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| 1 | Overexpression of GhPFN2 enhances protection against Verticillium dahliae invasion in cotton显示文摘Growing evidence indicates that actin cytoskeleton is involved in plant innate immune responses,but the functional mechanism remains largely unknown.Here,we investigated the behavior of a cotton profilin gene(GhPFN2) in response to Verticillium dahliae invasion,and evaluated its contribution to plant defense against this soil-borne fungal pathogen.GhPFN2 expression was up-regulated when cotton root was inoculated with V.dahliae,and the actin architecture was reorganized in the infected root cells,with a clear increase in the density of filamentous actin and the extent of actin bundling.Compared to the wild type,GhPFN2-overexpressing cotton plants showed enhanced protection against V.dahliae infection and the actin cytoskeleton organization in root epidermal cells was clearly altered,which phenocopied that of the wild-type(WT) root cells challenged with V.dahliae.These results provide a solid line of evidence showing that actin cytoskeleton reorganization involving GhPFN2 is important for defense against V.dahliae infection. | Wenyan Wang Yongduo Sun Libo Han Lei Su Ouixian Xia Haiyun Wang | 2017 | Science China(Life Sciences)2017，60，8： | 4 |
| 2 | 花椰菜BobACT基因的克隆及其作为内参基因的研究显示文摘实时荧光定量PCR技术是探索植物基因功能和调节机理的有效手段。选择合适的内参基因是获得实时荧光定量PCR准确性数据的必备条件。ACT基因高度保守且表达稳定,常作为内参基因被广泛应用。为了获得花椰菜ACT基因,以转录组测序和RT-PCR方法为手段克隆得到花椰菜肌动蛋白基因Actin。该基因等电点为5.395,理论分子量为41.77 kD;其cDNA开放阅读框长1134 bp,编码氨基酸377个,GenBank登录号为MG598643。Wolf Psort分析发现,BobActin蛋白亚细胞定位于细胞质基质中。Motif Scan分析显示,BobActin蛋白质的氨基酸序列4~377位为Actin保守结构域。进化分析表明,同源序列基因编码的蛋白质与同为十字花科的甘蓝、芜菁和油菜同源蛋白的相似性达到90%以上,具有高度的保守性。在此基础上,设计了1对荧光定量PCR引物,分析显示,该引物具有较高的特异性和扩增效率,在花椰菜根、茎、花、花球、叶片等不同组织和低温、高温、盐处理、干旱处理、ABA处理等胁迫处理下均能稳定表达,适合在花椰菜基因表达研究中作为内参基因,为开展花椰菜重要功能基因的挖掘、表达模式以及调控机理的研究提供参考。花椰菜在内参基因方面的研究还处于初步阶段,今后可继续克隆其他内参基因,丰富花椰菜的内参基因库,从而进一步提高花椰菜基因表达分析研究的稳定性、重复性和准确性。 | 林珲 朱海生 温庆放 黄丽芳 | 2019 | 植物遗传资源学报2019，20，3： | 4 |
