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| 1 | SSR分子标记在作物遗传育种中的应用显示文摘SSR(simple sequence repeat)是建立在PCR技术上的一种广泛应用的分子标记,具有含量丰富、多态性高、共显性等优点。本文简要介绍了SSR分子标记技术的原理和特点,重点介绍了SSR分子标记技术在作物遗传育种中的应用,主要在作物遗传多样性、基因定位、分子辅助标记、遗传图谱构建、品种鉴定和纯度鉴定等方面进行阐述。 | 罗冉 吴委林 张旸 李玉花 | 2010 | 基因组学与应用生物学2010,29,1: | 144 |
| 2 | 利用SRAP与SSR标记分析不同类型甜菜的遗传多样性显示文摘为选育优质甜菜新品种,指导种质资源引进和利用,为进行分子标记辅助选择育种提供科学依据,采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合,对甜菜单胚雄性不育系及保持系等49份材料进行遗传多样性分析。利用4个表型差异显著的甜菜品系对SRAP的64对引物组合及SSR的11对引物组合进行扩增,分别筛选出有效引物组合11对和9对。SRAP的11对引物组合共产生199条扩增带,其中有86条多态性带,多态性带的比率平均为43.7%。SSR的9对引物共产生35条扩增带,多态性比率为100%。全部材料的平均遗传距离为0.3860,平均遗传相似系数为0.6795,大约30%的材料遗传距离或遗传相似系数具显著或极显著差异。遗传相似系数平均值比较,多胚四倍体品系0.7264>单胚杂交组合0.7243>国外品种0.7060>多胚二倍体品系0.6908>单胚品系0.6837。在遗传距离0.20处,将49个甜菜材料划分为A、B、C、D4个类群,D类群又分为4个亚类,较好地显示了甜菜材料丰富的遗传多样性。表明不同甜菜品种具有相当高的异质性,国外与国内材料的遗传基础存在一定差异,但生产应用的甜菜品种间存在亲缘关系较近、遗传基础较窄的倾向。 | 王华忠 吴则东 王晓武 方智远 | 2008 | 作物学报2008,34,1: | 68 |
| 3 | 分子标记技术在棉花品种鉴定上的研究进展显示文摘DNA指纹技术的发展大体分为三个阶段:第一代的分子标记是以Southern杂交为基础的RFLP,第二代分子标记是以PCR为基础的各种DNA指纹标记,第三代分子标记是以单核苷酸多态性为基础的SNP。本文概述了品种鉴定技术的研究与应用进展,重点介绍了用于棉花品种鉴定的四种主要的分子标记技术:RFLP、RAPD、AFLP和SSR,对每一种分子标记的技术原理、在棉花品种鉴定上的应用研究状况及存在的优缺点进行了具体阐述。通过比较分析,提出了SSR标记适用于棉花品种鉴定的独特优越性。并对基于SSR分子标记技术构建我国棉花品种DNA指纹库的重要意义与必要性进行了分析。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 王俊芳 | 2009 | 棉花学报2009,21,4: | 33 |
| 4 | 国家棉花区试新品种的SSR指纹图谱分析显示文摘以2009年度参加黄河流域国家棉花区试的57份参试品种为材料,运用筛选确定的22对多态性好、条带清晰的SSR引物对参试品种进行分子标记分析,共检测出145个等位位点,其中106个为多态性位点,平均每对引物4.8个,多态性比率平均达到72.7%,PIC平均值为0.661。利用106个多态性片段构建了这些品种的SSR指纹图谱。遗传聚类结果显示,在相似系数为0.98时,57个区试品种完全区分开;同一地区和同一单位育成的品种在不同程度上聚在一类,说明它们的遗传关系较近。 | 孙宁 杨付新 付小琼 王秀玲 刘逢举 李亚丽 汤磊鹏 | 2011 | 棉花学报2011,23,3: | 17 |
