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| 1 | 文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测显示文摘为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点。共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67;多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172~0.744、0.040~0.720、0.187~0.793;G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高;Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点来自注释基因序列。将30对文蛤多态性SSR引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为40%和30%。这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定了基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和QTL定位等研究。 | 齐晓艳 董迎辉 姚韩韩 周小龙 林志华 | 2013 | 水产学报2013，37，8： | 10 |
| 2 | 文蛤属2种贝类多变量形态分析及日本文蛤的物种有效性显示文摘为探讨日本文蛤与中国文蛤属2种贝类的形态差异及日本文蛤的物种有效性,采用多变量形态度量,结合传统分类方法,获得日本文蛤和中国大陆文蛤属2种贝类8个形态比例性状,并做单因素方差分析、聚类分析、主成分分析、判别分析及Mantel检验。结果表明,(1)单因子方差分析显示,日本文蛤与中国大陆文蛤属2种贝类,在8个比例性状中存在着5~8个显著差异(P<0.05);(2)聚类分析表明,6个文蛤地理种群距离相近,且呈现南北分别聚为一类,而日本文蛤与长乐丽文蛤相近;(3)主成分分析构建了3个主成分,其贡献率分别为34.88%、18.61%、16.89%,累积贡献率为70.38%,三维主成分散布图进一步表明日本文蛤与丽文蛤均独立于文蛤不同地理种群重叠区之外;(4)判别分析构建了8个判别函数,判别准确率P1为39.09%~100%,P2为47.06%~100%,日本文蛤与中国大陆文蛤属2种贝类的综合判别率为70.60%,其中日本文蛤判别准确率为100%,丽文蛤判别准确率高于91.67%;(5)Mantel检验结果表明,各种群间的地理距离与欧氏距离之间存在显著相关性(r=0.623 7,P<0.01)。研究认为,日本文蛤属于丽文蛤,与长乐丽文蛤属于同一种不同地理种群;根据MAYR等提出的75%规则,8个比例性状中有5个性状大于1.28,两个丽文蛤群体已达到亚种水平。 | 吴杨平 姚国兴 陈爱华 张志伟 | 2011 | 水产学报2011，35，9： | 9 |
| 3 | 利用SRAP标记研究四个暗纹东方鲀群体的遗传多样性显示文摘利用相关序列扩增多态性SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)分子标记首次对4个暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)群体(1个长江捕捞群体、1个放流群体和2个养殖群体)进行了遗传多样性分析。从49对引物组合中筛选出18对扩增条带清晰、稳定的引物组合对4个群体进行扩增,共获得231个位点,其中多态位点数为156个,总多态位点百分率为67.53%。4个群体内多态位点比例为54.98%—58.87%,群体的Nei’s基因多样性指数(H)为0.1992—0.2005,群体Shannon多样性指数(I)为0.2953—0.3016,群体间基因流(Nm)为4.1291。长江捕捞群体的多态位点比例、基因多样性指数、Shannon多样性指数均略高于其他三个群体。采用UPGMA法对4个群体进行聚类分析显示,上海养殖群体单独聚为一类,其余3个群体聚为另一类。AMOVA结果表明遗传变异主要来源于群体内,占总遗传变异的87.40%。以上结果表明,4个暗纹东方鲀群体具有较高的遗传多样性,群体间相似性较大,并且存在一定的基因交流。 | 程长洪 张敏莹 刘凯 徐东坡 段金荣 周彦锋 施炜纲 | 2012 | 水生生物学报2012，36，5： | 6 |
