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1甜椒核心种质遗传多样性与亲缘关系分析显示文摘以102份甜椒核心种质为研究材料,对8个农艺性状进行遗传多样性分析,并且基于基因型效应值进行性状间的相关性和种质间的亲缘关系分析。8个农艺性状的多样性指数分别为4.60、4.60、4.59、4.57、4.60、4.58、4.58和4.53,表明甜椒核心种质存在丰富的遗传多样性。首花节位与株高呈极显著正相关,相关系数为0.38;果纵径与株高呈极显著正相关,与首花节位呈显著相关,相关系数分别为0.37和0.23;果柄长与株高呈显著相关,相关系数为0.20;果肉厚与果纵径、果横径呈极显著正相关,相关系数分别为0.28和0.30;单果质量与果纵径、果横径、果肉厚呈极显著正相关,与首花节位呈显著正相关,相关系数分别为0.37、0.67、0.53和0.20。不同种质间遗传距离变幅为1.51-10.41,表明这些核心材料间遗传差异较大。在聚类重新标定距离为16.5时,102份甜椒核心种质被分为27个类群,其中20个类群分别由1份种质材料组成,表明这20份种质与其余种质亲缘关系较远。该研究明确了不同甜椒种质间的亲缘关系,为甜椒核心种质资源的有效利用和新品种选育提供了理论依据。刘子记 申龙斌 杨衍 曹振木 2016江苏农业科学2016,44,5:21
2苦瓜核心种质资源构建方法的比较显示文摘【目的】通过比较不同方法构建的苦瓜Momordica charantia核心种质资源的优劣,选择能代表原群体遗传多样性的核心种质,为苦瓜种质资源的高效利用提供依据。【方法】采用混合线性模型对154份苦瓜种质的第1雌花节位、瓜纵径、瓜橫径、瓜肉厚和单瓜质量等5个性状的基因型值进行无偏预测;基于性状的基因型预测值,采用马氏距离计算苦瓜种质间的遗传距离;通过8种聚类方法和3种抽样方法,按照30%的抽样率构建苦瓜核心种质资源,评价不同聚类方法和抽样方法构建苦瓜核心种质的优劣。【结果】8种聚类方法构建的核心种质所有5个性状的变异系数均高于原群体;最短距离法构建的苦瓜核心种质5个性状的方差和变异系数均高于原群体,明显优于其他7种聚类方法。优先抽样法和偏离度抽样法构建的核心种质的极差与原群体一致,但偏离度抽样法构建的苦瓜核心种质有3个性状的变异系数高于其他2种抽样法,表明偏离度抽样法略优于随机抽样法和优先抽样法;基于马氏距离、偏离度抽样法及最短距离法获得了46份苦瓜核心种质,其中,Y5、Y87、Y112和Y139为苦瓜骨干材料。【结论】基于马氏距离、偏离度抽样法及最短距离法获取的46份苦瓜核心资源能够代表原群体的遗传多样性。本研究进一步证实了来源于印度及东南亚地区的苦瓜种质具有丰富的遗传多样性,为苦瓜种质资源的收集、评价与高效利用提供了重要依据。刘子记 牛玉 朱婕 刘昭华 杨衍 2017华南农业大学学报2017,38,1:18
3广西粉蕉种质果实品质性状的遗传多样性及相关性分析显示文摘以在广西收集的具有代表性的21份粉蕉特色种质果实为材料,通过检测可溶性糖、可滴定酸等的含量,进行品质性状的遗传多样性和相关性分析。结果表明:维生素C、脂肪、类胡萝卜素、丹宁和花青素变异系数达50%以上,花青素变异系数高达159.15%,性状变异大。15个品质性状的遗传多样性指数(H')为0.908 9~1.894 7,平均数达1.608 2,表现为遗传多样性丰度高,为粉蕉特色种质的创新利用提供丰富的材料基础。粉蕉果胶和维生素C等8对性状间存在极显著正相关,果胶和碳水化合物等5对性状间存在显著正相关,钾和维生素C等7对性状间存在极显著负相关,钾和碳水化合物等5对性状间存在显著负相关。龙芳 林茜 邹瑜 赵明 何海旺 武鹏 李贤高 王趣有 潘永杰 林贵美 2017基因组学与应用生物学2017,36,3:16
