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| 1 | 早熟禾种质资源ISSR遗传多样性分析显示文摘以国内外34份早熟禾为材料,利用ISSR分子标记技术对其进行了遗传多样性分析研究。结果表明,供试材料间的GS值变化范围在0.573-0.921之间,说明其遗传变异率较高,遗传种质资源丰富;采用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.74为界限,将供试材料分为3个类群,类群Ⅰ占供试材料的82.35%,类群Ⅱ、Ⅲ所占比例分别为5.88%和11.76%,其中来自中国农科院草原所的草地早熟禾和来自新疆农业大学的草地早熟禾被聚到第二类群,斗士、哥来德、优异、莫诺波利草地早熟禾品种被聚为第三类群,其余供试材料被聚为第一类群,表明供试早熟禾属野生材料和品种间有较大的遗传差异性。 | 郭郁频 任永霞 张颖超 闫利军 米福贵 | 2014 | 中国草地学报2014,36,3: | 20 |
| 2 | 利用表型数据构建狗牙根初级核心种质显示文摘本研究以831份狗牙根种质资源为试材,根据15个数量和质量性状,研究了狗牙根初级核心种质构建的方法。从总体取样规模(5%,10%,15%,20%,25%和30%)、组内取样比例(简单比例、对数比例、平方根比例和多样性比例)和取样方法(随机取样和聚类取样)3个层次探讨构建狗牙根初级核心种质的最佳取样策略,共形成48种取样策略。应用均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率4个参数来检验各取样策略的优劣。比较初始种质和初级核心种质两者基于主成分的样品分布图及性状间的相关系数,对构建的初级核心种质进行确认。结果表明,25%是最适宜的总体取样比例;4种组内取样比例中平方根比例优于简单比例、对数比例和多样性比例;2种取样方法中,聚类取样明显优于随机取样。最终确定25%的总体取样规模下,组内采用平方根比例和聚类抽样方法是构建狗牙根初级核心种质的最佳取样策略。根据获得的最佳取样策略最终在表型水平建立了包含208份种质的狗牙根初级核心种质,该种质可以作为整体资源的代表性样本,在狗牙根种质资源的充分开发和利用中发挥重要作用。 | 郑轶琦 郭琰 房淑娟 徐亚楠 陈静波 刘建秀 | 2014 | 草业学报2014,23,4: | 18 |
| 3 | 牛鞭草品种EST-SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析显示文摘为探讨牛鞭草(Hemarthria spp.)品种间的遗传多样性,从86 对EST-SSR 引物中筛选出8 对引物对牛鞭草属6 个品种进行指纹图谱的构建及遗传多样性分析.结果表明,8 对EST-SSR 引物对牛鞭草属6 个品种共扩增出193 条清晰条带,多态性条带161 条,多态性比例为83.4%.每条引物的多态信息含量(PIC)为0.480 ~ 0.695,平均为0.602.UPGMA 聚类分析表明,牛鞭草属6 个品种在相似系数为0.652 处可分为两大类群.8 对EST-SSR 引物均能将6 个品种完全区分开,以3 对EST-SSR 引物扩增的电泳图谱为基础,建立了牛鞭草属6 个品种的指纹图谱标准模式图,每个品种都有唯-的指纹图谱.牛鞭草属6 个品种的平均Nei’s 基因多样性指数为0.333,平均Shannon 信息指数为0.496,品种间的相似系数介于0.399 ~ 0.782 之间.可见,牛鞭草属植物品种的遗传多样性较丰富,种间差异明显. | 黄秀 曾捷 聂刚 刘欢 黄琳凯 张新全 蒋晓梅 张瑜 张博涛 | 2014 | 热带亚热带植物学报2014,22,2: | 13 |
| 4 | 饲草型小黑麦遗传多样性的ISSR分析显示文摘本研究利用ISSR分子标记对30份饲草型小黑麦种质进行遗传多样性分析,以了解不同饲草型小黑麦种质间的遗传差异,为小黑麦种质资源保护、品种选育及分子鉴定提供理论依据。结果表明:参试小黑麦种质遗传多样性较丰富,利用ISSR的12条引物共检测到124条扩增条带(位点),平均多态性比率(PPB)为77.42%。30份小黑麦种质的遗传相似系数(GS)为0.66~0.91。在GS=0.765处将30份小黑麦种质分为6类,其中8809及81S37与其他种质的遗传距离最大,单独聚为一类;826126和北联3号为第Ⅴ类;33RD ITSN、CHEROKEE和新小黑麦5号为第Ⅰ类;北联4号、PH389、DH796、中拉一号和安83-25为第Ⅳ类;其余种质聚为第Ⅱ类。第Ⅳ类与第Ⅴ类小黑麦种质的遗传相似系数均较小,如果其他性状符合育种目标,可相互进行杂交。 | 赵雅姣 田新会 杜文华 | 2017 | 草地学报2017,25,3: | 11 |
