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| 1 | 山东近海牙鲆(Paralichthys olivaceus)自然和养殖群体10个微卫星基因座位的遗传多态性分析显示文摘采用微卫星遗传标记技术对山东近海牙鲆自然群体和养殖群体的遗传多样性进行了研究。实验所用牙鲆于 2 0 0 3年 5月分别采自山东近海和青岛胶南养鱼场 ,各 2 0尾 ,取全血或肌肉组织 ,以酚 仿抽提方法提取基因组DNA ,利用筛选获得的 1 0对微卫星引物进行PCR扩增 ,反应产物经 8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离、EB显色 ,用ImageMaster1DElite(Version3 0 1 )软件分析电泳结果 ,并计算了相应的遗传学参数。结果表明 ,在自然和养殖群体中 ,1 0个基因座位的等位基因平均数 (a)分别为 6 7和 6 1 ,每个基因座位有效等位基因数 (ae)分别为1 8— 6 8和 2 5— 6 7,群体平均杂合度 (H)分别为 0 81 2 0和 0 731 0 ;两个群体间的遗传相似性系数、遗传距离和基因分化系数为 0 85 5 8、0 1 5 5 7和 0 0 5 5 8;自然群体内每个座位上的多态信息含量 (PIC)为 0 5 9— 0 84、个体识别率 (DP)为 0 5 4— 0 86、非父排除率 (PPE)为 0 41— 0 72 ,其累积个体识别率和非父排除率均达到 0 9999,表明所选座位属中高识别力的遗传标记 ,可以将它们应用于今后牙鲆雌核发育群体的遗传变异分析以及进一步的遗传育种的研究中。 | 王伟 尤锋 高天翔 张培军 | 2004 | 海洋与湖沼2004,35,6: | 53 |
| 2 | 微卫星DNA标记技术及其在遗传多样性研究中的应用显示文摘微卫星 DNA的高突变率、中性、共显性及其在真核基因组中的普遍性 ,使其成为居群遗传学研究、种质资源鉴定、亲缘关系分析和图谱构建的优越的分子标记。本研究系统介绍了微卫星 DNA在结构和功能上的特点 ,并对微卫星 DNA标记技术应用的遗传学机理和一般方法进行了扼要的阐述。另外 ,本研究还探讨了微卫星 DNA标记技术在遗传多样性研究中的应用现状 。 | 徐莉 赵桂仿 | 2002 | 西北植物学报2002,22,3: | 55 |
| 3 | 野生大熊猫生态学研究进展与前瞻显示文摘在现代食肉目动物中,大熊猫无疑是最为引人注目的物种之一,既在科学上具有重要的研究价值,同时亦是世界自然保护的象征。自20世纪80年代初期我国政府与世界自然基金会合作开展野生大熊猫生态学研究以来,迄今已积累了大量有关该物种及其栖息地的生态学知识,近年来3S技术及分子生物学技术的推广应用将野生大熊猫生态学研究提升到了一个崭新的高度。本文在综合大量历史文献的基础上,从栖息地生态学、觅食生态学、繁殖生态学、行为生态学、分子生态学、种群生态学和群落生态学等不同方面就野生大熊猫生态学的研究现状进行了梳理,力图归纳已有研究发现,阐明研究结果的科学价值及在保护生物学上的意义。同时,结合研究与保护管理工作的需要,对未来研究方向进行了前瞻。 | 魏辅文 张泽钧 胡锦矗 | 2011 | 兽类学报2011,31,4: | 36 |
| 4 | 标本DNA研究进展显示文摘标本DNA是十分重要的遗传资源。在生物的起源及进化研究中 ,应用越来越广泛。详细介绍了标本DNA的特性、提取方法、扩增、测序、甄别、时限及已经取得的一系列成果 ,并对其中存在的问题进行了分析和评述。 | 庞峻峰 张亚平 | 2001 | Zoological Research2001,22,6: | 35 |
