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1中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究 Ⅰ.玉米品种纯度及真伪鉴定中SSR技术标准实验体系的建立显示文摘本研究从DNA提取、PCR扩增、电泳检测等环节对SSR技术进行了优化,最终建立一套完善的适用于玉米品种鉴定的SSR标准体系。并以玉米杂交种农大108的纯度鉴定为例,探索了该体系在玉米杂交种鉴定中实际应用的可行性。王凤格 赵久然 郭景伦 刘龙洲 2003玉米科学2003,11,1:102
2比较三种DNA指纹分析方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用显示文摘本项研究归纳出三种DNA指纹分析方法 ,即特征谱带法、引物组合法和核心引物组合法 ,并比较了这三种方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用价值。在玉米基因组上均匀选取 6 2对SSR引物对 6 0个玉米自交系进行分析。 6 2对SSR引物共检测到 2 38个等位基因变异 ,平均每个位点的等位基因数4 0 8个 ,平均多态性信息量 (PIC) 0 6 12 ,平均标记索引系数 (MI) 2 5 8,评估引物多态性的三个指标并不完全一致。三种方法的比较研究表明 ,特征谱带法仅在固定的材料范围内有效 ,当扩大范围后 ,原来具有特征带的样品往往不再具有特征带 ,且需要筛选大量的引物 ,效率很低 ;引物组合法通过不同引物的有限组合 ,完全可以区分全部材料 ,避免了筛选大量引物的工作 ;核心引物组合法是引物组合法的扩展 ,不同实验室通过使用固定的一套核心引物组合 ,其指纹图谱可以相互比较和整合 ,为玉米DNA指纹图谱分析的标准化奠定基础。王凤格 赵久然 郭景伦 佘花娣 陈刚 2003分子植物育种2003,1,5:62
3中国玉米新品种标准DNA指纹库构建研究的几点思考显示文摘概述了中国玉米新品种DNA指纹库构建研究中的五个主要问题,即选用哪些品种材料、选用什么标记方法、SSR标记存在哪些问题、选用哪些SSR引物及如何提高建库效率等,并提出了相应的解决方案,对其应用前景及主要应用领域进行了探讨。王凤格 赵久然 郭景伦 孙世贤 2005植物学通报2005,22,1:46
4SRAP和SSR标记构建的甘蓝型油菜品种指纹图谱比较显示文摘利用SRAP(sequence-related amp lified polymorph ism)和SSR标记构建了甘蓝型油菜品种指纹图谱,并对两种标记方法进行了比较。结果表明:(1)每对SRAP引物扩增出20.36个条带,其中4.44个是清晰、易于辩认的多态性带;每对SSR引物扩增出3.88个条带,均为多态性条带。(2)采用25对SRAP和SSR引物分别构建40个和75个品种的特异指纹图谱,SRAP指纹中具有特异图谱的比例(82.5%和50.7%)高于SSR指纹图谱的结果(60.0%和44.4%)。品种数越多具有特异指纹的品种越少。(3)运用引物组合法构建品种指纹图谱,大大地提高了指纹图谱的特异性。25对SSR引物组合扩增97个多态性谱带,两个不同的品种具有相同谱带的概率只有6.3108×10-30。组合指纹图谱比组合数码图谱更直观。与SRAP标记相比,SSR标记以其扩增谱带少、易于识别和统计而更适合用于引物组合法构建品种指纹图谱。文雁成 王汉中 沈金雄 刘贵华 2006中国油料作物学报2006,28,3:46
