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| 1 | 应用微卫星分型方法进行大熊猫父亲鉴定显示文摘选用18对大熊猫特异的微卫星引物对成都动物园、成都大熊猫繁育研究基地的大熊猫幼子及其母亲和可疑父亲DNA作了PCR扩增。扩增产物在ABI373测序仪上做基因扫描。应用Genotyper672软件处理分型数据,经Cervus2.0软件对亲子关系进行分析。结果表明,在母子关系确实的情况下,18个基因座联合的父亲鉴定排除概率E为0.999921,置信度为95%。而在母子关系不清的条件下,E=0.994109,但置信度低于80%。由于圈养大熊猫的母子关系都是确实的。因此,基因型分析的结果能有效确认出这些大熊猫之间的父子关系。但要准确鉴定出野生大熊猫的亲缘关系,我们还需更多的微卫星标记。 | 张志和 沈富军 孙姗 Victor A.David 张安居 Stephen J.O'Brien | 2003 | 遗传2003，25，5： | 36 |
| 2 | 应用微卫星标记分析圈养大熊猫遗传多样性显示文摘以来源于成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心的34只圈养大熊猫(分为a群体和b群体)和7只圈养野生大熊猫(圈养野生群)作为研究对象,利用AY161177~AY161218、Ame-μ5~Ame-μ70和g001~g905等30个微卫星标记对其遗传多样性现状进行分析,并探讨保持圈养大熊猫遗传多样性的方法.微卫星数据表明,30个微卫星标记多态性好(PIC=0.621~0.640),圈养大熊猫遗传多样性水平(a群体:A=5.48,Ho=0.475,He=0.696;b群体:A=5.24,Ho=0.453,He=0.719;圈养野生群:A=3.80,Ho=0.514,He=0.725)高于6个濒危物种(Ho=0.210~0.390,He=0.150~0.430)但低于3个非濒危物种(Ho=0.620~0.710),圈养大熊猫遗传多样性水平都保持在较高水平,但圈养群遗传多样性水平与圈养野生群相比有所降低.F统计量及基因流Nm分析结果证明,a、b两群体间遗传分化程度不高(Nm=2.610,Fst=0.0874,Fit=0.4116),存在个体交换和一定程度的近交,b群体近交程度高于a群体(a群体Fis=0.3221,b群体Fis=0.3983).因此,现阶段圈养大熊猫的管理重点是避免近交和遗传多样性丧失,将圈养大熊猫种群作为同一管理单元,把纠正大熊猫系谱中的错误、科学选择大熊猫个体进行群体间交流作为关键点,利用微卫星技术保持和提高大熊猫种群的遗传多样性水平. | 王芳 彭真信 张金国 田亮 韩红兵 曹之晨 张志和 沈富军 李德生 张和民 张立波 连正兴 | 2007 | 生物化学与生物物理进展2007，34，12： | 15 |
| 3 | Dynal磁珠富集大熊猫微卫星标记显示文摘应用Dynal磁珠生物素标记的微卫星探针与大熊猫基因组酶切片段杂交,捕获400~600bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pGEM T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。应用γ32P标记的探针筛选文库,从2880个转化子中获得了260个阳性克隆。对54个序列进行了测序,并成功地设计了大熊猫微卫星引物37对。该方法能有效提高筛选微卫星标记的效率。 | 沈富军 Phill Watts 张志和 张安居 Stephanie Sanderson SteveJ.Kemp 岳碧松 | 2005 | Acta Genetica Sinica2005，32，5： | 14 |
