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| 1 | 涮辣与辣椒属5个栽培种亲缘关系的研究显示文摘利用筛选出的11对ISSR引物对涮辣(Capsicum frutescens L. var. shuanlaense)和辣椒属5个栽培种[一年生辣椒(Capsicum annuum)、灌木状辣椒(C. frutescens)、中国辣椒(C. chinense)、浆果状辣椒(C. baccatum)和绒毛辣椒(C. pubescens)]共计71份种质的DNA进行PCR扩增,共扩增出112条谱带,多态性平均为90.17%,材料间遗传相似系数在0.049~0.875之间。在相似系数为0.31时,涮辣与C. frutescens聚在一组,说明涮辣属于C. frutescens。Capsicum frutescens var. shuanlaense与C. annuum亲缘关系最近,其次是C. chinense,与C. baccatum亲缘关系较远,与C. pubescens亲缘关系最远。相似系数为0.397时,供试的66份C. annuum材料进一步分为7个亚组,个旧皱壳辣、建水樱桃椒各自单独聚在一起,其它基本按长角椒(var.longum)、指形椒(var.dactylus)+短锥椒(var. breviconoideum)、灯笼椒(var. grossum)、樱桃椒(var. cerasiforme)和簇生椒(var. fascicutatum)聚类,与辣椒植物形态学分类结果大体一致。 | 孟金贵 张卿哲 王硕 张应华 | 2012 | 园艺学报2012,39,8: | 12 |
| 2 | 濒危植物五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)天然种群遗传多样性的ISSR标记分析显示文摘五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)是中国四川特有野生珍稀濒危植物,仅分布于雅砻江中上游干旱河谷地带;探索其遗传多样性特征可以为其遗传资源的保护和利用提供理论依据.本文采用ISSR技术对五小叶槭的5个野生种群的44份材料进行遗传多样性分析,8条引物总共检测到38个位点,其中多态性位点35个,多态位点百分率(PPL)平均为90.21%.应用分析软件Popgen32分析得出:在物种水平上,五小叶槭的香农多样性指数(I)为0.3924,Nei氏基因多样性指数(H_e)为0.2498;种群间基因分化系数(G_(st))为0.3722,种群间的基因流(N_m)为0.8433,这表明五小叶槭的遗传变异主要存在于种群内.在种群水平上,香农多样性指数(I)为0.2125, Nei氏基因多样性指数(H_e)为0.1456.结果表明木里、九龙三垭宫和康定这3个种群的遗传多样性水平较高,而雅江和九龙洛莫种群遗传多样性较低.通过Mantel检测,种群间遗传距离和地理距离之间没有显著相关性. | 郝云庆 罗晓波 王晓玲 | 2019 | 四川大学学报(自然科学版)2019,56,1: | 9 |
| 3 | 大蒜ISSR-PCR反应体系的正交优化建立显示文摘为探寻出更适宜大蒜的ISSR反应体系,以‘弥渡紫皮’大蒜为试材,对ISSR-PCR反应体系中的5个主要因素(dNTPs、Taq酶、Mg2+、引物浓度、模板DNA)在4个不同水平上进行正交设计L16(45)优化。结果表明,含10×PCRBuffer2.5μL、2.5mmol/LMg2+、0.15mmol/LdNTPs、1.5UTaqDNA聚合酶、0.4μmol/L引物、20ng/μL模扳DNA的25μL反应体系为大蒜的最佳反应体系。利用新建立的反应体系对20个不同大蒜品种进行扩增,具有极好的稳定性和重复性。 | 李雪 韩曙 杨正安 张映钧 杨嵩明 赵德安 车吉星 李志萌 | 2013 | 中国农学通报2013,29,10: | 7 |
