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| 1 | CoMFA Model of Anti-tumor Activity for Fluoroquinolon-3-yl s-Triazole Sulfide-ketone Derivatives and Implications for Molecular Design显示文摘Comparative molecular field analysis(CoMFA)techniques were used to perform three-dimensional quantitative structure-activity relationship(3D-QSAR)studies on the anti-tumor activity(pIH and pIC)of 28 fluoroquinolon-3-yl s-triazole sulfide-ketone derivatives(FQTSDs)against two cancer cell lines,including human hepatoma Hep-3B cells and human pancreatic cancer Capan-1 cells.23 compounds were randomly selected as the training set to establish the prediction models,which were verified by the test set of 6 compounds containing template molecule.The obtained cross-validation(Rcv2)and non-cross-validation correlation coefficients(R2)of the CoMFA models were 0.477 and 0.850 for pIH,and 0.421 and 0.836 for pIC,respectively.The contributions of steric and electrostatic fields to pIH were determined to be 48.1%and 51.9%,and those to pIC were 49.4%and 50.6%,respectively.The CoMFA models were then used to predict the activities of the compounds in the training and testing sets,and the models had a strong stability and good predictability.Based on the 3D contour maps,four novel FQTSDs with a higher anti-tumor activity were designed.However,the effectiveness of these novel FQTSDs is still needed to be verified by experimental results. | 冯惠 冯长君 | 2021 | Chinese Journal of Structural Chemistry2021，40，6： | 5 |
| 2 | 吡啶并嘧啶衍生物抗乳腺癌活性的CoMFA模型显示文摘基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立25种吡啶并嘧啶衍生物抗乳腺癌活性(pIC)的三维定量构效关系(3D-QSAR)。训练集中20个化合物用于建立预测模型,测试集6个化合物(含模板分子)作为模型验证。已建立的CoMFA模型的交叉验证系数(Rcv^2)、非交叉验证系数(R^2)分别为0.467、0.891,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场对pIC的贡献率依次为40.8%、59.2%。基于此研究结果,设计了4个具有较高抗乳腺癌活性的新化合物,有待医学实验验证。 | 冯惠 石春玲 冯长君 | 2020 | 化学研究与应用2020，32，8： | 5 |
| 3 | 氟喹诺酮三唑酮衍生物抗增殖活性的CoMFA模型显示文摘应用比较分子力场分析法(CoMFA)研究了18种氟喹诺酮三唑啉酮衍生物对人白血病HL60细胞的体外抗增殖活性(pH)。建立的模型在高相关系数值(R2=0.969)和交叉验证系数值(R2cv=0.473)方面显示出良好的相关和预测能力。空间场和静电场对pH的贡献分别为58.5%和41.5%。基于CoMFA等高线图,揭示了该系列化合物抗增殖活性的一些关键结构因素,如疏水作用、空穴契合、库仑力及氢键等。这些结果为理解其作用机制、设计具有高抗增殖活性的新型氟喹诺酮三唑啉酮类化合物以及预测其活性提供了有益的理论参考。 | 冯惠 于洪锋 冯长君 | 2021 | 化学通报2021，84，3： | 3 |
