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| 1 | 基于SSR分子标记的78份核桃种质资源遗传多样性分析显示文摘以78份核桃农家品种及栽培种为材料,利用SSR分子标记技术,从25对SSR引物中筛选出8对引物对78份核桃资源的遗传多样性进行分析,为核桃种质资源保存和利用、培育核桃优良新品种提供参考依据。结果显示:共检测到55个多态性位点,平均每个位点检测到的等位基因数为6.875个,等位基因的变化范围为1~16个,每个SSR位点的多肽信息含量(PIC)在0.075~0.228,平均为0.151。基于遗传相似系数,利用UPGMA方法进行聚类分析,结果显示供试材料之间遗传相似系数介于0.605~1.000,当遗传系数为0.704时,可将78份资源分为5部分,分析发现栽培种与农家品种以及不同地理来源的核桃品种界限不明显,存在相互渗透的现象。78份材料间遗传距离较小,平均为0.23,遗传相似度高。用Structure 2.2分析群体结构发现最佳亚群体数为2,分别包含25和53份核桃资源。 | 敬丹 骆翔 陈利娜 李好先 唐丽颖 曹尚银 | 2020 | 江西农业学报2020,32,6: | 9 |
| 2 | 玉米高密度SNP遗传图谱构建及其秃尖QTL定位显示文摘【目的】构建在秃尖性状上存在明显差异的玉米高密度SNP遗传图谱,并对其秃尖QTL进行定位,为玉米秃尖分子机理研究及玉米抗秃尖品种选育提供理论参考。【方法】以无秃尖性状的自交系S群411331为母本、有秃尖性状的自交系综53313为父本,通过杂交和自交获得F2代群体。利用容量达10K的分子芯片获取大量SNP分子标记,从中筛选出具有多态性的SNP分子标记,构建F2代群体的高密度遗传图谱,并结合秃尖表型数据,分别采用QTL定位软件Rqtl和QTL.gCIMapping.GUI 1.1对相应的秃尖QTL位点进行鉴定及定位。【结果】F2代群体的平均秃尖长度为4.25 cm,说明其秃尖性状更偏向于父本综53313,秃尖整体较长,且秃尖变幅为0~6.1 cm,偏度和峰度值均位于-1.00~1.00,符合数量性状的分布特征。从2612个多态SNP分子标记中共筛选出2599个SNP分子标记成功构建遗传连锁图谱,总图距5624.38 cM,标记间平均距离2.27 cM。利用Rqtl共检测到6个QTL,分别位于第3、4、5、6、8和9染色体,其中加性效应和显性效应最大的2个QTL分别位于第6和8染色体,解释遗传变异的14.4%和16.3%。利用QTL.gCIMapping.GUI 1.1共检测到9个QTL,分别位于第1、4、5、6、8和9染色体,显性效应和加性效应最大的2个QTL分别位于第6和8染色体,与Rqtl检测结果相比,二者均在第8和9染色体的同一位置检测到1个QTL,在第5染色体检测到的QTL位置也较邻近,且效应最大的2个QTL均位于第6和8染色体;不同之处在于Rqtl在各染色体上只检测到1个QTL,而QTL.gCIMapping.GUI 1.1在第6和8染色体分别检测到2和3个QTL,在第1染色体检测到1个QTL,在第3染色体未检测到QTL,而Rqtl检测出的第1和3染色体QTL情况相反。【结论】玉米秃尖QTL分别位于第1、3、4、5、6、8和9染色体,其中主效QTL在第6和8染色体。 | 覃嘉明 王兵伟 郑加兴 覃永嫒 黄安霞 何静丹 韦绍丽 时成俏 | 2020 | 南方农业学报2020,51,6: | 6 |
| 3 | SSR标记在玉米研究中的应用研究进展显示文摘简单重复序列作为第二代分子标记技术,在农作物分子辅助育种、种质资源鉴定等方面得到了广泛的应用。该文介绍了SSR标记引物开发及其原理,并对SSR标记在玉米种质资源遗传多样性分析、DNA指纹图谱构建、杂交种种子纯度鉴定以及杂种优势种群划分等方面的应用进行了综述,旨在为推进精准育种、缩短育种周期等提供参考。 | 吴子温 路运才 | 2020 | 安徽农学通报2020,26,2: | 3 |