| 5 | 7个燕麦品种的ISSR遗传多样性分析显示文摘利用ISSR分子标记技术对贵州引种的7个燕麦品种进行遗传多样性分析。从50条引物中筛选出17条作为燕麦ISSR引物,总共扩增出204条条带,平均每个引物扩增出12条条带,其中具有多态性的条带有103条,平均每个引物扩增出多态性条带6. 06条,多态性比率为50. 49%。用Popgene32软件计算出7个供试燕麦品种的遗传相似系数(GS)为0. 855~0. 945,变幅为0. 09。其中,加燕2号和Hay Wire二者之间的遗传相似系数最大(0. 945),亲缘关系较近,遗传差异最小;甘早和青海白燕麦遗传相似系数最小(0. 855),亲缘关系较远,遗传差异最大,存在较高的遗传多样性。研究结果为贵州燕麦品种培育提供理论依据。 | 余青青 王普昶 赵丽丽 陈超 唐华江 李继伟 | 2018 | 江苏农业科学2018,46,19: | 10 |
| 6 | 北京地区野生柴胡种质资源的ISSR研究显示文摘目的:通过ISSR分子标记技术考察北京地区野生柴胡不同种质资源之间的亲缘关系。方法:从43条引物中筛选出8条合适的引物,对北京地区不同产地采集的15份野生柴胡种质资源进行ISSR分析,构建聚类系统树状图。结果:8条引物共扩增出130条条带,其中多态性条带114条,占87.7%,聚类分析显示北京地区野生柴胡遗传多样性较高,并存在明显的种内遗传变异。结论:北京地区野生柴胡呈现一定的地域性分布趋势,应加以保护,初步认为百花山山腰及山脚柴胡值得推广种植,研究为北京地区柴胡种质亲缘关系研究及栽培品种的选育奠定了基础。 | 赵香妍 刘长利 薛文峰 张夏楠 罗容 | 2015 | 中国现代中药2015,17,10: | 9 |
| 7 | 3种楠木DNA提取及其ISSR标记鉴别显示文摘【目的】采用ISSR分子标记鉴别楠属3个树种。【方法】以紫楠、浙江楠和桢楠木材为对象,比对改良CTAB-SDS法、CTAB法和试剂盒法3种方法提取的木材基因组DNA质量,采用ISSR-PCR技术对3个树种24个样本基因组DNA进行扩增。【结果】改良CTAB-SDS法和CTAB法较适合这3种木材的DNA提取。序列扩增筛选出7条稳定、条带清晰且多态性好的引物,确定其最佳退火温度。7条引物共扩增出67条大小为100~2 000 bp的条带,其中多态性条带43条,多态率64.2%。【结论】这7条引物扩增的多态性条带都可用于鉴别与区分这3种楠木。 | 王英 骆嘉言 钟文翰 石江涛 樊帅 | 2016 | 四川农业大学学报2016,34,4: | 6 |
| 8 | 高牛鞭草(Hemarthria altissima)及其近缘种种质资源SCoT多样性分析显示文摘利用SCoT标记对来源于四大洲的46份牛鞭草(Hemarthna spp.)种质资源[包括36份高牛鞭草(Hemarthria altissima)、8份扁穗牛鞭草(Hemarthria compressa)及2份Hemarthria uncinata]的遗传多样性和亲缘关系进行了研究.从48条SCoT引物中筛选出条带清晰、多态性好和重复性好的22条,对46份牛鞭草(Hemarthria spp.)种质资源进行扩增.结果表明:共获得597条带,多态性比率(PPB)为89.1%,平均每条引物扩增多态性条带24.3条,多态信息含量(PIC)范围为0.443 ~0.877,平均0.623.46份牛鞭草种质资源平均Nei's基因多样性指数为0.273,平均Shannon信息指数为0.486,表明46份牛鞭草种质资源具有丰富的遗传多样性.供试材料间的遗传相似系数介于0.611~0.943之间,聚类分析和主成分分析结果高度相似,基本将供试材料按牛鞭草种类及地理来源分为4大类,表明46份牛鞭草种质资源的遗传多样性与牛鞭草种类及其地理来源具有一定的相关性.可见,SCoT能用于牛鞭草种质资源遗传多样性研究,是一种有效的分子标记.本研究将有利于牛鞭草种质资源的收集及评价利用. | 黄秀 张新全 张瑜 蒋晓梅 曾捷 刘欢 聂刚 张博涛 黄琳凯 | 2013 | 热带作物学报2013,34,11: | 6 |
