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| 1 | 四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析显示文摘由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae )侵染引起的稻瘟病是全球水稻生产上最严重的病害之一.利用6对 SSR 荧光标记对采自四川绵阳、营山、雅安、北川和武胜地区的5个稻瘟病菌群体的遗传结构进行分析.结果表明,在124个稻瘟病菌中检测出43个等位基因,平均每个位点的观测等位基因数为7.2,有效等位基因数为3.1,所有位点均显著偏离 Hardy-Weinberg平衡.5个群体的平均观测杂合度(0.374)低于期望杂合度(0.502),暗示群体内存在因近交而导致的杂合子缺失. AMOVA 分析显示,绝大多数遗传变异(81.17%)存在于群体内个体间,仅有18.83%的变异来自于群体间的差异.5个地理群体间呈现高水平的遗传分化(遗传分化系数为0.057~0.528).Mantel 检验表明,群体间的遗传距离与地理距离相关未达显著水平,说明稻瘟病菌的遗传变异呈现随机分布的空间模式.群体遗传学数据分析表明5个群体间存在不同程度的基因流(基因流水平为0.472~4.347),基于贝叶斯聚类法的 Structure 分析也证实了这一结果. | 王玲 左示敏 张亚芳 陈宗祥 潘学彪 黄世文 | 2015 | 中国水稻科学2015，29，3： | 17 |
| 2 | 植物病原菌SSR标记开发与利用显示文摘SSR标记具有共显性、高多态性、位点专化性、稳定性好、操作技术简单等特点,是十分理想的分子标记。随着一些简单、经济和高效的SSR分离技术的发展,SSR标记已逐渐在植物病原菌中被开发和利用。本文综述了植物病原菌中SSR标记的主要开发策略及其应用进展。 | 徐静静 蔺宇 朱振东 | 2008 | 植物保护2008，34，1： | 14 |
| 3 | 我国棉花黄萎病菌基于SSR的遗传多样性分析显示文摘为了对棉花黄萎病菌群体的遗传多样性进行研究,以棉花黄萎病菌基因组DNA为模板,用双因素和单因素水平优化的方法对SSR反应体系的重要参数进行摸索和优化,建立了最适反应体系。从300对引物中筛选出13对多态性较高的引物,并对来自我国12个省96个县(市)的170个棉花黄萎病菌株进行SSR分析。SSR图谱的聚类分析结果将供试菌株划分为2个群体:群体Ⅰ有26个菌株,其中18个为新疆菌株,占69.23%;群体Ⅱ有144个菌株,其中138个为内地菌株,占95.83%。新疆菌株与其它省份的菌株存在明显差异,SSR指纹图谱与菌株地理来源存在显著的相关性,而与菌株致病力强弱没有表现出相关性,但弱致病力菌株可能更容易发生遗传变异。 | 尹志新 朱荷琴 李志芳 冯自力 | 2011 | 棉花学报2011，23，4： | 12 |
| 4 | 桃江和浏阳病圃稻瘟病菌遗传多样性的SSR分析显示文摘2009年,在桃江和浏阳采集了26个品种上的稻瘟病标样,经单孢分离获得162个稻瘟病菌株,利用10对SSR引物进行了遗传多样性分析。结果表明,在0.80的相似水平上,162个菌株划分为23个宗谱,L01为优势宗谱,占总菌数的72.8%;在2个病圃相同品种上分离得到的59个菌株归属16个宗谱,桃江病圃的有13个宗谱,浏阳病圃的有5个宗谱,其中相同的宗谱有2个,相异的宗谱有14个,各占12.5%和87.5%;空中捕捉的21个菌株归属6个宗谱,属优势宗谱L01的有16个菌株,占76.2%,说明空中捕捉的菌株多数来自于病圃中的优势宗谱。研究还表明,2个病圃中的稻瘟病菌均具有遗传多样性,且特点各异;病菌宗谱与水稻品种之间有一定的相关性;来源于同一病圃的菌株亲缘关系较为密切。 | 白珍安 任佐华 毛莹 周翎 李书 刘二明 | 2011 | 湖南农业科学2011，，4： | 8 |
| 5 | SSR标记及其在水稻遗传育种中的研究进展显示文摘SSR标记广泛应用于作物遗传育种,呈共显性,具有多态性丰富、重复性好、技术难度较低等优点。就SSR标记的原理、特点以及SSR标记在水稻遗传育种中的研究状况进行了综述。 | 吴朝晖 | 2007 | 湖南农业科学2007，，3： | 5 |
| 6 | 黑龙江省稻瘟病菌遗传多样性研究显示文摘利用8个代表性菌株从153对引物组合中筛选出多态性高且稳定性好的10对引物组合,对来自黑龙江省各水稻主要产区的214个稻瘟病菌菌株进行RSAP(Restriction site amplified polymorphism)分析,得到134条多态性条带,经聚丙烯酰胺凝胶电泳,得到196个不同单元型(带型)的代表性菌株的指纹图谱。用UPGMA进行聚类分析,以相似系数0.83为界,将214个菌株196个单元型划分为10个遗传宗谱,10个遗传宗谱在黑龙江省的分布存在明显地域差异。 | 张俊华 刘扬 孙洪利 潘春清 刘洋大川 张明 王中业 | 2013 | 东北农业大学学报2013，44，1： | 4 |
| 7 | 湖南省草莓灰霉病菌遗传多样性研究显示文摘为探明湖南省草莓灰霉病菌群体遗传结构、分化及变异规律,采用荧光标记技术对湖南省9个地理菌群的180株草莓灰霉病菌基因组DNA进行SSR分析。结果表明:9对SSR引物共检测到56个观察等位基因(Na),平均值为6.22;有效等位基因(Ne)为1.27-4.89,平均值为3.44;不同位点的基因多样性指数(H)为0.21-0.80,平均值为0.65;不同位点Shannon’s信息指数(I)为0.37-1.83,平均值为1.34。供试180株样品9个SSR多态性位点上多态性信息量PIC变化范围为0.13-0.91,不同位点PIC差异大,这一规律与I和H基本一致。不同SSR位点总的遗传多样性(Ht)为0.21-0.77,平均值为0.65;群内遗传多样性(Hs)为0.19-0.50,平均值为0.40;遗传分化系数(Gst)为0.10-0.46,平均值为0.37;基因流(Nm)为0.58-4.47,平均值为1.16。不同地理菌群平均观察等位基因(Na)、有效等位基因数目(Ne)分别为2.93和2.07,Shannon’s信息指数(I)平均为0.67,基因多样性指数(H)平均为0.40,平均多态性位点数(NP)、多态位点百分率(P)分别为6.78和75%。依据不同地理菌群之间的遗传距离(0.2797-1.9225),将供试湖南省9个地理菌群分为4大类:第Ⅰ大类主要由长沙、邵阳、岳阳、衡阳、张家界、湘潭种群组成;第Ⅱ大类主要由郴州种群组成;第Ⅲ大类主要由株洲种群组成;第Ⅳ大类由常德种群组成。总之,湖南省各地草莓灰霉病菌群体遗传多样性丰富,但地理群体间差异小,病菌遗传变异主要来自群体内部,不同地区间存在病菌的移动。 | 刘双清 王翀 张亚 廖晓兰 马文月 柏连阳 | 2016 | 中国蔬菜2016，，7： | 4 |
