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| 1 | 中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析显示文摘【目的】采用SSR标记构建2008年中国3大棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从214对候选引物中筛选出36对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建棉花主栽品种DNA指纹图谱。【结果】36对SSR引物在32份材料中共扩增出142种多态性基因型,每对引物的基因型从2—11种不等,平均每对引物扩增出3.94种基因型。9对引物在10个品种上具有特征带型。最少采用5对引物进行组合鉴定即可将32个棉花品种完全区分开。NTSYS-pc V 2.10软件分析表明,长江流域棉区品种间遗传差异最大,新疆棉区次之,黄河流域棉区最小。常规品种的遗传基础窄于杂交陆地棉。【结论】核心引物组合法相比特征谱带法更适用于构建中国棉花主栽品种DNA指纹图谱,品种间的亲缘关系与地理来源有一定的相关性。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 | 2011 | 中国农业科学2011,44,1: | 126 |
| 2 | 玉米品种SSR标记毛细管电泳荧光检测法与变性PAGE银染检测法的比较研究显示文摘以192份玉米品种为材料,用7对SSR引物对毛细管电泳荧光检测和常规的变性PAGE银染检测两种SSR标记检测方法进行比较分析。结果表明,两种方法检测的SSR标记片段大小一致。毛细管电泳荧光检测法检测的结果更为精确、灵敏、高效,更适用于高通量材料的检测分析。对少量材料进行检测分析以及SSR标记的筛选时,使用常规的变性PAGE银染检测法更经济适用。 | 易红梅 王凤格 赵久然 王璐 郭景伦 原亚萍 | 2006 | 华北农学报2006,21,5: | 61 |
| 3 | SSR分子标记研究进展显示文摘SSR标记广泛分布于基因组中,呈孟德尔遗传,多态性丰富,信息量大,已被作为一种理想的分子标记之一而广泛应用。文中重点介绍了SSR标记的开发和SSR技术试验体系的研究进展,旨在为SSR分子标记的研究与应用提供参考信息。 | 罗兵 孙海燕 徐港明 扬志刚 沈宗根 顾雯雯 高阳 郑佳亮 | 2013 | 安徽农业科学2013,41,12: | 46 |
| 4 | 玉米叶片DNA快速提取方法改进研究显示文摘分子生物学研究需要大量的DNA样品,DNA的快速提取是提高研究效率的关键。研究比较多种植物DNA的提取方法,对部分实验步骤做了修改,建立了适于玉米叶片DNA微量快速提取的新方法。该方法不仅操作步骤简单、速度快、省时间,而且可以确保提取的玉米基因组DNA有足够的浓度和纯度。利用此方法,在一般实验室条件下每人每天可以提取150~200个DNA样品,一个DNA样品可供50~60次PCR反应使用,DNA质量可以确保一般的PCR扩增,适用于玉米遗传多样性、分子标记辅助选择、引物筛选和分子标记定位等多种研究目的。 | 卢振宇 李明顺 谢传晓 李新海 曲延英 张世煌 | 2008 | 玉米科学2008,16,2: | 35 |
| 5 | 单粒棉花种子DNA快速提取方法显示文摘本研究以棉花干种子为材料,探索一种适用棉花品种SSR分析的DNA快速提取方法。先采用SDS提取液进行一步裂解,并将RNA的去除操作融入抽提过程,从而简单快速的获得高质量棉种基因组DNA。紫外检测与琼脂糖凝胶电泳检测结果均表明,所得DNA纯度高,完整性好。另外,SSR分析结果也显示,扩增带型清晰易辨,重复性与稳定性好。相比常规的以棉花幼苗叶片为材料的DNA提取法,本方法在降低实验成本的同时大大提高了工作效率。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 | 2010 | 分子植物育种2010,8,4: | 33 |
