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| 1 | 利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性显示文摘选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2个二倍体I.trifida(2x)品系(4597-10和4597-21)、四倍体I.trifida(4x)、六倍体I.trifida(6x)、二倍体I.temussima(2x)和I.littorallis(2x)以简化基因组测序技术SLAF-seq测序,获得724 589个SLAF标签,其中多态性SLAF标签35 310个。通过序列分析,获得40 765个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些SNP分析了8个种质的群体结构和系统发生树。结果表明,利用简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记;通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种I.trifida的亲缘关系比较近。这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据。 | 石璇 王茹媛 唐君 李宗芸 罗永海 | 2016 | 作物学报2016，42，5： | 18 |
| 2 | 基于EST-SSR标记甘薯连锁图谱构建及淀粉性状的QTL定位显示文摘【目的】利用分子标记技术,构建甘薯遗传连锁图谱,并分析甘薯淀粉含量性状的QTL位点,为高淀粉含量甘薯种质资源利用及甘薯分子标记辅助育种提供理论和实践依据。【方法】以高淀粉含量品种万薯5号为母本、低淀粉含量品种商丘52-7为父本建立杂交群体,利用EST-SSR标记,采用'双假测交'策略和运用Join Map4.0软件,分别构建双亲遗传连锁图谱,并结合F1(2012、2013年)群体表型数据采用区间作图法对淀粉含量性状进行QTL检测。【结果】利用1 679对EST-SSR引物筛选出的1 045对多态性引物检测F1群体的标记基因型,获得了1 418个标记位点。分别对上述获得的父母本多态性标记进行遗传连锁分析,在LOD≥5.0情况下,分别构建父母本的连锁遗传图谱。采用642个标记的多态性位点构建母本连锁群74个,其中,215个标记位点位于连锁图谱上,占标记多态性位点总数的33.5%。每个连锁群上有2—11个标记位点,连锁群长度在0.6—129.4 cM,图谱总长为3 826.07 c M,标记间平均距离为17.80 c M。属于父本的776个标记位点构建了80个连锁群,共有252个标记位点构建在连锁图谱上,占标记总数的32.5%,每个连锁群上有2—24个标记位点,连锁群长度在2.0—156.8 c M,图谱总长为3 955.0 cM,标记间平均距离为15.7 c M。以F1杂交群体构建的遗传连锁图谱,结合2012年、2013年2个环境,利用QTL作图软件MapQTL5.0,采用区间作图法进行分析,共检测到17个与淀粉含量性状相关的QTL,贡献率在8.4%—40.5%。其中qWsc-1、qWsc-2、qWsc-3 3个QTL位于母本万薯5号连锁群上,且在2年环境中均可检测到;14个QTL位于父本商丘52-7连锁群上,qSsc-1、qSsc-2、qSsc-3、qSsc-4、qSsc-8、qSsc-10、qSsc-11、qSsc-12是在2个环境均检测到的QTL。qSsc-5、qSsc-6、qSsc-7、qSsc-9、qSsc-13、qSsc-14是只在1个环境检测到的QTL。标记GDAAS0603在双亲中和2个环境中均同时检测到,这些环境稳定QTL可用于分子标记辅助选择。【结论】分别构建了亲本EST-SSR分子标记连锁群图谱,丰富了构建甘薯图谱的标记类型,定位了17个与淀粉含量相关的QTL位点。 | 唐道彬 张凯 吕长文 谢德斌 傅体华 王季春 | 2016 | 中国农业科学2016，49，23： | 10 |