| 4 | 基于CoMFA研究氟喹诺酮C-3噻唑酮衍生物抗胰腺癌活性显示文摘应用比较分子力场分析(Comparative molecular force field analysis,CoMFA)方法研究了18种氟喹诺酮C-3噻唑酮衍生物对胰腺Capan-1细胞的体外抗增殖活性(p A).训练集中14个化合物用于建立预测模型,测试集6个化合物(含模板分子和新设计的1个分子)作为模型验证.通过基于配体的原子契合的叠合方式,获得了训练集的统计显著模型.CoMFA模型使用3个主成分给出交叉验证系数(R 2 cv)值为0.436,非交叉验证系数(R 2)值为0.956,估计F值为72.217.结果显示,模型具有良好的稳健性与预测能力.基于CoMFA等高线图,揭示了该系列化合物抗增殖活性的一些关键结构因素.这些结果为理解其作用机制、设计具有高抗肿瘤活性的新型氟喹诺酮C-3噻唑酮类化合物提供有益的理论参考. | 冯长君 | 2021 | 徐州工程学院学报(自然科学版)2021，36，3： | 3 |
| 5 | 基于人工神经网络研究芳胺喹唑啉衍生物的抗胃癌活性显示文摘基于分子电性距离矢量(Mt)表征21个芳胺喹唑啉衍生物的分子结构,并与其对人胃癌细胞的抗癌活性(pI)关联。通过最佳变量子集回归方法建立上述化合物抗胃癌活性的三参数(M15、M18、M82)定量构效关系模型。其交叉验证系数(Rcv2)、非交叉验证系数(R2)依次为0.386和0.737。通过R、Rcv2、VIF等检验,模型具有较好的相关性、稳健性和预测能力。结果显示,-CH2-、-CH<、-O-、-S-和-NH-等分子结构单元直接影响这些化合物的抗胃癌活性。将M15、M18、M82作为人工神经网络的输入层结点,采用3∶3∶1的网络结构,利用BP算法获得了令人满意的pI模型,其R2和标准偏差SD分别为0.992和0.080,表明pI与三参数呈现优异的非线性关系。 | 杨杰元 杨雪颖 杨沛艳 冯惠 冯长君 | 2021 | 化学通报2021，84，8： | 3 |
| 6 | CoMFA Study on Anti-proliferative Activity of Fluoroquinolone Amide Derivatives显示文摘The in vitro anti-proliferative activity(pICi,i=hp,ca,hl)of fluoroquinolone(rhodanineα,β-unsaturated ketone)amide compounds,referred to as“fluoroquinolone amide derivatives(FQADs)”towards Hep-3B,Capan-1 and HL60 cells,was studied by the 3D-QSAR method of comparative molecular field analysis(CoMFA).Based on the training set of 14 compounds,the prediction model was established,which was further verified by the test set of 5 compounds with template molecule included.It is found that steric and electrostatic fields contribute 66.8%and 33.2%to pIChp,61.4%and 38.6%to pICca,and 61.5%and 38.5%to pIChl,respectively.The Rcv 2(i.e,cross-validation coefficient)is 0.324,0.381,and 0.421 for pIChp,pICca,and pIChl,respectively,while the corresponding R2(i.e,non-cross-validation coefficient)all reach 0.999.Then,the models were employed to estimate the activities of the training and test compounds,and the results show that the stability and predictability of developed models are very satisfactory.According to the contour maps of steric and electronic fields,bulky groups linked to 2-,3-,4-positions of phenyl ring,and electropositive groups near the 4-position and electronegative groups far away may increase the anti-proliferative activity.Using the information provided by the 3D contour maps,four new FQADs owing higher antiproliferative activity were designed,but their effectiveness should be further tested by experiments. | 冯惠 曹景沛 冯长君 | 2022 | Chinese Journal of Structural Chemistry2022，41，3： | 2 |