| 5 | 微卫星标记在分子生态学中的应用及其位点的分离策略显示文摘微卫星DNA作为一种优良的遗传标记在分子生态学领域得到了广泛应用,本文综述了其在分子种群生物学、分子环境遗传学、分子适应等研究领域中的应用情况.微卫星位点的获得是开展各项研究的前提,传统的构建微卫星文库再杂交筛选的方法工作量大、效率低,因而在实践过程中又产生了富集文库法、PIMA法、FIASCO法等新的分离策略.本文对几种微卫星位点分离技术进行介绍并对其进行分析比较,为分子生态学研究过程中微卫星位点筛选方法的选择提供参考. | 薛辉 吴孝兵 晏鹏 | 2005 | 应用生态学报2005,16,2: | 32 |
| 6 | 哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析显示文摘采用磁珠富集法构建哲罗鱼(Hucho taimen Pallas)荩因组微卫星文库。哲罗鱼基因组DNA经MboⅠ限制性内切酶消化后,选取400-900bp的片段,用生物素标记的简单重复序列(ACA)15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,获得目的片段,连接T载体克隆,构建基因组微卫旱富集文库。再用同位素标记的(ACA)15探针进行二次筛选,筛选出686个阳性克隆,阳性克隆率为35.94%。对其中140个阳性克隆进行测序,共获得149个微卫星序列,4个小卫星序列,其GenBank Accession Number为DQ110955~DQ121108。其中perfect(完美型)62个,占41.61%;imperfect(非完美型)92个,占61.74%;compound(混合型)5个,占3.36%,重复次数主要分布于6~45(81.21%),平均重复次数为32.5,这表明(ACA/TGT)。在哲罗鱼基因组DNA中含最非常丰富。本研究旨为从DNA水平上研究哲岁鱼种群结构、遗传多样性及目前群体现状等方面提供有效工具。 | 佟广香 鲁翠云 匡友谊 梁利群 尹家胜 孙效文 | 2006 | 中国水产科学2006,13,2: | 33 |
| 7 | 剑尾鱼微卫星DNA的筛选显示文摘以剑尾鱼(Xiphophorushelleri)为材料,经MboⅠ限制性内切酶消化基因组DNA后,选取500~2000bp的片段连接到经BamHⅠ酶切的pUC18载体上,转化大肠杆菌DH5α构建部分基因组文库。采用设计合成的(AC)7、(GT)7重复序列为引物,PCR筛选部分基因组文库,对其中9个重组阳性克隆进行测序,结果共获得24个微卫星序列,其中Perfect(完美型)13个,占54.2%;Imperfect(非完美型)3个,占12.5%;Compound(混合型)8个,占33.3%。表明(AC/GT)n在剑尾鱼的基因组DNA中含量非常丰富。同时,根据其中3个克隆微卫星的侧翼序列设计引物,PCR扩增剑尾鱼基因组DNA,结果均扩增到目的片段。而且,这3对引物扩增出来的微卫星片段在非选育的剑尾鱼中显示出多态性,而在近交系19代则表现为单态,为剑尾鱼的实验动物化遗传研究提供了理论依据。 | 李霞 白俊杰 吴淑勤 叶星 劳海华 简清 | 2004 | 中国水产科学2004,11,3: | 27 |
| 8 | 分子系统学研究进展显示文摘Molecular systematics has developed very quickly these years,on which most studies of molecular ecology have been focused.In this paper,the main content of this comprehensive subject is briefly reviewed.We emphasized on its techniques,including their principles,advantages and disadvantages as their applications.Several problems have been enumerated which exist in recent research of molecular systematics.The development tendency of molecular systematics is also discussed in this paper. | 徐宏发 王静波 | 2001 | 生态学杂志2001,20,3: | 26 |
