Crop Breeding Chips and Genotyping Platforms: Progress, Challenges, and Perspectives

查看全文 作　　者：Awais [1,2]Rasheed;Yuanfeng [1]Hao;Xianchun [1]Xia;Awais [3]Khan;Yunbi [1,2]Xu;Rajeev K. [4]Varshney;Zh-onghu [1,2]He

机构地区：[1]Institute of Crop Sciences, National Wheat Improvement Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Beijing 100081, China;[2]International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMY-F), c/o CAAS, Beijing 100081, China;[3]Department of Plant Pathology and Plant-Microbe Biology, Cornell University, Geneva, NY, USA;[4]International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru 502324, India

出　　处：《Molecular Plant》索引2017年第10卷第8期,共18页

基　　金：This study was supported by the National Key Research and Development Program of China (2016YFD0101802 and 2016YFE0108600) and National Natural Science Foundation of China (31550110212). 摘　　要：在为基因在领域庄稼和树印射和发现的分子的标记试金的开发和应用程序有一个很快升起的趋势。因此 ? 远,超过 50 个 SNP 数组和 genotyping-by-sequencing (GBS ) 的 15 种不同类型平台在超过 25 庄稼种类和长期的树被开发了。然而,少得多努力在为引起程序使用开发 ultra-high-throughput 和划算的 genotyping 平台上被作了。在这评论,我们在存在 SNP 数组和 GBS 技术和策略讨论科学瓶颈开发指向的平台为收割分子的繁殖。我们建议实际繁殖平台应该采用的那未来自动化了 genotyping 技术,任何一个数组或定序基于,目标 ? 功能的多型性 underpinning 经济特点,并且为量的特点提供理想的预言精确性,用在在庄稼的宽基因背景下面的通用应用程序。如此的平台的发展在庄稼植物由于大遗传型显型差距由于费用低效率,和知识水平在工艺的水平面对严肃的挑战。如此的 genotyping 平台将在考虑在主要庄稼在下一十年里被完成,这被期望?(a)快速的开发?在重要特点的基因发现,(b)通过新分析模型和人口图案加深了量的特点的理解,导致基因和为重要繁殖特点负责的小径的鉴定的多层的 -omics 数据的(c)集成,和在大规模 genotyping 的费用有效性的(d)改进。庄稼繁殖芯片和 genotyping 平台将提供崭新的机会与减轻气候变化的效果的需要的收益潜力,质量,和提高的改编加速栽培变种的开发。 关键词：基因分型技术作物育种技术平台芯片成本效益展望分子标记分析农艺性状基因

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