| 4 | 浙江和广西两种文蛤的分子鉴定及形态特征分析显示文摘以文蛤如东群体(RD)和北海群体(BH)为对照群,利用线粒体COⅠ基因序列分析技术对苍南文蛤(CN)和北海白壳文蛤(BW)进行了分子鉴定。结果表明,苍南文蛤和斧文蛤的碱基组成非常相似,通过文蛤属贝类基因序列同源性比对和分子系统聚类分析发现,苍南文蛤CN1、CN2与斧文蛤的同源性分别达到100.0%、99.2%,在依据遗传距离构建的系统进化树上,2个苍南文蛤也与斧文蛤单独聚为一支,据此将苍南文蛤确定为斧文蛤,此结果将斧文蛤的分布区域向北扩展到了浙江南部沿海,修正了现有文献中记载的仅在我国南海诸省分布的说法;而白壳文蛤与其它6种文蛤的基因序列同源性都不高(79.6%~85.3%),在系统进化树上单独分出一支,明显是独立于这些文蛤之外的新种。斧文蛤、白壳文蛤与文蛤群体COⅠ基因的遗传多样性分析显示,文蛤BH群体的变异位点数、单倍型数和核苷酸多样性指数均最大,斧文蛤其次,而白壳文蛤10条基因序列完全相同,未发生任何核苷酸位点变异,说明其遗传多样性很低。应用方差分析和Tukey多重比较,分析了斧文蛤、白壳文蛤与文蛤群体的形态差异,发现斧文蛤的壳长明显大于壳高,且SMW/TW、IW/TW 2个参数与文蛤、白壳文蛤群体差异显著(P<0.05);而白壳文蛤的壳宽指数大、壳型相对膨胀,SW/SL和SW/SH值均最大,与文蛤和斧文蛤群体差异显著(P<0.05)。本研究结果可为文蛤属贝类种间鉴别、种质资源保护及系统进化研究提供基础资料。 | 董迎辉 姚定余 林志华 姚韩韩 陆荣茂 | 2011 | 水产学报2011，35，10： | 3 |
| 5 | 利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性显示文摘利用相关序列扩增多态性SRAP分子标记对3个河川沙塘鳢( Odontobutis potamophila)自然群体[安徽省当涂( DT)群体、浙江省余姚( YY)群体、江苏省太湖东西山( DXS)群体]进行了遗传多样性分析。从196对引物组合中筛选出11对扩增条带清晰、稳定的引物组合对3个群体进行扩增,共获得71个位点;3个群体内多态位点占比为6.90%∽24.14%,其中DT群体多态位点占比为6.90%,YY群体多态位点占比为24.14%、DXS群体多态位点占比为24.14%;群体的Nei’s基因多样性指数(H)为0.0330∽0.0939[DT(0.0330)〈YY(0.0784)〈DXS(0.0939)],群体Shannon’s 多样性指数(I)为0.0463∽0.1368[DT(0.0463〈YY(0.1206)〈DXS(0.1368)]。可见DXS群体、YY群体的多态位点占比、Nei’s基因多样性、Shannon’s多样性指数均稍高于DT群体。研究还发现,3个群体间的Nei’s无偏遗传距离为0.0363∽0.2867,遗传相似度为0.7507∽0.9644,DXS群体与YY群体的遗传距离最小(0.0363),遗传相似度最大(0.9644),亲缘关系最近。采用 UPGMA 法对3个群体进行聚类分析显示,YY群体和DXS群体聚为1支,DT群体聚为单独的1支。综合试验结果表明,3个河川沙塘鳢自然群体的遗传多样性较低。 | 侯新远 张洪伟 尹绍武 张丽娟 胡亚丽 | 2014 | 江苏农业科学2014，42，10： | 2 |
| 6 | 养殖文蛤病害研究进展及前景展望显示文摘文蛤是重要的海洋经济贝类,随着人工养殖的发展,暴发性死亡病害频繁发生,造成重大的经济损失。文章通过归纳总结分析,对养殖文蛤病毒性疾病、细菌性疾病、寄生虫性疾病等主要病害的病原体与致病症状、流行规律、组织病理学、检测与诊断、预防和治疗方法等进行综合评述,并展望其研究应用前景。 | 张彬 黄婷 熊建华 谢达祥 韦嫔媛 彭金霞 陈晓汉 | 2012 | 西南农业学报2012，25，5： | 2 |
| 7 | 两种壳色文蛤选育亲本及其子一代的SSR和ISSR分析显示文摘利用9对SSR引物和6条ISSR引物对江苏省文蛤良种场保存的红、黄两种壳色文蛤选育亲本(分别以PR和PY表示)及其子一代(红壳色文蛤亲本的后代产生壳色分离分别为红壳色子一代RF1R、黄壳色子一代RF1Y,黄壳色文蛤亲本的后代全部为黄壳色YF1)进行遗传多样性监测。9对微卫星引物在文蛤5个群体的多态信息含量(PIC)在0.643 0~0.704 9之间,表观杂合度(Na)在0.745 5~0.794 6之间,期望杂合度(Ne)为0.717 5~0.752 0。6条ISSR引物在5个文蛤群体中多态位点百分率为92.11%~97.37%,Shannon多样性指数(I)PR最高为0.503 3,RF1Y最低为0.412 6。