4甘蔗SCoT-PCR反应体系优化与多态性引物筛选及应用显示文摘目标起始密码子多态性(Start condon targeted polymorphism,SCoT)分子标记是一种新型的标记,结合了ISSR标记和RAPD标记的优点.本研究针对SCoT-PCR反应体系的影响因素,以甘蔗叶片DNA为材料,在单因子实验的基础上,采用L16(45)正交实验设计,进一步探讨了模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物及Taq酶等5个因素对甘蔗SCoT-PCR扩增效果的影响,建立了甘蔗SCoT-PCR的优化反应体系.25μL PCR反应混合液中,含50 ng DNA模板、2.0μL 10×Ex Taq Buffer(Mg2+Plus)、0.625 U Ex Taq酶,dNTP和引物的终浓度分别为0.22 mmol/L和0.9μmol/L.以我国种植面积最大的栽培品种新台糖22号为模板,应用优化体系,对40条SCoT标记引物进行测试,筛选出16条有效扩增的引物,且均为多态性引物,其GC含量在50%~67%之间.该体系的稳定性和SCoT标记引物的扩增能力,通过基于随机选择的4条引物对9份具有地理来源和遗传背景不同的甘蔗种质进行标记分析来验证,结果共扩增出84条带,其中多态性条带占82.14%,平均单条引物可扩增出21条.研究结果为在甘蔗上进一步开发和应用功能性SCoT标记奠定了基础.苏亚春 凌辉 王恒波 阙友雄 吴期滨 陈珊珊 许莉萍 2012应用与环境生物学报2012,18,5:16
5栽培沉香遗传多样性的ISSR和AFLP分析比较显示文摘探讨2种分子标记技术在沉香属药用植物遗传多样性研究中的应用。用ISSR和AFLP分子标记分析了海南、云南、广东、广西等地17份沉香属植物的遗传多样性。14个ISSR引物、8对AFLP引物分别检测到119、919个位点,多态性位点百分率分别为73.95%、86.94%。由于AFLP标记具有较高的多态性位点检测效率,AFLP标记分析的遗传多样性参数高于ISSR。虽然基于Nei's遗传距离的聚类分析结果存在着一定的差异,但用Mantel检测对2种方法检测的遗传一致度进行相关性分析表明,二者之间存在着明显的相关性(r=0.7705,P=0.0003)。ISSR标记与AFLP标记均能应用于沉香属植物的遗传多样性研究。2种标记的研究结果均揭示出沉香属植物具有较高的遗传多样水平。杨春勇 李海涛 李学兰 高微微 2013植物遗传资源学报2013,14,3:16
6基于ISSR标记的中国芋种质资源遗传多样性分析显示文摘本研究利用ISSR分子标记技术对国家种质武汉水生蔬菜资源圃收集并保存的来自全国各地的72份芋种质资源进行遗传多样性检测。研究结果表明,13条ISSR引物在72份芋种质资源中共扩增出109条带,其中 85条带具有多态性,多态性比率为78.51%;72份芋种质资源间遗传相似系数变幅的范围为0.56-0.97,说明ISSR标记能够揭示芋资源之间较高的遗传多样性;在遗传系数为0.725处,72份芋种质资源被聚为三个大类若干亚类,为进一步研究芋种质资源分类、起源、保存和利用奠定了基础。董红霞 柯卫东 黄新芳 刘玉平 刘义满 李峰 孙亚林 2014植物遗传资源学报2014,15,2:16
7ISSR技术在食用菌研究上的应用显示文摘ISSR分子标记是一种基于SSR基础上发展起来的新技术,具有很好的稳定性和多态性,且有操作简便、安全,成本低等特点。该研究回顾了ISSR分子标记在食用菌的遗传多样性、杂交育种、品种鉴定等方面的研究进展,指出其对菌种改良、保护菌种资源、规范食用菌市场管理等有重要的作用。在未来的工作中,不断改进现有的ISSR技术,并与其它分子标记技术结合应用,是发展食用菌分子水平研究的需要。孟虎 孙国琴 睢韡 石爱霞 2016北方园艺2016,,5:15