5适于玉米杂交种纯度鉴定的SSR核心引物的确定显示文摘为了确定一套适于玉米杂交种纯度鉴定的核心SSR引物,利用10个SSR引物对420份已知玉米(Zea mays)杂交种进行DNA指纹分析。综合考虑多态性和杂合率两个指标,确定bnlg161和bnlg1450为玉米杂交种纯度鉴定的首选核心引物,利用这两个引物进行筛选,412个品种(占98%)能够找到具有杂合带型的鉴定引物,确定5个引物bnlg439、bnlg125、umc2105、umc1705和bnlg1792为玉米杂交种纯度鉴定的备选核心引物。研究了纯度鉴定所用特异引物的选择,将特异引物分为两类:第一类是利用单个引物检测,某品种的基因型仅出现1次,将该引物作为该品种在特定品种范围内的特异引物,在420个品种中,累计29个品种具有第一类特异引物,其中umc1705和bnlg1450作为特异引物的次数最多,均为8个,phi072和phi065没有作为特异引物;第二类是根据引物基因频率表,将预测基因型频率低于2.40E-03(即1/420)的基因型作为特异基因型,除了phi072和bnlg161外,其它8个引物均可能成为具有特定基因型品种的第二类特异引物。利用推荐的7个纯度鉴定用核心引物可进一步筛选每个玉米杂交种的双亲互补型引物,建立了已知玉米杂交种的纯度鉴定DNA指纹图谱。王凤格 赵久然 王璐 易红梅 郭景伦 戴景瑞 原亚萍 卢柏山 杨国航 2007农业生物技术学报2007,15,6:39
6DNA分子标记技术在玉米种子纯度鉴定中的应用显示文摘从常规鉴定、生化鉴定及分子标记技术鉴定等方面,阐述了玉米种子纯度鉴定的重要性。进一步对RAPD、RFLP、SSR和AFLP等分子标记技术在种子纯度鉴定和品种真实性分析中的应用潜力及存在问题进行比较,得出SSR分子标记技术是目前种子纯度和品种真实性鉴定中最适宜的技术。罗黎明 刘丽 于丽娟 番兴明 2011生物技术进展2011,1,1:21
7利用SSR技术鉴定苏玉20的纯度显示文摘苏玉20是江苏省农业科学院2004年选育成功的高产优质玉米杂交种。以苏玉20玉米杂交种及其亲本为材料,从80对玉米SSR引物中筛选出在苏玉20双亲之间多态性明显、重复性较好的4对引物bnlg1306、phi065、bnlg2291和umc1590用于苏玉20纯度鉴定。这4个SSR标记特异性好,且人为掺杂与田间鉴定均与利用SSR标记鉴定结果高度一致。尤其是,这些引物同时可以用于郑单958的纯度鉴定并可以区分苏玉20和郑单958杂交种。因此,该方法具有准确可靠、实用性强等优点,为生产上杂交种苏玉20纯度的快捷有效鉴定提供了科学依据。孟庆长 陈艳萍 杨兴华 赵文明 张彦兵 袁建华 2009江苏农业学报2009,25,3:19
8小白菜品种的SSR指纹图谱及遗传特异性分析显示文摘为研制我国小白菜品种的DUS测试标准,搜集和筛选了形态差异大、不同生态类型的地方品种和目前生产上栽培面积大的杂交一代品种80份,在植物学性状调查的基础上,利用SSR标记对80份小白菜品种进行了遗传特异性分析,构建了SSR指纹图谱。从131对SSR引物中筛选了20对多态引物组合,对80个品种进行了分析,共检测出56个多态性条带,多态性比率73.68%,平均每对引物组合产生2.8个多态性条带。用5对引物Na12E02、Na12A08、Ni4D09、BRMS-269和BRMS-296的组合获得了每个品种的SSR特征带,可以将80个品种区分开来,从而建立80份小白菜品种的SSR指纹图谱。基于SSR标记的聚类分析表明,形态相似或来源相同的品种遗传基础相近,以遗传距离为0.36为划分标准,87.50%的品种具有遗传特异性。王笑一 于拴仓 张凤兰 余阳俊 赵岫云 张德双 2008华北农学报2008,23,5:18
9DNA分子标记与玉米种子纯度检验显示文摘本文阐述了RFLP、RAPD、AFLP及SSR 4种分子标记的方法、原理及在玉米纯度鉴定中的作用,并对其优缺点进行了评述。宇文强 叶雨盛 戴保威 彭义 曾桂萍 2005种子2005,24,12:11