| 6 | 利用SSR标记进行玉米品种一致性检测研究显示文摘为了评估SSR标记在玉米品种一致性鉴定中的应用价值及确定基于SSR标记的玉米一致性鉴定标准,利用13个SSR标记对213份来自2004年国家区域试验的玉米单交种(包括16份重复材料)进行了一致性分析,每个品种取20个个体,除在染色体6和8上各选取了2个和3个标记外,其他染色体上均各选取1个SSR标记。结果显示:一致性检测中异型带的类型有7种,每种出现的概率不同;不同品种在不同引物位点的一致性分布情况差别较大。比较位于同一染色体的引物一致性检测结果,发现在相同染色体上位置较近的不同引物一致性检测结果具有较高的相关性,因此提出在选用一致性检测的引物时应遵循均匀分布的原则,减少引物间的相关性。通过剔除自交个体对品种一致性比率进行校正(仅有7个品种),校正值可反映品种真实的遗传一致性和稳定性。综合考虑品种在单个引物位点的一致性和在所有位点的平均一致性,提出了划分玉米品种一致性级别的标准。 | 王凤格 赵久然 戴景瑞 王璐 易红梅 郭景伦 孙世贤 廖琴 杨国航 | 2007 | 分子植物育种2007,5,1: | 29 |
| 7 | 小麦SSR分析体系的简化显示文摘SSR标记具有多态性高、实验重复性好和共显性遗传的特点,被广泛应用在作物遗传育种研究中。其实验流程主要包括基因组DNA提取、PCR扩增和PAGE凝胶电泳与染色。本实验比较了3种DNA提取方法从小麦不同组织提取DNA的效果和3种PAGE凝胶银染方法,建立了一套经济、快捷的SSR分析体系。 | 季伟 王立新 孙辉 王茅雁 赵昌平 | 2007 | 农业生物技术学报2007,15,5: | 30 |
| 8 | 棉花杂交种纯度的SSR标记检测及其与田间表型鉴定的相关性显示文摘以分布于棉花26条染色体的36对SSR核心引物,在6份成套中棉所系列杂交种间筛选双亲互补型杂合位点作为纯度检测标记,采用单位点平均法与双位点差异法统计SSR标记检测结果;在棉铃期考察棉花株型、铃形、叶形、花及茎等性状,比对田间表型与分子检测结果,分析相关性。结果表明,34对核心引物在6个杂交种上获得101个杂合位点,平均每个杂交种具有16.8个。田间表型鉴定结果高于分子标记检测结果,单位点平均法的相关性高于双位点差异法,校正后的相关性进一步提高,相关系数r=0.7841,呈高度相关。EST-SSR标记的检测结果与田间表型鉴定结果的相关性显著高于Genomic-SSR标记。相同染色体上的不同引物检测结果差异较小。不同的统计方法与标记类型获得的分子标记检测结果差异较大。高度纯合的亲本将会有效提高分子标记鉴定结果与表型鉴定结果的相关性。 | 匡猛 杨伟华 张玉翠 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅 周红 | 2011 | 作物学报2011,37,12: | 26 |
| 9 | 水稻Wx基因的遗传多态性及其与主要米质指标的相关性分析显示文摘利用RM190和484/W2R-ACCⅠ标记分析了50个水稻非糯品种的Wx基因的等位性变异。其中,RM190揭示出7种(CT)n纯合变异类型和1种杂合类型,分别为(CT)20、(CT)19、(CT)18、(CT)17、(CT)14、(CT)11、(CT)10和(CT)11/(CT)18,并以(CT)11和(CT)18两种类型为主;484/W2R-ACCⅠ共揭示出2种纯合类型和1种杂合类型,分别为G/G型、T/T型及G/T型;(CT)11大多为G/G型,(CT)18大多为T/T型,这两个标记可将供试材料划分为10种等位基因变异类型。进一步分析表明,RM190揭示的Wx基因多态性可以解释直链淀粉含量变异的59.3%;484/W2R-ACCⅠ揭示的Wx基因多态性可以分别解释直链淀粉含量及胶稠度变异的56.1%和24.6%;而两标记共同可解释直链淀粉含量变异的72.4%。还对这两个标记在育种实践中的应用前景进行了探讨。 | 万映秀 邓其明 王世全 刘明伟 周华强 李平 | 2006 | 中国水稻科学2006,20,6: | 21 |