两种标记均显示了较高的多态性。与红、黄壳色亲本相比,3种壳色后代的遗传多样性均未发生显著变化。两种标记对5个文蛤群体的聚类结果基本一致:5个群体聚为两大类,红壳色亲本文蛤及其子代为一类,即RF1R群体和RF1Y群体先聚一起,然后再与PR群体聚在一起;另外黄壳色亲本文蛤及其子代为一类,即PY群体与YF1群体聚一起,最后统一聚为一类。就整体而言,两种标记所检测的多样性均在同一水平,也就是说经过一代的选育,其多样性水平变化并不明显,仍保持较高水平,可以继续进行下一代人工繁殖选育。 | 郑培 陈爱华 沈和定 张志伟 姚国兴 吴杨平 张雨 王成暖 周娜 | 2013 | 上海海洋大学学报2013，22，4： | 1 |
| 8 | 不同地理种群红壳色文蛤的杂种优势显示文摘以广西原种种群中红壳色文蛤(G、g)、江苏原种种群红壳色文蛤(S、s)为材料,进行不同地理种群双列杂交试验,建立杂交组合G(♀)×s(♂)和S(♀)×g(♂),自交组合S(♀)×s(♂)和G(♀)×g(♂)。对各组合受精卵直径、孵化率以及早期生长进行了比较。结果表明:以广西种群红壳色文蛤为母本的组合G×s、G×g在受精卵直径与以江苏种群为母本的组合S×g、S×s存在差异(P<0.05),孵化率无显著差异(P>0.05)。浮游期以及附着期的壳生长均表现为母本效应,组合G×s、G×g生长较组合S×s、S×g更具生长优势。杂交组合均比自交组合生长快,表现出杂种优势。 | 陈爱华 姚国兴 吴杨平 张雨 | 2014 | 江苏农业科学2014，42，1： | 1 |
| 9 | 暗纹东方鲀SRAP-PCR体系的建立与优化显示文摘以暗纹东方鲀基因组DNA为材料,利用正交设计L16(45)对影响暗纹东方鲀SRAP-PCR反应的5个因素(Mg2+、Taq酶、dNTPs、模板DNA、引物)在4个水平上进行正交组合,确立了暗纹东方鲀SRAP反应最佳体系为:20μL的PCR体系中含有Mg2+1.5 mmol·L-1、Taq酶0.5 U、模板DNA 75 ng、dNTPs 0.15 mmol·L-1、引物0.2μmol·L-1。利用30个暗纹东方鲀样本对该体系进行验证,结果表明该体系稳定可靠。 | 程长洪 张敏莹 刘凯 徐东坡 段金荣 周彦锋 施炜纲 | 2011 | 浙江农业学报2011，23，6： | 0 |
| 10 | 红壳色文蛤F_1代养殖群体多样性分析显示文摘运用形态学标记和分子标记对江苏省文蛤良种场红壳色文蛤F1代养殖群体(父母本为江苏野生红壳色群体)进行遗传多样性分析。用文蛤壳长、壳宽、壳高和体重4个可量性状进行形态学数据的聚类分析,显示可量性状变异系数在38.48%-82.95%。运用7个引物微卫星基因座的多态性进行了养殖群体F1代的分子标记评估,结果表明,7个微卫星基因位点的平均等位基因数3.857 1,平均有效等位基因数2.583 0,平均观察杂合度0.565 3,平均期望杂合度0.565 3,Shannon指数平均数1.050 1,多态信息含量平均数0.522 5。综合形态学数据和分子标记的研究结果表明,红壳色文蛤江苏养殖群体F1代的遗传多样性处于中度偏高水平,具有较高的遗传改良潜力。 | 郑培 陈爱华 姚国兴 吴杨平 张志伟 张雨 沈和定 | 2012 | 生物技术通报2012，28，2： | 0 |
| 11 | 近十年中国海洋生物多样性研究进展显示文摘本文系统地总结了近10年中国研究人员在遗传、物种、生态系统3个层次上对海洋生物多样性研究的重要进展,并使用VOSviewer软件对近10年中国近海生物多样性的研究成果进行文献计量分析。近年来,中国研究人员借助新的研究方法和手段,比如分子生物学和流式细胞术等,可以在物种多样性水平进行更准确和快速的分类鉴定,借此在中国近海发现了较多新的物种;通过多学科交叉融合,更多的是在生态系统水平探讨海洋生物多样性,也为今后海洋生态系统的修复提供了科学依据。目前中国的海洋生物多样性研究紧跟国际科技前沿和步伐,在深海、海山和极端环境生物类群等新兴领域有了长足发展,新物种的发现不断更新了原有认识,对典型海洋生态系统的监测和部分入侵物种的整治有了长足的进步。中国近海生物多样性高,监测数据全,通过整合空间数据资料和时间序列变化,进行更广更深的宏观生态模式分析研究十分必要。通过探究生物多样性的多重胁迫因子及其交互作用,可为优化海洋生物多样性的保护和管理提供帮助。 | 孙军 宋煜尧 施义锋 翟键 燕文卓 | 2022 | 生物多样性2022，30，10： | 0 |
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