Genome-Wide Analysis of DNA Methylation in Soybean

查看全文 作　　者：Qing-Xin [1,2]Song;Xiang [1]Lu;Qing-Tian [1]Li;Hui [1]Chen;Xing-Yu [1]Hu;Biao [1]Ma;Wan-Ke [1]Zhang;Shou-Yi [1]Chen;Jin-Song [1]Zhang

机构地区：[1]State Key Lab of Plant Genomics, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;[2]University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China

出　　处：《Molecular Plant》索引2013年第6卷第6期,共14页

基　　金：973 project,National Natural Science Foundation of China,Transgenic Research Project 摘　　要：Cytosine methylation 是为基因表示和 transposable 元素(TE ) mobilityduring 植物的动态规定的重要机制发展过程。这里,我们鉴别用高产量的 sequencingand 的基因的抄写开始地点然后在在 single-baseresolution 开发种子的大豆根,茎,叶子,和子叶分析了 DNA methylation 地位。在不同机关 DNA methylation 介绍在机关之中揭示了 2162 个差别 methylated 区域,并且 hypomethylated 区域的部分与附近的基因的高表示被相关。因为一级 TE (retrotransposons ) 和类 II TE (DNA transposons ) 的 differentdistribution, CG 和 CHG methylation 的低快车的 genesshowed 高水平的倡导者但是 CHH methylation 的底层。我们进一步发现班 II TE 的 CHH methylationlevel 比一级 TE 高,可能由于在班 II TE 的更多的 smRNAs 的存在。在开发种子的 cotyledonsof, smRNA 丰富断然粗略地与 hypermethylated 区域,但是否定地被相关 relatedto hypomethylated 区域。这些研究在 soybean.Key 词在 DNA methylation, smRNA 丰富, TE 分发,和基因表示之中提供重要卓见进复杂相互影响: 关键词：DNA甲基化基因组分析大豆反转录转座子甲基化水平跨国企业发育过程转录起始位点

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