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1microRNA与甲状腺乳头状癌相关性分析显示文摘目的筛选甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)显著差异表达的microRNA(miRNA),分析其与PTC发病机制的相关性。方法选取确诊的PTC癌组织及癌旁正常组织样本各6份,提取总RNA,采用转录组测序技术,筛选显著差异表达的miRNA,预测其靶基因并进行基因功能(Gene Ontology,GO)注释及信号通路数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;qRT-PCR法验证显著差异的miRNA在正常人甲状腺细胞(Nthyori3-1)及人甲状腺乳头状癌细胞(TPC-1及k1)中的表达水平。结果共测得2036个miRNA,已知1591个,新发现445个;共发现1166个miRNA差异表达,表达上调446个,表达下调720个,其中miR-124、mi R-7显著下调,miR-494、miR-106a-3p及novel-miR-26显著上调。经GO及KEGG分析,这5个显著差异miRNA的靶基因参与细胞周期、迁移及凋亡,与AMPK、Axon guidance、氨基酸代谢等信号通路的激活关系密切。novel-miR-26在TPC-1及k1细胞中表达量较在Nthy-ori3-1细胞中相对高表达(P均<0.01);miR-124在TPC-1及K1细胞中的表达量较在Nthyori3-1中相对低表达(P均<0.01)。结论显著差异表达的miR-124、miR-494、miR-106a-3p、miR-7及novel-miR-26可作为PTC潜在的分子标志物;Axon guidance、AMPK及蛋白代谢等信号通路在PTC的调控机制中起重要作用。谢青 房延兵 伊琳 杨锐 毛玉娟 江华 申进增 何亚丽 顾远晖 2021中国生物制品学杂志2021,34,1:3
2探讨脓毒症性急性肾损伤患者miRNA-494诊断效能显示文摘目的:探讨脓毒症致急性肾损伤患者循环微小RNA-494(miRNA-494)的水平变化及诊断效能。方法:纳入2018年01月~2020年01月我院重症医学科收治的脓毒症致急性肾损伤(AKI)56例归为观察组,选择同期收治的非脓毒症56例归为对照组;抽取静脉血测定miRNA-494水平收集临床资料,分析miRNA-494在两组表达变化及其与临床指标间的关系,评估miRNA-494预测脓毒症所致AKI的临床价值,分析影响因素。结果:本研究发现,(1)观察组年龄、BUN、Scr、Cys-C、KIM-1及miRNA-494水平高于对照组,但eGFR水平低于对照组;(2)miRNA-494诊断脓毒症性AKI的曲线下面积为0.84(0.77~0.92);(3)高miRNA-494患者BUN、Scr及Cys-C水平显著升高,eGFR水平显著降低,miRNA-494与BUN、Scr及Cys-C呈正相关关系,与eGFR呈负相关关系;(4)miRNA-494>6.71与脓毒症所致AKI相关,其优势比(OR)(95%CI)为1.72(1.34~3.69)。结论:miRNA-494是潜在的诊断脓毒症所致AKI的指标,也是其独立危险因素。李倩倩 罗亮 嵇丹丹 鲍洁 2020中国中西医结合肾病杂志2020,21,12:0
3miRNA-494-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息分析显示文摘目的采用生物信息学的方法对miRNA-494-3p的靶基因进行预测,并对靶基因集合进行功能富集分析和信号通路分析。方法应用微小RNA(miRNA)靶基因数据库StarBase进行靶基因预测,选取miRanda、PITA和Targetscan 3个数据库预测结果的交集作为进一步分析的基因集合。利用DAVID数据库,对靶基因进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果3个数据库预测到miRNA-494-3p的靶基因253个,其功能分别富集在蛋白质结合、双链DNA结合、RNA结合等分子功能,RNA聚合酶Ⅱ的转录调控、细胞增殖的正调控、细胞分化、细胞凋亡等生物学过程以及细胞核、核质、胞浆、细胞质、细胞隔膜等细胞组分上;生物学通路主要富集于癌症通路、FoxO信号通路、细胞吞噬作用、刺猬信号通路、细胞黏附连接、肌动蛋白细胞骨架的调控、谷氨酸能突触、昼夜节律以及p53信号通路中。结论miRNA-494-3p的功能主要富集在与癌症、胰岛素抵抗、糖尿病、炎症、胚胎发育等相关的多个信号通路中,为进一步研究其对靶基因和信号通路的调控作用及其可能的机制提供了线索。王玉美 徐广峰 张琳欣 郑君 杨欣 张佩滢 林小飞 2023中国药物经济学2023,18,8:0
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