| 9 | 大熊猫和北极熊基因组微卫星分布特征比较分析显示文摘本研究比较分析了大熊猫和北极熊全基因组序列中的1~6碱基重复的完美型微卫星序列的分布特征,通过微卫星序列搜索和统计软件MSDB分析分别得到855 018和936 238个微卫星序列,其长度总和分别是14 919 240 bp和18 434 348 bp;分别占基因组大小的0.64%和0.79%,大熊猫和北极熊基因组总丰度分别是371.8个/Mb和405.6个/Mb,二者基因组中微卫星都是单碱基重复的最多,其次是二碱基、四碱基、三碱基和五碱基,六碱基重复类型的数量最少。大熊猫和北极熊含量最丰富的重复拷贝类别主要有A、AC、AG、AAAT、AAAG、AT和C等。本研究为后续开发和筛选大量高质量的熊科物种微卫星标记提供了数据支持。 | 李午佼 李玉芝 杜联明 黄杰 沈咏梅 张修月 岳碧松 | 2014 | 四川动物2014,33,6: | 23 |
| 10 | 微卫星技术及在动物遗传多样性研究中的应用显示文摘微卫星作为第二代分子遗传标记 ,已经在很多领域得到广泛应用 .微卫星位点的获得有两条常用技术途径 :1)利用已发现的微卫星位点寻找新的位点 ;2 )用经典分子生物学方法克隆特定基因组的微卫星位点 .微卫星分析的一般步骤包括 :DNA的提取 ,PCR扩增 ,扩增产物及大小的检测和数据分析 .DNA芯片技术的出现 ,为微卫星技术的应用提供了更广阔的前景 .在动物遗传多样性研究中 ,可以通过微卫星技术进行种间、种内、群体之间。 | 张于光 李迪强 肖启明 饶力群 | 2001 | 湖南农业大学学报(自然科学版)2001,27,5: | 19 |
| 11 | 用PCR法快速筛选中国对虾含微卫星的重组阳性克隆显示文摘运用PCR法在中国对虾的小片段基因组文库中快速筛选含有微卫星序列的重组阳性克隆。PCR中使用的引物为载体pGEM - 3zf(+)上多克隆位点两侧的T7/Sp6启动子引物和根据微卫星核心重复序列设计的STR引物 :STR1:5’ -ATATATATATATAT - 3’ ;STR2 :5’ -TCTCTCTCTCTCTC - 3’。直接使用含有重组克隆的菌液 ,在PCR反应前增加一段裂解细菌的高温。筛选出来的含有微卫星序列的重组阳性克隆经DNA测序验证。结果证明 ,采用PCR方法用菌液快速筛选含有微卫星序列的重组阳性克隆完全可行 ,而且具有简便、快速、高效。 | 徐鹏 周岭华 相建海 | 2001 | 水产学报2001,25,2: | 19 |
| 12 | 微卫星DNA标记用于中国对虾亲子关系的鉴定显示文摘在水产养殖中应用微卫星标记来确定亲缘关系已经得到认同和广泛使用。本研究通过控制交尾,利用微卫星标记确定中国对虾后代的亲缘关系,对微卫星标记应用于中国对虾的家系识别进行初步探讨。作者以4个谱系清晰的家系为基础,检测两对微卫星标记EN0033和RS062在中国对虾家系鉴别中的应用。结果表明,利用两对微卫星引物产生的DNA指纹图谱,能够有效地区分中国对虾4个家系。根据微卫星数据计算各家系之间的遗传距离,构建UPGMA图,得到的结果与各家系来源情况一致,进一步证明了微卫星技术在进行家系间的遗传分析中的可行性。EN0033和RS062两对微卫星标记的累积个体识别率高达0.989,属于高识别力的遗传标记系统,可以利用它们进行中国对虾的亲缘关系鉴定。 | 孙昭宁 刘萍 李健 何玉英 张秀梅 | 2007 | 海洋水产研究2007,28,3: | 18 |
