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| 1 | 洋葱转录组SSR信息分析及其多态性研究显示文摘采用生物信息学方法分析洋葱(Allium cepa L.)转录组中的SSR位点信息,并设计简单重复序列(SSR)引物,以期为洋葱分子标记辅助育种提供有力工具。利用MISA工具筛选了洋葱转录组测序获得的106 932条unigenes(84.04 Mb),并对其SSR位点信息进行了分析,共筛选得到5 959个SSR位点(占总unigenes的5.10%),其发生频率为1/14.1 kb。SSRs位点中主导类型是以AAG/CTT(占总SSRs的10.20%)为主的三核苷酸重复,占总SSRs的37.27%;其次是单、二核苷酸重复,其出现频率分别为30.91%和24.75%。利用Primer5共设计出5 258对SSR引物。随机选择20对引物进行PCR扩增,其中12对扩增出清晰可重复的条带,9对在24个不同类型洋葱材料中表现出多态性。利用UPGMA作图,将24个洋葱材料分为4类。 | 李满堂 张仕林 邓鹏 侯喜林 王建军 | 2015 | 园艺学报2015，42，6： | 45 |
| 2 | “十二五”我国茄子遗传育种研究进展显示文摘茄子是我国重要的大众蔬菜,'十二五'期间我国茄子遗传育种研究成绩显著:育成70余个商品性好、抗逆、丰产的茄子新品种,在各蔬菜主产区推广应用;筛选和创新出一批优异的茄子种质资源;杂交优势利用等常规育种技术和单倍体诱导、分子标记辅助选择等现代生物育种技术都取得了重要进展。本文综述了近五年我国茄子新品种选育、种质资源评价与创制、育种技术研究等方面取得的主要进展,并对今后我国茄子遗传育种的研究方向进行了展望。 | 连勇 刘富中 田时炳 陈钰辉 张映 | 2017 | 中国蔬菜2017，，2： | 47 |
| 3 | 基于转录组测序的茄子SSR标记开发显示文摘应用Trinity软件对茄子转录组测序数据组装,得到总长度为47919660 bp的45404条Unigenes,MISA从中检索到8316个SSR位点,发生频率为18.32%,平均5.63 kb一个位点。SSR位点中单碱基重复类型最多,为5372个,占到64.60%;其次为三碱基重复1628个,占到19.58%。三碱基重复中AAG/CTT是优势重复单元,占三碱基重复数的31.6%;二碱基重复中AG/CT是优势重复单元,占二碱基重复数的42.3%。利用Primer 3设计引物,共得到858对SSR引物,随机选取100对引物对17份茄子材料进行扩增,结果表明:有84对可以扩增出条带清晰的片段,有47对引物扩增片段为多态性片段。对47对多态性引物进行分析,多态性信息含量范围为0.10-0.64,平均多态性信息含量为0.32,UPGMA聚类分析可将17份材料分为3类。以上结果表明,基于茄子转录组测序开发的SSR标记可以为茄子的遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更加丰富的标记来源。 | 魏明明 陈钰辉 刘富中 张映 连勇 | 2016 | 植物遗传资源学报2016，17，6： | 32 |
