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1三角紫叶酢浆草ISSR反应体系的建立与优化显示文摘采用正交设计直观分析法,对影响三角紫叶酢浆草ISSR-PCR反应较大的5个因素(Mg2+、Taq酶、引物、模板DNA、dNTP)在5个水平上进行优化实验;从100个随机引物中筛选出适宜的引物,并筛选出其最佳退火温度;最后对反应程序进行优化。由此首次建立了适合三角紫叶酢浆草的ISSR-PCR反应体系:25μL反应液中含10×buffer 2.5μL,Mg2+1.25mmol/L,Taq酶0.9U,引物0.3μmol/L,模板DNA 60~100ng,dNTP 0.25mmol/L。反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性50s,退火时间60s(根据不同引物选择对应最佳退火温度),72℃延伸1.5min,循环40次;72℃延伸7min,4℃保存。这一优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术研究酢浆草属植物提供理论依据和技术参考。胡甦 王永清 陶炼 2011草业学报2011,20,5:23
220个茶花品种遗传关系的ISSR分析显示文摘采用ISSR分子标记技术对茶花品种群中有代表性的20个国内外茶花品种进行了品种间遗传关系的分析。从60对随机扩增引物中筛选出了21对扩增带型清晰及重复性好的引物序列,共扩增出153条带,其中146条呈现多态性,多态性条带比例为95.4%;Nei's基因多样性指数介于0.40-0.48,Shannon信息指数在0.57-0.67,基因分化系数介于0.5-0.7,基因流值介于0.2-0.5,遗传相似系数介于0.50-0.74,平均为0.63。参试的20个茶花栽培品种间遗传差异相对比较窄;结合花型形态学特征与UPGMA聚类分析结果,可将20个茶花品种分为2个大类群。此外,结果显示:ISSR分子标记适用于分析山茶品种间遗传多样性和亲缘关系。倪穗 李纪元 王强 2009林业科学研究2009,22,5:20
3道地药材霍山石斛及其相似种的分子鉴定显示文摘为检测霍山石斛与霍山产铜皮石斛、霍山产铁皮石斛及其它产地的几种药用石斛的差异,对霍山石斛及其相似种进行ISSR分子标记比较研究。结果表明,尽管霍山石斛及其相似种的外部形态差异较小,但在ISSR分子标记指纹图谱上却存在着显著而稳定的差异。因此,根据ISSR分子标记指纹图谱所显示的多态性位点差异,能准确鉴别霍山石斛及其相似种植物及药材。此方法简单、稳定性高、可重复性好,在霍山石斛的分子鉴定研究中有较大的应用价值。刘明珍 陈乃富 刘秀珍 邓辉 李耀亭 何祥林 2009生物学杂志2009,26,5:17
4兰科石斛属植物分子生物学研究进展显示文摘随着分子生物学技术的进步,石斛属植物在分子方面的研究快速发展,不仅为石斛属植物的快速鉴别提供了新途径,较全面的揭示了其种群的遗传多样性和亲缘关系,更为揭示石斛属植物生长发育、代谢调控机制奠定了重要的分子基础。鉴于此,该文从分子鉴定、遗传多样性、功能基因等方面对近年来石斛属植物分子生物学方面的研究现状进行综述,以期为该领域的进一步研究及石斛属植物的有效保护、开发和利用提供理论依据。李清 李标 郭顺星 2016中国中药杂志2016,41,15:17
5药用石斛ISSR分子标记研究显示文摘目的:探索药用石斛鉴别的分子生物学方法,为药用石斛质量控制提供理论依据。方法:采用ISSR-PCR方法扩增药用石斛DNA片段,根据基因分型能力筛选ISSR引物,并建立药用石斛鉴别条形码。结果:筛选出两条Rp值大于8的引物,能完全区分6个种共8个类群的药用石斛。结论:ISSR分子标记可用于药用石斛的种类和产地鉴定。杨立昌 邓辉 乙引 张习敏 王亚筑 林俊清 2010中药材2010,33,12:16
6霍山产3种药用石斛及其杂交优势种的ISSR-PCR分子标记鉴别显示文摘目的:利用ISSR分子标记技术对安徽霍山产3种药用石斛及其杂交优势种进行鉴别。方法:优化ISSR-PCR反应体系:引物[(AC)8CT]0.5μM,Mg2+2.0 mM,dNTP 200μM,Taq 1 U/20μl,筛选出RP值高的引物,建立ISSR分子标记指纹图谱。结果:根据ISSR分子标记指纹图谱可以鉴别霍山产3种药用石斛及其杂交优势种。结论:ISSR分子标记技术可用于霍山产3种药用石斛及其杂交优势种鉴别,且简单、经济、重现性好。邓辉 陈乃富 李耀亭 刘明珍 何祥林 2009种子2009,28,2:16
