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| 1 | 黄麻应用核心种质的DNA分子身份证构建显示文摘构建并研究黄麻应用核心种质是促进黄麻遗传育种和挖掘优异基因的必要途径。在300份黄麻种质资源的农艺性状观察统计基础上,构建了黄麻应用核心种质,包含61份品种(系),可划分为高产、优质、抗病等16种应用类型。为准确鉴定这61份应用核心种质,以46对核心引物为基础,筛选出12对荧光核心引物,采用荧光标记毛细管电泳分析这12对引物的多态性,共检测出140个多态性位点。将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,选取了12对荧光核心引物的组合,构建出该应用核心种质的字符串DNA分子身份证,进而构建了相应的条形码和二维码DNA分子身份证,可迅速被电子设备识别。这些结果可促进黄麻种质资源的高效利用及快速分子鉴定。 | 郭艳春 张力岚 陈思远 祁建民 方平平 陶爱芬 张列梅 张立武 | 2021 | 作物学报2021，47，1： | 20 |
| 2 | 利用SSR构建甜菜品种的分子身份证显示文摘为了实现快速鉴定甜菜品种真实性以及纯度的目的,本研究利用SSR分子标记技术对国内已登记的部分甜菜品种进行了指纹图谱构建。利用17对带型清晰、重复性好、多态性高、易于识别的引物作为核心引物对39份甜菜品种的基因组DNA进行扩增。结果表明,只需利用以下5对核心引物:LNX38、LNX95、SB06、SSD6和SB13,便可完全鉴别出39个甜菜品种。利用SSR引物构建甜菜品种的分子身份证,真正达到了快速、高效地鉴定品种纯度以及真实性的目的,也更有效地维护了甜菜品种市场的秩序,并保护了育种家的利益。 | 栗媛 王茂芊 邳植 吴则东 | 2019 | 中国糖料2019，41，4： | 11 |
| 3 | 甜菜品种SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析显示文摘筛选出20对多态性高、带型清晰、重复性好的SSR标记引物对供试甜菜品种进行PCR扩增,根据扩增产物构建SSR指纹图谱,并分析其遗传多样性。结果显示,共检测出112个等位基因,平均每对引物5.6个,利用获得的等位基因计算遗传距离,107个品种的遗传距离变化范围在0.065~0.467之间,平均遗传距离0.298。Shannon’s多样性指数变异范围0.78~2.90;PIC值介于0.08~0.83;Nei’s指数介于0.39~1.87。利用类平均法(UPGMA)进行聚类分析,可将107个甜菜品种分为2个类群。类群Ⅰ29个品种,类群Ⅱ78个品种。类群Ⅰ和Ⅱ又可分为多个亚群。结果表明,每个甜菜品种有区别于其他品种唯一的数字指纹,说明用于试验的20对SSR标记适用于甜菜品种真实性的鉴定,同时甜菜品种指纹图谱库的构建也为甜菜品种鉴定提供技术基础。 | 丁刘慧子 邳植 吴则东 | 2021 | 作物杂志2021，，5： | 7 |
| 4 | 利用SSR分子标记构建甜菜登记品种的分子身份证显示文摘通过构建111份甜菜登记品种的分子身份证,促进甜菜品种DUS测试标准体系的建立,实现甜菜品种的快速检索与比对,为甜菜品种指纹鉴定和溯源管理提供理论依据。利用22对简单重复序列(SSR)核心引物,基于最适的取样策略对来自国内外不同地区的111份甜菜登记品种进行遗传多样性分析以及分子身份证构建。结果显示,22对引物共检测到101个等位基因,每对引物检测出3~7个等位基因,平均为4.59个;Shannon多样性指数(I)为0.60~1.73,平均为0.95;Nei s期望杂合度(H_(e))为0.41~0.79,平均为0.56;PIC值范围为0.91~0.99,平均值为0.96,22对引物可用于区分甜菜品种。利用UPGMA聚类分析,22对引物将111份材料划为3个类群(G1~G3),聚类结果大致与其地理来源一致;通过获得的等位基因计算遗传距离,111份甜菜品种的遗传距离范围为0.059~0.564,平均值为0.325,甜菜品种间具有一定的遗传多样性。基于最少引物区分最多品种的原则,通过UPGMA聚类分析,仅用6个SSR引物组合可将全部材料区分。结果表明,基于6对SSR引物扩增的结果,通过数字与英文的形式,使用在线二维码软件构建的111份甜菜登记品种的分子身份证,丰富了甜菜品种指纹图谱的可视化形式,从而提高了品种鉴定的效率,保护育种者及消费者权益。 | 王宇晴 李乔乔 阚文亮 邳植 吴则东 | 2022 | 江苏农业科学2022，50，18： | 6 |
