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1如何挖掘GEPIA数据库中研究数据并生成分析结果表达图显示文摘GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)即基因表达谱数据动态分析,是一个由中国人新开发的用于癌症和正常基因表达谱分析的公共数据库,填补了癌症基因组学大数据信息的缺口。GEPIA分析来自TCGA和GTEx项目的9736个肿瘤和8587个正常样本的RNA测序表达数据,TCGA和GTEx的表达量数据都是在同一个pipeline下重新算出来的,可以直接进行非常全面的表达分析。该数据库是一个开放的公共数据库,感兴趣的研究者可以申请其中的数据进行相关研究,本文旨在对GEPIA数据库的架构以及基因数据的提取、分析、结果表达制图方法进行介绍。闫小妮 田国祥 潘振宇 杨津 柳青青 吕军 2019中国循证心血管医学杂志2019,11,5:12
2乳腺癌多基因检测的再思考:机遇与挑战显示文摘Oncotype DX~(21基因)与MammaPrint~(70基因)检测已先后获得美国临床肿瘤学会推荐,用于指导早期浸润性乳腺癌辅助治疗决策。但在目前循证医学证据下,多基因检测仍只能作为传统临床病理因素的补充,并应严格限制在特定群体中应用。此外,目前多基因检测仍存在检测一致性不高、远期预测价值有限、特定方案获益预测欠佳等诸多瓶颈。未来,依靠高通量平台建立多组学特征谱、多学科交叉创新预测模型及多节点监测风险动态演进应成为乳腺癌多基因检测的发展方向。余之刚 王斐 2018山东大学学报(医学版)2018,56,1:3
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