| 7 | 硝基芳烃对梨形四膜虫急性毒性的CoMFA模型显示文摘研究45种硝基芳烃对梨形四膜虫急性毒性的半数生长抑制浓度负对数值(pIC 50)的三维-定量构效关系(3D-QSAR)。基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立训练集的3D-QSAR模型,其判定系数(R 2)为0.932,交叉验证系数(Q 2)为0.738,表明模型具有良好的相关性、稳定性和预测能力。该模型的立体场和静电场对pIC 50值的贡献率依次为39.0%和61.0%。基于CoMFA等势图,揭示了2,3位上键合负电基团是影响硝基芳烃对梨形四膜虫急性毒性的主要因素。 | 唐自强 冯长君 | 2020 | 生态毒理学报2020，15，5： | 2 |
| 8 | 喹唑啉衍生物抗胃癌活性的CoMFA模型显示文摘基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立23种喹唑啉衍生物抗胃癌活性(pM_(G))的三维定量构效关系(3D-QSAR).训练集中20个化合物用于建立预测模型,测试集6个化合物(含16号模板分子及2个新设计的分子)作为模型验证.建立的CoMFA模型的交叉验证系数(Q^(2))、非交叉验证系数(R^(2))分别为0.312、0.854,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力.该模型中立体场、静电场贡献率依次为62.6%、37.4%,表明影响抗胃癌活性(pM_(G))的主要因素是取代基的疏水性和空间位阻,其次是取代基的库仑力、氢键及配位.基于该研究结果,设计了2个具有较高抗胃癌活性的新化合物. | 冯长君 | 2022 | 徐州工程学院学报(自然科学版)2022，37，1： | 2 |
| 9 | CoMFA Model and Molecular Design of Anti-excitatory Activity for Benzodiazepinooxazole Derivatives against Mice显示文摘A 3D-QSAR study was conducted to analyze the anti-excitatory activity(p E)of benzodiazepinooxazole derivatives to mice by the comparative molecular field analysis(CoMFA)method.Among the 54 active molecules,a training set of 46 compounds was randomly selected to construct the CoMFA model;the remaining compounds,together with template molecule(No.54)and two newly designed molecules constitute a test set of 17 compounds to validate the model.The obtained cross-validation coefficient(R_(cv)^(2)),the non-cross validation coefficient(R^(2)),and the test value F of the CoMFA model for training set are 0.516,0.899,and 57.57,respectively.The model was used to predict the activities of all compounds in the training and testing sets,and the results indicated that the model had good correlation,strong stability and good predictability.Based on the 3D contour maps,eight novel benzodiazepinooxazole derivatives with higher anti-excitatory activity were designed.However,the effectiveness of these novel benzodiazepinooxazole derivatives is still needed to be verified by the experimental results. | 朱利兰 秦正龙 冯长君 | 2021 | Chinese Journal of Structural Chemistry2021，40，8： | 2 |
