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| 1 | 36份枣品种SSR指纹图谱的构建显示文摘利用12对SSR引物对36个枣品种进行分析,采用荧光M13毛细管电泳技术进行多态检测,共检测到99个多态位点,每对引物的多态位点数达到8.25,PIC值变幅为0.62~0.85,平均为0.75。依据12对SSR引物在36个品种中扩增的特异带型组合,采用引物—带型组合法构建了36个枣品种的指纹图谱,并对这36份枣品种做聚类分析,遗传相似系数在0.6667~0.9444之间。研究结果为枣树分类、种质鉴定和分子育种提供了重要的工具。 | 麻丽颖 孔德仓 刘华波 王斯琪 李颖岳 庞晓明 | 2012 | 园艺学报2012，39，4： | 62 |
| 2 | 利用SSR分子指纹和商品信息构建水稻品种身份证显示文摘为方便水稻种子质量的追溯和管理,提出基于SSR分子指纹和商品信息构建水稻品种身份证的新思路。在前期研究基础上,进一步确定了由12个水稻SSR标记构成的核心标记组(每条染色体1个),对127份安徽省审定(或主推)水稻品种进行荧光标记分析,构建供试水稻品种分子指纹,在此基础上,再与品种基本商品信息相结合,并进行数字化编码,构建了127份水稻的品种身份证。该身份证号码组成的第1部分为商品码,代表品种的基本商品信息,包括品种类别、品种选育(或审定)的区域和时间等;第2部分为指纹码,代表水稻品种的分子指纹信息;第3部分为补充码(或特异基因识别码),代表品种的特异基因信息。还对127份水稻品种身份证进行了条码表述(一维码和二维码),以便水稻品种种子的身份标识和溯源管理。 | 陆徐忠 倪金龙 李莉 汪秀峰 马卉 张小娟 杨剑波 | 2014 | 作物学报2014，40，5： | 68 |
| 3 | SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用显示文摘以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行、结果可靠。 | 程本义 夏俊辉 龚俊义 杨仕华 | 2011 | 中国水稻科学2011，25，6： | 59 |
| 4 | SSR分子标记的研究进展显示文摘介绍SSR分子标记的开发方法,综述了SSR标记在通用性、遗传多样性与种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位与克隆、数量性状基因位点(QTLs)分析、DNA指纹图谱构建等研究中的应用及最新进展,对提高SSR分子标记电泳检测效率提出一些建议.同时展望了SSR分子标记的应用前景. | 杨梦婷 黄洲 干建平 徐君驰 庞基良 | 2019 | 杭州师范大学学报(自然科学版)2019，18，4： | 49 |
| 5 | 利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱显示文摘为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系,构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物,构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235个等位基因,平均每个等位基因检测到多态性位点7个,多态性位点变化范围为2~12个。20个高粱品种36个SSR位点的遗传多样性指数和多态性信息量的变化范围分别为0.3490~0.8813和0.3144-0.8696,平均值分别为O.6976和0.6571。从36对SSR引物中筛选到多态性丰富的2对引物作为高粱品种鉴定的特征引物,2对SSR特征引物组合可区分所有供试品种。20+高粱品种的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各品种特定的图谱,为品种鉴别提供依据。 | 王瑞 张福耀 程庆军 田承华 凌亮 | 2015 | 作物学报2015，41，4： | 31 |