| 5 | SSR分子标记技术在茄子杂交种子纯度鉴定中的应用显示文摘利用SSR分子标记技术进行种子纯度鉴定是一种准确快速、简单高效的方法。试验选用100对引物在鄂茄子2号亲本间进行PCR扩增,从中筛选出的3对引物SM17、SM29、SM51在双亲本间能够扩增出差异互补的条带。利用这3对引物对鄂茄子2号杂种一代群体进行纯度鉴定,鉴定结果为97.1%;与同批次种子的田间鉴定结果(96.1%,鉴定地点海南岛)接近,说明应用SSR分子标记技术实施茄子杂种一代种子的纯度鉴定是可行的。 | 张敏 谈太明 徐长城 谈杰 黄树苹 王春丽 | 2013 | 湖北农业科学2013,52,8: | 15 |
| 6 | 利用SSR标记鉴定棉花杂交种兴杂2号纯度的研究显示文摘杂交棉在制种过程中往往因母本去雄不彻底或漏去雄形成自交铃而导致制种纯度不高,寻找快速准确的纯度检测方法是杂交棉种子生产和经营急需解决的问题。试验以棉花杂交种兴杂2号及其亲本为材料,选用77对异源四倍体棉花SSR引物,采用SSR分子标记技术筛选出双亲间的多态性产物,并对兴杂2号种子的纯度进行了检测。结果表明,CP55、CP128、CP483、CP478等4对引物在兴杂2号双亲间扩增出多态性产物,可以准确地鉴别出兴杂2号及其亲本间的差异,为棉花杂交种兴杂2号的纯度鉴定提供了一个准确、稳定、快捷、实用的检测方法。 | 许兰杰 聂战胜 詹克慧 | 2008 | 中国农学通报2008,24,6: | 14 |
| 7 | 黄河流域棉花主要品种SSR指纹图谱构建及遗传差异分析显示文摘利用SSR分子标记构建了2009-2010年黄河流域23个主要棉花品种和2010年山东省区试4个品系的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。63对引物在27份供试材料中共扩增到多态性条带254条,平均每对引物4.03条。22对引物在23个品种(系)上具有特征谱带,除鲁棉研21号、鲁棉研36号、鲁436、邯棉559外,均可用1对引物进行鉴定;采用引物组合法只需要5对引物就能将27份供试材料区分开,并利用这5对引物构建了上述品种(系)的数字指纹图谱。遗传多样性分析显示,27个品种(系)间遗传相似系数介于0.5394~0.9685之间,平均为0.6878,并且同一省份所选育的品种(系)大都聚到同一类群,说明黄河流域选育的品种还存在一定的地域局限性。 | 韩宗福 王景会 申贵芳 王宗文 赵逢涛 李汝忠 张军 孔凡金 赵静 | 2011 | 棉花学报2011,23,6: | 12 |
| 8 | SSR分子标记在棉花遗传育种中的应用及进展显示文摘SSR(Simple Sequence Repeat)是在PCR(Polymerase Chain Reaction)基础上发展起来的一种新的分子标记技术,具有高度多态、共显性、保守性、且仅需少量的DNA、操作简便、重复性好、稳定可靠等优点,在动物、植物、微生物等研究领域中得到了广泛应用。简述了SSR分子标记技术在棉花上的DNA提取方法、引物开发、PCR反应体系、扩增后检测方法优化上的进展及其在棉花遗传育种中的遗传图谱的构建、遗传多样性的鉴定、功能基因和QTLs的定位、标记辅助育种和品种、杂种、突变体、亲缘关系的鉴定及种子纯度的检测方面的应用情况,从而为相关工作者在这方面的研究提供参考。 | 赵海燕 渠云芳 黄晋玲 | 2009 | 中国农学通报2009,25,22: | 11 |
| 9 | SSR分子标记在棉花中的应用显示文摘SSR分子标记以其多态性高、重复性好、共显性、易用PCR分析并在基因组中分散分布等优点而在许多领域中被广泛应用。对SSR分子标记在棉花遗传图谱构建、遗传多样性测定、品种鉴定、种子纯度检测以及标记辅助育种等方面的应用进行了介绍,为该技术在棉花遗传育种中更好的应用提供理论参考依据。 | 陈浩东 李育强 洪亚辉 | 2007 | 湖南农业科学2007,,2: | 10 |
| 10 | 棉花品种指纹图谱构建及棉种鉴定技术研究显示文摘采用单粒棉种DNA快速提取方法,以18份陆地棉和3份海岛棉品种为材料,从78对棉花SSR引物中筛选出55对具有多态性的引物,并确定了33对棉种鉴定用的备选核心引物。通过构建棉花品种DNA指纹图谱,所选21份材料只需要6对引物就可以完全鉴别。该方法也可以用来鉴定棉花种子真实性和检测品种纯度。 | 王俊芳 杨伟华 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 | 2009 | 中国棉花2009,36,3: | 10 |