| 10 | 培氟沙星均三唑硫醚类化合物抗增殖活性的3D-QSAR研究与分子设计显示文摘基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立24种培氟沙星均三唑硫醚衍生物对人白血病细胞(HL60)抗增殖活性(pM)的三维定量构效关系(3D-QSAR).训练集中20个化合物用于建立预测模型,测试集10个化合物(含模板分子22及新设计的5个分子)作为模型验证.已建立的3D-QSAR模型的交叉验证系数(Rcv^2)、非交叉验证系数(R2)分别为0.436、0.903,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力.该模型中立体场、静电场贡献率依次为71.8%、28.2%,表明影响抗增殖活性(pM)的主要因素是在苯环的3,4-位上引入小体积的负电性基团.基于三维等势图,设计了5个具有较高抗增殖活性的分子,有待医学实验验证. | 冯惠 王晓辉 王菊 冯长君 | 2021 | 云南大学学报(自然科学版)2021，43，1： | 1 |
| 11 | 基于CoMFA研究培氟沙星均三唑硫醚衍生物抗增殖活性与分子设计显示文摘基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立24种培氟沙星均三唑硫醚衍生物对小鼠白血病细胞(L1210)抗增殖活性(pIC)的三维定量构效关系(3D-QSAR)。训练集中20个化合物用于建立预测模型,测试集8个化合物(含模板分子22及新设计的3个分子)作为模型验证。已建立的3D-QSAR模型的交叉验证系数(Rcv2)、非交叉验证系数(R2)分别为0.659和0.926,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场贡献率依次为72.8%及27.2%,表明影响抗增殖活性(pIC)的主要因素是在苯环的4-位上引入小体积的负电性基团。基于三维等势图,设计了3个具有较高抗增殖活性的分子,有待医学实验验证。 | 冯惠 秦正龙 李靖 冯长君 | 2020 | 湖南师范大学自然科学学报2020，43，6： | 1 |
| 12 | 氟喹诺酮C-3均三唑衍生物抗增殖活性的QSAR研究显示文摘基于拓扑化学理论,用原子类型的电性拓扑状态指数(E_(A))描述了48个氟喹诺酮C-3均三唑衍生物分子的化学微环境。基于E_(A)和最佳变量子集回归,建立上述化合物对人白血病细胞(HL60)的抗增殖活性(p H)的定量构效关系(QSAR)模型。其最优四元(E_(8)、E_(13)、E_(19)、E_(42))模型的判定系数(R^(2))和逐一剔除法交叉验证系数(R_(cv)^(2))分别为0.853和0.813。经R^(2)、R_(cv)^(2)、F_(IT)、A_(IC)、F、V_(IF)等统计指标检验,所建模型具有良好的稳定性、相关性和预测能力。结果显示影响氟喹诺酮C-3均三唑衍生物对人白血病细胞(HL60)的抗增殖活性的主要因素是与靶标形成氢键,以及配位和疏水作用。 | 杨杰元 杨雪颖 杨沛艳 冯惠 冯长君 | 2022 | 化学研究与应用2022，34，10： | 1 |
| 13 | 基于拓扑指数研究多氯联苯生物降解速率常数显示文摘基于Kier的分子形状指数(J)和新提出的氯原子位置指数(D)表征66个多氯联苯的分子结构,并与其生物降解速率常数对数(lnK)关联。通过最佳变量子集回归方法建立多氯联苯lnK的三变量参数(DCl、^(2)J、^(3)J)的QSAR模型。其传统相关系数和交叉验证相关系数依次为0.854和0.837。通过“三性”原则检验,该模型具有令人满意的相关性、稳健性和预测能力。结果显示影响多氯联苯ln K的主要因素是分子内所含氯原子的数目及其所处位置。 | 杨杰元 杨雪颖 杨沛艳 冯惠 冯长君 | 2022 | 环境科学与技术2022，45，4： | 0 |
| 14 | 多溴联苯醚生物富集因子的CoMFA模型显示文摘研究19种多溴联苯醚(PBDEs)在淡水生物正颤蚓体内生物富集因子(lg B_(CF))的三维-定量构效关系(3D-QSAR).基于比较分子力场分析(CoMFA)建立训练集的3D-QSAR模型,不仅表现出显著的统计质量,而且还表现出令人满意的预测能力,具有高相关系数值(R^(2)=0.80)和交叉验证系数值(Q^(2)=0.32).该模型中立体场、静电场贡献率依次为45.1%、54.9%.基于CoMFA等高线图,多溴联苯醚的lg B_(CF)主要取决于溴原子在苯环上的位置,其次才与溴原子数正相关. | 冯长君 | 2023 | 徐州工程学院学报(自然科学版)2023，38，4： | 0 |
| 15 | 噻吩并吡啶并嘧啶衍生物抗鼻咽鳞癌活性的3D-QSAR研究与分子设计显示文摘运用比较分子力场分析(CoMFA)方法,建立25种噻吩并吡啶并嘧啶衍生物分子结构与抗鼻咽鳞癌活性(pM)的三维定量构效关系(3D-QSAR),以揭示影响pM的微观结构因素,探讨其体外抗肿瘤作用的分子机理。训练集中20个化合物用于建立预测模型,测试集含13号模板分子和新设计的3个分子共9个化合物,用于模型验证。所建CoMFA模型的交叉验证系数R2cv、非交叉验证系数R2分别为0.372、0.853。该模型中立体场、静电场贡献率依次为53.7%、46.3%,表明影响pM的主要因素是取代基的疏水性和空间位阻,其次是取代基的库仑力、氢键及配位。设计了3个具有较高抗鼻咽鳞癌活性的新化合物,有待医学实验验证。 | 秦正龙 杨伟华 冯长君 | 2021 | 南京理工大学学报2021，45，6： | 0 |