| 9 | 柳枝稷种质资源遗传多样性的ISSR分析显示文摘应用ISSR标记对138份柳枝稷种质的遗传多样性和遗传结构进行研究,为资源保护利用提供理论依据和技术支持。研究结果显示,1)从100个ISSR引物中筛选出16个条带清楚且稳定的引物,共扩增出220条谱带,其中,多态性谱带196条,多态性比率(PPB)为89.09%,平均每个引物扩增条带数为13.75条。2)POPGENE 1.32软件分析结果显示,138份柳枝稷基因多样性指数(H)为0.2498,Shannon指数(I)为0.3880,表明供试的种质间遗传多样性较丰富,遗传多样性水平较高。3)AMOVA 1.55软件方差分析结果显示,43.40%的遗传变异存在于生态型之间,56.60%遗传变异存在于生态型之内,说明遗传结构的变异主要存在于生态型之内。4)NTsys-pc 2.1软件进行UPGMA聚类分析和主成分分析(PCA),供试138份柳枝稷种质间Dice遗传相似系数(GS)值为0.4000~0.8818,平均值0.7237,结果表明,低地型材料聚为一大类,高地型材料聚为一大类。 | 张瑜 黄琳凯 张新全 蒋晓梅 杨盛婷 聂刚 严海东 | 2013 | 草业学报2013,22,6: | 4 |
| 10 | 利用SSR、EST-SSR标记构建狗牙根抗寒种质数字图谱显示文摘以抗寒与寒敏感狗牙根为材料,用12对EST-SSR、SSR引物分别对12份抗寒与寒敏感狗牙根(已通过表型、生理鉴定)进行扩增。结果表明:EST-SSR引物(ES3862、ES8174、ES6865)、SSR引物(CDE45、CDE33、CDE95)可将抗寒及寒敏感狗牙根区分开;EST-SSR引物组合(ES5349+ES3862、ES5349+ES8174、ES2010+ES5349)、SSR引物组合(CDE55+CDE45)能将12份材料区分开,最终构建了可以区分抗寒种质的数字图谱。利用标记获得的0、1数字矩阵对材料进行亲缘关系分析的结果表明:两类标记分别扩增出38条、44条带,多态性比例为97.43%、95.65%;各材料遗传相似系数分别在0.4858~0.9487、0.4855~1.000之间,在遗传相似系数为0.4858和0.4855处能将抗寒与寒敏感狗牙根明显区分。 | 马亮 张延辉 帕提古丽.麦麦提敏 李培英 阿不来提 | 2015 | 中国草地学报2015,37,6: | 4 |
| 11 | 绿竹ISSR-PCR反应体系的建立与优化显示文摘以绿竹基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用单因素试验方法,对dNTPs、Mg^(2+)、Taq DNA聚合酶、引物、模板DNA设置7个不同浓度梯度进行研究,并对退火温度和循环次数进行筛选,建立绿竹ISSR-PCR最佳反应体系和扩增程序,并利用优化后的体系对100条ISSR引物进行筛选。最终确定的最佳反应体系为:20μL的扩增体系中,dNTPs浓度为0.2 mol/L,Mg2+浓度为2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶用量为1.0 U,引物浓度为0.4μmol/L,DNA用量为50 ng,10×PCR buffer体积为2μL、剩余体积用灭菌dd H2O补全。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性45 s,(根据引物的退火温度)复性30 s,72℃延伸90 s,循环38次;72℃延伸10 min,4℃保存。以此体系为基础进行引物筛选,在100条ISSR引物中筛选出14条扩增条带清晰、多态性较高、重复性好的引物。本研究建立了绿竹ISSR-PCR最佳反应体系并筛选出高多态性引物,为绿竹的指纹图谱、遗传多样性分析、分子育种和品种鉴定等研究提供了基础。 | 徐雯 瞿印权 陈剑成 何天友 荣俊冬 陈礼光 郑郁善 | 2017 | 江苏农业科学2017,45,15: | 4 |