| 4 | 基于SSR标记的花菜类作物遗传多样性及群体结构分析显示文摘【目的】为了解花菜类种质的遗传基础,分析种质群体的亲缘关系,为花菜育种提供参考。【方法】选用22对SSR引物,利用毛细管电泳荧光检测技术对96份花菜类种质材料进行遗传多样性分析,根据Nei’s遗传距离和非加权配对法(UPGMA)进行聚类分析以及以Structure软件的混合模型聚类法推断材料构成群体的遗传结构。【结果】22对引物在96份材料中共扩增出91个等位位点,平均每对引物为4.136个。从22对引物中筛选出了10对条带清晰、稳定性好的多态性引物,可用于花菜类作物种质资源的鉴定和研究。根据花球性状,将材料分为青花菜(24份)以及花椰菜(72份)2个组群,经多态性分析,2个组群的观察等位基因数值(Na)分别为2.727和3.091;有效等位基因数(Ne)分别为1.910和1.841;Shannon’s指数(I)分别为0.675和0.667,说明这2个组群的遗传多样性均不够丰富。聚类分析也将96份材料分为2个组群,第Ⅰ组为24份青花菜材料,包括1份西兰苔杂交种和23份青花菜杂交种;第Ⅱ组为72份花椰菜材料,包括29份花椰菜自交系、36份花椰菜杂交种和7份花椰菜主栽品种。花椰菜自交系被分到了4个亚群,但在各亚群中材料之间的遗传距离较小,杂交组配时,选用不同亚群的自交系进行组配,以获得更大的杂交优势。群体结构分析中,当K=2时,ΔK出现明显的峰值,最大值为1658.48,为最佳群体组群数,与聚类分析结果基本一致。且96份材料的Q值均大于0.6,说明该花菜资源的遗传结构较为单一。【结论】所参试材料种质群体内遗传多样性不够丰富,遗传背景单一,亟需重视对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用,加强种质材料共享和交流,促进花菜种业发展。 | 卢俊浩 张婷 张鹏 木万福 杨龙 张建华 黄晓蓉 寸婕 管俊娇 | 2022 | 西南农业学报2022,35,8: | 2 |
| 5 | SSR荧光检测解析224份山西玉米自交系的遗传结构与遗传关系显示文摘为利用杂种优势,对玉米自交系的遗传结构及遗传关系进行解析非常必要。本研究基于40个SSR位点的分析,对山西224份玉米自交系的遗传结构与遗传关系进行了解析。共检测出171个等位变异,平均每个位点4.28个;平均每个位点多态性信息量PIC、标记索引指数、基因多样性指数分别为0.44、2.02和0.50;有9份种质存在特异等位变异,分布在9个SSR位点。模型聚类法将自交系化分为瑞德群、兰卡斯特群及唐四平头群3类群;遗传结构成份(Q值)分析表明,每个类群存在一些跨类群自交系。遗传距离聚类分为瑞德群、兰卡斯特群、唐四平头群及其他群4类,其中,瑞德群和兰卡斯特群占所有材料的90%左右。本研究还针对杂种优势测验种的选择、选用的标记类型及聚类方法进行了讨论。研究结果为自交系的改良和利用及选配新杂交组合提供了理论基础。 | 李锐 尚霄 尚春树 常利芳 闫蕾 白建荣 | 2022 | 中国农学通报2022,38,5: | 1 |
| 6 | 利用SSR标记分析云南保山玉米遗传多样性显示文摘本研究利用农业标准(NY/T1432-2014)推荐的SSR核心引物,以云南保山推广种植的15个玉米品种为研究材料,进行遗传多样性分析。结果表明,共有17对引物在玉米品种间产生72个多态性片段,每对引物扩增出3~6个多态性片段,平均每个引物4.3个;有效等位基因数为1.219~1.750,平均为1.448;Nei's遗传多样性指数为0.176~0.418,平均为0.283;Shannon信息指数为0.315~0.605,平均为0.444;SSR多态信息量(PIC)平均值为0.686,变幅为0.512~0.812。聚类分析结果显示,遗传相似系数平均0.632,变幅为0.417~0.819;在遗传相似系数0.65处可将15个品种划分为五类。本研究可以为云南省保山玉米品种的选育和推广提供理论和技术支持。 | 李松 施德林 娄灯吉 史云东 | 2021 | 分子植物育种2021,19,14: | 1 |