| 4 | 基于茄子基因组重测序的InDel标记开发及应用显示文摘茄子是我国重要的蔬菜作物,然而相比于其他茄果类蔬菜,分子标记在茄子中的应用较少。本研究基于2份在果实与抗性上存在显著差异的茄子的全基因重测序数据,鉴定出151327个InDel位点,随机选择并设计了180个InDel标记,利用重测序材料及其杂交一代进行有效性鉴定,结果显示:180个InDel标记均可获得PCR扩增产物,其中62个标记具有多态性,多态率为34.7%。基于62个InDel标记聚类分析结果揭示出24份紫红长茄自交系的遗传多样性,其中46个标记表现出多态性,每个标记的Nei′s基因多样性指数在0.0799~0.4991之间,Shannon′s多样性指数分布在0.1732~0.6923之间。基于24个InDel标记聚类分析结果揭示出143份茄子品种的遗传多样性,在遗传相似系数0.65处,143份茄子品种大体可以分为Ⅰ~Ⅶ七大类群。基于2对InDel标记的茄子品种纯度鉴定结果与田间鉴定结果相吻合。 | 吉康娜 郅俊杰 林丹妮 颜爽爽 田时炳 曹必好 邱正坤 | 2019 | 植物遗传资源学报2019，0，5： | 21 |
| 5 | 利用SSR分子标记技术鉴定和分析茄子杂种F_1的纯度显示文摘【目的】分析、鉴定茄子杂种F1纯度,为提高茄子杂交育种效率提供参考依据。【方法】在育苗期,采用SSR分子标记技术对栽培茄×栽培茄正、反杂交种和野生茄×栽培茄杂交种进行纯度鉴定及亲缘关系分析。【结果】从124对SSR引物中筛选出15对在亲本间存在差异、扩增稳定、条带清晰的引物;从210株杂种F1单株中共鉴定出208株真杂种,杂种纯度为99.0%,鉴定结果与田间性状调查结果一致;栽培茄×栽培茄正、反交组合的F1与亲本的亲缘关系均较近,遗传关系差别微小;野生茄×栽培茄组合的F1与父本的亲缘关系均较远,且表现出偏母本遗传。【结论】SSR分子标记技术能快速、准确鉴定茄子杂交后代的纯度,可作为分子标记辅助育种手段用于指导选择符合茄子育种目标的优良杂交品种选育。 | 王艳娜 王益奎 李文嘉 蒋雅琴 吴永官 黎炎 康德贤 | 2015 | 南方农业学报2015，46，9： | 16 |
| 6 | 茄子杂交品种种子纯度的SSR分子标记鉴定显示文摘基于分子标记的茄子(Solanum melongena)杂交种子纯度快速检测技术体系的建立对茄子杂交品种的研究具有重要的意义。本研究以茄子杂交品种'苏崎3号'、'苏崎4号'及其双亲为试验材料,采用NaOH裂解法快速提取DNA与SSR标记分析相结合的方法,对茄子杂交品种种子纯度的鉴定技术进行了研究。结果表明,利用NaOH裂解法提取的DNA能够进行正常的SSR分析。从46对SSR引物中各筛选出1个共显性标记,对'苏崎3号'和'苏崎4号'种子进行群体检测,发现分子标记鉴定结果与田间鉴定结果一致。研究结果表明NaOH裂解法和SSR标记分析相结合可实现对茄子杂交品种种子纯度的快速和准确鉴定。 | 刘军 周晓慧 庄勇 | 2013 | 分子植物育种2013，11，6： | 13 |
| 7 | 利用ISSR分子标记鉴定苦瓜杂交种纯度显示文摘【目的】采用ISSR分子标记对苦瓜杂交一代品种秀玉1号纯度进行鉴定,为生产上提高苦瓜新品种纯度鉴定效率提供参考。【方法】利用ISSR技术和91条引物,对苦瓜品种秀玉1号及其亲本的DNA指纹进行分析。【结果】从91条引物中筛选出两条特征引物ISSR-845和ISSR-891,能同时扩增出F1代及其父母本的多态性条带510和300 bp。其中,ISSR-845能够区分父本机械性混杂,ISSR-891能够准确区分母本自交系与杂种F1代;经群体验证,该标记与田间鉴定结果高度一致。【结论】ISSR技术具有准确、简便、高效、实用性强等优点,可用于生产上苦瓜种子纯度的快速鉴定。 | 陈龙正 徐海 宋波 张慧 况媛媛 袁希汉 | 2013 | 南方农业学报2013，44，12： | 9 |