| 12 | 菊科药用植物遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析显示文摘本研究采用ISSR分子标记对菊科各属种质进行遗传多样性和亲缘关系进行分析,为种质资源的有效保存及分子鉴定奠定基础。采用ISSR-PCR扩增国家中药种质资源库保存的菊科40个属的40份药用植物,琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,NTSYS-pc2. 1软件对电泳结果进行多态性分析,UPGMA构建遗传树。此次实验筛选出8条引物,40份材料扩增出68个位点,多态性位点为68个,多态性位点百分率为100%,遗传相似性系数范围在0. 71~0. 91。UPGMA聚类分析结果表明在相似性系数为0. 75时可将这40种菊科药用植物分为7类。结果表明目前搜集的40个属材料遗传多样性较为丰富,选择的8个ISSR引物可进一步用于后续种质资源的分子鉴定。 | 唐小慧 胡静 任超翔 宋婕 裴瑾 吴清华 陈江 | 2018 | 天然产物研究与开发2018,30,10: | 3 |
| 13 | 基于ISSR标记的藤本月季品种遗传多样性及其分子身份证的构建显示文摘38个藤本月季品种ISSR分子标记结果表明,23条引物共扩增出212个多态性位点,多态性比率高达72.35%。基因分化系数GS值变化范围在0.755~0.971,变化幅度较小,品种亲缘关系较近。38个藤本月季品种的群体遗传参数中平均观测等位基因数为1.973 5,平均有效等位基因数1.578 1,平均Nei’s基因多样性指数为0.372 6,平均Shannon’s信息指数为0.572 3。38个品种间的遗传分化系数(Gst)为0.785 6,基因流(Nm)为0.058 4,表明38个品种遗传多样性丰富。由聚类分析图可知,38个品种可聚为3个大类7个分支。以23条引物中多态性较好且能区分这38个供试品种的17条引物对不同品种扩增条带进行统计,建立了38个藤本月季品种的分子身份证。 | 高鹏华 于文剑 赵芮 熊阳阳 王锦 | 2019 | 江苏农业科学2019,47,18: | 3 |
| 14 | 七种风铃草属植物亲缘关系的ISSR分析显示文摘为了解四川风铃草属植物的资源丰富度和遗传进化情况,该研究利用ISSR分子标记,探究了四川7种风铃草属植物的亲缘关系,为风铃草属植物的分子标记辅助鉴定、资源保护、花卉品种的开发与育种提供理论基础。结果表明:40条ISSR引物中有28条引物能够扩增出清晰的条带,扩增总条带数为164,其中有98.8%的扩增条带具有多态性,供试的7种风铃草属植物遗传相似性系数在0.421~0.945之间,其中钻裂风铃草与藏滇风铃草的遗传相似度最高为0.945,说明它们之间的亲缘关系很近。此外,ISSR分子标记聚类结果表明,7种风铃草属植物可以明显聚为4大类:西南风铃草、灰毛风铃草、灰岩风铃草为一类;紫斑风铃草与流石风铃草各成一类,这两种在形态上与其它各种风铃草差异较大;最后是钻裂风铃草与藏滇风铃草为一类。 | 包志远 曲继鹏 杨在君 路璐 廖明莉 周梦霞 彭正松 | 2018 | 广西植物2018,38,6: | 1 |
| 15 | 狗牙根品种(系)表型及分子遗传变异研究显示文摘狗牙根系世界著名多年生禾本科暖季型草坪草,广泛用于不同用途草坪建植。本研究对国内审定的5个狗牙根品种,1个新品系及1个国外引进品种进行表型性状和分子遗传的比较研究,以进一步明确我国狗牙根品种资源的利用特性和遗传基础。结果表明,1)供试狗牙根品种(系)‘02011’在试验区域的成坪速度为53d,绿期为269d,高于国内审定品种;2)反映株高、匍匐茎、旗叶、花序等特性的9个表型性状在品种间差异均达极显著水平(P<0.01);3)各品种(系)在匍匐茎表面颜色、花序抽出度、叶片上表面颜色、生长习性、生殖枝表面花青甙显色、外颖颖壳、颖尖花青甙显色等植物新品种测试性状上表现出不同程度的群体差异;4)SRAP与SSR分子标记各18对引物分别扩增出167和316条谱带,多态性比例分别为87.51%和70.13%,来自相同地域的供试狗牙根品种具有较近的遗传相似度。 | 谢欢 蒋林峰 马洪平 张新全 刘伟 彭燕 | 2016 | 草业学报2016,25,3: | 1 |