| 13 | 微卫星位点获取方法的研究进展显示文摘微卫星标记(simple sequence repeat,SSR)是进行分子遗传学研究的一种有效手段,并以其多态性高、信息含量大、保守性等特点成为最受人们欢迎的分子标记之一。但微卫星标记具有种族特异性,必须采用特异引物进行PCR检测,因而存在引物开发的问题。本文就筛选基因组文库法、微卫星富集法、数据库查找法、近缘物种筛选法、TOMMI法和FI-ASCO法等具有代表性的微卫星标记开发策略进行了综述,旨在为分子生态学研究过程中微卫星位点筛选方法的选择提供参考。 | 孙波 鲍毅新 赵庆洋 张龙龙 胡知渊 | 2009 | 生态学杂志2009,28,10: | 17 |
| 14 | 大熊猫脑源性神经营养因子基因的克隆与表达显示文摘参照人BDNF基因序列设计出一对引物和利用聚合酶链式反应(PCR),首次从大熊猫基因组DNA中扩增和克隆到BDNF基因,并使其在大肠杆菌中得到了表达。序列分析表明,大熊猫和人的BDNF基因的核苷酸序列同源性高达94%。在推导的多肽序列中,除在前导肽区有两个氨基酸的差异外,大熊猫BDNF的成熟区与人和其它已报道的哺乳动物BDNF成熟区的氨基酸序列完全一致,显示了极高的保守性。本文首次在分子生物学水平上对大熊猫核基因组功能基因进行研究分析,其结果为深入开展大熊猫的神经系统疾病防治,神经生理以及分子进化,系统发育等方面的研究奠定了重要基础。 | 林峰 杨玉华 张义正 陈红卫 费立松 宋云芳 何光昕 张安居 | 1998 | 兽类学报1998,18,2: | 16 |
| 15 | 应用微卫星标记分析圈养大熊猫遗传多样性显示文摘以来源于成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心的34只圈养大熊猫(分为a群体和b群体)和7只圈养野生大熊猫(圈养野生群)作为研究对象,利用AY161177~AY161218、Ame-μ5~Ame-μ70和g001~g905等30个微卫星标记对其遗传多样性现状进行分析,并探讨保持圈养大熊猫遗传多样性的方法.微卫星数据表明,30个微卫星标记多态性好(PIC=0.621~0.640),圈养大熊猫遗传多样性水平(a群体:A=5.48,Ho=0.475,He=0.696;b群体:A=5.24,Ho=0.453,He=0.719;圈养野生群:A=3.80,Ho=0.514,He=0.725)高于6个濒危物种(Ho=0.210~0.390,He=0.150~0.430)但低于3个非濒危物种(Ho=0.620~0.710),圈养大熊猫遗传多样性水平都保持在较高水平,但圈养群遗传多样性水平与圈养野生群相比有所降低.F统计量及基因流Nm分析结果证明,a、b两群体间遗传分化程度不高(Nm=2.610,Fst=0.0874,Fit=0.4116),存在个体交换和一定程度的近交,b群体近交程度高于a群体(a群体Fis=0.3221,b群体Fis=0.3983).因此,现阶段圈养大熊猫的管理重点是避免近交和遗传多样性丧失,将圈养大熊猫种群作为同一管理单元,把纠正大熊猫系谱中的错误、科学选择大熊猫个体进行群体间交流作为关键点,利用微卫星技术保持和提高大熊猫种群的遗传多样性水平. | 王芳 彭真信 张金国 田亮 韩红兵 曹之晨 张志和 沈富军 李德生 张和民 张立波 连正兴 | 2007 | 生物化学与生物物理进展2007,34,12: | 15 |