| 8 | 辣椒杂交种SSR分子标记鉴定及表型比较分析显示文摘利用SSR分子标记技术对热辣3号辣椒杂交种进行纯度鉴定。从85对SSR引物中筛选出10对引物在热辣3号亲本间表现明显的多态性,均为共显性标记。为了提高鉴定结果的准确性,选用位于辣椒不同染色体上的3对共显性标记对热辣3号辣椒进行纯度检测,种子纯度为99.49%。分子标记鉴定与表型鉴定比较分析表明,2种鉴定结果高度一致。研究结果表明,SSR分子标记可以用于热辣3号辣椒杂交种纯度的快速、准确检测。 | 刘子记 李静婷 杨衍 曹振木 | 2014 | 华北农学报2014，29，1： | 9 |
| 9 | 茄子SSR多态性标记筛选及杂交种纯度鉴定显示文摘【目的】建立一套快速、准确、高效的茄子杂交种纯度鉴定方法,为其制种过程中除伪存真及大面积推广应用提供技术支持。【方法】挑选已公布的48对SSR引物对2个茄子杂交种15-16和1-7的亲本进行多态性标记筛选,选取有效引物对茄子杂交种进行纯度鉴定,并结合田间植株纯度鉴定,验证SSR分子标记纯度鉴定的有效性。【结果】在48对SSR引物中,有12对引物在杂交种15-16亲本材料中存在多态性,其多态性引物带型呈互补带型的有8对(SM14、SM15、SM17、SM20、SM29、SM30、SM34和SM45);有5对引物在杂交种1-7亲本材料中存在多态性,其多态性引物带型呈互补带型的有4对(SM15、SM20、SM24和SM29)。分别选取2对呈互补带型的SSR引物进行杂交种纯度鉴定,结果显示杂交种15-16和1-7的纯度分别为99%和100%,与田间种植鉴定结果一致。【结论】采用SSR分子标记检测茄子杂交种纯度具有准确、高效的特点,可为茄子杂交制种过程中真假杂种鉴定提供技术支持。 | 张洪源 谈杰 张敏 黄树苹 陈霞 王春丽 谈太明 | 2017 | 南方农业学报2017，48，7： | 9 |
| 10 | 黄瓜品种‘川绿2号’SSR指纹图谱的构建和纯度鉴定显示文摘为了快速而准确地鉴定杂交黄瓜种子的纯度和真伪,用164对全基因组覆盖的SSR引物对黄瓜品种‘川绿2号’及其亲本进行多态性筛选。结果表明,28对引物在亲本间具多态性,这些引物在1~7号染色体均有分布,其中2、6号染色体上分布有较多多态性位点。28对多态性引物中共显性引物22对,缺失多态性引物6对。共显性引物中有10对引物在杂交后代表现为清晰、稳定的父母本互补的带型,特异性强,可分辨程度高,可以用来区别其中混杂的母本、父本及其他种子,为‘川绿2号’及其亲本指纹图谱的核心引物。利用这10对引物对1批‘川绿2号’种子进行检测,分子标记鉴定纯度为96.0%,真、假杂种编号与田间鉴定结果一致。这28对引物组成指纹图谱不仅能为‘川绿2号’杂交种的真伪鉴定、纯度检测及亲本提纯等工作提供更加准确的技术指导,还可为遗传多样性分析、重要表型基因定位分析等提供信息。 | 杨宏 刘小俊 梁根云 李跃建 | 2016 | 西南农业学报2016，29，2： | 9 |
| 11 | 分子标记技术在茄子种质资源评价中的应用研究进展显示文摘介绍了常用分子标记的类型及其特点,包括RFLP、RAPD、SSR、ISSR、SRAP、AFLP、CAPS、INDEL和SNP等,综述了分子标记在茄子遗传连锁图谱构建与QTLs定位、遗传多样性与亲缘关系评价、品种鉴定与纯度分析、分子标记辅助选择育种等方面的研究进展,对存在的问题及今后的发展方向进行了探讨,以期为茄子种质资源的高效利用与种质创新提供理论参考。 | 廖秋石 雷刚 陈学军 袁欣捷 黄月琴 周坤华 方荣 | 2020 | 江西农业学报2020，32，8： | 9 |