| 16 | 35份狗牙根种质材料指纹图谱构建及染色体倍性鉴定显示文摘[目的]通过鉴定来自不同地区的35份狗牙根(Cynodon spp.)种质资源,为其种质资源的开发与利用提供理论基础。[方法]以29份狗牙根优良种质材料为研究对象,以6份源自国外的优异品种为对照,利用流式细胞术(FCM)检测染色体倍性,通过相关序列扩增多态性(SRAP)和简单重复序列(SSR)分子标记技术进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。[结果]共筛选出10对SRAP引物,扩增出155条清晰的谱带,其中多态性条带有132条,多态性比率为85.16%;筛选出10对SSR引物,扩增出166条清晰的谱带,多态性条带有144条,多态性比率为90.00%;35份狗牙根材料的遗传相似系数(GS)为0.524~0.927,变幅为0.403,表明这些材料之间存在丰富的遗传变异。基于GS进行聚类分析,在GS为0.699处,将35份狗牙根材料分为4类。利用7对SRAP引物和5对SSR引物分别构建35份狗牙根材料的DNA指纹图谱。通过FCM鉴定出各自的染色体倍性,其中二倍体1份、三倍体28份、四倍体6份。[结论]应用FCM、SSR和SRAP等技术能够充分揭示狗牙根不同种质材料间存在的遗传差异,可用于狗牙根种质资源的遗传多样性分析、种质鉴定等研究工作,为后续狗牙根新品种选育奠定基础。 | 何法慧 左倩倩 于景金 杨志民 | 2023 | 南京农业大学学报2023,46,1: | 1 |
| 17 | 油楠基因组DNA提取·ISSR反应体系优化及引物筛选显示文摘[目的]对油楠基因组DNA提取、ISSR反应体系优化及引物筛选进行探讨。[方法]运用改良CTAB法对油楠树皮进行基因组DNA提取,利用单因素试验,对油楠ISSR-PCR反应各因素水平进行优化。[结果]运用改良CTAB法对油楠树皮进行基因组DNA提取效果最佳;最优体系:20μl反应体系中,模板用量20 ng,引物浓度0.6μmol/L,d NTPs浓度0.2 mmol/L,Mg2+浓度2.0 mmol/L,Taq酶用量1.5 U,10倍反应缓冲液2μl,dd H2O补至20μl;以该体系为基础进行引物筛选,在100条ISSR随机引物中筛选出13条多态性较高、扩增条带清晰、重复性好的引物。[结论]该研究丰富了油楠遗传学基本资料,为油楠遗传多样性研究奠定基础。 | 吴忠锋 杨锦昌 尹光天 李荣生 邹文涛 袁洁 | 2015 | 安徽农业科学2015,43,26: | 1 |
| 18 | 昆明10种草坪草的ISSR指纹图谱构建显示文摘草坪业在发展过程中出现一些种的混淆,为了区分不同草坪草,采用昆明常见的10种草坪草为样本,利用简单重复序列(inter-simple sequence repeat,简称ISSR)分子标记技术构建昆明地区常见草坪草的指纹图谱。从28条引物中筛选出15条特异性较好的引物,对其进行退火温度筛选。结果表明,引物UBC834、UBC842、UBC844退火温度分别为58、58、55℃时多态性较好。对引物UBC834、UBC842、UBC844的电泳图谱进行0、1读带,构建了3个草坪草的数字指纹图谱,可以将供试的10种草坪草全部区分开来。 | 王开拓 吴田 蓝增全 | 2020 | 江苏农业科学2020,48,2: | 0 |
| 19 | 23个德国鸢尾品种(系)的ISSR分析显示文摘以23个德国鸢尾品种(系)为材料,利用ISSR标记研究23份材料间的遗传多样性。结果表明,10条引物共获得68条清晰可辨的条带,多态性条带为61条,平均每条引物扩增出6.8条带,多态性位点百分率为89.7%;23个德国鸢尾品种(系)的平均有效等位基因数为1.897 1,平均Nei's基因多样性指数为0.331 3,平均Shannon信息指数为0.491 1,品种间的遗传相似系数(GS)范围在0.375~0.850,变幅为0.475,说明供试材料具有丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析结果表明,GS值0.706时,23个德国鸢尾品种(系)可聚为5类。利用2个ISSR引物UBC814、UBC900扩增谱带构建的指纹图谱可以把23个德国鸢尾品种(系)完全区分开。 | 张永侠 缪淼 原海燕 杨永恒 刘清泉 黄苏珍 | 2017 | 江苏农业科学2017,45,2: | 0 |