| 6 | 利用荧光SSR标记鉴别杨树品种显示文摘世界上天然杨树约100多种,我国有50多种。杨树作为重要造林树种,多用于水土保持、防风防沙和园林绿化,也是造纸、建筑及木材工业的重要经济树种。杨树易繁殖,生长速度快,生产周期短,在我国广泛栽培,我国也是世界上杨树人工林面积最大的国家(Carleetal.,2005)。我国杨树引种和育种的历史可追溯到新中国建立时期,杨树种质资源十分丰富,我国已培育了许多优良杨树品种(马常耕,1995)。随着育种技术的发展,新品种产生的速度与日俱增。然而,由于杨树品种繁多,形态相似,容易出现品种混淆。特别是近年来杨树种苗市场的迅速发展,为了追逐经济效益,杨树种苗市场上出现了以次充好。 | 冯锦霞 张川红 郑勇奇 孙荣喜 | 2011 | 林业科学2011，47，6： | 25 |
| 7 | 高盐低pH值法提取玉米基因组DNA的研究显示文摘优化建立了基于玉米叶片的高盐低pH值法提取玉米基因组DNA,经琼脂糖电泳检测表明,提取的DNA主带清晰、无降解现象、质量好,满足基于SSR标记的5色荧光电泳检测系统。此方法比目前提取植物基因组DNA常用的CTAB法和SDS法具有成本低、步骤简单、不使用酚、氯仿、异戊醇等有毒有机试剂的优点,是提取玉米基因组DNA的一种较好的方法。 | 许理文 王凤格 赵久然 易红梅 | 2009 | 玉米科学2009，17，1： | 21 |
| 8 | SSR荧光标记毛细管电泳法与国家冬油菜区试指纹鉴定平台的构建显示文摘为了油菜品种指纹检测的精确性及未来构建大规模油菜新品种指纹数据库,应用SSR荧光标记毛细管电泳检测法构建国家冬油菜区试指纹鉴定平台。以40对荧光引物对2012-2013年度163份国家冬油菜区试参试品种(系)进行分析。结果共检测到42个等位位点和131个等位变异。其中A基因组(n1~n10)检测位点25个,C基因组(n11~n19)检测位点17个。每个位点等位变异数从2到6不等,平均为3.02。42个检测位点的PIC值变化范围在0.10~0.69之间,平均值为0.36。其中引物BRGMS171的杂合度、PIC值分别高达0.67、0.70,可考虑作为以后区试杂交种纯度鉴定的核心标记。SSR位点的纯合度分析得出本年度18份常规种平均纯合度为81.9%,145份杂交种为57.9%。以131个等位变异计算品种(系)间DICE相似系数,163份品种(系)间平均遗传相似系数变幅为0.607~0.765,变幅最大的为品种(系)FC03(0.438~0.879),变幅最小为品种(系)宜油21(0.611~0.806)。 | 许鲲 李锋 吴金锋 谷铁城 陈碧云 高桂珍 闫贵欣 李俊 乔江伟 汪念 伍晓明 | 2014 | 中国油料作物学报2014，36，2： | 21 |
| 9 | 毛细管电泳荧光检测中的异常电泳类型及原因分析显示文摘采用毛细管电泳荧光检测技术进行玉米SSR标记的片段分析。利用峰型、峰面积和其它荧光干扰峰等方面的特征对特异峰和非特异峰进行甄别。分析了特异峰的具体表现类型及原因:包括N+1峰、稀有峰、连续多峰、三峰和高低峰等。探讨了片段扩增产物大小与异常峰型的关系。为保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,提出了数据统计规范化的解决方案。 | 王凤格 易红梅 赵久然 王璐 | 2007 | 分子植物育种2007，5，6： | 17 |
| 10 | 玉米SSR分子标记技术操作流程研究进展显示文摘SSR分子标记是一种基于PCR技术的分子标记技术,以其多态性高、共显性遗传、检测简单等优点在玉米品种鉴定、杂种优势类群划分等方面有广泛的应用。DNA提取、PCR扩增、产物检测是玉米SSR分子标记的技术流程的重要环节。尽管出现了一些能够整合SSR标记流程几个环节甚至是整个流程的实验设备,但这样的仪器常常本身价格昂贵,实验药品、耗材等成本也很高。因此,近年来,科研人员对玉米SSR分子标记技术流程各步骤进行大量的优化和改进,使实验过程更加简化、高效。为此综述了玉米SSR分子标记技术流程的DNA提取、PCR扩增、产物检测3个关键环节,分析认为这一技术流程的发展体现了实验试剂集成化、实验操作标准化、实验流程自动化的总体趋势。 | 曹士亮 曹靖生 王成波 贺强 | 2012 | 中国农学通报2012，28，15： | 16 |