| 12 | 利用SSR标记技术鉴定南瓜杂交种纯度的研究显示文摘为研究SSR标记技术在南瓜杂交种纯度鉴定上的可行性,本研究利用选取的33对南瓜SSR引物,对2个中国南瓜杂交品种(大果蜜本与蜜宝)和2个中国南瓜杂交组合(P12与P13)的杂交种样品进行了纯度鉴定,并与田间形态鉴定结果进行了对比分析。研究结果表明,SSR鉴定与田间种植鉴定的结果差异在0.7%~1.8%之间,相关系数达到0.999,达到极显著相关水平,并进一步建立回归方程。本研究结果证实了SSR标记技术应用于南瓜杂交种纯度鉴定工作的可行性与可靠性,为南瓜杂交种纯度鉴定提供技术与理论支持。 | 韩小霞 胡新军 袁祖华 李勇奇 杨建国 粟建文 | 2014 | 分子植物育种2014，12，1： | 8 |
| 13 | SSR标记对甜瓜杂交种‘众天翠雪’纯度的鉴定显示文摘旨在筛选能够用于甜瓜杂交种纯度和真实性鉴定的SSR引物。利用公认的18对多态性较好的甜瓜SSR(Simple Sequence Repeats)引物对甜瓜杂交种'众天翠雪'及其亲本进行多态性筛选,并在杂交群体中进行验证。13对引物在亲本间具有多态性条带,经过多次重复,筛选到2对引物在亲本间具有多态性、子代中兼具双亲条带,并且在子代群体中检测结果与田间形态鉴定结果一致。引物RF151和RF144能够作为‘众天翠雪’杂交种纯度鉴定的特异引物进行纯度检测。作为共显性标记特性的SSR分子标记可以作为杂交种纯度鉴定的重要工具。 | 赵光伟 欧点点 贺玉花 徐志红 孔维虎 张健 王平勇 徐永阳 | 2017 | 中国农学通报2017，33，9： | 8 |
| 14 | 基于茶树芽叶转录组序列的EST-SSR分布特征研究显示文摘采用生物信息学方法对茶树(Camellia Sinensis)叶部不同发育阶段(单芽/三叶)转录组中的EST-SSR位点信息进行分析,以期为茶树分子标记辅助育种提供有效的参考。利用SSRFINDER软件,对茶树芽叶转录组的高通量测序获得的97454条Unigenes序列(100.91Mb)进行大通量SSR位点的筛选,共获得36249个SSR位点,分布于27913条Unigenes序列中,其发生频率为28.64%,平均分布密度为1/2.78 kb。在茶树芽叶的转录组序列中共发现962种碱基重复基元,其中占主导的是以(AG/CT)n为主(占总SSRs的23.78%)的二核苷酸重复,占到总SSRs的59.19%,其次是三核苷酸和单核苷酸重复,其占比分别为20.92%和13.13%。茶树芽叶转录组所含不同重复基元SSRs的平均长度,相对全器官转录组较短,其中占比最高的是重复长度为18 bp的中长重复序列,占到总SSRs的23.37%,而大于25 bp的较长序列重复极少。同时对茶树不同器官转录组测序的SSR分布特性进行了分析比较,以期为后续的分子标记开发提供参考。 | 陈琪 杨华 韦朝领 张正竹 宛晓春 | 2016 | 安徽农业大学学报2016，43，2： | 8 |
| 15 | 应用分子标记技术检测作物杂交种纯度研究进展显示文摘随着作物基因组工程的快速发展,丰富的基因组序列为分子标记的开发和应用奠定了基础。分子标记技术可以弥补和克服杂交种纯度形态学及同工酶鉴定中的许多缺陷和难题,为作物杂交种纯度鉴定提供一种准确、可靠、快速、方便的方法。本文综述了几种常用分子标记技术的原理、优缺点及在作物杂交种纯度鉴定中的应用现状。 | 刘子记 曹振木 杨衍 | 2013 | 种子2013，32，6： | 7 |
| 16 | 分子标记在作物遗传育种中的应用显示文摘阐述了分子标记在作物遗传育种中构建分子标记遗传图谱、基因定位、品种纯度的鉴定、遗传多样性和物种亲缘关系研究、分子标记辅助育种等方面的应用,对分子标记技术的发展作出了展望。 | 谭建萍 李映萍 余江勇 杨雪 金生英 谭本智 | 2015 | 绿色科技2015，17，10： | 6 |