| 3 | 基于SRAP分子标记的冰草遗传连锁图谱构建显示文摘构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行了构建。结果表明:(1)共筛选出22对多态性好、标记位点清晰稳定的SRAP适宜引物,对冰草杂种F2分离单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得510个SRAP多态性标记位点,其比率占88.2%。(2)偏分离分析表明,偏分离标记比率仅为14.12%,符合遗传作图的要求。(3)成功构建了冰草的SRAP分子标记遗传连锁图谱,该图谱有14个连锁群、510个标记,连锁群间长度范围86.4~179.0cM,覆盖基因组总长度1 912.9cM,标记间平均间距3.75cM,为高密度遗传图谱。 | 李佳奇 于卓 杨东升 于肖夏 吴国芳 牛亚青青 | 2019 | 西北植物学报2019，39，1： | 9 |
| 4 | 高淀粉多抗甘薯新品种苏薯29的选育显示文摘【目的】选育高淀粉多抗甘薯新品种,为长江流域薯区甘薯淀粉产业发展提供良种支持。【方法】以优质高产品种苏薯16号为父本、高抗高淀粉率品种浙紫薯1号为母本,通过有性杂交,采取干物质含量和产量低世代选择,抗性和品质高世代鉴定的技术路线选育甘薯新品种,并参加国家甘薯品种长江流域区域试验和多点生产力大区比较试验。【结果】选育的苏薯29属淀粉型甘薯品种,薯形呈长纺锤形,薯皮红色,薯肉淡黄色,结薯集中整齐,单株结薯数平均4.6个,大中薯率84.8%,耐盐、耐贮性较好,熟食品质优;在国家甘薯品种长江流域区域试验中,平均薯干产量9964.4 kg/ha,比徐薯22(CK)增产11.95%;平均淀粉产量6786.3 kg/ha,比CK极显著增产15.58%,平均薯块干物质含量和淀粉率分别为33.75%和23.00%,分别比CK高3.40%和2.95%(绝对值);高抗茎线虫病,抗根腐病和蔓割病,不抗黑斑病。2016年5月通过国家甘薯品种鉴定委员会鉴定,定名为苏薯29,鉴定编号为国品鉴甘薯2016015。【结论】苏薯29丰产稳产性好,淀粉产量高,适合在长江流域薯区及周边地区推广种植,也可在江苏滩涂盐碱地种植。 | 贾赵东 马佩勇 边小峰 禹阳 郭小丁 谢一芝 | 2018 | 南方农业学报2018，49，5： | 9 |
| 5 | 分子生物学技术在甘薯育种中的应用显示文摘甘薯是一种重要的粮食、蔬菜、工业原料及新型能源作物。目前,分子生物学技术已在甘薯育种中得到广泛应用,尤其是分子标记和基因克隆技术。简要概述了DNA分子标记在甘薯起源进化、遗传图谱的构建、遗传多样性、基因定位等方面的应用进展,并对其有关品质基因、块根发育基因、抗逆基因、抗病基因的克隆和遗传转化进行了综述,旨在为甘薯的深入研究提供参考。 | 李俊 王章英 罗忠霞 陈新亮 房伯平 李育军 刘小红 | 2011 | 广东农业科学2011，38，15： | 8 |
| 6 | 四川、重庆不同紫苏遗传多样性的SRAP研究显示文摘目的:研究四川重庆不同紫苏材料的遗传多样性,为种质资源的分类和选育打下理论基础.方法:采用SRAP分子标记方法对来自四川、重庆的10份紫苏材料进行遗传多样性分析,利用popgene1.32及NTSYS-pc2.1软件处理数据,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树状图.结果:26对SRAP引物组合扩增出167条带,多态比率(PPB)为51.57%.10份材料的遗传距离变化范围为0.098 8~0.916 3,平均为0.490 8.用籽材料中,四川和重庆地区的平均多态位点百分率为27.25%,在两个地区间,SRAP标记的平均H值分别为0.149 6和0.232 8.平均I值为0.221 1和0.350 8.结论:SRAP分子标记适合用于紫苏材料的遗传多样性分析,能够清晰地揭示不同材料间的亲缘关系,为下一步紫苏的良种选育提供科学依据. | 蔡顺顺 张兴翠 | 2013 | 西南师范大学学报(自然科学版)2013，38，3： | 8 |
