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| 1 | 基于网络药理学探讨西洋参-丹参治疗冠心病的作用机制显示文摘目的基于网络药理学方法分析西洋参-丹参药对治疗冠心病的分子机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索西洋参、丹参的活性成分及其靶点,并在Uniport数据库标准化蛋白质靶点信息;通过Gencards、OMIM、TTD、DRUGBANK数据库获取冠心病相关靶点基因,筛选药物和疾病共同靶点,利用CytoScape3.7.0软件构建“成分-靶点”网络,筛选关键活性成分;通过STRING平台进行蛋白质相互作用分析,构建共同靶点PPI网络,筛选关键靶点基因;采用DAVID数据库对共同靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过CytoScape3.7.0软件构建“成分-靶点-通路”网络。结果共筛选得到西洋参-丹参63个活性成分和153个潜在靶点,与1420个冠心病靶点相映射,得到72个共同靶点,富集分析得到GO分析结果578个、信号通路116条;西洋参-丹参的关键活性成分木犀草素、丹参酮ⅡA、β-谷甾醇、4-亚甲丹参新酮、丹参新醌D、二氢丹参内酯、2-异丙基-8-甲基菲-3,4-二酮、罂粟碱、鼠尾草酚酮和隐丹参酮主要通过调控信号传导与转录激活因子3(STAT3)、蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤抑制蛋白53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、白细胞介素6(IL6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、人原癌基因c-Fos(FOS)、白细胞介素1β(IL1B)等相关靶点蛋白,干预机体的细胞增殖凋亡、炎症反应、信号转导、缺氧反应、基因表达、药物反应、对雌二醇的反应、蛋白质磷酸化等生物学过程,并可能通过HIF-1信号通路、PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路、雌激素信号通路、T细胞受体信号通路等对冠心病的发生发展产生影响。结论初步揭示了西洋参-丹参治疗冠心病多成分、多靶点、多通路的作用机制,为进一步临床开发利用提供理论基础和研究方向。 | 林泉 徐凤芹 马晓娟 王哲 李丹丹 殷惠军 | 2021 | 中西医结合心脑血管病杂志2021,19,11: | 2 |
| 2 | 基于网络药理学和分子对接研究益气复脉方君药药对党参-丹参治疗室性早搏的分子机制显示文摘目的利用网络药理学和分子对接技术探讨益气复脉方君药药对党参-丹参治疗室性早搏(PVB)的物质基础和作用机制。方法通过TCMSP平台挖掘党参、丹参的活性成分及靶点。借助GeneCards、OMIM、TTD数据库查询PVB的相关靶点。构建Venn图得到党参-丹参药对(DDP)与PVB的共同靶点。通过Cytoscape3.9.1软件绘制“党参-丹参药对-活性成分-共同靶点”网络图,并筛选核心活性成分。运用STRING数据库构建PPI网络,筛选核心靶点。利用Metascape平台进行基因本体(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用AutoDock Vina 1.1.2软件将核心活性成分与核心靶点进行分子对接。结果得到DDP活性成分84种,筛选出木犀草素、丹参酮ⅡA、豆甾醇等18种核心活性成分。61个共同靶点中筛选得到20个核心靶点,主要涉及丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)等。GO分析中,生物学过程主要有细胞群增殖、生长因子反应、脂质反应等。KEGG通路分析主要富集在AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、MAPK信号通路等。分子对接结果显示核心活性成分与核心靶点蛋白的结合活性均较好,大部分活性成分(90%)与靶蛋白具有强烈的结合活性。结论DDP可能通过多靶点、多通路的发挥对PVB的治疗作用,为进一步研究DDP治疗PVB的物质基础和作用机制提供方向。 | 林晖 李颖妃 任雪玉 胡继强 徐江林 董巧稚 崔晓云 | 2023 | 中国循证心血管医学杂志2023,15,4: | 1 |
| 3 | 心房颤动病人射频消融前后miRNA-328、miRNA-223表达与预后的关系显示文摘目的探讨心房颤动病人射频消融前后miRNA-328、miRNA-223表达与预后的关系。方法选取2014年9月—2018年5月在我院心内科住院的心房颤动病人62例,所有病人在瓣膜置换术同期直视下进行射频消融术治疗,收集病人住院期间血清及右心房心肌组织,分别进行miRNA-328、miRNA-223表达检测,超声检测,心肌组织苏木精-伊红(HE)、Masson染色,采用多元线性回归分析法分析预后转复率的影响因素。结果心房颤动病人心肌组织HE染色表现为心肌细胞增大,肌束明显增粗;Masson染色切片可见心肌细胞染色呈红紫色,细胞走行不一,大小不均,心肌细胞增大。射频消融术后62例病人窦性心律转复51例,转复率为82.3%。术后病人左心室舒张末期内径和左房直径均低于术前(P<0.05),miRNA-328和miRNA-223相对表达量均低于术前(P<0.05)。多元线性回归显示,miRNA-328和miRNA-223相对表达量、左房直径与舒张压为影响心房颤动病人预后转复率的独立危险因素(P<0.05)。结论射频消融术治疗心房颤动有很好的转复效果,miRNA-328和miRNA-223表达可有助于临床心房颤动的预后评估。 | 肖金平 付景秋 李小雷 陈俊 | 2020 | 中西医结合心脑血管病杂志2020,18,21: | 1 |
| 4 | 基于R语言的汉防己甲素治疗高血压分子机制研究显示文摘目的:运用R语言程序研究汉防己甲素高血压基因靶点。方法:基于STITCH、Pubchem和HPRD数据库,运用R语言程序研究汉防己甲素相关基因的高血压疾病网络,应用DAVID平台进行靶点的功能富集分析、通路富集分析。结果:汉防己甲素共获得了117个与高血压相关的靶点。结论:通过R语言编程进行数据库筛选,深度挖掘中药化学成分的疾病作用靶点,研究其潜在分子机制,为研究提供方向指南。 | 李娜 张艳英 范津玲 赵振营 | 2019 | 中国药师2019,22,5: | 0 |
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