| 17 | 热辣2号辣椒纯度鉴定及优良自交系遗传多样性分析显示文摘为了提高种子质量和充分利用辣椒种质资源。应用SSR分子标记对热辣2号杂交种纯度进行鉴定并对部分辣椒优良自交系进行遗传多样性分析。以热辣2号母本材料CAYB02和父本材料CAYB01为模板筛选85对辣椒SSR引物。其中12对引物在亲本间能扩增出明显的多态性,多态性比率为14.12%,多态性标记分别位于辣椒1、3、4、6、7、9、11、12号染色体,利用3对位于不同染色体上的SSR标记对热辣2号黄灯笼椒杂交种的纯度进行鉴定,热辣2号种子纯度为98.79%,标记鉴定结果与田间鉴定结果一致。研究结果表明.利用SSR标记鉴定辣椒杂交种纯度是切实可行的。利用12对多态性明显、稳定可靠的SSR引物对部分辣椒自交系进行遗传多样性分析,共扩增出60条条带,多态性位点比率为100%.平均每对引物检测出5个等位基因。30份辣椒自交系间遗传相似系数变幅为0.33~1.00,平均为0。65.表明供试材料间具有丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,在遗传相似系数为0.47时,可以将中国辣椒和一年生辣椒区分开来。在遗传相似系数为0.85时.30份辣椒优良自交系分为11个类群.辣椒种质遗传关系与地理来源和农艺性状具有一定的相关性。 | 刘子记 杨衍 孙继华 刘昭华 曹振木 | 2014 | 热带作物学报2014，35，5： | 6 |
| 18 | 川翠3号黄瓜SSR指纹图谱的构建及种子纯度鉴定显示文摘为了建立杂交黄瓜品种川翠3号的快速纯度鉴定体系,用164对全基因组覆盖的SSR引物对川翠3号及其亲本进行了多态性筛选及纯度鉴定。其中4对引物表现出稳定的共显性,电泳图谱清晰、易分辨,特异性强,对川翠3号种子鉴定纯度为99.0%,真、假杂种编号与田间鉴定结果一致,可以用来区别其中混杂的母本、父本及其他种子,说明这4对引物组成的指纹图谱能为川翠3号杂交种的真伪鉴定、纯度检测及亲本提纯等提供准确的技术指导。 | 杨宏 刘小俊 梁根云 李跃建 | 2015 | 长江蔬菜2015，，2： | 5 |
| 19 | 应用分子标记检测作物杂交种纯度研究现状及比较分析显示文摘分子标记技术可以弥补和克服杂交种纯度形态学及同工酶鉴定中的许多缺陷和难题,为作物杂交种纯度鉴定提供一种准确、可靠、快速、方便的方法。通过综述几种常用分子标记技术的原理、优缺点及其在作物杂交种纯度鉴定中的应用现状,展望了分子标记检测技术在杂交种纯度检测乃至遗传育种、良种推广中的重要性,以期为研究分子标记技术提供参考。 | 刘子记 曹振木 杨衍 | 2013 | 长江蔬菜2013，，12： | 4 |
| 20 | 利用SSR分子标记技术快速鉴定津甜100甜瓜种子纯度显示文摘利用SSR分子标记技术鉴定甜瓜种子纯度,是甜瓜种子生产、销售过程中的关键环节,对甜瓜产业发展具有重要意义。利用津甜100亲本对24对甜瓜SSR引物进行多态性筛选,得到多态性高、在F_(1)代中条带差异较大的2对引物。利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对F_(1)群体进行鉴定,鉴定结果与田间鉴定结果一致,纯度均为99.0%。因此,笔者筛选得到多态性高、条带差异大的2对引物,可鉴定津甜100甜瓜种子。 | 武云鹏 李肯 张若纬 彭冬秀 | 2021 | 中国瓜菜2021，34，3： | 4 |
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