8甘薯种质资源遗传多样性的ISSR分析显示文摘【目的】利用ISSR分子标记分析不同类型甘薯种质的遗传多样性,为甘薯种质资源的传播途径分析、分类鉴定、有效利用及杂交亲本选择等提供参考依据。【方法】从100条ISSR引物中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复性好的ISSR引物,利用其对129份甘薯种质材料进行扩增,通过DPS 7.05计算不同种质间的遗传距离,并采用非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析。【结果】以筛选获得的20条ISSR引物对129份甘薯种质材料进行扩增,共获得232条条带,其中多态性条带230条,多态性条带比例达99.14%,平均每条ISSR引物扩增出11.60条条带。基于ISSR分子标记的5份野生种平均遗传距离为0.4637,124份甘薯栽培种平均遗传距离为0.1805。野生种与地方品种、引进品种和育成品种间的平均遗传距离分别为0.4688、0.4618和0.4643;而在124份栽培种中,地方品种与引进品种间的平均遗传距离最大(0.2024),引进品种与育成品种间的平均遗传距离最小(0.1673),地方品种与育成品种间的平均遗传距离为0.1978。聚类分析结果表明,当在遗传距离为0.3200时可将野生种与栽培种完全区分开;5份野生种在遗传距离为0.3200时又被划分为4个类别;124份栽培种在遗传距离为0.2000时可划分为6个类别,其中,新种花、福菜薯18号和黄皮9号3个品种各自单独组成一个类群(第Ⅰ、Ⅱ和Ⅴ类),金山57、豫薯8号和瑞薯1号组成第Ⅲ类;第Ⅳ类包含93个地方品种和育成品种;第Ⅵ类由25个地方品种和育成品种组成。【结论】不同类型和不同来源地的甘薯种质资源间存在较大遗传差异,以野生种与栽培种间的遗传差异最大,而栽培种间又以地方品种和引进品种间差异较大,即地方品种资源在我国甘薯育种亲本选择利用方面还具有很大的应用潜力。ISSR分子标记是一种适用于甘薯资源遗传多样性分析的理想分子标记。刘中华 林志坚 李华伟 许泳清 李国良 邱永祥 邱思鑫 汤浩 2019南方农业学报2019,50,11:12
9ISSR分子标记技术及其在茶树研究中的应用显示文摘随着现代生物技术的发展,DNA分子标记技术在茶树研究领域的应用越来越多,ISSR分子标记技术以其高效、快速、稳定、可靠等诸多优点而被广泛应用。介绍了ISSR分子标记在构建植物DNA指纹图谱上的应用,综述了ISSR分子标记技术在茶树亲缘关系研究、遗传多样性分析、品种鉴定、遗传图谱构建等领域中的应用研究进展,探讨了ISSR分子标记在茶树研究中存在的一些问题,为更好地应用ISSR技术开展构建茶树DNA指纹图谱等研究提供参考。林志坤 孙威江 陈志丹 林伟东 肖思 2014广东农业科学2014,41,9:11
1069份无芒雀麦种质资源遗传多样性分析显示文摘利用ISSR分子标记技术鉴定来自国内外69份无芒雀麦材料的种质遗传多样性。19个ISSR引物共扩增出109条谱带,其中104条是多态条带,多态性位点比率为95.41%。用POPEGEN32软件对数据进行分析,结果表明,69份无芒雀麦材料总的Nei’s基因多样性指数为0.255 0,Shannon信息指数为0.396 9,无芒雀麦总的遗传多样性水平较高。用SLT-NTsys2.1e软件对69份无芒雀麦进行UPGMA聚类分析和主成分分析,发现69份无芒雀麦遗传关系复杂,69份无芒雀麦聚类分析在相似系数为0.51处分为8个类群;二维主成分分析将69份无芒雀麦分为9个类群。比较二维、三维主成分分析和UPGMA聚类分析结果,最终将69份无芒雀麦划分成9个遗传类群。宋旭红 于涛 田青松 韩冰 2010西北农业学报2010,19,12:10
11不同生姜品种抗氧化活性的比较显示文摘本文以8个不同生姜品种的根茎为试验材料,利用DPPH法、水杨酸法、邻苯三酚自氧化法、金属鳌合离子法测定其抗氧化性,最后利用隶属函数分析法进行综合评价。结果表明:供试8个生姜品种都有较强的抗氧化能力;利用不同方法测定不同生姜品种的抗氧化性结果不尽相同,其中DPPH清除率以冀姜18最高,为91.78%,安徽铜陵大姜最低,为70.93%;羟自由基清除率以冀姜5最高,为85.02%,冀姜7最低,为71.89%;超氧阴离子清除率中最高的是冀姜5,为46.239%,最低的是冀姜1,为20.647%;金属离子鳌合率最高的是安徽铜陵大姜59.87%,最低的是冀姜1,为12.50%。通过隶属函数法进行综合评价发现,8种生姜品种的综合抗氧化活性顺序由强到弱依次为:冀姜5、山东昌邑大姜、山东娃娃姜、冀姜2、安徽铜陵大姜、冀姜18、冀姜7、冀姜1。王向东 王永存 马艳芝 付丽军 宋玥 马毅超 2018中国果菜2018,38,5:10
