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| 1 | 彩色马铃薯品种‘转心乌’类黄酮-3'5'-羟化酶(F3'5'H)基因的生物信息学和表达分析显示文摘类黄酮-3'5'-羟化酶(F3'5'H)基因是合成蓝色飞燕草色素类花色苷的关键酶基因。本研究采用RT-PCR法从彩色马铃薯品种‘转心乌’中克隆到了F3'5'H基因的c DNA,并进行了生物信息学和组织表达模式分析,希望能探明F3'5'H基因在彩色马铃薯花色苷合成中的作用及表达方式。克隆到的F3'5'H c DNA序列全长1 720 bp,编码509个氨基酸残基,同源比对表明F3'5'H与茄科植物聚在一起,其次是其它双子叶植物。F3'5'H具有信号肽和明显的跨膜结构域,属于分泌蛋白且为稳定的亲水蛋白,定位于细胞质。说明F3'5'H在细胞质中的粗糙型内质网上合成前体后,跨膜运输到其它部位或细胞器中发挥作用。α螺旋和无规则卷曲是F3'5'H的主要二级结构元件。F3'5'H具有细胞色素P450的'PPGP'、'AGTDT'、'FGAGRRICAG'三段基序,且只有一个功能结构域,与细胞色素P450的功能结构域相匹配,属于细胞色素P450家族的一员。组织特异性表达结果表明:F3'5'H相对表达量和花色苷含量均是块茎高于叶片和地上茎,它们的变化趋势基本一致,花色苷含量较高的器官,其F3'5'H的相对表达量也高,说明花色苷的积累与F3'5'H的表达正相关。 | 肖继坪 杨晓娜 郭华春 | 2015 | 基因组学与应用生物学2015，34，7： | 12 |
| 2 | Multiplex qPCR for serodetection and serotyping of hepatitis viruses: A brief review显示文摘The present review describes the current status of multiplex quantitative real time polymerase chain reaction(q PCR) assays developed and used globally for detection and subtyping of hepatitis viruses in body fluids. Several studies have reported the use of multiplex q PCR for the detection of hepatitis viruses, including hepatitis A virus(HAV), hepatitis B virus(HBV), hepatitis C virus(HCV), hepatitis D virus(HDV), and hepatitis E virus(HEV). In addition, multiplex q PCR has also been developed for genotyping HBV, HCV, and HEV subtypes. Although a single step multiplex q PCR assay for all six hepatitis viruses, i.e., A to G viruses, is not yet reported, it may be available in the near future as the technologies continue to advance. All studies use a conserved region of the viral genome as the basis of amplification and hydrolysis probes as the preferred chemistries for improved detection. Based on a standard plot prepared using varying concentrations of template and the observed threshold cycle value, it is possible to determine the linear dynamic range and to calculate an exact copy number of virus in the specimen. Advantages of multiplex q PCR assay over singleplex or other molecular techniques in samples from patients with co-infection include fast results, low cost, and a single step investigation process. | Mohammad Irshad Priyanka Gupta Dhananjay Singh Mankotia Mohammad Ahmad Ansari | 2016 | World Journal of Gastroenterology2016，22，20： | 5 |
| 3 | SYBR Green实时荧光定量聚合酶链反应宽范围检测人GAPDH基因体系的建立显示文摘目的建立一种快速、灵敏的人3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)基因实时荧光定量-聚合酶链反应(RT-PCR)方法。方法根据GeneBank数据库中提供的人GAPDH基因(NC000012)mRNA序列,在其保守区域设计一对用于RT-PCR引物,通过优化反应体系和反应条件,成功建立了检测人GAPDH基因的SYBR Green RT-PCR方法。结果实验结果表明,该检测方法检测人GAPDH基因的最低检测拷贝数可达到15copies/μL,在一个较宽的浓度范围内(1.5×1011.5×107)具有良好的线性关系(r=0.992)。溶解曲线呈现了清晰的单一峰型,Tm值为(84.5±0.2)℃。结论该研究为人GAPDH基因作为内参基因进行人功能基因与病原基因表达的定量分析提供了一种更为快速、灵敏的方法。 | 李喆 张影 徐颖华 辛晓芳 | 2015 | 国际检验医学杂志2015，36，22： | 2 |
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