| 7 | SRAP标记在植物性状标记和遗传图谱构建中的应用研究进展显示文摘由于SRAP标记简便、快速、不需预知物种的序列信息,近年来已广泛应用于植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因连锁标记、基因定位、比较基因组学研究及杂种优势预测等研究。基于此,综述了SRAP分子标记在植物性状标记和遗传连锁图谱构建方面的应用进展,以便为今后的研究提供相应的理论依据。 | 王从彦 | 2012 | 河南农业科学2012，41，9： | 7 |
| 8 | 石榴SPAR-PCR反应体系的正交设计优化及验证显示文摘以重瓣红花石榴为供试材料,采用五因素四水平的正交设计,对SRAP反应体系中的Taq DNA聚合酶,Mg2+,dNTPs,引物、模板DNA进行优化,最终确定最佳反应体系为:dNTP 0.12 mmol/L,Mg2+2.0 mmol/L,引物0.48μmol/L,Taq酶1.0 u,模板DNA 40 ng,总反应体积为25μL。利用优化后体系随机抽取4份石榴材料进行验证,均能扩增出稳定条带。本研究为SRAP标记技术在石榴分子遗传学中的应用提供了科学依据。 | 王军 杨荣萍 洪明伟 吴兴恩 李甦 姜勤 李文祥 | 2013 | 云南农业大学学报(自然科学版)2013，28，3： | 7 |
| 9 | 甘薯生物技术育种研究进展显示文摘甘薯是世界上重要的粮食作物.甘薯遗传上的高度杂合性、种间种内杂交不亲和性以及多倍性,使甘薯常规育种面临诸多挑战.生物技术在改良甘薯品质、抗病性、抗逆性等方面具有很大应用潜力.概述了甘薯生物技术育种的研究现状,主要包括细胞工程、分子标记辅助育种、基因工程等. | 翟红 何绍贞 赵宁 刘庆昌 | 2017 | 江苏师范大学学报(自然科学版)2017，35，1： | 5 |
| 10 | ISSR分子标记快速预测远志中sibiricose A5和sibiricose A6的含量显示文摘目的:优化远志简单重复序列区间(ISSR)扩增多态性反应体系,设计一对聚合酶链式反应(PCR)引物用于快速预测远志药材中sibiricoseA5和sibiricoseA6的含量高低。方法:采用UPLC测定远志药材中sibiricoseA5与sibiricoseA6的含量,通过单因素试验优化远志ISSR反应体系,利用ISSR分子标记技术筛选出与sibiricoseA5和sibiricoseA6含量相关的特异性DNA片段,针对此片段设计特异性PCR引物。结果:7批远志药材中sibiricoseA5和sibiricoseA6的含量差异较大,变化范围分别为0.8954~3.2276,0.6442—2.0578mg·g^-1。对筛选出的与sibiricoseA5和sibiricoseA6含量相关片段(890—8)进行克隆测序后,设计出了1对特异性引物(YZ—SA),可用于快速预测远志药材中sibiricoseA5和sibiricoseA6的含量高低。结论:优化后的远志ISSR反应体系具有标记位点清晰、检测多态性能力强等特点,设计出的特异性引物可用于快速预测远志药材中sibiricoseA5和sibiricoseA6的含量高低。 | 王海花 王丹丹 陈彤垚 张福生 秦雪梅 马存根 | 2018 | 中国实验方剂学杂志2018，24，24： | 3 |
| 11 | 甘薯分子遗传图谱研究进展与展望显示文摘阐述了国内外甘薯多倍性及核型、分子标记开发、分子遗传图谱构建、数量性状定位的研究进展,分析了甘薯分子遗传图谱构建中存在的问题:(1)甘薯多倍性的属性尚未明了,核型信息匮乏;(2)目前用于构建甘薯遗传图谱的分子标记种类稀少、数量匮乏;特别缺少基于特异片段位点的分子标记,如SSR标记、EST-SSR标记和基于抗病基因同源序列的分子标记开发等;(3)目前所得到的分子标记遗传图谱尚未达到实用的程度;(4)作图群体偏小,制约了精细分子标记遗传图谱的构建以及QTL的准确性。并指出今后需加强研究的几个方面。 | 梁雪莲 罗忠霞 房伯平 谢振文 | 2014 | 广东农业科学2014，41，3： | 3 |
| 12 | 甘薯分子遗传图谱构建及QTL定位研究进展与展望显示文摘分子遗传图谱的构建和数量性状位点(QTL)定位对于植物分子育种具有重要意义.主要综述了甘薯分子遗传图谱构建及重要性状QTL定位的研究进展,系统总结了国内外针对甘薯品质性状、产量性状、抗性性状及地上地下部性状所构建的遗传图谱和定位到的QTL,分析目前存在的主要问题,并对其发展前景进行了展望. | 马猛 闫会 李强 | 2020 | 江苏师范大学学报(自然科学版)2020，38，4： | 3 |
