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| 1 | MALDI-TOF MS自建数据库对非结核分枝杆菌鉴定的应用价值显示文摘目的构建基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)非结核分枝杆菌(NTM)鉴定数据库并评价其应用价值。方法收集2018年1月—2021年5月临床分离NTM菌株72株,分别采用直接同源序列比对法和MALDI-TOF MS法进行菌种鉴定,MALDI-TOF MS以“自建数据库+MBT DB5989数据库”鉴定菌株为实验组,以“MBT DB5989数据库”鉴定菌株为对照组,比对分析两组鉴定符合率,评估MALDI-TOF MS自建数据库对NTM鉴定的应用效能。结果以分子鉴定结果为金标准,对照组鉴定符合率为51.61%(32/62),实验组鉴定符合率为95.16%(59/62),联合使用自建数据库鉴定符合率明显增高(χ^(2)=30.102,P<0.001);剔除MBT DB5989数据库缺失NTM菌株后,对照组鉴定符合率为86.48%(32/37),实验组鉴定符合率为97.30%(36/37),差异无统计学意义(χ^(2)=2.902,P=0.088);实验组1株类戈登分枝杆菌错误鉴定为戈登分枝杆菌。结论MALDI-TOF MS数据库选择直接影响NTM鉴定结果,自建数据库可提升MBT DB5989数据库对NTM的鉴定效能。 | 徐茂锁 刘亚隽 张慧 周聪 齐伟强 申春梅 | 2022 | 临床检验杂志2022，40，3： | 3 |
| 2 | 自建MALDI-TOF MS霉菌数据库的研究显示文摘目的建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)霉菌数据库,提高引起临床相关感染的各种霉菌的鉴定能力。方法收集临床标本来源的霉菌266株,纯培养后进行霉菌18S rDNA扩增测序,获得菌种鉴定结果。选取210株霉菌用于数据库的构建,通过甲酸萃取法提取蛋白,应用MALDI-TOF MS配套的FlexControl软件收集蛋白谱图,采用Biotyper软件构建评价数据库。其余56株霉菌用于数据库鉴定能力的验证,分别用商品化数据库、自建的MALDI-TOF MS数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,应用χ2检验比较数据库的鉴定率差异。结果自建本地化MALDI-TOF MS霉菌鉴定数据库包含19个菌属,67个菌种,共计204株霉菌的质谱图。用于数据库验证的56株霉菌中,用商品化数据库鉴定正确18株,鉴定正确率为32.1%,用扩展数据库鉴定正确51株,鉴定正确率为91.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论自建霉菌数据库提高了霉菌的鉴定能力,从而有助于临床霉菌感染的病原诊断和治疗。 | 李艳君 孙钊坤 丁赔赔 王姣贤 董蓉 赵强元 | 2021 | 国际检验医学杂志2021，42，6： | 2 |
| 3 | MALDI-TOF MS自建库对不同来源大肠埃希菌的鉴定能力验证显示文摘目的 收集并建立具有特征的大肠埃希菌MALDI-TOF MS自建库,并观察自建库对不同来源大肠埃希菌菌株的鉴定能力。方法 采集2019年3月-2020年8月新疆医科大学第五附属医院检验科临床标本分离出的142株人源性大肠埃希菌菌株;采集自北京市怀柔区和延庆区养殖场分离出的40株动物源性大肠埃希菌菌株。通过16S rRNA测序确定其种属,并进行MALDI-TOF MS鉴定,筛选出合格的蛋白质指纹图谱,使用MicroID 4.0自建库功能对其进行建库。分别使用本地及北京收集的大肠埃希菌菌株对自建库进行验证,评估自建库对不同来源的大肠埃希菌的鉴别区分能力。结果 基于40株合格的人源性大肠埃希菌菌株的蛋白指纹图谱建立自建库,人源性与动物源性大肠埃希菌菌株对自建库进行验证,鉴定结果分别为96%、83%高度可信,其鉴定结果可信程度差异有统计学意义(P<0.05)。结论 本次建立的自建库可用于区分鉴定人源性与动物源性的大肠埃希菌菌株,自建库的4个代表性特征峰具有地域特征,可用作不同地区菌株的鉴别与参考图谱数据库的补充。 | 张浩科 赵智龙 李紫薇 宫海燕 | 2022 | 新疆医科大学学报2022，45，8： | 1 |
| 4 | 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在大肠埃希菌分群中的应用显示文摘目的评价基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对大肠埃希菌菌群的鉴别能力。方法通过VITEC 2 Compact全自动细菌鉴定仪及药敏分析系统对人和动物源性的大肠埃希菌敏感菌株进行初步筛选,然后将获得的21株人源和42株动物源性大肠埃希菌进行16S rRNA基因测序及同源性分析,同时通过MALDI-TOF MS技术对大肠埃希菌指纹图谱进行鉴定。结果与16S rRNA基因测序相比,不同来源的菌株蛋白质特征图谱呈现明显的分群趋势,MALDI-TOF MS法对不同来源的菌株具有较强的鉴别区分能力。结论MALDI-TOF MS法可用于菌株来源差异性的鉴别。 | 宫海燕 张启龙 赵智龙 刘利勤 朱家强 周德刚 | 2022 | 中国消毒学杂志2022，39，12： | 0 |
| 5 | MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌的实验条件优化显示文摘目的构建用于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)鉴定马尔尼菲篮状菌的数据库,并探索用于MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌的最佳培养条件和前处理方法。方法利用8株马尔尼菲篮状菌构建自建数据库,比较不同培养基[沙保弱葡萄糖琼脂培养基(SDA)、沙氏葡萄糖肉汤培养基(SDB)]、培养温度(28、35℃)、培养天数、前处理方法(甲酸乙腈法、直涂法)对质谱谱图质量及鉴定正确率的影响。结果在VITEK MS科研模式(RUO模式)中成功构建马尔尼菲篮状菌质谱自建数据库。SDA较SDB更适合MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌,后者采集的质谱谱图中干扰峰较多。两种温度培养采集的质谱谱图的特征峰相似,但35℃菌落的鉴定正确率略高。培养3~5 d时的菌落鉴定正确率均高于71.4%,其中培养5 d时鉴定正确率最高,可达100.0%。甲酸乙腈法的提取效果优于直涂法。结论马尔尼菲篮状菌在SDA上35℃培养3~5 d,并使用甲酸乙腈法进行前处理可得到最佳的鉴定正确率。这对于形态不典型的马尔尼菲篮状菌同样适用。 | 刘俞谷 贺莹 傅俊方 龙军 熊君 江凌晓 王艳芳 | 2022 | 国际检验医学杂志2022，43，2： | 0 |
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