10野生花生高油种质DNA指纹身份证构建显示文摘以20份高油野生花生为材料,从252对SSR引物中筛选出46对扩增条带清晰且多态性丰富的引物对其基因组DNA进行扩增,46对引物共扩增出425条带,全部为多态性条带,多态条带比例为100%。每对引物扩增获得的条带数为2~21条,平均9条。其中引物2E6的扩增效率最高,能将20份材料中的14份区分开。双引物组合2E6/PM403的鉴别能力最强,能将20份材料中的18份区分开。5组三引物组合能将20份材料完全区分,包括2E6/PM403/1B9、2E6/PM403/9A7、2E6/PM403/10H1A、2E6/PM403/PM201、2E6/PM403/PM458,其中三引物组合2E6/PM403/10H1A为涉及引物中的最佳引物组合。综合使用野生花生材料的国家统一编号、引物名称、分子数据建立了20份野生花生高油种质DNA指纹身份数据库,为野生花生的安全保存和保护以及有效利用奠定了基础。赵新燕 黄莉 任小平 姜慧芳 陈玉宁 2010华北农学报2010,25,6:11
11种子检验技术的现状与展望显示文摘种子检验是农业生产使用符合质量标准种子的保证,是农业丰收的基础。该文总结了当前国内外种子检验技术的发展现状,并对近年来种子检验的研究成果作了简单的综述,阐述了种子发芽试验、种子活力和生活力的测定、种子纯度的测定和种子健康度检验的方法,并探讨了以往种子检验中存在的问题与不足,最后对种子检验的发展方向和趋势进行了展望。成雪峰 张凤云 2009种子2009,28,8:9
12利用SSR进行品种纯度鉴定的研究进展显示文摘对品种纯度鉴定现状和困难、分子标记SSR原理和优点以及SSR在品种纯度鉴定中的应用等进行综述,并对高通量、高效率的DNA指纹图谱构建技术和全自动基因分析技术的实现作了展望。乔军 王利英 石瑶 2011天津农业科学2011,17,4:8
13不同类型玉米RAPD指纹图谱的构建显示文摘采用 RAPD标记技术对在云南省种植的不同类型玉米构建指纹图谱 ,在种子检验中用于鉴别种子真伪。从 80个引物中筛选到多态性好 ,带型稳定的 5个引物 ,总共检出 42个等位基因 ,片段大小在 40 0 bp~ 1 4 0 0 bp之间。分别建立了这些玉米材料的 RAPD指纹图谱及相应的数字指纹。吴渝生 程在全 徐雨然 熊华斌 2002种子2002,21,5:7
14桃品种鉴定的SSR核心引物筛选及其应用显示文摘为筛选出一套桃(Prunus persica L.)简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)的核心引物,以36份不同种质类型桃为材料,从已发表的桃全基因组SSR引物中,筛选出多态性高、稳定性强、分辨率高、重复性好及非特异扩增片段少的SSR引物10对。基于入选的核心引物对,构建24份登记品种、31份观赏桃的SSR分子指纹图谱,并对40个桃自交系后代的纯度进行鉴定,表明该研究获得的10对SSR核心引物可以用于桃品种指纹库构建,为更好地研究和利用这些桃种质提供理论依据,也为桃新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。关利平 王玲玲 曹珂 王力荣 2021中国果树2021,,6:7
15依赖性派生玉米品种DNA指纹鉴定标准研究显示文摘模仿育种是一快速、高效、针对性强的(改良)育种方法,但是根据最新国际保护公约规定,所育品种属于依赖性派生品种,侵害了原品种权人的权利。改良品种与原品种的遗传差异多大才算是依赖性派生品种,目前国内外没有标准。以BA为母本,以H28、昌7-2、9502、P138、齐319、连87、吉853、京2101、京343、京832为父本组配了10对同母异父玉米杂交组合,研究了杂交组合两两之间的遗传差异。结果表明:遗传差异在20%以下的组合,父本之间具有明确的血缘关系;遗传差异在20%~30%的组合,父本之间有40%具有血缘关系,没有血缘关系的占60%;遗传差异在30%以上的组合,父本之间全部没有血缘关系。无论两父本之间是姊妹系,还是其中一个父本是用另一个父本回交2次改良而成,用它们组配的杂交组合之间的遗传差异都在10%以上。通过回交3次改良的组合,与原组合之问的遗传差异在10%以下。因此,将遗传差异小于10%作为判断是否是依赖性派生品种的DNA指纹鉴定标准。郭景伦 2006华北农学报2006,21,1:7
