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| 1 | 急性B淋巴细胞白血病的差异microRNA综合调控网络的生物信息学分析显示文摘目的通过生物信息分析途径,从系统水平揭示参与急性B淋巴细胞白血病(B—ALL)发病的分子机制,为研究提供新的思路。方法从公共数据库GEO中下载B—ALL的microRNA(miRNA)芯片数据,利用QlucoreOmicsExplorer3.0软件筛选差异表达miRNA,再分析得到差异miRNA与靶基因、长链非编码RNA和转录因子各自的调控数据,然后构建以差异miRNA为中心的综合调控网络。另外,功能富集分析有功能的靶基因。结果共筛选出15个差异miRNA,其中7个miRNA表达上调,8个miRNA表达下调。通过差异miRNA为中心的综合调控网络可知,hsa—miR.126和hsa—miR-486—3p调控大量的靶基因,其中hsa.miR-126的靶基因包括MYC基因。hsa—miR.29a、hsa.miR-130a和hsa—miR-181c调控大量的长链非编码RNA,包括XIST。hsa.miR-181a.2、hsa—miR.18ib-2和hsa.miR-663调控大量的转录因子,包括CDX2、YYl等。hsa—miR.126靶基因的通路分析显示富集到Wnt通路。结论通过生物信息学方法分析得出,hsa—miR-29a、hsa.miR-126和hsa—miR-181家族是B.ALL的核心差异miRNA,及其转录因子CDX2、长链非编码RNAXIST和靶基因MYC基因在B.ALL的发生发展中起重要作用,可能为潜在的治疗靶点。 | 曾妙娜 马文丽 郑文岭 | 2016 | 中华血液学杂志2016,37,7: | 3 |
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