| 11 | 小麦SSR指纹图谱及品种身份证的构建——基于毛细管电泳分析显示文摘为解决小麦品种区分难的问题,以黄淮海和长江中下游地区160个小麦主栽品种为试验材料,经初筛和复筛,从分布于小麦21个连锁群的105对SSR引物中,筛选出21对稳定、多态性高的引物(每条染色体上各选取1对)。对供试小麦品种进行SSR荧光标记的毛细管电泳分析,获取其SSR分子指纹信息,并与品种基本商品信息结合,进行数字化编码,构建了160个小麦的品种身份证,实现小麦品种信息唯一性、通用性、可识别性和可追溯性的统一,为小麦种子的质量追溯和管理提供便利,同时为种子市场的知识产权保护提供科学依据。 | 秦瑞英 许学 张立平 李莉 方钰 汪秀峰 倪金龙 陆徐忠 杨剑波 | 2017 | 中国农学通报2017，33，34： | 15 |
| 12 | 桂花品种SSR荧光指纹图谱的构建显示文摘利用SSR荧光标记技术筛选出的11对SSR荧光标记引物,构建了64个桂花品种的SSR指纹图谱。11对SSR引物共扩增出143个等位基因,平均每个位点13个等位基因。群体平均的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Shannon's信息指数(I)、观察等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为0.619 7、0.848 3、2.323 7、17.833 3和8.228 2。四季桂与秋桂(金桂、银桂和丹桂)的遗传距离较远。利用引物OF002、OF019、OSM63和OSM63中的任意2对可区分所有供试品种。64个桂花品种的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各品种特定的图谱,为品种鉴别提供依据。 | 段一凡 王贤荣 梁丽丽 李雪霞 向其柏 | 2014 | 南京林业大学学报(自然科学版)2014，38，S1： | 15 |
| 13 | 不同SSR标记检测技术及其在花生栽培种遗传多样性分析中的应用显示文摘以85份花生栽培种为材料,分别应用银染法和荧光检测法检测9对SSR引物的扩增产物。比较结果显示,荧光检测法具有灵敏度高、检测结果准确、效率高等优点。聚类分析表明,银染法与荧光检测法分别能够区分74个、82个花生品种,并分别聚成8个、9个类群;荧光检测法的聚类结果虽然反映的品种间遗传多样性较低,但与品种类型、产地及其亲缘关系相关程度更高,表明荧光检测数据更精确、可靠。遗传多样性分析发现,地方品种的遗传多样性指数最高,其次为多粒型育成品种,表明我国地方品种和多粒型育成品种蕴藏了丰富的优异性状,有利于对其挖掘和利用。 | 王燕龙 单雷 付春 徐平丽 姜言生 柳展基 曲志才 唐桂英 | 2014 | 植物遗传资源学报2014，15，1： | 14 |
| 14 | 基于高基元SSR构建黍稷种质资源的分子身份证显示文摘为快速鉴定黍稷(Panicum miliaceum)资源,建立大数据管理平台,为种质身份标识和溯源管理提供理论依据。本研究以来源于4个生态栽培区的130份资源为材料,基于35个高基元SSR(四、五和六碱基重复各21、10和4个)构建分子身份证。结果表明,35个标记中有30个扩增条带稳定,可用于分子身份证构建。30个标记共检出等位变异(Na)90个,平均为30个;有效等位变异(Ne)为2.3186~2.9982,平均为2.7607;Shannon多样性指数(I)为0.9158~1.0873,平均为1.0472;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.5687~0.6665,平均为0.6360;多态性信息含量(PIC)为0.5151~0.7898,平均为0.6966;观测杂合度(Ho)为0.5000~-0.8678,平均为0.7168;期望观测杂合度(He)为0.5710~0.6691,平均为0.6386。