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| 1 | 基于网络药理学探讨丹参、三七药对干预血管新生的分子机制显示文摘目的:运用网络药理学方法研究丹参、三七药对干预血管新生,治疗心血管疾病的潜在活性成分和可能的作用机制。方法:利用中药系统药理学技术平台数据库(TCMSP)和蛋白质序列数据库(UniProt)筛选出丹参、三七口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18的主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards等数据库获取血管新生靶点基因。将成分靶点与疾病靶点上传至STRING数据库和Cytoscape软件,构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白PPI网络,并根据其度值筛选出关键靶点。通过R x64软件进行GO功能富集分析和KEGG富集分析。结果:共获取丹参、三七有效成分66个,与血管新生交集的核心靶蛋白有23个,包括RELA、FOS、MMP9、TP53、AKT1等基因,主要富集在AGE-RAGE、MAPK、IL-17、TNF和松弛素等信号通路。结论:本研究结果初步预测了丹参、三七药对对血管新生的作用机制,并为进一步深入揭示其通过干预血管新生,治疗心血管疾病的分子机制提供了理论基础。 | 陈硕 蒲翔 李娜 陈梦璐 华宝莹 王昊天 唐依莲 田丹 李来来 | 2022 | 贵州中医药大学学报2022，44，3： | 3 |
| 2 | 基于网络药理学及分子对接探讨瓜蒌薤白半夏汤合涤痰汤治疗冠心病的作用机制显示文摘目的探讨瓜蒌薤白半夏汤合涤痰汤治疗冠心病的作用机制。方法运用网络药理学预测作用机制,并用分子对接进行验证。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选活性成分和预测其对应靶点,检索文献补充活性成分;通过GeneCards、OMIM数据库获得冠心病相关靶点;利用Cytoscape软件构建分析网络,STRING网站分析靶点蛋白的相互作用(PPI),关键靶点在Metascape网站进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析。结果共收集162个活性成分,对应靶点259个,冠心病共同靶点198个;进一步筛选出35个重要成分,73个关键靶点,KEGG富集到最重要的通路是脂质和动脉粥样硬化,其通路上成分与靶点分子对接的结合能均小于-5 kcal/mol。结论脂质与动脉粥样硬化通路是瓜蒌薤白半夏汤合涤痰汤治疗冠心病的重要机制之一,起重要作用的成分为槲皮素、山奈酚、木樨草素等,靶点为AKT1、TNF、IL-6、TP53、IL-1B、PPARG,主要与脂质改善、抗炎、抗氧化应激以及凋亡调节有关。 | 钟宇鹏 罗京彪 林淑娴 | 2023 | 中国处方药2023，21，1： | 1 |
| 3 | 基于网络药理学探讨加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭的潜在靶点及作用机制显示文摘【目的】利用网络药理学预测加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在靶点及其作用机制。【方法】通过TCMSP和BATMAN数据库获取加味参附颗粒的相关活性成分和靶点,通过GeneCards、DisGeNET数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点,取交集靶点;运用STRING数据库进行靶蛋白互作分析。运用Metascape数据库对药物-疾病共同靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因百科全书(KEGG)富集分析。运用Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点-通路网络图。【结果】筛选出加味参附颗粒中42个活性成分和435个直接作用的蛋白靶点,得到38个药物-疾病交集靶点。GO与KEGG富集分析结果显示,加味参附颗粒在血液循环、清除氧自由基、平滑肌细胞的调节、细胞和基因调控等多生物过程方面,通过IL-6、RELA、TNF、VEGFA、MMP-2、MAPK8、TP53、EDN1、MMP-9等核心靶点,流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、AGERAGE、HIF-1、MAPK、IL-17、TNF、cAMP、钙等信号通路治疗慢性心力衰竭。【结论】加味参附颗粒可通过改善心脏供血、抑制炎症反应、抗氧化应激、抑制心肌重构、调节心肌细胞的代谢等方面多靶点多途径治疗慢性心力衰竭。 | 叶润杰 黄培红 | 2023 | 广州中医药大学学报2023，40，11： | 0 |
| 4 | 基于整合用药网络与靶点网络中药治疗糖尿病合并冠心病核心处方及作用机制探讨显示文摘目的整合用药网络与靶点网络方法分析文献中治疗糖尿病合并冠心病方剂的核心处方及药理机制,为今后的实验研究和临床应用提供一种新的思路。方法检索中文文献来源于中国学术期刊全文数据库(CNKI)、万方数据库(Wanfang Data)、维普生物医学数据库(VIP)、中国生物医学文献数据库(SinoMed)、web of science、PubMed、Embase、Cochrane Library中收录治疗糖尿病合并冠心病的相关文献中的方剂,建立处方-药物数据库。运用古今医案平台(V2.3.5)进行频次统计、性味归经分析、关联分析和复杂网络分析,寻求核心处方。利用Cytoscape 3.9.1软件构建靶点网络。将有效靶点导入STRING数据库,构建蛋白质相互作用(PPI)网络分析;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果整理后共得到方剂295首,涉及中药204味,其中频次>20次的中药35味,用药频次最高的是丹参;关联规则发现药对黄芪→丹参和黄芪→麦冬的支持度最高;根据频数分析、关联分析、复杂网络分析结果以及临床用药经验,总结出治疗糖尿病合并冠心病的核心处方:丹参、黄芪、麦冬、川芎、五味子、瓜蒌、当归、茯苓。现代中药化学成分研究发现该核心处方的关键成分为槲皮素、黄芪紫檀烷苷、山柰酚、木犀草素等,核心靶点AKT1、TP53、IL-6、CASP3、VEGFA、ESR1、HSP90AA1、EGFR、PPARG、STAT3等。GO功能富集通路为激活剂结合等,KEGG富集通路主要为PI3K-Akt信号通路等。结论通过数据挖掘,得出文献中治疗糖尿病合并冠心病的核心处方组成为丹参、黄芪、麦冬、川芎、五味子、瓜蒌、当归、茯苓,其核心成分为槲皮素、黄芪紫檀烷苷、山柰酚等,这些成分通过PI3K-Akt信号通路作用于AKT1、TP53、IL-6、CASP3、VEGFA、ESR1等靶点,为糖尿病合并冠心病的科学研究和临床治疗提供思路。 | 刘奕呈 马晓昌 张笑涵 刘毅 谢雁鸣 | 2023 | 药物评价研究2023，46，7： | 0 |