16基于引物“随机组合”构建观赏桃SSR指纹图谱显示文摘近年来,我国观赏桃新品种日渐繁多、名称混乱、市场难以监管。同时用以区分品种的SSR指纹图谱的构建方法在研究界无统一的科学标准,尤其是构成最终引物组合的核心引物的确定。具体操作流程层出不穷、五花八门。为探索筛选SSR指纹图谱核心引物的科学方法,同时构建观赏桃SSR指纹图谱,该研究选用35对已报道的SSR引物对22份观赏桃种质进行试验。结果表明:通过PCR扩增与分析,多态性较高的8对引物——候选引物总共扩增出31个多态性条带,变幅为3~5个.PIC值变幅为0.458~0.668,MI值变幅为1.374~3.340。采用“随机组合”法对8对引物进行C18、C28、C38…依次分析,得到区分能力最强的3种不同的最少引物组合方式——候选组合,并能区分出18份种质.从中发现区分能力最强的3种引物组合方式并不都是由引物PIC值、alleles数量或MI值等多态性指标最高的引物组成,而是由互补性最强的引物组成。选用组合内各引物多态性条带总数最多的组合方式“4—3”(BPPCT001+BPPCT015a+BPPcT017+BPPcT025)为22份观赏桃种质构建了指纹图谱。基于此,通过常规多态性指标筛选候选引物可以确定出单对引物鉴别能力最强的少量引物;通过“随机组合”筛选候选组合可以进一步确定出引物之间互补性最强的几种组合方式;根据组合内各引物的多态性条带总数确定最终核心引物可以确定出可扩容性最大的引物组合。该研究最终建立了候选引物——候选组合——核心引物组合“三步法”确定SSR指纹图谱核心引物组合的科学方法,不仅为22份供试观赏桃种质构建了SSR指纹图谱,也为其它作物SSR指纹图谱的构建提供了新的思路。王清明 程怡 马建伟 张云婷 张勇 2016广西植物2016,36,3:5
17SSR指纹图谱技术在玉米种子鉴定中的应用显示文摘随着各种新型DNA分子标记的出现,带动了SSR指纹图谱技术的快速发展。长期以来,玉米种子质量问题成为玉米产业发展的限制因素,随着生物技术的发展,SSR指纹图谱在玉米种子鉴定中的作用成为研究热点。本文着重介绍了指纹图谱的概念、分析方法和作用等几个方面的内容。朱正梅 赵军华 胡贤女 2008农业科技通讯2008,,10:4
18DNA分子标记技术在玉米纯度鉴定中的应用综述显示文摘种子纯度是保证优良品种增产潜力得以发挥的关键因素,因而品种纯度检验对保证种子质量具有重要意义。DNA分子标记技术是随着分子生物学的发展而发展起来的一种新型的种子纯度和真实性的鉴定方法,它具有简便、快速、准确等优点。本文介绍了4种分子标记技术的概念、原理及特点,并对每种标记技术在玉米自交系和杂交种纯度鉴定的应用进行了综述。认为SSR技术是目前玉米种子纯度检测较适宜的分子标记技术。车卓 2013农业科技与信息2013,,2:2
19SSR在玉米种质资源分析及评价中的应用显示文摘介绍SSR分子标记在玉米遗传图谱构建、亲缘关系及杂种优势群划分、孤雌生殖单倍体鉴定等方面的应用,并对SSR标记技术在玉米研究中的应用进行展望。朱祥芬 王黎明 2015安徽农业科学2015,43,16:2
20中国玉米品种标准DNA指纹库构建研究进展显示文摘本文概述了北京市农林科学院玉米研究中心在'中国玉米品种DNA指纹库构建研究'方面的工作进展.该项目通过长期深入系统的研究,确定了建库材料的选择标准;并通过各种标记方法比较,确定SSR标记作为建库标记;进而优化SSR技术体系,确定一套核心引物;还在多重PCR反应及DNA指纹检测试剂盒开发、利用杂交种F1代种子果皮组织鉴定亲本自交系、依赖性派生品种鉴定等方面进行了探索性研究.在上述研究基础上,该项目在纯度及真伪检测、国家区试品种一致性及真实性监控及新品种DUS测试等领域已开始了系统的应用.赵久然 王凤格 郭景伦 2004华中农业大学学报2004,23,z1:1
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