| 1 | 珊瑚菜抗盐相关基因GlERF11克隆与盐胁迫表达分析显示文摘目的 鉴定珊瑚菜抗盐基因GlERF11并分析其在盐处理下的表达量变化。方法 对GlERF11基因进行cDNA全长克隆以及生物信息学分析,使用荧光定量PCR方法对GlERF11基因进行定量表达分析。结果 GlERF11基因cDNA全长1019 bp,开放阅读框全长537 bp,编码178个氨基酸。生物信息学分析显示,GlERF11蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构域,相对分子质量为19710.95 Da,包含AP2超家族保守结构域。系统进化树分析显示,GlERF11蛋白与伞形科植物胡萝卜ERF11蛋白亲缘关系较近。荧光定量分析显示,珊瑚菜幼苗的GlERF11基因受盐胁迫影响后表达量均有所提高,处理后12 h变化最为显著。结论 本研究针对珊瑚菜抗盐相关基因GlERF11开展生物信息学分析,研究为珊瑚菜品种改良以及育种提供了重要的理论基础与思路。 | 徐瑶 任宏伟 孙唯航 张馨方 田雪梅 谭玲玲 袁涛 高婷 | 2022 | 世界科学技术-中医药现代化2022，24，5： | 0 |
| 2 | 甘薯IbERF071基因的克隆及表达特性分析显示文摘为探究甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)IbERF071基因在抗蔓割病中的调控作用,根据甘薯转录组数据,从甘薯高抗蔓割病品种‘鄂薯11’中克隆获得1个编码乙烯应答的基因,命名为IbERF071,并对其进行生物信息学分析,以及侵染蔓割病病原菌、外施茉莉酸甲酯和乙烯利的基因表达模式分析。结果表明,IbERF071基因的CDS序列大小为864bp,共编码287个氨基酸;在其编码的氨基酸序列的第79~142位包含1个AP2保守结构域,在第205~254位包含1个卷曲螺旋;IbERF071氨基酸序列与牵牛InERF氨基酸序列的相似度高达89%以上,具有高度同源性,且在系统发育树上也聚为同一支;IbERF071蛋白不稳定指数、脂肪系数和总亲水性平均系数分别为48.26、47.35和-1.003,分子质量为32215.31ku,等电点为5.12,表明该蛋白是一种不稳定的亲水性蛋白质;IbERF071蛋白二级结构中,随机卷曲、α螺旋、延伸链和β转角所占比例分别为61.67%、26.83%、8.01%和3.48%,三级结构中,22%的氨基酸残基结构置信度达到64.06%,IbERF071蛋白定位于细胞核上,没有跨膜蛋白且不存在跨膜螺旋区;IbERF071基因启动子区包含真核生物启动子基本元件胁迫响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、低温响应元件MYC、干旱诱导元件ERE、脱落酸效应元件、植物防御响应元件、水杨酸响应元件TCA等30种顺式作用元件;IbERF071基因在根、茎、叶中均有表达,且在根中表达量显著高于茎、叶,经蔓割病原菌侵染后,IbERF071基因的相对表达量显著升高,并在侵染2h时表达量达到峰值,茉莉酸甲酯处理72h和乙烯利处理48h后,其表达量显著提高。综合来看,甘薯IbERF071蛋白属于AP2/ERF超级家族,具有较高的保守性,IbERF071在调控甘薯抗蔓割病菌中的功能以及JA和ET介导的激素信号转导途径的过程中起重要作用。 | 徐乐 陈培茹 刘意 焦春海 雷剑 王连军 柴沙沙 靳晓杰 杨园园 程贤亮 杨新笋 张文英 | 2022 | 长江大学学报(自然科学版)2022，19，3： | 0 |
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