| 3 | 巴西橡胶树排胶机制研究进展显示文摘橡胶树是世界上商业用天然橡胶最主要的来源,排胶是天然橡胶生产的最后关键环节,为了安全高效的获取胶乳产量,橡胶树排胶机制的研究一直受到人们的重视。橡胶树中的乳管是天然橡胶合成和储存的组织,人们通过割胶收集从乳管中流出的胶乳用作提炼天然橡胶。胶乳的排出速度及排胶持续时间是决定天然橡胶产量的重要因素,是排胶动力和排胶阻力共同作用的结果。笔者对与排胶相关的乳管细胞学基础、排胶主要初动力的乳管膨压、排胶继动力的乳管胶乳水分稀释效应以及乳管排胶阻力的形成及其调控机制等研究进行了归纳,主要分析了乳管伤口堵塞物的形成和影响排胶阻力的多种因素,指出乳管堵塞在胶乳的停排中起重要作用。针对目前排胶机制的研究进展缓慢这一现状,我们提出有必要从以下几点展开深入研究:(1)乳管膨压形成相关的树皮木质素合成和调控;(2)水分运输相关的水通道蛋白基因表达和活性分析;(3)停排相关的乳管伤口末端堵塞物的形成和调节。这些研究将为全面解析橡胶树排胶机制奠定基础,也可为分子辅助育种-选育排胶通畅的种质提供依据。 | 史敏晶 丁欢 田维敏 | 2022 | 中国农学通报2022，38，9： | 3 |
| 4 | 细胞微丝骨架在玉米抗纹枯病菌Rhizoctonia solani侵染中的作用显示文摘为探究细胞微丝骨架在玉米抗纹枯病侵染过程中的作用,采用微丝骨架解聚剂LatB预处理玉米离体叶片后接种立枯丝核菌Rhizoctonia solani AG1-IA,显微观察病原菌的侵染过程,并检测活性氧(ROS)、细胞坏死及抗病基因(PR1、ZmDREB2A)表达等抗病反应情况。结果显示,与未经LatB预处理相比,LatB预处理加快了R.solani侵染后玉米病斑的形成,并影响了侵染结构的发育;在侵染后期,LatB促进了R.solani诱导的玉米叶片中ROS积累、细胞坏死反应和PR1基因表达;溶剂DMSO预处理与未经LatB预处理的结果类似,表明DMSO对本试验的影响较小。研究表明,细胞微丝骨架不仅参与玉米抗R.solani的侵入,而且通过调控ROS、PR1基因表达,细胞死亡等抗病信号提高玉米抗病防御能力。本研究为进一步研究细胞微丝骨架在玉米对纹枯病的抗病机理中的作用提供了重要参考。 | 王伟 裴艳刚 王宇霜 孙霞 戴浩 龚国淑 常小丽 | 2018 | 植物保护2018，44，5： | 2 |
| 5 | 过量表达GhPFN2基因增强棉花对大丽轮枝菌的抗性显示文摘越来越多的研究表明,微丝骨架参与植物先天免疫过程,但是其作用机制尚不明确.本研究发现,棉花(Gossypium spp.)的profilin基因(GhPFN2)在大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)侵染条件下表达水平上调,推测GhPFN2可能参与棉花应答黄萎病过程.当棉花根部侵染大丽轮枝菌后,根表皮细胞中微丝的密度和成束度显著增加.与野生型相比,过量表达GhPFN2棉花对黄萎病的耐受性提高,并且棉花根部微丝骨架高级结构与野生型受到大丽轮枝菌侵染后的表型一致.这些结果表明,GhPFN2能够介导微丝骨架的重排,进而参与棉花抵御大丽轮枝菌的侵染过程. | 王文燕 孙永铎 韩利波 苏鸓 夏桂先 王海云 | 2017 | 中国科学:生命科学2017，47，9： | 1 |
| 6 | 巨须裂腹鱼水霉菌的分离鉴定及其对脾脏转录组的影响显示文摘为分析感染水霉菌对巨须裂腹鱼脾脏转录组的影响,探索水霉菌感染巨须裂腹鱼的分子机制,实验随机选取生活在同一水域中的5尾健康和5尾感染水霉菌的巨须裂腹鱼,采用PDA琼脂培养基和分子生物学方法对巨须裂腹鱼水霉菌进行分离鉴定,并采用Illumina HiSeqTM 2000高通量测序平台,对健康和感染水霉菌的巨须裂腹鱼脾脏组织进行转录组测序,并对测序数据进行拼接、注释和差异表达基因分析。结果显示,从巨须裂腹鱼皮肤上分离鉴定得到3株水霉菌;转录组数据显示,健康组和感染水霉病组分别获得46619504条和43912876条数据,与健康组相比,感染水霉菌组共有1889个基因发生差异表达,其中1414个基因上调,475个基因下调,随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证,验证结果与转录组测序一致。对健康组和感染水霉菌组的差异表达基因进行GO功能富集发现,上调基因主要富集于241个功能中,下调基因主要富集于60个功能中,上述基因主要涉及分子功能类、细胞组分类和生物过程类等生理功能;KEGG通路富集分析发现,差异表达基因主要富集在免疫疾病、内分泌和代谢疾病、病毒感染性疾病、消化系统及排泄系统等。研究表明,感染水霉菌会影响巨须裂腹鱼脾脏组织多种基因的表达量,实验结果为进一步探索巨须裂腹鱼水霉菌的感染机制奠定了基础。 | 孔庆辉 刘海平 刘锁珠 索朗斯珠 徐业芬 赵晓玲 商振达 | 2023 | 水产学报2023，47，8： | 0 |
