数(I)在0.244 9~1.796 1之间,平均值为1.021。聚类分析表明,90份材料的遗传相似系数在0.59~1之间,以遗传相似系数值0.66为阈值,可以将供试材料分成5个群,聚类结果较好地体现了各品种之间的亲缘关系。 | 姚栋萍 刘春林 甘玉姿 辛业芸 | 2016 | 杂交水稻2016，31，2： | 6 |
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