| 5 | 山东核桃良种SSR指纹图谱及分子身份证的构建——基于毛细管电泳分析显示文摘通过分析山东省内核桃良种的遗传背景,并构建其分子身份证,以期为核桃品种的选育、良种的质量追溯提供技术支持。本研究以17个核桃品种为试材,利用荧光SSR分子标记方法构建其指纹图谱,在分子层面进行数据分析。17个核桃品种间Nei’s遗传距离0.181~0.720,遗传相似系数0.267~0.867;筛选出5对SSR核心引物构建品种的指纹图谱,核心引物可分成HF9+HF15,HF3+HF9+HF14两组,每组均可完全区分17个品种;以指纹图谱为基础,与商品信息结合,数字化编码生成核桃品种分子身份证。17个核桃品种遗传基础较广,其聚类结果与地理位置相关性不大;5对核心引物多态性较好,可用于构建核桃指纹图谱;编码生成的分子二维码为核桃良种鉴定提供基础。 | 梁燕 韩传明 周继磊 孙超 王翠香 李春明 王静 闵旭峰 公庆党 孟晓烨 杨绪强 | 2022 | 中国农学通报2022，38，15： | 5 |
| 6 | 水稻功能性插入缺失标记(InDel)的筛选与应用显示文摘开展水稻品种纯度和真实性鉴定对水稻遗传育种和种子生产有着重要的意义。以245个长江中下游主推水稻品种为研究材料,从643个插入缺失(InDel)位点中筛选出124个功能性多态性位点,建立了InDel高效检测体系。进一步利用InDel标记vf0121641804和SSR标记RM7120分析水稻样品的纯度,同时选用覆盖12条染色体的24对InDel引物和48对SSR标准引物分析水稻品种真实性,结果表明,采用InDel标记检测水稻品种纯度和真实性的结果与采用SSR标记检测结果一致,说明水稻功能性InDel标记也可用于水稻品种纯度和品种真实性的鉴定。在此基础上,鉴定了245个水稻品种124个InDel标记的基因型遗传多样性并进行了聚类分析,结果表明,水稻材料间存在明显的群体结构,基本反映了不同品种间的亲缘关系。水稻功能性InDel标记的筛选与应用,不仅为品种纯度和真实性鉴定、遗传多样性分析提供了新方法;而且可用于分子辅助育种,提高强优势组合的预见性。 | 王钰 马卉 许学 秦瑞英 杨剑波 汪秀峰 | 2019 | 作物杂志2019，0，4： | 5 |
| 7 | 73份紫心甘薯品种SSR标记指纹图谱构建显示文摘随着人们生活水平的提高,紫心甘薯因其具有较高的营养和保健价值越来越受到人们的欢迎.本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选到2对多态性好的SSR引物XZSSR15和XZSSR63.利用毛细管电泳技术对筛选到的引物进行多态性检测,共检测出35个位点,每个位点均具有多态性,每对引物平均多态性位点数17.5个,引物平均多态信息含量(PIC)为0.604 3,Shannon多样性指数(I)为0.354 5,Neil多样性指数(H)为0.223 6.利用2对引物构建73份紫心甘薯品种的SSR指纹图谱,通过分析遗传相似性系数和0,1指纹图谱,发现2对SSR引物可以将73份紫心甘薯品种完全区别开来. | 高闰飞 苏在兴 后猛 唐维 刘旋旋 闫会 王欣 刘亚菊 张允刚 马代夫 李强 | 2019 | 江苏师范大学学报(自然科学版)2019，37，1： | 5 |
| 8 | 104个甘薯品种的cpSSR指纹图谱构建及遗传多样性分析显示文摘基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,单条引物平均扩增的条带数为5.27,平均多态性百分率为81.03%。根据引物在甘薯材料中的扩增结果,构建104个甘薯品种的指纹图谱。对104个甘薯品种的扩增结果进行聚类分析,每个品种间的遗传距离为0.0386~5.2723,平均遗传距离为0.2201,在遗传系数为0.74时将104个甘薯品种分为5组。 | 王崇 王连军 杨新笋 雷剑 柴沙沙 张文英 焦春海 田小海 | 2021 | 热带作物学报2021，42，6： | 4 |