| 16 | Dynal磁珠富集大熊猫微卫星标记显示文摘应用Dynal磁珠生物素标记的微卫星探针与大熊猫基因组酶切片段杂交,捕获400~600bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pGEM T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。应用γ32P标记的探针筛选文库,从2880个转化子中获得了260个阳性克隆。对54个序列进行了测序,并成功地设计了大熊猫微卫星引物37对。该方法能有效提高筛选微卫星标记的效率。 | 沈富军 Phill Watts 张志和 张安居 Stephanie Sanderson SteveJ.Kemp 岳碧松 | 2005 | Acta Genetica Sinica2005,32,5: | 14 |
| 17 | 微卫星DNA技术用于中国对虾家系构建中的系谱认证显示文摘用6个微卫星标记对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)的5个家系进行系谱鉴别和遗传多样性研究.6个微卫星位点中有5个位点是多态的,并在所有家系中都显示了高度的遗传差异.5个家系中,5个多态微卫星位点共发现了30个等位基因,每个位点的等位基因数在5~8之间.实验中共发现了4个家系特异性等位基因:2#家系及4#家系各1个,5#家系2个.根据已知亲本及子代基因型,可推断出5个家系中全部亲本的基因型,据此鉴别各家系.在EN0033位点,可将5#家系与其他4个家系相区别;在RS0859位点,可将3#和4#家系与其他3个家系相区分.因此,EN0033和RS0859标记可用于鉴别5#、3#和4#家系的家系特异性标记.研究表明,用5个微卫星标记,且最少用2对微卫星标记即可鉴别5个中国对虾家系. | 孙昭宁 刘萍 李健 何玉英 张秀梅 | 2005 | 中国水产科学2005,12,6: | 13 |
| 18 | 微卫星DNA标记及其应用显示文摘微卫星DNA存在于大多数生物的基因组中,一般由1~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,所以微卫星DNA标记的应用范围非常广泛。笔者就微卫星DNA标记在基因组连锁图构建、基因定位、QTL分析、标记辅助选择、杂种优势预测、亲缘关系鉴定、近交动物以及医学等方面的应用作逐一概述。 | 瞿陆峰 潘伟荣 曾养志 | 2010 | 畜牧与饲料科学2010,31,4: | 13 |
| 19 | 大熊猫基因组微卫星DNA的分离与序列分析显示文摘以 pBS+为克隆载体 ,构建圈养大熊猫基因组DNA的小插入文库 .分别用生物素标记的 (CAC) 5和γ - 32 P -dATP标记的 (CA) 15寡核苷酸为探针 ,对重组质粒进行斑点杂交 ,获得 15个阳性克隆 ,并测定了插入片段的DNA序列 .其中有一部分序列已被分析 ,本文对剩余的 8个DNA序列进行分析 ,发现它们大小不一 ,从 2 5 9bp~ 881bp ,有 6个序列含有不同重复单位的一、二、四核苷酸的完整串联重复 .斑点杂交和Southern杂交证明 ,这些序列均来自大熊猫基因组 .上述结果为利用PCR技术研究大熊猫遗传多样性和了解大熊猫基因组结构积累资料 .表 2参 | 曹玫 杨玉华 王喜忠 王亚军 张义正 宋云芳 费立松 何光昕 | 2001 | 应用与环境生物学报2001,7,3: | 12 |
| 20 | 野生大熊猫种群数量调查方法研究进展显示文摘大熊猫(Ailuropodamelanoleuca)是中国特有珍稀野生动物,被誉为野生动物保护领域的'旗舰物种'。大熊猫种群数量的变化可以实时反应大熊猫种群动态,提供大熊猫分布区域、栖息地质量等最直接的信息,是制定大熊猫保护方案的基础,也是有效实施大熊猫保护措施的前提。综述了几种传统野生大熊猫种群数量调查方法(包括直接计数法、数学模型法、距离-咬节分析法及分子生物学方法),以及近年来最新应用于野生动物种群数量调查的红外相机技术、足迹鉴定法,讨论了传统方法中可能存在的问题、分析新方法的应用前景,并针对今后的野生大熊猫种群数量调查提出了一些建议与展望。 | 史雪威 张晋东 欧阳志云 | 2016 | 生态学报2016,36,23: | 12 |