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| 1 | 广东省人免疫缺陷病毒1亚型基因序列特征分析显示文摘目的研究广东省人免疫缺陷病毒1(HIV-1)亚型的基因序列特征。方法 2002年采集100份 HIV-1感染者的外周静脉抗凝血,分离单核细胞(PBMC),提取前病毒 DNA,通过聚合酶链反应(PCR)扩增,获得包膜蛋白(ENV)区基因的核酸片段,并对其 C2~V3及邻区核苷酸序列进行测定和分析。所得序列用 GCG 软件包进行系统进化树和氨基酸变异分析。结果经过离散率计算和系统进化树分析后证实,其 PCR 扩增阳性的75份样品中,44份(58.7%)为重组毒株 CRF01-AE(circulating recombinant form 01-AE),27份(36%)为 CRF-BC,4份为泰国 B′亚型(5.3%)。结论广东省 HIV-1以 CRF01-AE 和 CRF-BC 为主,也存在泰国B′亚型。目前我省境内有多种亚型存在,流行趋势日益严峻。加强艾滋病患者的治疗,以及控制和预防艾滋病的传播是今后面临的重要任务。 | 万卓越 李杰 刁丽梅 林鹏 邢辉 王玉 马鹏飞 姜树林 邵一鸣 | 2006 | 中华预防医学杂志2006，40，5： | 17 |
| 2 | 广东省艾滋病患者HIV-1基因亚型分析显示文摘目的 了解目前广东省HIV/AIDS患者HIV-1基因型的流行状况.方法 用套式PCR对222例HIV/AIDS患者外周血单核细胞(PBMC)中HIV前病毒DNA膜蛋白env基因C2-V4区及其邻近区域片段进行扩增,并对片段进行序列测定,与国际HIV-1标准毒株序列进行比较,依据同源性确定基因型.结果 222例患者中,111例PCR扩增阳性并得到相应的序列,66例(59-46%)为CRF01-AE重组亚型,18例(16.22%)为BC型,18例(16.22%)为B亚型,9例(8.11%)为C亚型.不同性别、不同年龄组、不同感染来源的HIV-1感染均以CRF01-AE为主(均为50%以上).对抗逆转录病毒治疗12个月临床有效的57例患者,CD4+T细胞计数的变化在各基因型分组及各治疗方案分组间的差异无统计学意义(F=95.72、85.61,P>0.05).结论 广东省HIV/AIDS患者中,目前流行的HIV-1毒株以CRF01-AE亚型为主,同时有BC(包括CRF07-BC、08-BC重组亚型)及B、C亚型存在,基因型分布与性别、年龄无明显相关性,基因型与抗逆转录病毒治疗方案的选择、疗效均无相关性. | 卓丽 唐小平 陈伟烈 邓西龙 | 2011 | 国际流行病学传染病学杂志2011，38，1： | 9 |
| 3 | 广东省HIV/HCV共感染者及单纯HIV感染者HIV-1基因亚型分析显示文摘目的了解广东地区HIV/HCV共感染患者和单纯HIV感染患者的感染途径及HIV-1病毒基因亚型分布特征,为艾滋病的治疗与预防提供实验室数据。方法采用巢式RT-PCR对广东地区51例HIV/HCV共感染患者和48例单纯HIV感染患者HIV-1 ENV基因c2v3区域及GAG基因p17区域进行扩增,PCR产物测序后所获得序列进行HIV-1病毒基因亚型分析。结果 HIV/HCV共感染患者主要感染途径为静脉注射毒品,约占82%,其HIV-1有4种基因亚型,不同亚型以及比例分别为CRF01_AE(54.9%)、CRF07_BC(33.3%)、CRF08_BC(4%)和B'型(7.8%),CRF01_AE亚型为经静脉注射毒品感染的HIV/HCV共感染患者的主要HIV-1基因亚型,约占54.7%;单纯HIV感染患者主要感染途径为性,约占77%,其HIV-1有5种基因亚型,不同亚型及比例分别为CRF01_AE(77.1%)、CRF07_BC(10.4%)、CRF08_BC(6.2%)、B'型(4.2%)和B型(2.1%),CRF01_AE亚型为经性途径感染的单纯HIV感染患者的主要HIV-1基因亚型,约占78.4%。结论广东省HIV/HCV共感染患者和单纯HIV感染患者中流行的HIV-1病毒基因亚型呈现多样性,尽管HIV/HCV共感染患者的主要感染途径与单纯HIV感染患者的不同,但HIV-1病毒主要基因亚型相同。 | 袁小珍 陈伟烈 卓丽 | 2013 | 广东医学2013，34，14： | 7 |