12比利时杜鹃栽培品种(系)的ISSR分析显示文摘采用ISSR标记对11个比利时杜鹃(Rhododendron hybridum)栽培品种(系)的遗传多样性进行研究.采用13条引物共获得多态性位点106个.POP-GENE 32软件分析结果表明,11个品种(系)的有效等位基因数为1.5564个,Nei's基因多样性指数为0.3207,Shannon多样性指数为0.4742,多态性位点百分率为85.48%,总的遗传多样性水平较高.利用6个标记产生的8个多态位点绘制了11个栽培品种(系)计算机化的ISSR指纹图谱,结果表明,ISSR标记可用于区分比利时杜鹃品种.郑宇 何天友 陈凌艳 陈礼光 荣俊冬 郑郁善 2011福建农林大学学报(自然科学版)2011,40,3:9
13ISSR分子标记鉴定香菇杂交菌株试验显示文摘以香菇(Lentinula edodes)808和0517为亲本,采用单孢杂交技术获得了香菇新杂交菌株0912(辽抚4号)。通过拮抗试验和ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记技术对杂交菌株辽抚4号进行遗传特性研究。拮抗试验结果表明:亲本菌株808和0517之间、亲本菌株808和杂交菌株0912之间的拮抗线都明显,均为褐色拮抗线,但亲本菌株0517和杂交菌株0912之间拮抗线较弱。采用ISSR分子标记技术对3个菌株分析表明:杂交菌株0912既含有亲本菌株808的一条特异性条带又含有0517的一条特异性条带,可以判定0912为亲本808和0517的杂交后代。宋莹 张忠伟 刘俊杰 肖千明 张季军 2015食用菌2015,37,3:9
14125份武夷山茶树种质资源的遗传多样性分析及DNA指纹图谱的建立显示文摘为开展武夷山茶树种质资源的科学利用与创新研究,本研究利用筛选出的12条ISSR引物对125份武夷山茶树种质资源进行分析。结果显示,12条引物共扩增出167个位点,其中多态性位点有160个,多态性比率为95.8%。供试茶树的遗传相似系数介于0.461 1~0.922 2之间,平均值为0.631 8,基于遗传相似系数建立了聚类树状图,揭示了125份茶树种质的亲缘关系。从160个多态性位点中筛选出18个多态性最丰富的位点,建立125份武夷山茶树种质资源的DNA指纹图谱,依据图谱差异可鉴定不同的茶树种质。陈志丹 林志坤 孙威江 林伟东 肖思 2016分子植物育种2016,14,12:8
15多花黄精遗传多样性和遗传变异规律研究显示文摘目的揭示多花黄精遗传多样性及地理分布特征。方法采用ISSR分子标记技术,对来自浙江、安徽、江西、福建、湖南、湖北6省20个种源118株多花黄精进行综合分析。结果 16条引物共扩增出130条清晰条带,其中多态性条带123条,平均多态百分率(PPL)为94.62%,种源内遗传多样性在33.85%~60.00%,平均Nei’s基因多样度(He)为0.1838,Shannon信息指数(I)为0.267 4,遗传分化系数(Gst)为0.529 3。UPGMA聚类分析显示,同一种源的种质基本上聚在一起,说明种源间的遗传分化大于种源内不同个体间的基因遗传分化;在遗传相似系数值等于0.61时可将118份种质聚为武夷山脉、武陵山脉和罗霄山脉、大别山脉、洞宫山脉和天目山脉4类。结论多花黄精具有丰富的遗传多样性,遗传变异与山脉密切相关,山脉之间的平原、水域隔离可能是导致群体间遗传分化的主要原因之一。研究结果对黄精种质资源保护、品种选育具有重要的理论价值与现实意义。刘新 斯金平 段承俐 刘京晶 2020中草药2020,51,10:8
16青花菜种质资源遗传多样性的ISSR分析显示文摘利用ISSR分子标记技术,对来自国内外的33个青花菜(Brassica oleracea var.italica)材料进行遗传多样性研究。从100条通用ISSR引物中筛选出15条用于PCR扩增,共得到可重复的211条清晰谱带,其中多态性谱带180条,多态性条带比率(PPB)为85.31%,平均Nei's基因多样性指数与Shannon's信息指数为0.332 7和0.487 7;材料间遗传距离范围为0.09~0.45,平均0.28;聚类分析表明,33份青花菜种质可分为4组,没有明显的地域分布规律。结果表明,ISSR标记可用于青花菜种质的分子鉴定;青花菜供试材料具有一定的遗传多样性。王岚 朱熠鹏 蒋明 楼潇潇 赵罗鹏 朱柯柯 管铭 2014浙江农业学报2014,26,4:8