| 16 | 取代嘧啶衍生物抗前列腺癌活性的3D-QSAR研究显示文摘运用比较分子力场分析(CoMFA)方法,建立18种取代嘧啶衍生物抗前列腺癌活性(pM)的三维定量构效关系。训练集中15个化合物用于建立预测模型,测试集13个化合物(含10号模板分子和新设计的9个分子)作为模型验证。建立的CoMFA模型的交叉验证系数(R_(ev)^(2))、非交叉验证系数(R^(2))分别为0.344、0.935,说明所建模型具有较强的鲁棒性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场贡献率依次为71.6%、28.6%。影响取代嘧啶衍生物抗前列腺癌活性的主要因素是取代基的疏水作用和空间位阻,其次是取代基的库仑力、氢键及配位作用。基于此研究结果,设计了9个新化合物,其抗前列腺癌活性有待医学实验验证。 | 冯惠 尚玉龙 冯长君 | 2022 | 化学通报2022，85，2： | 0 |
| 17 | 基于人工神经网络研究小鼠抗搏击能力显示文摘为研究30种苯二氮[艹卓]恶唑衍生物对雄性小鼠抗搏击活性(E)的定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR),按照分子的拓扑环境编程计算了30种化合物的电性距离矢量模(M D,D=1,2,…,91).通过逐步回归方法,建立了E的3参数(M_(10)、M_(16)和M_(59))QSAR模型.R_(cv)^(2)和V IF诊断结果显示,该模型具有良好的稳定性和预测能力.将M_(10)、M_(16)和M_(59)作为人工神经网络的输入层结点,采用3∶5∶1的网络结构,利用BP算法获得BP-E模型,其相关系数的平方R 2和标准偏差S分别为0.984和0.054,表明E与上述3参数具有良好的非线性关系.根据进入模型的3个变量可知,影响苯二氮[艹卓]恶唑衍生物对雄性小鼠抗搏击活性的主要因素是—CH 3、—CH 2—、■、—NH—和—OH(O)等微观基团. | 朱利兰 冯长君 | 2021 | 深圳大学学报(理工版)2021，38，3： | 0 |
| 18 | 培氟沙星均三唑硫醚衍生物抗肝癌活性的CoMFA模型与分子设计显示文摘基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立24种培氟沙星均三唑硫醚衍生物抗肝癌活性(pM)的三维定量构效关系(3D-QSAR)。训练集中20个化合物用于建立预测模型,测试集10个化合物(含模板分子及新设计的5个分子)作为模型验证。所建立的3D-QSAR模型的交叉验证系数(Rcv^2)、非交叉验证系数(R^2)分别为0.705、0.940,说明模型具有较强的稳定性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场贡献率依次为74.8%、25.2%,表明影响抗肝癌活性(pM)的主要因素是取代基的疏水性和空间契合,其次是库仑力、氢键及配位。基于三维等势图,设计了5个具有较高抗肝癌活性的分子,有待医学实验验证。 | 唐自强 刘长宁 冯长君 | 2020 | 化学通报2020，83，10： | 0 |
| 19 | 氟喹诺酮均三唑衍生物抗肿瘤活性的CoFMA研究显示文摘通过比较分子力场分析方法(CoMFA)研究氟喹诺酮均三唑衍生物对人肝癌细胞(SMMC-7721)、鼠白血病细胞(L1210)和人白血病细胞(HL60)的体外增值抑制活性的三维定量结构-活性相关(3D-QSAR).根据CoMFA模型的立体场和静电场三维等势线图可知,外部苯环的4-位引入的近正远负大体积基团,有利于提高氟喹诺酮均三唑衍生物的抗肿瘤活性. | 冯惠 堵锡华 陈艳 冯长君 | 2020 | 分子科学学报2020，36，3： | 0 |
| 20 | 酚类化合物麻醉毒性的CoFMA研究显示文摘通过比较分子力场分析方法(CoMFA)建立酚类化合物对梨形四膜虫极性麻醉毒性(p T)的三维定量结构-活性相关(3D-QSAR)模型。基于训练集41个化合物建立了预测模型,10个化合物作为验证集(含模板分子)。训练集的CoMFA模型显示立体场、静电场对麻醉毒性贡献依次为53.9%和46.1%。其交叉验证相关系数(R_(cv)^(2))为0.735,非交叉验证相关系数(R^(2))为0.971。对训练集、测试集中的化合物麻醉毒性进行预测,显示出较强的稳定性和良好的预测能力。根据CoMFA模型的立体场和静电场三维等势线图可知,在羟基的间、对位上引入小体积基团,以及邻、对位有负电性基团,有利于提高酚类衍生物的麻醉毒性。基于此,设计了7种具有更高麻醉毒性的酚类化合物,有待生物医学实验验证。 | 冯惠 石春玲 李靖 周俊 冯长君 | 2021 | 生态毒理学报2021，16，3： | 0 |
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