| 11 | 利用SSR快速鉴定棉花品种真实性和纯度显示文摘利用SSR分子标记技术对棉花品种真实性和纯度进行分析研究,旨在为棉花品种提供分子鉴定依据。以具有代表性的棉花品种为材料,经过引物初筛和复筛,确定26对均匀分布于棉花染色体上的SSR核心标记。结果表明,26对核心标记在120份材料中筛选得到138个等位位点,其中129个为多态性位点,多态性比率达93.48%。以标准样品为对照,利用26对核心标记对10份棉花常规种进行真实性鉴定,发现仅有源棉6号与标准品种的DNA图谱高度一致,其他9份常规种与标准品种均存在8~18个差异位点,分子鉴定结果与田间鉴定相符。另外分别筛选5对特征引物作为纯度检测标记,采用单位点平均法统计4份常规棉品种检测结果表明,源棉6号纯度最高,为98.0%,源棉1号最低,为90.5%,检测结果与田间纯度鉴定呈现正相关性。研究表明利用SSR标记技术鉴定棉花品种真实性和纯度的方法完全可行。 | 王欣怡 艾先涛 王俊铎 梁亚军 龚照龙 郑巨云 郭江平 买买提.莫明 李雪源 | 2017 | 作物学报2017,43,10: | 9 |
| 12 | 花生新品种汕油21种子纯度SSR标记鉴定体系的建立和应用显示文摘为探索花生品种纯度的分子标记鉴定方法,采用SSR标记构建不同花生品种的指纹图谱。结果表明:利用3对SSR标记引物构建20个花生品种的指纹图谱,该图谱可以将汕油21与其它19个花生品种进行区分,这些品种包括汕油162、汕油212、汕油31、汕油33、汕油71、粤油5号、粤油7号、粤油29、粤油32、汕油27、汕油523、粤油9号、粤油13、粤油14、粤油79、粤油114、J11、仲恺花1号和泉608等;以3对SSR引物对汕油21繁育种子60个样品进行种子纯度检测,共有2对标记引物检测到3个杂株样品,该种子批的纯度为95.0%。因此,利用SSR标记构建花生品种指纹图谱并应用于汕油21品种纯度鉴定是可行的。 | 詹世雄 郑奕雄 刘冠明 庄东红 | 2007 | 种子2007,26,9: | 9 |
| 13 | 新疆8个棉花品种(系)的指纹图谱分析显示文摘利用ISSR对8个新疆品种(系)进行指纹图谱构建。通过基因组多态性分析,从60条引物中筛选到11条扩增效果好的引物,用其中2条引物UBC809,UBC841建立8个品种的指纹图谱,统计品种鉴定的置信概率达到1/8388608。结果显示,ISSR分子标记技术对棉花品种的指纹图谱构建具有高效性和准确性。 | 姜伟 李雪源 何觉民 陆建农 | 2007 | 华北农学报2007,22,B10: | 8 |
| 14 | SSR分子标记辅助选择转育棉花胞质雄性不育系的回交亲本显示文摘将常规育种选择方法和分子标记技术相结合,对用于回交转育棉花胞质雄性不育系的33个早熟陆地棉品系进行筛选。用9个主要性状观察值和260对SSR引物扩增结果均可将33个品系聚为2大类4亚类,这些亚类之间的表型特征差异较明显。从基于分子标记结果划分出的A1、A2、B1、B2亚类中挑选出关键性状综合表现较好的优良品系,并参照主要性状观察值的聚类结果剔除表现型相似的品系,筛选出8个典型代表优良品系,用以进一步回交转育棉花胞质雄性不育系。 | 相吉山 谢宗铭 董永梅 田琴 李有忠 司爱君 | 2011 | 棉花学报2011,23,2: | 8 |
| 15 | 甘蓝型双低油菜杂交种丰油10号纯度的SSR鉴定显示文摘品种纯度影响品种的一致性和稳定性,是品种鉴定的一项重要指标。为建立甘蓝型油菜杂交种丰油10号的SSR标记纯度鉴定方法,以丰油10号及其亲本为材料,利用SSR荧光标记与毛细管电泳相结合的方法,在128对SSR引物中筛选出2对可用于丰油10号纯度鉴定的引物。2对SSR引物对丰油10号的纯度鉴定结果为85.64%,与田间表型纯度鉴定的结果 87.18%相比,纯度值非常接近,说明筛选的SSR标记可用于丰油10号杂交种纯度鉴定。 | 何俊平 张书芬 王建平 蔡东芳 曹金华 文雁成 胡坤 赵磊 王东国 朱家成 | 2019 | 作物杂志2019,0,1: | 7 |