| 7 | TaARPC5 is required for wheat defense signaling in response to infection by the stripe rust fungus显示文摘Numerous studies using a combination of confocal microscopic-and pharmacological-based approaches have demonstrated that the actin cytoskeleton dynamically responds to pathogen infection.Here,we observed that phalloidin treatment induced actin nucleation,resulting in enhanced resistance of wheat against the stripe rust pathogen Puccinia striiformis f.sp.tritici(Pst).To define the mechanism underpinning this process,we characterized a family of conserved actin-binding proteins,the actin related protein(ARP)family,which controls actin polymerization.Specifically,we identified and characterized a wheat ARPC gene(Ta ARPC5),which encodes a 136-amino acid protein containing a P16-Arc domain,the smallest subunit of the ARP2/3 complex.Ta ARPC5 m RNA accumulation was induced following the infection of plants with the avirulent Pst strain,and following the elicitation with flagellin(e.g.,flg22)as well.Subcellular localization analysis revealed that Ta ARPC5 is primarily localized to the cortical actin cytoskeleton,and its precise cellular localizations suggest the proximity to processes correlated with the actin-organelle interface.Upon treatment with virulent Pst,Ta ARPC5-knockdown plants exhibited a significant reduction in the expression of PTI-specific m RNAs.Conversely,we observed enhanced induction of reactive oxygen species(ROS)accumulation and a decrease in Ta CAT1 expression following infection with an incompatible Pst isolate.Together with yeast complementation assays,the current study demonstrates a role for Ta ARPC5 in resistance signaling in wheat against Pst infection by regulating the host actin cytoskeleton. | Jia Guo Huan Peng Tuo Qi Sanding Xu Md Ashraful Islam Brad Day Qing Ma Zhensheng Kang Jun Guo | 2022 | The Crop Journal2022，10，1： | 0 |
| 8 | 橡胶树前纤维蛋白(profilin)基因家族的鉴定及表达分析显示文摘肌动蛋白细胞骨架可能在橡胶树乳管伤口堵塞过程中发挥重要作用。前纤维蛋白(profilin)是肌动蛋白动态平衡的重要调节子,但对橡胶树profilin基因家族系统研究的报道较少。通过分析橡胶树基因组和转录组数据,鉴定到6个橡胶树profilin基因,对其基本特性及蛋白保守基序、结构特征、进化关系和表达模式等进行分析。基因结构分析表明,橡胶树profilin基因都包含3个外显子2个内含子,编码的蛋白序列含有profilin蛋白特有的保守基序KYMVIQGE和VIRGKKG。进化分析显示,橡胶树profilin并未严格分为营养型和生殖型2种类型。profilin蛋白二级结构以无规则卷曲为主,三级结构均包含3个α螺旋和7个β折叠。表达分析结果显示,4个profilin基因在胶乳中高表达,橡胶树排胶和碘化钾处理调控这4个profilin基因表达,推测profilin基因参与橡胶树排胶过程。该研究结果为进一步阐明橡胶树profilin基因在乳管伤口堵塞和排胶中的作用奠定基础。 | 邓治 李德军 | 2021 | 热带作物学报2021，42，9： | 0 |