基于UPGMA聚类将材料划为3个类群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),就山西省材料而言,地方品种和育成品种分别划归类群Ⅰ和Ⅲ,农家种在3个类群中均有分布。主成分分析将试材归为4类,聚类结果与其地理来源一致。基于最少标记区分最多种质的原则,剔除相似系数高的3个标记(RYW23、RYW49和RYW51),筛选其余27个标记,发现仅用17个标记组合(RYW35、RYW40、RYW37、RYW18、RYW30、RYW16、RYW20、RYW19、RYW8、RYW5、RYW3、RYW7、RYW1、RYW14、RYW9、RYW6和RYW10)可将全部材料区分。用ID Analysis 4.0、在线条形码生成器和二维码技术(http://gffzzd119e9fbe2b14cechucownvo9qkbo66nv.ffgz.tsg.suse.edu.cn/app/html/bcgcode128.php和http://gffzz1450fdb025844063sucownvo9qkbo66nv.ffgz.tsg.suse.edu.cn/)构建了130份资源的字符串、条形码和二维码DNA分子身份证。 | 陈小红 林元香 王倩 丁敏 王海岗 陈凌 高志军 王瑞云 乔治军 | 2022 | 作物学报2022，48，4： | 13 |
| 15 | 基于SSR标记的花椰菜和青花菜遗传多样性分析显示文摘选用30对SSR引物,利用毛细管电泳荧光检测技术对收集和引进的花椰菜、青花菜、宝塔菜(又叫罗马花椰菜)和近缘野生种及地方种共计187份材料的遗传多样性进行分析,进一步明确了花椰菜、青花菜、地方种和近缘野生种与如今栽培种间的遗传差异和亲缘关系,可为优异种质创新和新品种选育提供参考。研究结果表明:30对SSR引物在187份材料的DNA样品中共扩增出313个等位位点,平均每对引物为10.4333个。依据材料的花球性状,将其分为4个类群即花椰菜(类群1,P1~P81)、青花菜(类群2,P82~P147)、宝塔菜(类群3,P148~P154)、近缘野生种及地方种(类群4,P155~P187)。总体来说,类群1、2和3之间的遗传多样性差异较小,类群4的遗传多样性最丰富。系统发育树和群体结构分析较为统一的将187份材料分为了3大组,花椰菜(G1)和青花菜(G2)被清晰地分到了两个极端,而宝塔菜与野生种聚在了一起,和地方种一起归为第3组(G3)。 | 盛小光 赵振卿 王建升 虞慧芳 沈钰森 王宣怀 顾宏辉 | 2019 | 植物遗传资源学报2019，20，4： | 13 |
| 16 | 花生SSR核心引物筛选及育成品种DNA指纹图谱构建显示文摘根据SSR引物在遗传连锁图上的位置,首先选择200对均匀分布在染色体上,且通过聚丙烯酰胺凝胶电泳银染技术筛选表现为条带清晰、可重复的单位点引物,再利用毛细管电泳技术筛选等位变异数≥4个、引物的PIC值≥0.4、杂合度≤0.1的引物,并参考其所在染色体位置,获得60对具有丰富的多态性、广泛的代表性、均匀分布的SSR引物,同时普通引物和荧光引物都具有较好的扩增效果,作为花生品种构建指纹图谱的核心引物。60对SSR引物在100份材料中共扩增出352个多态性等位位点,引物扩增的等位位点均值为5.87;每对引物可区分的基因型数目均值是6.35;引物的多态性信息指数(PIC值)均值是0.54。高多态性的SSR引物占66.67%,SSR引物杂合度都在0.06以下。品种间的遗传相似系数变幅为0.530~0.683。构建了100份花生的指纹图谱,每一条指纹都具有唯一性,可标识一个品种,为全国花生品种及资源的DNA指纹数据库的构建奠定基础。 | 任小平 郑艳丽 黄莉 陈玉宁 周小静 陈伟刚 雷永 晏立英 万丽云 廖伯寿 姜慧芳 | 2016 | 中国油料作物学报2016，38，5： | 12 |