| 9 | 籽用美洲南瓜种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建显示文摘利用20对SSR引物分析48份籽用美洲南瓜种质的遗传多样性并建立指纹图谱,为籽用美洲南瓜种质的亲本选配、保护和鉴定提供依据。结果显示,这20对引物在48份籽用美洲南瓜种质中扩增出115条具有多态性的等位基因,位点的Shannon信息指数(I)均值为1.36、遗传多样性指数(H)均值为0.69、多态性信息指数(PIC)均值为0.63。聚类分析显示,20对SSR引物可将48份种质从0.659相似系数水平上分成两大类。其中,第Ⅰ类包含46份种质,在遗传相似系数为0.679处又将其分为3个亚类。第一亚类包含来自内蒙古巴彦淖尔市的15份种质和来自甘肃的18份种质,第二亚类包含来自新疆的10份种质,第三亚类包含来自山西的3份种质。第Ⅱ类包含了来自内蒙古呼伦贝尔市的2份种质。综合各项指标筛选出5对SSR核心引物将48份籽用美洲南瓜种质完全区分并构建了指纹图谱。 | 张颖 王萍 李二娜 田晓春 陈鹏 | 2022 | 中国瓜菜2022，35，6： | 2 |
| 10 | 八倍体草莓DNA指纹图谱的构建与初步遗传分析显示文摘为对草莓品种进行分子鉴定,从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物,采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析,检测每个标记等位变异大小,并进行初步遗传分析。将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标注,为了简化编码,引物P1~P18分别编号为字母A~R,将引物编号与相应的带型编码进行组合得到该样品在特定引物的扩增产物编码,按照18对引物顺序串联这些编码形成该品种的DNA指纹图谱。结果表明:18对SSR引物共扩增得到多态性条带150个,不同引物扩增到多态性条带数4~17个,共检测到377个带型;各引物的多态性信息含量(PIC)值为0.494~0.908,平均值为0.738;利用18对SSR引物共构建了84个草莓品种的DNA指纹图谱。聚类分析结果表明:在遗传相似系数为0.99时能将所有品种区分开,一些来源相同的品种被优先聚在一起。综上,本研究成功构建84个草莓品种的DNA指纹图谱,这些品种遗传关系较近。 | 刘国霞 张全芳 杨雪 谭晴晴 胡悦 范阳阳 姚川 崔刚 步迅 陈雪燕 刘炳福 | 2023 | 中国农业大学学报2023，28，2： | 2 |
| 11 | 黑龙江省水稻品种的遗传多样性显示文摘为了研究黑龙江省当前水稻品种的遗传基础及其亲缘关系,利用农业行业标准《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法(NY/T 1433—2014)》中公布的47对SSR标记,对来自黑龙江省不同积温区的231份水稻品种进行遗传多样性分析。结果显示:47对SSR标记在231份水稻中共检测到136个等位基因,每个位点等位基因变幅为2~5个,平均2.92个;基因多样性变幅为0.11~0.79,平均0.56;多态性信息量(PIC)变化范围为0.11~0.76,平均0.49;标记指数(MI)的变化范围在3.18~18.39,平均6.52。聚类分析将231份水稻分为3类7群,聚类结果与主成分分析结果一致。综上所述,黑龙江省水稻品种遗传多样性不够丰富(平均PIC值为0.49),同一积温区品种间亲缘关系较近。育种中注意南北部品种的杂交,以便拓宽遗传背景,培育出绿色优质高产新品种。 | 张佳琦 郭宗珊 刘长华 李荣田 | 2022 | 中国农学通报2022，38，17： | 1 |
| 12 | 52个马铃薯遗传多样性分析及SSR分子身份证构建显示文摘马铃薯(Solanum tuberosum L.)种质资源遗传多样性评价是开展遗传育种的前提和基础,为探究马铃薯种质资源的遗传背景,进而为新品种的选育提供育种材料。以52个马铃薯品种(系)为研究材料,采用SSR标记分析亲缘关系,进而评价其遗传多样性,并构建指纹图谱。从25对SSR引物中筛选出多态性丰富、稳定性好的16对引物,并对52份马铃薯品种(系)进行SSR扩增分析,16对SSR引物扩增出147个多态性条带,引物平均多态条带比率为64.71%,平均Nei’s遗传多样性(Nei’s genetic diversity,H)和平均Shannon’s指数(Shannon index,I)分别为0.14和0.24。