| 9 | Plant biotic interactions显示文摘Plants are constantly under attack by pathogens,pests,and parasites,resulting in severe consequences on global food production and human health.While pathogens and pests find their ways to invade and communicate with their hosts,plants have evolved sophisticated immune systems to fight infections.In the field of plant-microbial interactions,most of the studies have focused on the function and signaling | Hailing Jin | 2016 | Journal of Integrative Plant Biology2016，58，4： | 0 |
| 10 | 甜瓜ADF7基因的克隆与生物信息学分析显示文摘肌动蛋白解聚因子(actin-depolymerizing factors,ADFs)通过剪切和解聚微丝来调控微丝组织和动态,被认为是肌动蛋白变化的重要调控因子。通过RT-PCR方法扩增得到甜瓜ADF7(CmADF7)基因序列,进行生物信息学分析和组织表达分析。结果表明CmADF7基因的开放阅读框(ORF)为414 bp,编码137个氨基酸,蛋白质理论分子量15.82102 kD,等电点5.32。生物信息学预测该蛋白是不具有跨膜结构的疏水性蛋白,亚细胞定位于细胞质中。基因结构分析显示CmADF7包含3个外显子,2个内含子,其中第1位外显子仅包含起始密码子ATG。结构域分析表明CmADF7具有高度保守的ADF-H结构域,其氨基酸序列为12~137位。同源性与系统进化分析证明CmADF7与同属葫芦科的西瓜的同源ADF亲缘关系较近。利用qRT-PCR分析发现CmADF7基因主要在花中表达,其他组织中检测虽有表达,但表达量都很低。序列分析表明,CmADF7启动子上存在一些参与光响应、胁迫应答及激素调节等相关顺式作用元件。新的甜瓜ADF蛋白结构和组织表达研究,将为进一步探索CmADF7蛋白功能和发掘其他CmADFs奠定基础。 | 吕艳玲 何明 张家旺 张丽丽 刘石磊 闫大波 汪澈 | 2020 | 沈阳农业大学学报2020，51，4： | 0 |
| 11 | 厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)基因组草图显示文摘厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)为木兰科(Magnoliaceae)木莲属(Manglietia)的木本植物,零星分布于我国广东省和广西壮族自治区,为国家二级重点保护野生植物。了解濒危物种基因组信息及其遗传多样性有助于合理地保护和利用濒危物种,实现濒危物种的解濒和复壮。为此,本研究通过高通量测序方法对厚叶木莲基因组进行测序,并利用测序数据开展厚叶木莲基因组草图的组装;之后,基于组装的基因组预测其中的重复序列和基因,进行系统发育和基因家族分析。结果表明,组装的厚叶木莲基因组大小为2092298891 bp,包含676个组装序列,N50(将组装的序列按照长度由大到小进行累加,当累加到某个序列时,累加的值为基因组50%的长度时,此序列的长度即为N50)为7961115 bp;利用BUSCO(Benchmarking Universal Single Copy Orthologs),针对“eudicots”和“embryophyta”这两个BUSCO单拷贝基因库,对基因组组装的完整性进行评估,组装的厚叶木莲基因组完整性分别为96.6%和98.8%。厚叶木莲基因组有76.5%的序列为重复序列,共有37900个基因,这些基因编码了41675个蛋白质序列。系统发育分析发现厚叶木莲与望春玉兰(Magnolia biondii)聚在一起,两者分化时间大致为10500000年前。厚叶木莲中与木质部/韧皮部、肌动蛋白丝、热、光合作用以及多种次生代谢相关的基因家族显著扩张,其中次生代谢相关基因在厚叶木莲基因组上呈串联和近端重复,这些基因的扩张和重复形成方式可能与厚叶木莲适应高海拔环境有关。本研究是国内外木兰科木莲属首个基因组报道,为更好地保护和开发厚叶木莲及木兰科其他物种的种质资源提供了遗传信息和参考。 | 甘新军 宾粤 陈焕锦 朱韦光 熊露桥 余恩萍 王峥峰 徐凤霞 曹洪麟 | 2023 | 广西科学2023，30，6： | 0 |
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