| 4 | 异源双链泳动分析法快速检测TT病毒基因型显示文摘目的 建立一种简单、敏感、特异和成本低的TT病毒 (TTV)基因型测定方法。方法采用巢式聚合酶链反应方法 (nPCR)对 96名正常人和 180例各型肝炎患者血清标本进行TTVDNA检测 ,然后采用异源双链泳动分析法 (HMA)和序列测定分析法对TTVDNA阳性标本进行基因分型。结果 各型病毒性肝炎中TTVDNA阳性率为 2 2 .2 % (40 / 180 ) ,正常人为 19.8% (19/ 96 ) ,两者差异无显著性 (χ2 =0 .2 2 0 ,P =0 .6 39)。在甲、乙、丙、戊型肝炎和非甲~戊型肝炎患者中TTVDNA阳性率分别为2 0 .0 % (6 / 30 )、16 .7% (5 / 30 )、2 3.3% (7/ 30 )、36 .7% (11/ 30 )和 18.3% (11/ 6 0 )。在 4 0例TTVDNA阳性标本中 ,经HMA法分型 ,G1型为 5 0 .0 % (2 0 / 4 0 ) ,G2型为 17.5 % (7/ 4 0 ) ,混合型为 2 5 .0 % (10 / 4 0 ) ,另有 7.5 %(3/ 4 0 )未能分型。 10例TTV混合型感染的标本经克隆测序及基因进化树分析 ,5例为G1和G2型 ,2例为G1和G3型 ,1例为G1和G4型 ,1例为G2和G3型 ,1例为G1、G2和G3混合型感染。结论 HMA是一种简单、敏感、特异和经济的分型法 ,可用于TTV基因型分型。 | 何忠平 庄辉 姚均 董庆鸣 戴旺苏 宋淑静 | 2003 | 中华流行病学杂志2003，24，9： | 7 |
| 5 | 辽宁省流行的人类免疫缺陷病毒1基因亚型调查显示文摘目的 了解辽宁省人类免疫缺陷病毒 (humanimmunodeficiencyvirus 1,HIV 1)各亚型的流行情况。方法 采集 1997年 6月至 2 0 0 0年 12月间辽宁省检出的 16例HIV 1感染者的全血标本 ,提取核酸后用巢式 聚合酶链反应 (nested PCR)技术扩增HIV 1env基因区 ,用异源双链泳动分析法 (heteroduplexmobilityassay ,HMA)进行HIV 1亚型的分析。 结果 辽宁省目前已有HIV 1A、B’、C和E亚型流行。经性途径感染占全部HIV感染的 31.2 5 % ,分别为泰国B(B’)亚型和A亚型 ,以B’为主 ;经注射吸毒感染占全部HIV感染 31.2 5 % ,分别为C亚型和E亚型 ,以C亚型为主 ,其中 1名吸毒者为B或E亚型 ;经输供血途径感染占全部HIV感染的 31.2 5 % ,主要为泰国B’亚型 ,也可见C亚型 ;垂直传播 1名为A亚型。结论 辽宁省已有多种亚型HIV 1毒株流行 ,有效地控制艾滋病经性乱。 | 韩晓旭 姜拥军 尚红 王亚男 卢春明 张世博 姜凤霞 邵一鸣 | 2001 | 中华流行病学杂志2001，22，6： | 4 |
| 6 | HIV-1亚型分子流行病学研究进展显示文摘HIV-1具有高度的遗传变异性,利用基因分型技术,对HIV-l基因亚型进行分类,得出HIV-l亚型流行特点及其地域分布等,对HIV-l的传播及其流行模式、病毒耐药研究和疫苗研发均具有重要意义。本文综述了近年来HIV-1基因分型相关技术及研究进展,为进一步研究HIV-1分子流行病学提供依据。 | 何浩岚 何金洋 蔡卫平 陈谐捷 许飞龙 陈伟烈 | 2010 | 传染病信息2010，23，6： | 4 |
| 7 | 九江市HIV-流行毒株基因序列测定和亚型分析显示文摘目的:了解九江市H IV-1流行毒株的亚型分布情况。方法:对采集的6份九江市H IV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得GAG基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果:在6份样品中发现B′亚型H IV-1毒株四株,B亚型和A/E重组亚型H IV-1毒株各一株。结论:H IV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。 | 张红波 邢辉 肖云 杨泽民 马鹏飞 卫星 刘羽真 吴光中 | 2005 | 中国卫生检验杂志2005，15，12： | 1 |
| 8 | Antigen Gene Cloning and Expression of HIV-1 Toward AIDS Vaccine Design Ⅱ.Subtype Classification and Quasi-species Identification of HIV-1显示文摘Objective:To analyze subtypes and quasi-species of isolated viruses from HIV-1 infected individuals among the population epidemiological dynamics of local HIV-1 isolates,thus laying a foundation for designing a