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| 1 | 启动子结构、功能预测和验证方法的研究进展显示文摘本综述总结了启动子结构、功能预测和验证的主要方法及其选用的研究进展。已知或克隆到靶基因的5'端上游序列后,应首先用生物信息学方法预测序列中的启动子,分析、预测其结构元件及其功能,再用实验方法验证元件的功能。生物信息学分析、预测是指单独或结合选用若干软件以及真核生物启动子、植物DNA顺式作用调控元件、植物顺式作用调控元件、Plant Prom、转录因子和转录调控区数据库;实验方法验证是指在综合考虑特定方法的原理、目标内涵和操作流程等多方面优劣势的基础上合理选用表达分析、染色质免疫共沉淀法、DNaseⅠ足迹法、电泳迁移率变动分析法和酵母单杂交法,但是,各方法均在运用中被不断改进,且目前使用最广泛的是表达分析法。启动子结构、功能预测和验证常选用两个或两个以上软件、数据库和方法,但可能会涉及到对不同数据库和方法产生的不一致或矛盾结果的甄别,将来应研发新的、更有效的研究DNA-蛋白互作的技术,与上述经典实验方法结合、用于启动子的功能研究。本综述可为启动子结构和功能的研究提供方法学参考。 | 曾晓玲 赵昶灵 文国松 丁灿 张洪玲 徐率 古朝山 | 2018 | 分子植物育种2018，16，12： | 9 |
| 2 | 不同质地杨梅果实肉柱细微构造与细胞壁组分及相关酶活性分析显示文摘使用激光共聚焦荧光显微镜观察了3个不同质地杨梅品种成熟果实的肉柱形态构造,并测定了果实细胞壁主要组分含量及相关酶的活性。结果表明:杨梅品种'荸荠种'与'东魁'的果实肉柱头部为圆钝型,而'硬丝安海变'的肉柱头部较为尖瘦;在3个品种果实肉柱的中心位置均可见类似维管束状组织贯穿,并均与头部顶端具有一个凸起的颗粒状物体相连接;在不同品种间肉柱横截面面积、细胞壁厚度与单位面积细胞数量差异不显著,但是东魁的肉柱横截面细胞数量显著大于其他2个品种的;硬丝安海变的果实硬度和细胞壁乙醇不溶物含量最高,与荸荠种差异显著;硬丝安海变与东魁的果实纤维素含量极显著高于荸荠种的,而纤维素酶活性与此正好相反;荸荠种的果实半纤维素含量及半纤维素酶活性显著高于其他2个品种的;荸荠种的果实水溶性果胶含量最高,极显著高于东魁的;荸荠种的果实果胶酶活性最低,极显著低于其他2个品种的。 | 焦云 柴春燕 马炜炜 舒巧云 | 2018 | 江西农业学报2018，30，5： | 5 |
| 3 | 非生物胁迫下小麦TaGAPCp1基因启动子的功能分析显示文摘探究质体形式的GAPCp (Plastidial glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)基因启动子响应干旱、盐和外源ABA等非生物胁迫的机理.首先从中国春小麦中克隆得到TaGAPCp1基因上游1 985 bp的核苷酸序列,经Plant CARE数据库分析表明,该启动子含有众多防御和逆境响应元件(defense and stress-responsive ele-ments,DSREs),激素响应元件(hormone-responsive elements,HREs)和光响应元件(light-responsive ele-ments,LREs).从小麦数据库下载Ta GAPCp亚家族基因启动子序列,序列对比分析表明,该亚家族成员启动子上功能元件种类相近但数量相差较大.构建含TaGAPCp1基因启动子的表达载体,通过农杆菌介导法转化烟草并进行ABA (100μmol·L^(-1))、PEG8000 (20%)、Na Cl (250 mmol·L^(-1))和4℃低温处理,组织化学染色显示TaGAPCp1基因启动子能驱动GUS基因的表达但活性明显低于Ca MV35S,GUS活性分析显示TaGAPCp1基因启动子能响应非生物胁迫.通过农杆菌介导的浸花法转化拟南芥,经潮霉素和羧苄青霉素筛选及叶片PCR检测,最终获得稳定遗传的转基因拟南芥20株,并得知转基因拟南芥中的GUS基因能被干旱胁迫显著诱导表达. | 魏文杰 邓霞 杨淑慎 | 2019 | 福建师范大学学报(自然科学版)2019，35，2： | 1 |
| 4 | 一种来自长柄扁桃、桃和梅的包含AP2结构域基因的生物信息学分析显示文摘通过分析长柄扁桃幼苗叶片转录组测序,从中找到一个包含AP2结构域的Unigene,该Unigene包含完整的开放读码框,全长3182bp,编码767个氨基酸,将其命名为ApAP2dc1。以ApAP2dc1的DNA序列作为信息探针,在桃和梅的基因组序列中进行查询比较,发现桃和梅的基因组中均存在ApAP2dc1的直系同源基因,分别命名为PpAP2dc1和PmAP2dc1。在桃和梅的基因组中还各发现一个串联重复的旁系同源基因,分别命名为PpRYdc1和PmRINGdc1。保守结构域分析表明,ApAP2dc1、PpAP2dc1和PmAP2dc1都含有AP2结构域,而PpRYdc1和PmRINGdc1不含AP2结构域;基因结构分析表明,PpAP2dc1和PmAP2dc1、PpRYdc1和PmRINGdc1虽然互为直系同源基因,但其基因结构有明显差异;旁系同源基因的启动子序列也有较大差异。该研究结果表明长柄扁桃、桃和梅基因组上的上述区域在进化上不保守,该区域的基因在结构和表达上正在进行快速趋异进化。 | 赵欢蕊 段义忠 相微微 王建武 | 2017 | 分子植物育种2017，15，8： | 0 |
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