| 17 | 分子标记辅助玉米自交系京24抗南方锈病的改良显示文摘近年来,南方锈病对中国玉米生产的危害日益严重。本研究选用齐319为供体亲本,利用分子标记辅助前景选择和背景选择,结合回交转育技术,改良骨干系京24的南方锈病抗性。利用荧光毛细管电泳检测系统,从13对引物中最终筛选出与抗病基因遗传距离较近,扩增稳定、分别位于抗病基因上下游的两对引物Phi118和P2,用于目标性状的前景选择,230个BC1代单株室内分子标记检测结果和海南自然发病情况的比较,验证了前景选择标记的有效性。同时,从100对SSR引物中,筛选出在供受体间具有明显差异的42对引物用于回交群体的背景选择。单色荧光标记引物的多重电泳检测,可显著提高背景选择的效率。 | 李少博 宋伟 王凤格 赵久然 余辉 蔚荣海 | 2012 | 分子植物育种2012，10，4： | 11 |
| 18 | 一个芝麻应用核心种质的DNA分子身份证构建显示文摘构建并研究应用核心种质是深入挖掘芝麻优异基因和提高育种效率的有效途径。经过对核心种质农艺、形态等性状4年4点的观察统计,构建了包括大粒、高木酚素、高油等23种应用型在内的131份芝麻应用核心种质。为了准确鉴别这批应用核心种质并对芝麻DNA分子身份证的构建方法进行探索,本研究利用SSR变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,从基于芝麻全基因组开发的32对SSR引物中,筛选出7对核心引物,进而采用SSR荧光标记毛细管电泳技术,共检测出53个多态性位点,最多一个引物检测到12个多态性位点。将毛细管电泳得到的分子量数据以数字+英文字母方式编码,用ID Analysis 4.0软件根据最少引物区分最多种质的原则选核心引物中的6对(ZMM1494、ZMM1648、ZMM3037、ZMM2818、ZMM1851、ZMM1935)组合,构建出如'4A32645(AC017)'这种简单、易使用的字符串DNA分子身份证,并确定了不同应用型的组内引物组合。还对131份应用核心种质构建了条形码和二维码DNA分子身份证,可迅速被电子设备识别,拓宽了DNA分子身份证的使用范围,并为以后芝麻种质标准化和品种DNA分子身份证库的构建奠定了重要的技术基础。 | 杨文娟 张艳欣 王林海 魏鑫 黎冬华 高媛 刘盼 张秀荣 | 2018 | 作物学报2018，44，7： | 10 |
| 19 | 12个油茶品种的SSR特征指纹鉴别显示文摘为了对普通油茶(Camellia oleifera)优良品种的准确鉴别开发一种新的分子识别方法,为油茶优良品种资源的保护提供技术支持,本研究拟利用SSR荧光标记构建12个长林系列油茶品种的SSR特征指纹。14对多态性SSR引物从12个油茶品种的14个SSR位点共扩增出62个多态性条带、检测出77种基因型,平均每个SSR引物扩增出4.4个多态性条带、检测出5.5种基因型。12个油茶品种14个SSR位点的多态信息含量变化范围和Dice遗传相似系数变异范围分别为0.08~0.84和0.39~0.90。基于12个油茶品种在14个SSR位点的基因型差异,共选出45种SSR特征引物与其对应的基因型组合,即SSR特征引物-基因型,可作为11个油茶品种的SSR特征指纹,为品种鉴别提供分子依据。本研究也为在更大层面上建立油茶品种的DNA指纹数据库、为油茶品种的辅助选育、以及应用于DUS测试提供了技术思路。 | 李海波 丁红梅 陈友吾 徐梁 李楠 胡传久 | 2017 | 中国粮油学报2017，32，10： | 9 |
| 20 | 基于荧光毛细管电泳技术的苜蓿SSR指纹图谱构建显示文摘利用高灵敏的荧光毛细管电泳检测技术对10份苜蓿种质材料进行SSR遗传分析,结果表明:筛选的17对SSR引物中5对引物(即引物MtTFSSR-19、MtTFSSR-41、Ms-29、Ms-50、MtB60)具有较好的扩增效果,利用5对引物的扩增图谱可将10份材料进行有效区分。以此为基础为每份苜蓿材料构建了SSR指纹图谱,并采用非加权组平均法对10份种质材料进行了相似系数聚类分析,为苜蓿种质鉴定技术体系提供了基础依据。 | 张迪 任立飞 张璐璐 张文浩 王天佐 | 2020 | 中国草地学报2020，42，6： | 9 |
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