| 8 | 稻瘟病菌重组研究概要显示文摘稻瘟病菌变异机制极其复杂,有性重组和准性重组可能起着重要作用,但在田间植株上还未找到直接证据,并综述了这两种变异机制的研究进展。 | 孟军 赵明富 何月秋 | 2005 | 江西农业大学学报2005，27，3： | 3 |
| 9 | Genetic diversity of Ustilago hordei in Tibetan areas as revealed by RAPD and SSR显示文摘Covered smut, which is caused by Ustilago hordei(Pers.) Lagerh., is one of the most damaging diseases of highland barley(Hordeum vulgare Linn. var. nudum Hook. f) in Tibetan areas of China. To understand the molecular diversity of U. hordei, a total of 27 isolates, which were collected from highland barley plants from Tibet, Sichuan, Qinghai, and Gansu provinces/autonomous region, were analyzed using random amplified polymorphic DNA(RAPD) and simple sequence repeat(SSR) markers. Among the 100 RAPD primers used, 24 primers exhibited polymorphism. A total of 111 fragments were amplified, of which 103 were polymorphic with a polymorphic rate of 92.79%. The average observed number of alleles(Na), effective number of alleles(Ne), Nei's genetic diversity(H), Shannon's information index(I) and polymorphism information content(PIC) value in the RAPD markers were 1.9279, 1.5016, 0.2974, 0.4503 and 0.6428, respectively. For the SSR markers, 40 of the 111 primer pairs exhibited polymorphism and provided a total of 119 bands, of which 109 were polymorphic and accounted for 91.60% of the total bands. The Na, Ne, H, I and PIC values of the SSR markers were 1.9160, 1.4639, 0.2757, 0.4211 and 0.4340, respectively. The similarity coefficients ranged from 0.4957 to 0.9261 with an average of 0.7028 among all the 27 isolates used. The dendrogram, which was developed based on the RAPD and SSR combined marker dataset showed that the 27 U. hordei isolates were divided into 3 clusters at similarity coefficient of 0.7314. We determined that RAPD and SSR markers can be successfully used to assess the genetic variation among U. hordei isolates. The RAPD markers revealed higher levels of genetic polymorphism than did the SSR markers in this study. There existed a moderate genetic difference among isolates. The molecular variation and differentiation was somewhat associated with geographical origin but not for all of the isolates. | ZHOU Yu CHAO Gui-mei LIU Jia-jia ZHU Ming-qi WANG Yang FENG Bai-li | 2016 | Journal of Integrative Agriculture2016，15，10： | 2 |
| 10 | SSR标记及在水稻遗传育种中的应用显示文摘SSR标记是在PCR基础上发展起来的新型分子标记,已开始应用于基因组研究的各个领域。概述了SSR类型、特点、原理,总结了其在水稻遗传育种方面的应用,并讨论了其所存在的问题。 | 张桂莲 陈立云 张顺堂 雷东阳 | 2004 | 作物研究2004，18，S1： | 1 |
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