7中国楸树(Catalpa bungei C.A.Mey)种质资源遗传多样性的ISSR分析显示文摘采用简单序列重复区间标记法(ISSR)分子标记技术,对中国楸树(Catalpa bungeiC.A.Mey)10个类型156个单株进行了遗传多样性分析。从46个简单重复序列引物中筛选出的14个引物共扩增出190条稳定的谱带,其中多态性谱带186条,多态性条带百分率达97.89%。在物种水平上,Nei′s基因多样性指数(H)为0.290 9,Shannon信息指数(I)为0.446 3,基因多样度(Ht)为0.296 7,基因分化系数(Gst)为0.397 1,基因流(Nm)为0.759 2。分析结果表明,楸树各类型间变异占总变异的39.71%,类型内的变异占总变异的60.29%,约为类型间变异的1.5倍,说明中国楸树类型内的变异在其遗传变异中占主导地位。楸树类型间的遗传相似系数介于0.668 4和0.984 9之间,平均为0.863 7。基于遗传相似系数的UPGMA聚类分析,可将楸树10个类型分为4类。石欣 李亚 杨如同 汪庆 姚淦 2011江苏农业学报2011,27,3:11
8萱草属野生资源遗传距离和多态性分析显示文摘以萱草属的9个野生种和1个变种为材料,应用ISSR-PCR分子标记技术,对野生种间的亲缘关系和多态性进行了研究。从123条ISSR通用引物中筛选出了10条扩增产物清晰且多态性高的引物,对实验样本进行扩增,共产生了218条条带,多态率为100%,野生种间遗传多态性丰富。采用TFPGA数据分析软件,计算出Nei's相似系数和遗传距离,构建亲缘关系树状聚类图。野生种之间的遗传距离为0.0187~0.4941,种间遗传差异明显。其中,北黄花菜与黄花菜的遗传距离最小,矮萱草与黄花萱草之间的遗传距离最大。亲缘关系聚类图显示各种被聚为4组:北黄花菜、黄花某、萱草、小萱草、重瓣萱草为一组;西南萱草、折叶萱草和小黄花菜聚为另一组;黄花萱草和矮萱草各为一组。因此,矮萱草与其他种间亲缘关系最远;黄花萱草其次;黄花菜与北黄花菜亲缘关系最近;萱草、小萱草、重瓣萱草亲缘关系接近;西南萱草与折叶萱草、小黄花某亲缘关系接近。朱云华 苏倩 武文婷 李霞 施季森 2007南京林业大学学报(自然科学版)2007,31,6:5
9皮下盘菌属种内及种间遗传多样性的ISSR分子标记显示文摘对皮下盘菌属(Hypoderma)4种23个菌株进行了ISSR分析。结果表明,被试材料ISSR标记多态性好,8个引物共扩增出131个条带,其中126条(占96.18%)具有多态性。经欧氏最短距离中的类平均法聚类,得到各菌株之间的ISSR标记的遗传相似性系数(GS)变异范围为0.30~0.82,23个菌株可聚为6类。通过ISSR分析结果与表型性状的比较和分析,明确了悬钩子皮下盘菌种内遗传差异体现在子囊果大小、形状及埋生深度、唇特征、侧丝顶端形状、子囊和子囊孢子形状及大小,以及寄主、着生部位和分布区域方面;皮下盘菌属的种间差异主要表现在子囊果、唇、侧丝、子囊及分生孢子器等部分形态学特征、寄主及着生部位方面。于红梅 林英任 陈莉 刘艳兵 韩加军 高小明 顾婷婷 2009微生物学杂志2009,29,2:5
10DNA分子标记在木耳属真菌中的应用研究进展显示文摘介绍了目前已在木耳属真菌中广泛应用的几种DNA分子标记技术(RFLP、RAPD、AFLP、ISSR、SRAP、SCAR、ITS、IGS),以及这些标记在木耳属真菌系统发育、分类研究、种间和种内鉴定、遗传多样性分析等方面的应用,并展望了这些标记技术在木耳属真菌中的应用前景。杨晓兵 宋慧 刘麒 李胜南 潘祖桐 2010菌物研究2010,8,3:3
11石斛ISSR-PCR体系的优化显示文摘为奠定石斛的遗传多样性研究基础,利用单因素和正交试验相结合的方法对石斛ISSR-PCR分子标记体系进行优化筛选。结果表明,20μL扩增体系中含有62.42 ng模板DNA、1.0 mmol/L dNTP、0.375 U/μL Taq酶、1.85 mmol/L Mg2+、1.20μmol/L UBC810引物,最适退火温度为45.4℃。李盛清 张传博 乙引 高巍 杨立昌 2012江苏农业科学2012,40,8:3