| 16 | 利用SSR分子标记辅助棉花提纯选育的研究显示文摘为研究SSR分子标记辅助提纯选育棉花新品种的可行性,本研究利用SSR分子标记对402系×33系杂交获得的F5高代材料进行分子标记辅助提纯选育分析,并通过前期已筛选的亲本具有多态性的4对SSR分子标记对F5群体、常规提纯选育F6(CKF6)群体及分子标记辅助提纯后F6(MASF6)群体进行遗传分析。结果表明:F5群体遗传相似系数在0.28~1.0之间,纯度为47%;CKF6群体遗传相似系数在0.57~1.0之间,纯度为58.75%,而MASF6群体带型完全一致;在农艺性状相同的情况下,利用SSR分子标记筛选的MASF6相对于CKFs在这些位点的纯合度提高了1.7倍。研究结果说明利用分子标记辅助提纯选育棉花是一项有效可行的方法。 | 王永强 刘建光 赵俊丽 郭娴 耿军义 王凯辉 张寒霜 | 2014 | 分子植物育种2014,12,3: | 7 |
| 17 | 应用SSR分子标记技术鉴定张氏红山茶杂交F1代真实性的研究显示文摘张氏红山茶Camellia changii是新兴的山茶属珍稀种质资源,在茶花杂交育种方面具有极高的科研价值。为建立鉴定张氏红山茶杂交后代的方法,本研究采用SSR标记技术,对以张氏红山茶为亲本的杂交后代以及所有杂交组合的亲本进行了分子鉴定。研究结果显示:张氏红山茶和博白大果油茶杂交后代仅有母本特征带,推测其有可能是自交种;张氏红山茶和超级南天武士的杂交后代出现了父母本均没有的条带,显示可能有外来血缘;其余组合杂交F1代均包含了父母本的特征带,从而表明杂交是成功的。从本研究结果看,应用SSR分子标记技术,可以方便地对杂交后代的真实性进行鉴定。 | 李琳琳 黄万坚 刘信凯 高继银 李凯凯 叶创兴 石祥刚 | 2014 | 广东园林2014,36,2: | 6 |
| 18 | 棉花品种基因纯度和特异性的SSR标记分析显示文摘为从分子水平上鉴定棉花品种的纯度和真实性,采用扩增带型清晰,多态性较高的SSR引物对51个常规棉品种进行了基因纯度鉴定、遗传聚类分析和品种特异性鉴定。基因纯度鉴定结果显示,69%的品种基因纯度较好,基因纯度在90%以上;12%的品种基因纯度较差,基因纯度在80%以下。聚类分析结果表明,所有品种分为2个大类和4个亚类,这反映出品种间的遗传基础较窄。品种特异性鉴定中,以遗传距离阈值T=0.01为划分标准,83%的品种具有特异性。这说明利用SSR标记可以有效鉴定棉花品种的基因纯度和特异性。 | 刘国栋 钟文 曲辉英 王芙蓉 张军 | 2011 | 中国农学通报2011,27,30: | 6 |
| 19 | 样本量对中苎1号群体遗传多样性参数的影响显示文摘为了确定群体的最适抽样量,本试验从中苎1号开放授粉群体中随机选取100蔸,并从中随机抽取10、20、30、40、50、60、70、80,90个个体组成抽样群体,计算其遗传多样性参数,得出SSR标记在样本量50以上时参数值变化不大,而SRAP标记在样本量60以上时结果较为稳定。为苎麻群体遗传多样性的研究中样本量的选择提供了依据。 | 谭龙涛 喻春明 陈平 王延周 陈继康 温岚 熊和平 | 2012 | 中国麻业科学2012,34,4: | 6 |
| 20 | 棉花杂交种SSR标记检测技术的研究显示文摘【目的】研究棉花杂交种SSR分子标记检测技术。【方法】以天云1号、天云3号及各自亲本为材料,用SDS-CTAB法提取组织DNA,通过SSR-PCR技术,进行SSR标记引物的筛选。【结果】从107对引物中共筛选出8对多态性效果较好的引物,平均每对引物产生3.2个多态性位点。【结论】该方法可以准确地鉴别出材料间的差异,为棉花杂交种分子检测提供了一个准确、稳定、快捷、实用的检测方法。 | 艾买提.图如普 申怀伟 梁亚军 冯方剑 郑炜佳 陈全家 | 2010 | 新疆农业科学2010,47,9: | 5 |