| 5 | 基于网络药理学探究柴胡-黄芩药对治疗高血压的作用机制显示文摘目的利用网络药理学研究方法,探讨药对柴胡-黄芩治疗高血压的的活性成分、作用靶点及相关通路,探究其作用机制。方法利用中药系统药理学数据库(TCMSP)获取柴胡和黄芩的主要活性成分,利用Uniprot数据库将靶点信息进行基因标准化处理,通过GeneCards、OMIM和Drugbank数据库查找高血压的疾病靶点,与Uniport数据库进行对比与筛选,取药物和疾病的交集靶点,将交集靶点导入STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,借助Cytoscape3.7.0靶点可视化软件对蛋白质互作网络图进行构建通过网络图筛选药物中的核心作用靶点,构建药物-有效化合物-作用靶点网络,通过Metascape生信在线分析网站对筛选出的靶点进行GO分子函数、GO生物过程、GO细胞组分以及KEGG通路富集分析。结果通过KEGG通路富集分析共获得201条信号通路,GO Molecular Functions富集分析中共得到188条GO功能条目,GO Biological Processes富集分析中共得到1700条GO功能条目,GO Cellular Components富集分析中共得到100条GO功能条目,通过筛选最终得到PI3K-Akt、JAK-STAT、Wnt、cGMP-PKG、AMPK、Hippo、CaN6种关键治疗靶点。结论柴胡-黄芩药对中有多个有效成分和作用靶点,对高血压有治疗效果。 | 王森森 段启栋 鲍慧玮 田健 | 2022 | 人参研究2022，34，5： | 0 |
| 6 | 基于网络药理学和分子对接探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制显示文摘目的:运用网络药理学和分子对接技术探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制。方法:应用TCMSP、Herb、TCMID平台检索养心活血通脉汤成分及作用靶点;经GeneCards、OMIM、DisGeNET平台获取稳定性冠心病靶点;运用Cytoscape 3.9.1建立“药物-活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。由Metascape平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用Auto Dock Tools软件进行有效成分与和核心靶点分子对接。结果:养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病主要成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花黄素、黄芩素、丹参酮ⅡA,关键靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子(VEGFA),关键通路为脂质和动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1信号通路(PI3K-Akt信号通路)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF信号通路)、丝裂原活化蛋白激酶信号通路(MAPK信号通路)、糖基化终产物/受体信号通路(AGE-RAGE信号通路)等。分子对接结果显示各有效成分与各核心靶点结合活性较好。结论:养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病作用机制主要为降脂、抗动脉粥样硬化、抗炎、抗心肌损伤。 | 张媛 喻正科 陈志红 赵启 马悦 鲜君 | 2023 | 湖南中医杂志2023，39，11： | 0 |
| 7 | 基于网络药理学研究三七治疗血小板聚集的作用机制显示文摘目的通过网络药理学研究三七治疗血小板聚集的作用机制。方法查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选三七的药物成分,使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点;运用GeneCards获取血小板聚集的疾病靶点,利用venny 2.1获取交集靶点。使用String进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析并使用Cytoscape构建网络图,使用Cytoscape软件构建“药物-靶点-通路”网络图。利用Metascape进行基因本体(GO)富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果三七中的7个有效成分通过多条通路直接作用于142个疾病靶点治疗血小板聚集,其中β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素和人参皂苷Rh2等是核心成分,肿瘤蛋白p53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、JUN、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、蛋白激酶B1(AKT1)是重要靶点。GO富集分析显示,生物过程(BP)主要涉及细胞对脂质的反应、对激素的反应、细胞对氮化合物的反应等;细胞组分(CC)主要涉及膜筏、膜微区、小窝和质膜筏等;分子功能(MF)主要涉及DNA结合转录因子结合、转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异度DNA结合转录因子结合等。KEGG通路富集分析表明,三七治疗血小板聚集的信号通路主要有晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/Akt、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、TNF、MAPK等。结论三七主要通过调节AGE-RAGE、PI3K/Akt、HIF-1、TNF、MAPK等信号通路的TP53、MAPK1、JUN、TNF、IL-6、AKT1等疾病靶点,调节酶类活性治疗血小板聚集。 | 王栋梁 李新 | 2023 | 国际生物医学工程杂志2023，46，5： | 0 |
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