| 7 | 不同青花菜品种F_(1)群体的遗传多样性分析显示文摘以7个不同青花菜品种的各144份F群体单株为试材,采用SSR分子标记方法,研究了青花菜杂交F_(1)代的遗传多样性及变异规律,以期为青花菜新品种选育提供参考依据。结果表明:3对SSR引物在供试材料中共检测到了27个等位基因位点,平均每个SSR标记9个等位基因;有效等位基因数(N)、Shannon′s多样性指数(I)、观测杂合度(H)、期望杂合度(H)、Nei′s期望杂合度和平均杂合度的平均值分别为2.536 4、1.129 7、0.768 0、0.598 7、0.598 4和0.454 8,遗传分化系数表明其变异主要存在于不同F_(1)子代群体内(74.07%);分子方差分析表明青花菜杂交F_(1)代遗传变异主要来源于其群体内(82.12%),这与遗传分化系数结果一致;UPGMA聚类分析结果表明,在遗传距离为0.2处可将7个不同青花菜品种分为3个类群;PCA分析结果表明,同个青花菜品种F_(1)子代或遗传距离相近的青花菜品种能够聚类到一起,这与群体遗传结构分析结果基本一致,而且不同青花菜品种的F_(1)子代有交叉重叠现象,同时也说明它们之间存在着广泛的基因交流。 | 高旭 檀国印 朱长志 何道根 | 2022 | 北方园艺2022,,17: | 1 |
| 8 | 基于高密度遗传图谱的多环境玉米穗长QTL定位显示文摘玉米是重要的粮食和饲料作物,穗长是影响玉米产量的重要性状之一。本研究以穗长差异显著的玉米自交系SG5及SG7为试验材料配制杂交组合,构建包含199个单株的F_(2)群体,基于前期研究中利用F_(2)群体构建的高密度遗传连锁图谱,结合2014、2018和2019年在海南省三亚市盘县玉米育种试验站种植调查的F_(2)、F_(2∶3)-2018和F_(2∶3)-2019三环境玉米穗长表型数据,利用WinQTLCart2.5的复合区间作图法(CIM)进行全基因组扫描,发掘控制玉米穗长性状的主效QTL位点。结果表明,共检测到5个控制玉米穗长性状的QTL位点qEL-1、qEL-2、qEL-3、qEL-4和qEL-5,分别位于第1、2、3、5、6染色体上,LOD值范围2.5%~16.6%,解释表型变异3.0%~25.6%,其中,qEL-1和qEL-2在三个环境中重复被检测到,qEL-3在F_(2)和F_(2∶3)-2018两个环境中被检测到,qEL-5在F_(2∶3)-2018和F_(2∶3)-2019两个环境中被检测到,而qEL-4只在F_(2)环境中被检测到;qEL-1位点在三环境下解释的表型贡献率均大于20%,LOD值超过15,位于第1染色体。本研究所得结果既可为玉米穗长性状改良提供理论参考,同时也可为研究玉米穗长性状遗传分子机理提供重要依据。 | 马晓杰 赵延明 王军燕 周苗苗 彭欣 潘乃菲 高惠敏 刘宸铭 苏成付 | 2023 | 山东农业科学2023,55,10: | 0 |
| 9 | 基于SSR标记的云南35个玉米自交系遗传多样性分析显示文摘【目的】合理利用国内外玉米种质资源进行玉米品种改良。【方法】利用农业标准(NY/T 1432—2014)推荐的简单重复序列标记(simple sequence repeat,SSR)核心引物,以云南玉溪培育的35个稳定玉米自交系为研究材料进行遗传多样性分析。【结果】共有20对引物在品种间存在105个多态性片段,每对引物扩增出3~9个多态性片段,平均每个引物5.25个;Nei’s遗传多样性指数为0.134~0.365,平均为0.240;Shannon’s信息指数为0.247~0.538,平均为0.385;SSR多态信息量平均值为0.644,变幅为0.482~0.832。聚类分析结果显示:遗传相似系数平均为0.704,变幅为0.505~0.962;在遗传相似系数0.650处可将35个品种聚为4大类群。【结论】35个玉米自交系遗传多样性丰富,含有杂种优势。研究结果可为云南玉溪玉米品种的选育和推广提供理论依据及实践指导。 | 李松 施德林 董云武 杨亚丽 余娇娇 | 2023 | 云南农业大学学报(自然科学版)2023,38,5: | 0 |