| 4 | 紫色观赏辣椒基因组DNA提取及ISSR-PCR体系的优化显示文摘为探索紫色观赏辣椒基因组DNA的最佳提取条件和建立ISSR-PCR最优反应体系,对比了3种基因组DNA提取方法,并通过正交设计试验优化了ISSR-PCR反应体系。结果表明,采用高盐低pH法从2种观赏辣椒中提取的基因组DNA的A(260/280)值分别为1.807和1.818,DNA电泳条带明亮整齐,无拖尾;ISSR-PCR最优反应体系(20μL)为:1×PCR buffer,1.5 mmol/L Mg^2+,0.6μmol/L引物,0.2 mmol/L dNTPs,1.0 U Taq DNA聚合酶,60 ng模板DNA,扩增所得分子图谱稳定性高、重复性好;唯有高盐低pH法提取的DNA经该ISSR-PCR体系扩增能体现出2个辣椒品种间分子图谱的差异。 | 邵峰 乙引 徐娟 龚记熠 张冬林 杨立昌 张永兰 | 2013 | 中国农学通报2013,29,28: | 5 |
| 5 | 珍稀濒危植物五小叶槭ISSR-PCR反应体系的建立和优化显示文摘五小叶槭为珍稀濒危植物,在研究被子植物的系统发育和古地理、古气候等方面具有重要的科学价值。本研究采用2XTaqMaster Mix,综合考虑Taq酶、Mg^(2+)和d NTPs,对影响五小叶槭ISSR-PCR反应的3个因素(DNA模板、引物和Master Mix)进行3水平正交试验,从而优化出五小叶槭ISSR-PCR反应最佳体系。结果表明,引物用量对反应结果影响最大,其次为DNA模板,2XTaqMaster Mix对反应结果影响最小。最佳反应体系(25μL)为:DNA模板(50 ng·μL^(-1))1μL,引物2μL,2XTaqMaster Mix 13. 5μL。 | 郝云庆 罗晓波 王晓玲 | 2018 | 四川林业科技2018,39,5: | 4 |
| 6 | 桑叶ISSR-PCR反应体系的建立与优化显示文摘[目的]建立和优化桑叶稳定的ISSR-PCR反应体系和扩增程序。[方法]采用5因素4水平的正交试验和单因子梯度优化相结合的方法对最适因素水平进行筛选。[结果]适用于桑叶的25μl ISSR-PCR反应体系中各因素的最佳浓度分别为:dNTPs 0.35 mmol/L、Mg2+2.5 mmol/L、Taq酶1.25 U、引物0.4μmol/L、DNA 100 ng。[结论]对于桑叶ISSR-PCR试验,一次正交试验基本可以建立满足要求的ISSR-PCR体系。 | 思彬彬 刘明丽 | 2012 | 安徽农业科学2012,40,3: | 3 |
| 7 | 火龙果EST-SSR分子标记反应体系的建立与优化显示文摘基于火龙果转录组测序序列设计引物,以生物学性状差异明显的11份火龙果种质DNA为材料,采用正交试验设计,对影响火龙果EST-SSR-PCR扩增的2×Taq PCR Master Mix、引物及模板DNA浓度等因素进行了优化,在此基础上对变性聚丙烯酰胺凝胶质量浓度及上样量进行筛选确定。以期建立适合火龙果的EST-SSRPCR最佳反应体系。结果表明,优化后的火龙果EST-SSR-PCR扩增的最佳反应体系为:10μL混合反应体系含基因组DNA 30 ng、6μL 2×PCR Mix和0.6μL(10-5mol/L)的EST-SSR引物。在聚丙烯酰胺凝胶电泳检测中,10%的变性聚丙烯酰胺凝胶质量浓度、2.5μL上样量扩增效果最佳。该体系的建立可为今后利用EST-SSR标记对火龙果遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供基础。 | 杨仕美 乔光 文晓鹏 | 2018 | 山地农业生物学报2018,37,3: | 3 |