| 10 | 玉米SSR分子标记技术操作规程的优化显示文摘[目的]建立玉米SSR标记技术操作规程,为其在生产中应用提供参考。[方法]以2个玉米杂交种(黔单16号、西山99)和4个玉米自交系(苏37、交51、黄C、4011)为试材,从玉米中提取基因组DNA,分别对不同DNA提取方法、SSR反应体系、PCR扩增程序和银染方法进行比较。[结果]采用SDS法、CTAB法提取DNA的扩增效果较好。玉米的最佳SSR反应体系为:1U Taq酶,1×Bufer,60ng模板DNA,2.0 mmol/LMg2+,0.15 mmol/LdNTPs,0.3μmol/L引物。最佳SSR扩增程序为:93℃,1 min;93℃,1 min;60℃,2 min;72℃,2 min,30个循环;72℃,5 min。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶或6%变性聚丙烯酰胺凝胶来检测玉米SSR标记较好。[结论]采用优化的SSR标记检测体系,对贵州51份玉米杂交种进行遗传多样性分析,大多数引物扩出清晰条带。 | 王伟 杨文鹏 关琦 张文龙 戴保威 | 2008 | 安徽农业科学2008,36,11: | 19 |
| 11 | 聚丙烯酰胺凝胶电泳银染的影响因素显示文摘聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳是一种常用的DNA检测方法,广泛应用于现代生物技术研究。PAGE电泳中的银染技术复杂,银染过程中所要用到的聚丙烯酰胺、过硫酸铵、硝酸银等几种药品的浓度和作用时间直接影响实验效果。6%的凝胶分辨率较高;0.2%比0.1%硝酸银显带灵敏度高;甲醛浓度在0.1%~0.2%(体积比)范围内显色差异不大;1.5%和3%氢氧化钠显色结果无差别;10 mg/mL的硫代硫酸钠用量应为100~200μL/L;弱碱、强碱和改良银染法各有其优缺点,研究者可根据研究需求选择适合的银染方法。弱碱法染色背景浅,适于品种指纹图谱分析。强碱法及简易银染法具有高效率、低成本和操作简便的特点,适用于分子标记辅助育种。 | 王竹林 杨睿 刘联正 钟欢 刘曙东 胡甘 | 2011 | 实验室研究与探索2011,30,9: | 19 |
| 12 | 分子标记技术在农作物品种鉴定上的研究进展及未来展望显示文摘概述了以AFLP、ISSR、SRAP以及SSR等4种主要的分子标记技术在农作物品种鉴定上的研究进展,提出了SSR将是未来利用分子标记技术鉴定品种纯度以及品种DUS测试的首选分子标记技术。同时介绍了在快速鉴定品种纯度上的研究进展,并预测未来利用互联网技术将分子标记指纹图谱和农作物品种形态学特征相结合实现品种快速检索、不同品种之间数字指纹比对以及比对信息快速输出以实现品种的快速鉴定,实现在农作物任何生长期均可达到快速鉴定品种纯度和真实性的目的,促进农作物品种权的保护以及中国种业的健康发展。 | 吴则东 江伟 马龙彪 | 2015 | 中国农学通报2015,31,33: | 17 |
| 13 | 玉米SSR分子标记技术操作流程研究进展显示文摘SSR分子标记是一种基于PCR技术的分子标记技术,以其多态性高、共显性遗传、检测简单等优点在玉米品种鉴定、杂种优势类群划分等方面有广泛的应用。DNA提取、PCR扩增、产物检测是玉米SSR分子标记的技术流程的重要环节。尽管出现了一些能够整合SSR标记流程几个环节甚至是整个流程的实验设备,但这样的仪器常常本身价格昂贵,实验药品、耗材等成本也很高。因此,近年来,科研人员对玉米SSR分子标记技术流程各步骤进行大量的优化和改进,使实验过程更加简化、高效。为此综述了玉米SSR分子标记技术流程的DNA提取、PCR扩增、产物检测3个关键环节,分析认为这一技术流程的发展体现了实验试剂集成化、实验操作标准化、实验流程自动化的总体趋势。 | 曹士亮 曹靖生 王成波 贺强 | 2012 | 中国农学通报2012,28,15: | 16 |