| 13 | 甘薯TD-SSR-PCR反应体系的优化显示文摘为探索甘薯最佳TD-SSR-PCR体系,利用L16(43)正交设计研究2×PCR Mix、引物、模板DNA等主要影响因素的适宜浓度,并在此基础上对扩增程序和聚丙烯酰胺凝胶电泳上样量进行优化。结果表明,优化后的TD-SSR-PCR反应体系包括:10μL 2×PCR Mix、100 ng模板DNA、0.4μmol/L引物,1μL甘油,总体积20μL;优化后的扩增程序为:94℃预变性4 min,94℃变性45 s、Tm+5℃~Tm-5℃(每循环退火温度下降0.5℃,Tm选用一对引物中的较小Tm值)退火30 s(退火时间因扩增片段大小而异)、72℃延伸1 min共20个循环,94℃变性45 s、Tm-5℃退火30 s、72℃延伸1 min共15个循环,最后72℃延伸7 min,4℃保存;聚丙烯酰胺电泳上样量以1.5~2μL为宜。在此条件下,利用引物Z37对10份甘薯材料进行PCR扩增,得到的条带清晰、多态性高,表明此条件适用于甘薯的TD-SSR-PCR反应体系。 | 南文卓 郑丹炜 朱国鹏 张小贝 | 2017 | 热带作物学报2017，38，1： | 3 |
| 14 | 甘薯与牵牛EST资源的SSR信息分析显示文摘为挖掘番薯(Ipomoea)属EST—SSR资源,从NCBI数据库下载23406条甘薯(印omoeabatatas(L.)Lam.)EST和62282条牵牛(巾omoeanil(L_)Roth)EST,利用生物信息学软件预处理、去冗余、拼接后得到12812条无冗余的甘薯EST(6.70Mb)和28422条牵牛唯一序列(17.19Mb)。对这些序列进行SSR搜索,在甘薯上获得328个SSR位点,出现频率为2.56%:牵牛上筛选到962个SSR位点,出现频率为3.38%。甘薯和牵牛EST.SSR具有多个共同特征:在SSR位点中,主要是二核苷酸重复类型,其次是三核苷酸重复;在二核苷酸重复中,出现最多的重复基序为AG/CT,其次是AT/AT;在三核苷酸重复中,主要基序是AAG/CCT;SSR位点的长度主要集中在20—22bp。结果表明,搜索出的EST—SSR重复基序类型丰富、多态性潜能高,具有较高的开发和利用价值。 | 兰孟焦 吴问胜 王瑞珍 赵朝森 赵现伟 | 2013 | 植物遗传资源学报2013，14，5： | 2 |
| 15 | 均匀设计优化甘薯ISSR-PCR反应体系显示文摘为探索适宜甘薯的ISSR-PCR反应体系,采用两轮均匀设计试验,对ISSR-PCR反应体系中模板DNA、引物和2×Taq Master Mix的用量进行优化.结果表明:在10μL ISSR-PCR反应体系中,含模板DNA 1.4μL,引物0.9μL,2×Taq Master Mix 5.1μL.在此最佳条件下,利用UBC808引物对22个甘薯品种扩增的条带清晰、多态性好,表明此反应条件适合于甘薯的ISSR-PCR反应体系. | 张安世 张利民 刘莹 | 2015 | 焦作师范高等专科学校学报2015，31，1： | 1 |
| 16 | 甘薯分子标记辅助育种研究进展显示文摘甘薯作为重要的粮食、饲料和工业原料,尽管传统育种在甘薯品种选育方面取得了一些成就,但并不能满足当前甘薯产业的需求。随着分子生物学和基因组学的发展,甘薯分子标记的开发利用、高密度遗传图谱的构建、重要性状的QTL定位和全基因组关联分析,均极大程度上解决了甘薯传统育种面临的困难,促进了甘薯育种的速度和效率。本文简要介绍了AFLP标记、RAPD标记、SSR标记、ISSR标记等分子标记在甘薯研究中的应用,就国内外甘薯遗传连锁图谱构建、数量性状QTL定位、甘薯全基因组关联分析研究进展进行了综述,并对甘薯遗传育种研究中功能标记的开发,及深入开展甘薯基因组学、转录组学和蛋白组学相关研究进行了展望。 | 吴胜男 孙凯 张海 刘峰 王凤 | 2022 | 黑龙江农业科学2022，，9： | 0 |
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