| 8 | 大麻ISSR反应体系的优化与引物的初步筛选显示文摘为探寻出更适宜大麻的ISSR反应体系,用以研究大麻的遗传多样性,利用梯度试验对dNTP、TaqDNA聚合酶和引物的浓度,预变性时间和退火温度5个因素进行优化,从而建立了适合大麻的ISSR-PCR反应体系。结果表明,在25μL体系中,dNTP 200μmol/L,模板1 ng/μL,引物200 nmol/L,聚合酶1 U(2.5 pmol/μL);预变性3 min(94℃),退火温度48℃,为大麻最佳反应体系;研究利用优化后的ISSR反应体系,在30条引物中,筛选出8条适合大麻的ISSR引物,体系具有较好的稳定性和重复性。 | 张利国 张效霏 常缨 宋宪友 房郁妍 郑楠 | 2014 | 中国农学通报2014,30,12: | 3 |
| 9 | 不同规格穴盘对远距离运输辣椒幼苗生长的影响显示文摘[目的]揭示不同规格穴盘对远距离运输辣椒幼苗生长的影响,为辣椒工厂化育苗提供技术支撑。[方法]研究4种不同规格穴盘(33、54、60、72孔)对远距离运输辣椒幼苗生长的影响。[结果]4种不同规格的穴盘育苗中,在行程800 km远距离运输后,以33孔的辣椒幼苗素质最好,但受运输影响较大,而54、60、72孔穴盘处理下对远距离运输辣椒幼苗生长影响结果基本一致。[结论]综合考虑经济成本和幼苗素质,在辣椒工厂化育苗中,远距离运输宜选用72孔穴盘。 | 杨小锋 李劲松 杨沐 陈明乐 黄植 | 2011 | 安徽农业科学2011,39,28: | 2 |
| 10 | 辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的建立及优化显示文摘为快速有效地确定辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系,采用正交优化设计方法,对影响辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的4个主要因素(模板DNA、引物、d NTPs、Taq酶)在4个水平上进行优化。结果表明,不同因素下各水平浓度对SSR-PCR的反应结果均有显著性影响,最佳反应体系(20μL)为:1.0 ng模板DNA,0.8μmol/L引物,0.5μmol/L d NTPs,1.0 U Taq酶。PCR扩增程序为:94℃预变性2 min;94℃变性15 s,58.4℃退火30 s,36个循环,72℃延伸2 min,最佳循环数为36。利用该体系对12份辣椒疫霉菌进行验证,证明该体系稳定可靠,本试验为辣椒疫霉菌遗传多样性分析研究及分子育种奠定了理论基础。 | 陶丽婷 杨世鹏 王丽慧 李屹 李莉 | 2017 | 江苏农业科学2017,45,7: | 0 |
| 11 | 凤仙花属植物SSR-PCR反应体系的建立与优化显示文摘SSR-PCR反应体系的建立与优化是凤仙花属植物(Impatiens L.)SSR标记研究的基础,本研究以8种凤仙花属植物为试材,对Mg^2+、Taq酶、dNTPs浓度、DNA模板、引物浓度等5因素进行L16(4^5)正交试验,探讨适合凤仙花属植物的SSR-PCR反应体系,并对主要因素进行优化。结果表明:Mg^2+、Taq酶和dNTPs浓度3个因素对凤仙花属SSR-PCR扩增结果有显著影响,影响程度为Mg^2+>Taq酶>dNTPs浓度>DNA模板>引物浓度;20μL为最佳反应体系,其中,2.6 mmol/L(含10×PCR Buffer)的Mg^2+,1.6 mmol/L的dNTPs,2μmol/L的引物,60 ng的DNA,0.1 U的Taq酶,ddH2O补齐剩余部分。利用优化后的反应体系对同属54种材料进行PCR扩增,扩增产物在130~200 bp,具4个等位基因,目标条带清晰,多态性良好。该体系的建立可为今后利用SSR标记对凤仙花种质鉴定、遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供了依据。 | 罗超 黄武略 朱佳鹏 冯志熙 刘应丽 黄海泉 黄美娟 | 2020 | 分子植物育种2020,18,17: | 0 |