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| 1 | 烟草叶绿体密码子的偏好性及聚类分析显示文摘综合运用多种软件对3种烟草属植物以及其他对照植物的6个叶绿体蛋白编码基因进行了分析。结果表明,普通烟草在密码子使用特性上与林生烟草最为接近,在所分析的59个密码子中,有39个密码子的RSCU(Relative Synonymous Codon Usage)值完全一样;8种参与分析的植物中共出现了30个具有偏好使用的密码子,其中7种双子叶植物在碱基组成上偏爱以C结尾的密码子,而水稻偏爱以T和C结尾的密码子;以RSCU值为基础的聚类结果显示出植物的密码子偏好性具有种族特征,表明基于叶绿体蛋白编码基因的密码子使用特性的聚类结果较适合用于系统发育分析的重要补充。 | 杨惠娟 刘国顺 张松涛 崔红 | 2012 | 中国烟草学报2012，18，2： | 14 |
| 2 | Codon Usage Database自动寻错平台CUDer的组建与应用显示文摘密码子用法数据库(CUD)是密码子用法与密码子优化研究领域的一个重要的在线服务,为了找出该数据库中潜在的两种不再适用的记录,即已过期的陈旧记录和在遗传密码类型上实际无法有效支持的记录(简称不支持记录),本文通过结合前期自主研发的两个软件BestCodon与CUDassist,组建了CUD自动寻错平台CUDer,并应用于上述问题的研究。结果发现,CUD中存在317条陈旧记录与4条不支持记录。对于陈旧记录,这些记录的物种分类号在NCBI中已发生变更,研究者应该避免使用这些记录的相关数据;对于不支持记录,本文借助CUDer计算得到这些记录正确的密码子用法表(CUT),弥补了当前CUD的不足。此外,该平台也为面向CUD的自动化数据处理,提供了一个新的软件框架,具有一定的借鉴意义。 | 余劲聪 方柏山 | 2011 | 生物信息学2011，9，3： | 0 |
| 3 | 水稻种子萌发出苗研究及直播生产上相关难题显示文摘水稻的出苗过程经过了种子的吸胀、萌动、发芽、出苗等阶段,涉及种子细胞活化修复、物质分解与代谢、能量代谢等生理生化活动,其调控网络十分复杂。本文在简要介绍种子萌发和出苗过程、生理生化活动的基础上,分析了影响种子萌发出苗的因素,提出了直播稻生产上与种子萌发和出苗相关的难题,即直播稻芽苗期遇到淹水和低温胁迫困扰直播稻的一次性全苗问题。 | 郑广杰 陶怡 沈兴连 叶昌 徐亚楠 褚光 徐春梅 王丹英 | 2023 | 中国稻米2023，29，6： | 0 |
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