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| 1 | 高温胁迫下半夏叶片的转录组分析显示文摘【目的】通过分析高温(38℃)胁迫下半夏(Pinellia ternate)叶片转录组数据,挖掘其响应高温胁迫相关的基因,探究高温胁迫影响半夏的分子机制。【方法】通过Illumina HiSeq测序对高温胁迫处理后的半夏叶片进行转录组分析,并用qRT-PCR技术对DEGs进行验证。【结果】转录组测序共获得38.48 Gb Clean data,与对照组(25℃)相比,高温处理后1138个DEGS上调表达,578个DEGs下调表达。GO富集分析表明,DEGs主要集中在转录因子复合体、内肽酶活性和血红素结合;KEGG富集分析表明,内质网蛋白质加工代谢通路的DEGs最多。基因表达水平分析表明,植物激素信号转导相关基因(PtARP1、PtGRP1、PtABF)、7个谷胱甘肽S转移酶基因PtGST和23个热激蛋白基因PtHSP在高温胁迫下表达量上调。qRT-PCR分析结果表明,9个DEGs在高温胁迫下的差异表达与转录组分析结果一致。【结论】通过对高温胁迫下半夏叶片进行转录组分析,挖掘高温胁迫相关基因,为进一步研究半夏高温胁迫响应机制提供理论参考。 | 郭连安 莫让瑜 谭均 潘媛 陈大霞 | 2022 | 甘肃农业大学学报2022，57，3： | 3 |
| 2 | 基于转录组分析高温胁迫下云南山茶抗氧化酶相关基因变化规律显示文摘【目的】探究云南山茶对高温胁迫的内在响应机理,筛选参与抗高温胁迫的抗氧化酶相关基因,并分析抗氧化酶相关基因的变化规律。【方法】选择40℃为胁迫温度对云南山茶幼苗进行处理,并在0、24、72h、re48 h(恢复48 h)、re72 h(恢复72 h)的时间节点,测定云南山茶叶片的抗氧化酶活性,同时对云南山茶叶片进行转录组测序,筛选出可能参与高温调控的抗氧化酶相关基因,对其富集通路进行分析并探究相关基因的变化规律。【结果】40℃高温胁迫下,云南山茶通过提高超氧化歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)等抗氧化酶活性来抵御高温胁迫;与CAT和SOD相关的基因集中富集在KEGG过氧化物酶体(Peroxisome)通路上,POD相关基因则富集在苯丙烷生物合成(Phenylpropanoid biosynthesis)通路中。CrSOD1、CrSOD10等5条基因的表达量与SOD活性变化趋势一致,而CrSOD5和CrSOD6等8条基因的表达规律与SOD活性变化趋势相反。其中CrSOD10、CrSOD20以及CrSOD17这3条基因与SOD活性有显著相关性(P<0.05)。CAT的相关基因中,未发现与CAT活性变化趋势一致的基因。CrPOD51和CrPOD58表达量与POD活性变化规律相同,CrPOD73等基因则存在相反的表达规律,其中CrPOD2等32条基因的表达量与POD活性呈极显著相关(P<0.01)。【结论】探究了云南山茶在高温胁迫下抗氧化酶相关差异基因的变化规律,发现了在云南山茶对抗高温胁迫的过程中可能起重要作用的抗氧化酶相关基因。 | 柏松 张冰 林先玉 屈燕 | 2023 | 西南农业学报2023，36，12： | 0 |
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