在遗传相似系数0.23处,52份材料经聚类分析分为3大类,类群Ⅰ包括49个品种(系),46个是北方品种(系),3个国外引进品种(系),均适宜晋北地区种植;类群Ⅱ包括2个品种,‘北方016’和‘晋薯16号’,特点是薯皮黄色、干物质含量高;类群Ⅲ仅包括‘晋薯15号’,在大类的划分上未按照地理来源进行聚类。在遗传相似系数0.36处,类群Ⅰ又可以分为7个亚类。基于最少引物鉴定最多种质的原则,利用C59、S25、C33、S151共4对引物组合可区分全部供试品种,构建出基于SSR标记的数字化指纹图谱及分子身份证。利用SSR标记技术多态性引物可以评价马铃薯种质资源的遗传多样性,通过分子身份证能够准确鉴别以及溯源不同马铃薯品种(系)。 | 安苗 王彤彤 付逸婷 夏俊俊 彭锁堂 段永红 | 2023 | 生物技术通报2023，39，12： | 1 |
| 13 | 94份谷子核心种质资源分子身份证构建显示文摘为科学准确的鉴别谷子种质资源,加强对谷子种质资源管理和新品种保护。筛选出33对SSR标记对94份谷子种质资源进行了分子身份证的构建。从分布在谷子9条染色体上的500多对SSR标记中,筛选出33对多态性标记扩增国内外94份谷子种质资源,检测到203个多态性片段,每对标记的等位基因数为3~10,平均为6.2个。标记位点的多态信息含量(PIC)变幅为0.429~0.864,平均为0.740。品种间特异指数差异较大,为63.336~268.523,平均为189.000。结果表明,根据标记的等位基因数确定10对分子标记b185、b260、b224、b103、b225、CAAS1044、b186、b253、b105、CAAS3008组合,即可将94份核心种质资源完全区分开。 | 李海权 降彦苗 刘亚男 耿玲玲 韩小洁 刘国庆 董立 | 2023 | 华北农学报2023，38，S01： | 0 |
| 14 | 魔芋种间分子鉴定的SSR标记开发显示文摘魔芋属(Amorphophallus)属于天南星科多年生草本植物,因其富含葡甘露聚糖,在中国、日本等亚洲国家被作为经济作物种植.虽然我国栽培魔芋的历史悠久,但目前尚未有一种可简单鉴定属内各物种的方法,这对魔芋的种植产业发展造成了一定困难.简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)被公认为作物品种及物种鉴定研究中强大、信息含量丰富的分子标记之一.通过滇魔芋的简化基因组测序数据开发了魔芋种间通用的SSR标记,并基于12个SSR标记对4个魔芋种进行了初步鉴定.结果表明,12个SSR标记的等位基因数(Na)在2~4之间,这批SSR标记可以有效地将滇魔芋和东亚魔芋鉴定出来,但对西盟魔芋和白魔芋的区分度不足.本研究为今后魔芋资源的分子鉴定提供启示. | 高永 | 2022 | 曲靖师范学院学报2022，41，3： | 0 |
| 15 | 应用STR荧光标记法分析大白菜品种遗传多样性显示文摘以19个大白菜品种为试材,采用STR分子标记技术构建烟台地区大白菜种质的指纹图谱与分子身份证。遵循染色体和扩增条带多样性原则,筛选出9对STR荧光标记引物,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和多重毛细管荧光电泳技术进行遗传多样性分析,并构建大白菜种质的STR指纹图谱,将指纹图谱的结果进行编码赋值,进一步构建分子身份证,同时进行品种间遗传关系聚类分析。结果表明,筛选出的9对STR引物具有较好的多态性,可有效区分参试的19个大白菜品种。9对引物共检测到52个等位基因,每对引物检测出3~8个等位基因,平均5.7778个;香农信息指数(I)的变化范围为0.7142~1.6685,平均为1.3787;Nei’s基因多样性指数(H)的变化范围为0.4474~0.7895,平均为0.6927;多态性信息含量(PIC)的变化范围为0.3681~0.7572,平均为0.6442;对STR扩增条带进行分析并编码,成功构建了19个大白菜品种的分子身份证。聚类分析结果显示,在遗传相似系数(GS)为0.66时,参试19个大白菜品种被分成3个类群,具有明显的地域特性。 | 钟世超 李潇萱 樊铭玺 谭浩然 陈晓峰 | 2023 | 中国蔬菜2023，，11： | 0 |
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