| 14 | 32个甜菜品种指纹图谱构建与遗传多样性分析显示文摘为了对国外引进的甜菜品种进行鉴别以及分析不同甜菜品种之间的亲缘关系,利用SSR标记构建了32份引进甜菜品种的指纹图谱并进行了遗传多样性分析。从101对SSR引物中筛选出了21对谱带清晰、易于识别的引物,这21对引物共检测出127个等位位点,其中多态性位点为107个,多态性比率为83.6%,每对SSR引物扩增出的等位位点数为2-11个,平均每对引物扩增出6.1个基因型,扩增的条带大小在90-500 bp之间。利用3对引物SB04、S6和S7的引物组合构建的指纹图谱就能够区分32个品种。聚类分析结果表明,在遗传距离0.17处,所有的供试品种被分为3类,从分子水平上说明甜菜品种之间的遗传基础比较狭窄。聚类分析结果与甜菜品种的来源具有很好的一致性,基本上是同一公司或者同一国别的品种被聚在了一起。 | 吴则东 王茂芊 吴玉梅 王华忠 马龙彪 | 2015 | 中国农学通报2015,31,12: | 15 |
| 15 | 基于SSR标记的越橘亲缘关系分析及品种鉴定显示文摘利用SSR标记对22个越橘栽培品种进行遗传差异及亲缘关系分析,并建立一套稳定的越橘品种鉴定体系,以期为越橘种质资源评价、鉴定、管理及越橘新品种培育奠定基础。本试验优化了一套越橘SSR-PCR反应体系,筛选出15个条带清晰、重复性好、多态性高的SSR标记,对22个越橘栽培品种进行亲缘关系分析,聚类结果与各品种的遗传背景以及表型呈现高度的一致性。从以上15个SSR标记中筛选出可用于越橘品种鉴定的SSR核心引物NA961和NA1040,核心引物组合能够完全区分22个越橘品种。用核心引物制作了参照分子量标记,构建了22个越橘品种的指纹图谱,建立了一套完整的越橘品种鉴定体系。实践验证SSR标记用于越橘品种鉴别的方法可行、结果可靠。 | 郭照东 夏秀英 安利佳 吕敏 李波 房文秀 高弘扬 | 2015 | 植物遗传资源学报2015,16,5: | 14 |
| 16 | 基于表型和SSR标记的梅花种质资源遗传多样性分析显示文摘为了提高梅花种质资源保存的效率和种质创新,本研究利用表型性状和SSR分子标记技术对11份梅花种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,11份种质资源表型性状具有丰富的变异类型,11个数量性状在群体间差异均达到极显著水平(p<0.01),品种内变异系数和品种间变异系数最大值均为核重(10.49%和103.56%),均值分别为6.26和26.16;遗传多样性指数(H’)的变幅为1.16~1.76,均值为1.44。24对SSR引物共检测到79个等位基因,平均为3.251 7,有效等位基因数在1.219 5~4.566 0之间,均值为2.537 3;香农信息指数(I)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)的变化分别为0.325 1~1.555 8、0.180 0~0.781 0、0.189 5~0.8182,均值分别为0.984 5、0.565 5、0.603 8;多态信息含量(PIC)值在0.163 8~0.745 1之间,均值为0.502 1;Q型聚类和基于UPGMA聚类的结果部分一致,遗传相似系数在0.445 8~0.807 2之间。综上看出,供试材料优良性状突出,遗传变异丰富,为新品种的选育提供帮助。 | 赵靓 罗燕杰 肖思文 蔡亚南 何立飞 遆羽静 李庆卫 | 2019 | 分子植物育种2019,17,13: | 10 |