122个茶花变异种与原种间的ISSR分析显示文摘对茶花变异种及原种进行ISSR分析,所选用的100个引物中有12个产生了较为清晰有效、重复性好的条带。12个引物共扩增出110条带,其中8个引物可扩增出多态性条带,多态位点百分率为11.8%。聚类分析表明,粉丹变异而来的金银丹与原种粉丹的遗传距离较小,由早春大红球变异而来的花早春与原种早春大红球的遗传距离较小,而粉丹和早春大红球2个种之间则差异较大。潘仙鹏 洪莉 干才连 华国伟 2010浙江农业科学2010,51,2:2
13散斑壳属ISSR-PCR反应条件的优化显示文摘以散斑壳属(Lophodermium)T29、T50、T62、R111菌株为研究材料,对该属ISSR-PCR反应体系中的模板DNA浓度、引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶浓度以及退火温度等条件进行优化,寻找出适合此类真菌ISSR-PCR反应的最佳反应体系为15μL反应体系中,模板DNA浓度为4~8ng/μL、引物浓度0.4~0.5μmol/L、Mg2+浓度2.0~2.5mmol/L、dNTPs浓度0.15~0.30mmol/L、TaqDNA聚合酶量1.5~2.5U,退火温度为52℃。韩加军 林英任 刘艳兵 于红梅 项艳 2008微生物学杂志2008,28,1:1
14针叶树生散斑壳属部分种内及近似种间亲缘关系的ISSR分析显示文摘应用ISSR分析技术,对22个散斑壳属(Lophodermium Chevall)菌株进行种内和近似种间亲缘关系的分析。通过欧氏最短距离中的类平均法聚类,得到各菌株之间的遗传距离在5.93~7.41之间,表明种内及近似种间有较丰富的遗传多样性。另外,在遗传距离7.12处,将22个供试菌株分为5类。通过ISSR分析结果结合表型性状的比较和分析,论证了子囊果埋生位置,子座、唇、子囊、子囊孢子等形态学特征以及寄主种类差异等在该类菌物种水平分类上的重要性。韩加军 林英任 郑倩 陈江琳 于红梅 刘艳兵 2009微生物学杂志2009,29,1:1
15送春与多花兰杂种ISSR-PCR反应体系的建立与优化显示文摘[目的]建立与优化送春与多花兰杂种ISSR-PCR的反应体系。[方法]用CTAB法提取送春、多花兰和送春×多花兰杂种的基因组DNA,针对ISSR-PCR扩增的体系中的Taq酶浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度和引物的用量4个因素,进行L9(43)正交试验,用引物UBC827扩增两亲本的混合DNA,所得PCR产物在琼脂糖凝胶上检测,同时针对去离子甲酰胺对反应的影响进行初步对照试验。[结果]根据PCR产物的琼脂糖凝胶检测结果,由试验得到的最佳反应体系为:1×buffer、2.5 mmol/L Mg2+、0.6μmol/L引物0、.25 mmol/L dNTP、1 UTaq酶、0.4μl去离子甲酰胺5、0 ng模板DNA,总体积为20μl。[结论]该反应体系的建立为利用ISSR技术进行兰花遗传连锁图谱构建、基因定位、种质资源鉴定与分类等提供参考。周丽 胡春根 2009安徽农业科学2009,37,17:1
16DNA分子标记在侧耳属真菌研究中的应用显示文摘介绍了目前已在侧耳属真菌中广泛使用的DNA分子标记技术(RFLP、RAPD、AFLP、ISSR、ITS、IGS标记)以及这些标记技术在侧耳属真菌系统发育和分类研究、菌种和菌株鉴定、遗传多样性和亲缘关系分析、遗传图谱构建和基因定位等方面的应用,展望了一些新分子标记技术在侧耳属真菌中的应用前景。高山 张金霞 边银丙 2008食药用菌2008,17,2:1
17海菜花ISSR-PCR反应体系的优化显示文摘以渐危植物海菜花基因组DNA为研究对象,筛选引物UBC-818[序列为(CA)_8G]研究并确定了该引物适宜的退火温度,对影响ISSR扩增效果的主要参数进行筛选和优化,确定了海菜花的ISSR分析的最佳反应体系:15μL反应体系中含25 ng模板DNA,0.2 mmol·L^(-1)引物,0.2μmol·L^(-1)dNTPs,2.0mmol·L^(-1)Mg^(2+),0.5 UTaq酶,1.5μL 10×PCR Buffer Mg^(2+)(-)[100 mmol·L^(-1)Tris-HCl(pH 8.3),500 mmol·L^(-1)KCl].李修岭 韩庆香 2009临沂师范学院学报2009,31,6:0
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