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| 1 | 基于RNA-Seq技术分析鼠源宿主防御肽对铜绿假单胞菌成熟生物被膜的清除作用显示文摘【目的】利用RNA-Seq技术探究修饰后的鼠源宿主防御肽CRAMP对铜绿假单胞菌PAO1成熟生物被膜的影响。【方法】采用结晶紫法检测生物被膜量,激光共聚焦扫描显微镜(CLSM)观察生物被膜形态学变化;利用Illumina二代高通量测序平台,采用PE150测序策略分析了CRAMP修饰肽干预PAO1生物被膜与对照组在转录水平的基因表达差异;利用1,3-萘二酚方法测定了PAO1生物被膜中藻酸盐含量。【结果】CRAMP修饰肽能显著减少PAO1成熟生物被膜量,并且在0.98-62.50μg/mL范围内呈一定浓度依赖性,CLSM显示CRAMP修饰肽能够显著减少细菌总荧光强度。转录组测序获得了12636700段干净读对,共鉴定出1582个差异基因,发现800个基因表达上调,782个基因表达下调。GO功能富集分析显示,1226个基因比对到GO功能分析数据库,在这些差异表达基因中,与分子功能、生物过程和细胞组成有关。KEGG通路富集分析显示,有603个表达差异显著基因比对到KEGG中的96条代谢途径,其中主要是各类氨基酸代谢途径、脂肪酸代谢途径、三羧酸循环、生物被膜调控系统等。分析发现CRAMP修饰肽可能作用于PAO1 c-di-GMP系统,增强细菌运动性和生物被膜分散,并且与其密度感应(quorum sensing,QS)系统和藻酸盐合成相关。最后经验证,CRAMP修饰肽显著减少了PAO1成熟生物被膜中藻酸盐的含量。【结论】CRAMP修饰肽对PAO1成熟生物被膜具有明显的清除作用,且能导致成熟生物被膜藻酸盐含量下降。通过转录组数据分析,可能是由于CRAMP修饰肽使PAO1 c-di-GMP水平下调导致的,具体机制还有待进一步探究。 | 张阳 程鹏 熊静 李晓芬 李会 王士源 彭练慈 韩玉竹 刘娟 陈红伟 | 2021 | 微生物学报2021，61，9： | 4 |
| 2 | 食源性细菌关键小分子信号通路研究进展显示文摘食源性细菌引起的食品腐败和生物被膜形成是食品科学领域关注的热点。研究表明这些现象与细菌群体感应(quorum sensing,QS)系统和第二信使环二鸟苷酸(cyclic di-guanosine monophosphate,c-di-GMP)系统密切相关,深入研究发现细菌可通过利用胞外自诱导物和胞内c-di-GMP分别感知细胞密度和外界刺激来调控一系列生理活性。鉴于此,本文主要围绕食品腐败和生物被膜形成关联的QS和c-di-GMP这两个系统,阐述食源性细菌关键小分子信号通路,探讨QS和c-di-GMP信号通路之间的调控网络,旨在更好地理解食品体系中细菌引起的腐败和生物被膜形成现象,提供保障食品品质与安全的控制靶点。 | 王飞飞 傅玲琳 鲍星月 刘长军 张晓双 王彦波 | 2018 | 食品科学2018，39，23： | 3 |
| 3 | 基于北斗系统的生物多样性的监测与保护显示文摘经济的发展对生态环境的保护提出了严峻的挑战,在经济腾飞的同时也伴随着生物多样性的破坏和生态环境的污染,如何协调经济、生态、生物三者的共同体关系成为了当今社会进步的痛点。基于北斗导航系统在中国科技领域已逐渐成熟,并逐步将其应用于生物保护领域,从而更好地实现生物多样性发展的长远目标。采用文献研究法、综合分析法并结合对北斗导航系统的技术认识,将其应用于生物种类调查、濒危动物跟踪、生态环境监测等。通过调查研究,能够有效促进北斗导航系统在生物多样性保护中发挥关键性的作用。 | 陈琪煌 郑炫 林以恒 陈俊杰 李雅珊 许艺娜 | 2020 | 农村经济与科技2020，31，19： | 1 |
| 4 | 环二鸟苷酸调控细菌胞外多糖生物合成的研究进展显示文摘细菌胞外多糖(Exopolysaccharide,EPS)是细菌生长代谢过程中自身合成并分泌到细胞壁外的一种次级代谢产物,可以调节细胞对不同基质的初始附着,保护细胞抗环境胁迫和脱水。作为潜在的益生元,EPS具有安全,无毒和特殊的理化性质,广泛应用在食品、医药、生物和工业等领域。然而,细菌代谢系统复杂,EPS的生物合成机制仍未得到全面解析。环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)作为一类重要的第二信使,在细菌的生物被膜形成、运动性、黏附、毒力以及EPS合成等众多生理活动上发挥重要的调控作用。c-di-GMP转录调控机制的解析,为探明细菌EPS的生物合成机理提供了全新的思路。本文详细总结了c-di-GMP的特性及合成降解途径,重点综述c-di-GMP在介导细菌EPS生物合成过程中的调控机理。本篇综述为揭示细菌EPS生物合成机理和构效关系的研究提供理论基础。 | 于连升 葛菁萍 平文祥 杜仁鹏 | 2023 | 食品工业科技2023，44，9： | 0 |
| 5 | 细菌环二鸟苷酸高效液相检测方法的建立显示文摘为建立适用于检测细菌菌环二鸟苷酸(C-di-GMP)的高效液相的方法,本文对高效液相的检测波长、流速和流动相等检测条件进行研究。研究结果确定的检测条件为:色谱柱:Diamonsil C18(2),150×4.6mm,5μm;进样体积20μL;流速0.5mL/min;检测波长253nm;流动相A为10mmol/L乙酸铵,流动相B为10mmol/L乙酸铵甲醇溶液,梯度洗脱。该条件下建立的标准曲线R2为0.994,加标回收率为88.2%~95.3%,精密度RSD为0.98%,可用于检测细菌中环二鸟苷酸。 | 李汝锶 卫耀辉 刘永吉 | 2021 | 轻工科技2021，，10： | 0 |
| 6 | 细菌蛋白糖基化修饰的生物学功能及应用研究进展显示文摘细菌在维持人体健康和诱导疾病的发展中扮演着重要角色,其生物学功能常与蛋白质表面附着的聚糖有关。近年来,细菌蛋白的糖基化修饰受到越来越广泛的关注。随着合成生物学的不断发展,以及人们对蛋白糖基化修饰系统的深入研究,部分蛋白糖基化修饰系统已经应用于工程菌中,独立发挥蛋白质修饰作用,使得'定制糖蛋白'成为可能。本文就细菌蛋白糖基化修饰过程中的基本组成要素、糖基化修饰类型、途径及其糖基化修饰的生物学功能和应用等方面的研究进展进行了综述。 | 李骁 闫晶敏 毛旭虎 | 2022 | 中华微生物学和免疫学杂志2022，42，4： | 0 |
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