| 17 | 适于甜菜品种鉴定的SSR核心引物的筛选显示文摘为了筛选出适合于甜菜杂交种鉴定的核心引物,以16个在中国种植面积较大的进口甜菜品种为材料,对已公布的130对甜菜SSR引物以及70对甜菜EST-SSR引物进行筛选。结果从200对甜菜SSR引物中筛选出了24对扩增条带清晰、重复性好且多态性高的核心引物。这24对引物中有22对引物的PIC值大于0.5,其中7对引物的PIC值均大于0.8,可以作为甜菜品种鉴定的首选核心引物。利用筛选出的核心引物对16个甜菜品种进行聚类分析,结果16个品种分为3类,基本上是同一公司的品种聚在了一起。甜菜SSR核心引物的筛选将大大加速甜菜品种纯度和真实性鉴定的速度,也将更快的促进甜菜分子生物学其他领域的发展。 | 吴则东 王茂芊 马龙彪 王华忠 倪洪涛 | 2015 | 中国农学通报2015,31,15: | 10 |
| 18 | 一种适用于甜菜大规模快速提取DNA的方法显示文摘目前甜菜DNA提取通常使用CTAB法,大多数人仍采取研钵研磨的方法,但是在大批量提取DNA的时候,该方法耗时费力,提取效率较低。为了提高提取DNA的效率以适应大规模PCR的需求,我们创新了使用CTAB提取DNA的方法。该方法为先在离心管放入钢珠,然后把样品放入离心管中,放入到液氮中冷冻后直接使用震荡研磨机研磨后,再利用CTAB法进行提取,结果表明,该法点提取的DNA浓度和纯度均表现较好,并且将提取的DNA用于SSR引物的扩增,所得条带清晰,实验结果较好,可提高效率30%。 | 闫彩燕 邹奕 吴则东 兴旺 李红侠 | 2018 | 中国糖料2018,40,6: | 8 |
| 19 | 小麦株高发育动态QTL定位及其与水分环境互作遗传分析显示文摘株高是影响小麦产量的重要农艺性状,对生境水分极为敏感。为探讨小麦不同发育时期株高数量性状遗传与水分环境互作,本研究利用抗旱性强的冬小麦(TriticumaestivumL.)品种陇鉴19与水地高产品种Q9086杂交,重组近交系(RIE)群体120个株系为供试材料,测定两试验环境(甘肃镇远和兰州)雨养(干旱胁迫,DS)和灌溉条件下不同发育时期株高,采用条件复合区间作图法进行株高发育动态数量遗传位点(quantitativetraitloci,QTL)分析。共检测到26个条件加性QTL(A.QTL)和56对上位性QTL(AA—QTL)。在A—QTL中,Qph.tiC8—1A—J、Qph.acs-4B-2、Qph.CtCS-5A-f、Qph.acs-5D-I、Qph.acs-6B-2和Qph.acs-7D-J在开花期前能重复表达,且有相对较高的贡献率(H2(A)))(7.39%~31.04%)。AA-QTL主要由非显著加性效应的位点间互作形成,贡献率(Hz似A))在1.38~24.27%之间,这些AA-QTL效应对后期株高有显著影响。有61.54%的A—QTL和58.93%的AA.QTL分别参与了水分环境互作,在雨养条件下普遍具有降低株高的效应。条件A—QTL的加性效应在拔节期最大,随后逐渐降低,更多的体现出上位性效应。说明控制小麦株高发育的数量性状基因易与水分环境发生互作,且在小麦不同发育阶段有不同的时空表达模式。本研究结果可为小麦抗旱遗传研究与分子改良提供基础资料。 | 张国宏 杨德龙 栗孟飞 李兴茂 倪胜利 幸华 | 2012 | 农业生物技术学报2012,20,9: | 7 |
| 20 | 水稻小穗退化突变体spd-hp73的遗传分析及基因定位显示文摘为了深入研究水稻幼穗发育及调控机制,经60 Co-γ射线诱变处理,获得一小穗退化突变体spd-hp73。经考察,与野生型hp73(CK)相比,该突变体生长势较弱,生育期提早,株高偏矮,分蘖数较少,包颈明显;同时,还显示出异常的花序结构,主要包括小穗严重退化,每穗粒数显著减少,着粒密度很低和结实率下降等。遗传分析表明,spd-hp73小穗退化突变性状受1对隐性基因控制,暂命名为spd-hp73。利用519个SSR分子标记,以spd-hp73×浙7954的448个单株F2作为定位群体,将小穗退化突变基因spd-hp73初步定位在第4染色体长臂RM471和RM273之间,与RM471和RM273的遗传距离分别为12.2cM和9.4cM。该结果为突变基因的精细定位和克隆奠定了良好基础。 | 任三娟 孙出 童川 赵霏 舒庆尧 沈圣泉 | 2013 | 浙江大学学报(农业与生命科学版)2013,39,3: | 7 |