17可可种质资源多样性与创新利用研究进展显示文摘就可可种质资源在起源、分布、传播、分类、鉴定及种质创新与利用等方面取得的研究进展进行综述。可可属植物有22种,仅可可(Theobroma cacao)和大花可可(Theobroma grandiflorum)用于栽培。可可种质资源多样性丰富,其分类研究经历了传统形态学划分的Criollo、Forastero和Trinitario遗传类群到现代分子标记划分的Maran^on、Curaray、Criollo、Iquitos、Nanay、Contamana、Amelonado、Purús、Nacional和Guiana遗传类群。目前,可可的生产性品种选育仍以实生选种和芽变选种为主。分子标记的开发、遗传连锁图谱的构建和全基因组测序的完成,为实现可可分子标记辅助育种提供了技术保障。秦晓威 郝朝运 吴刚 李付鹏 赖剑雄 2014热带作物学报2014,35,1:8
18福建柏优树子代ISSR遗传多样性与指纹图谱显示文摘采用ISSR分子标记技术对24个福建柏家系的遗传多样性进行分析.结果表明:16条引物共扩增出215个位点和190个多态性位点,多态位点百分率达86.74%,表现出较好的多态性,福建柏各家系间存在较大的遗传变异,且ISSR标记能有效揭示家系间的多态性;家系间遗传相似系数为0.58~0.87,遗传距离为0.13~0.50,表现出丰富的遗传多样性;以遗传距离L1为界,将24个福建柏优树子代划分为3类,不存在明显的地域性规律;仅用UBC841就能完全鉴别出所有待测家系.表明建立的福建柏DNA指纹图谱ISSR分子标记技术可有效地用于福建柏家系的资源评价和指纹图谱构建.万娟 罗睿 陈剑成 沈少炎 何天友 荣俊冬 郑郁善 2017福建农林大学学报(自然科学版)2017,46,4:8
19ISSR荧光标记毛细管电泳与谷子品种遗传多样性分析显示文摘谷子源于中国,遗传多样性丰富,近年来,科研人员培育出来了许多新品种,但是,可选用的目标种质资源不多,育种形势不乐观。ISSR荧光标记毛细管电泳法是一种以DNA测序为平台的检测方法,拥有更高的自动化、准确性等一些优点。本实验利用ISSR荧光标记毛细管电泳技术对30个优异的谷子品种进行了遗传多样性分析。ISSR分析结果也表明参试的谷子品种遗传变异丰富,8条ISSR引物扩增出120多条多态性条带,遗传相似系数的变化范围为0.89~0.93。数据处理后聚类结果发现一些地理来源不一致的品种也被聚集在一起,这种情况的出现或许是因为人类的行为所造成的,使得谷子品种间体现出了近亲缘的关系。本实验可以为谷子品种的分类鉴定、谷子优异种质的科学利用及分子标记辅助育种提供理论依据。常玉卉 张艾英 刘盼 张莉 2017分子植物育种2017,15,8:7
20柳州汪洞乡古茶树种质资源遗传多样性的ISSR分析显示文摘本研究利用ISSR分子标记技术对柳州融水县汪洞乡古茶树种质资源的遗传多样性和亲缘关系进行分析,选取10个ISSR引物对87株柳州汪洞乡古茶树单株及4个对照茶树品种的基因组DNA进行扩增。10条引物共扩增出67条谱带,其中多态性条带共64条,多态性比率达95.5%,每条引物扩增条带为5~9条,平均多态性条带6.4条。每条引物扩增条带的多态性为80%~100%,扩增条带大小在100~2 000 bp。供试样品的Jaccard相似系数在0.35~0.85之间,平均值为0.60。在相似系数0.6处可将全部91份样品划分为10大类群。本研究从分子水平上揭示了该古茶树群体资源单株间的亲缘关系,可为该资源的进一步开发利用提供研究基础。郑丹琳 陈涛林 葛智文 陈美丽 戴斯佳 罗军武 冉立群 2018分子植物育种2018,16,11:7
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