candidate AIDS vaccine.Methods:By hetero-duplex mobility assay(HMA)and single strand conformation poly-morphism(SSCP)analysis on amplicons from single-primed polymerase chain reaction(SP-PCR),subtypes and quasi-species of tested HIV-1 isolates were elucidated,and amplicons were sequenced for confirmation.Results:Specific amplicons from different subtypes and quasi-species of HIV-1 could be discernible by HMA and SSCP analysis.HIV-1 isolates from different patients might be either a different srbtype or an identical subtype,and HIV-1 isolates from an individual were present in a population of quasi-species. | 曾庆平 杨瑞仪 冯丽玲 陈竹华 曾常红 | 2002 | Chinese Journal of Sexually Transmitted Infections2002，2，2： | 0 |
| 9 | Antigen Gene Cloning and Expression of HIV-1 Toward an AIDS Vaccine Design Ⅰ.Amplification and Sequencing of HIV-1 Antigen Genes显示文摘Objective:To amplify antigen genes from patients with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) in Guangdong Province for candidate AIDS vaccine design. Methods:Viral nucleic acid was isolated from 10 HIV-1 infected individuals' peripheral blood collected during 1995-2000 in Guangdong Province. The viral gag p24 gene and env gp120 gene were amplified by nested-PCR and sequenced. The homologies among HIV-1 isolates were compared with HIV-BLAST. Results: Among 10 HIV-1 isolates, nine are homologous to viruses of subtype B, and one is homologous to viruses of subtype E. Conclusion: Subtype B viruses of HIV-1 are predominantly present in Guangdong Province. | 曾庆平 冯丽玲 杨瑞仪 陈竹华 曾常红 | 2002 | Chinese Journal of Sexually Transmitted Infections2002，2，1： | 0 |
| 10 | 九江市HIV-1流行毒株基因序列测定和亚型分析显示文摘目的了解九江市艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株的亚型分布情况。方法对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得gag基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株4株,B亚型和A/E重组亚型HIV-1毒株各1株。结论HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。 | 张红波 邢辉 肖云 杨泽民 马鹏飞 卫星 刘羽真 吴光中 | 2006 | 中国艾滋病性病2006，12，2： | 0 |
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