| 4 | 华南虎、东北虎、孟加拉虎的D-loop和ND5序列及其在系统进化分析中的应用显示文摘 本文采用PCR和质粒克隆测序方法, 获得了华南虎线粒体D loop区的480 bp序列和东北虎、孟加拉虎线粒体D loop区的503 bp序列; 同时还获得了这三个虎亚种和金钱豹线粒体ND5基因5’端309 bp的部分序列。根据D loop序列分析, 华南虎与孟加拉虎、东北虎的平均距离 (p distance) 分别为 0 110 88 和 0 110 87,而东北虎与孟加拉虎间的平均距离为0 009 94; 根据ND5序列分析, 华南虎与孟加拉虎、东北虎的平均距离分别为0 114 34和0 117 58, 而东北虎与孟加拉虎间的平均距离为0 003 24。三个虎亚种的mtDNA D loop和ND5序列比较表明, 华南虎是这三个虎亚种中最为古老的亚种。 | 张文平 张志和 沈富军 岳碧松 | 2005 | 四川动物2005，24，1： | 12 |
| 5 | 圈养大熊猫的系谱分析显示文摘应用SparksVer1 4软件结合手工算法对现有的圈养大熊猫系谱进行了遗传分析。结果表明 ,圈养大熊猫群体规模小 ,漂变是导致遗传多样性丢失的主要因素。由于分散管理 ,现有群体正面临着近亲交配、种源枯竭的危险。因此 ,应统一遗传管理 ,加强各繁殖系之间的基因交流 ,使圈养大熊猫的遗传多样性能够保持在较高的水平之上。 | 沈富军 张志和 李光汉 张安居 | 2002 | Acta Genetica Sinica2002，29，4： | 10 |
| 6 | 眠乃宁对华南虎麻醉效果的观察显示文摘 | 赵波 袁耀华 李光汉 何光昕 沈富军 | 2006 | 中国兽医杂志2006，42，7： | 9 |
| 7 | 圈养大熊猫群体间的基因流状况分析显示文摘圈养群体的遗传管理一个非常重要的手段就是实现不同群体间的基因交流。为了全面评估大熊猫圈养群体间的基因流状况,本研究以卧龙中国大熊猫保护中心的31只圈养大熊猫(简称卧龙群体)和成都大熊猫繁育研究基地与楼观台陕西省珍稀野生动物抢救饲养研究中心的37只圈养大熊猫(简称成都群体,其中楼观台1只)为研究对象,以7个大熊猫微卫星位点为分子标记,发现卧龙群体和成都群体间的遗传分化水平很低(Fst=0.041,P=0.001);尽管整个圈养群体的近交程度较低(Fis=0.026),但是成都群体的近交系数(Fis=0.045)远高于卧龙群体的近交系数(Fis=0.002);谱系分析、贝叶斯分析和系统进化法分析均显示,这两个群体间存在着基因流,但是这种基因流是单向的。此结果提示各个大熊猫饲养单位之间必须实现更多的合作,将大熊猫群体作为一个管理单元进行管理,从而实现更多的基因流。 | 孙小雅 张志和 张文平 沈富军 王跃招 | 2010 | 四川动物2010，29，3： | 8 |
| 8 | 大熊猫γ-干扰素基因的克隆与序列分析显示文摘本实验应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从ConA诱导培养的大熊猫外周血淋巴细胞总RNA中扩增得到大熊猫γ-干扰素基因(GenBank accession No:DQ630727),并将其克隆到pGEM-T载体中。经菌落PCR鉴定、序列测定与序列分析,结果表明,经克隆得到的IFN-γ基因开放阅读框由498个核苷酸组成,编码一个由166个氨基酸组成的多肽,包括编码19个氨基酸的信号肽和147个氨基酸的成熟肽,预测蛋白分子量和等电点分别约为20Ku和9.36。与GenBank中其他哺乳动物的IFN-γ基因比较,它与犬、猫、人、猪、牛、羊、马、兔、鼠等的核苷酸序列同源性在57.7%(鼠)~93.2%(犬)之间;IFN-γ编码氨基酸序列同源性在46.8%(鼠)~92.8%(犬)之间;进化树构建结果表明大熊猫与犬的遗传距离最近。 | 黄道超 张志和 杨光友 张安居 郭万柱 王成东 候蓉 沈富军 袁欣 | 2008 | 中国预防兽医学报2008，30，1： | 8 |
| 9 | 发情期大熊猫阴道真菌的分离鉴定及酵母菌药敏试验显示文摘为弄清发情期大熊猫阴道内可培养真菌的种类及对药物的敏感性,为大熊猫的生殖道合理用药提供参考,对10只发情大熊猫阴道分泌物进行真菌分离培养、形态学鉴定并用真菌ITS序列通用引物对分离真菌进行PCR扩增、序列测定等;对分离到的5株酵母菌选用5种抗真菌药进行药敏试验。结果,从大熊猫阴道分泌物中共分离到30种真菌,包含25种霉菌和5种酵母菌(链状假丝酵母菌、担子菌类酵母菌、季也蒙毕赤氏酵母菌、汉氏德巴利氏酵母菌、皮状丝孢酵母菌)。5种酵母菌均对两性霉素B、制霉菌素敏感;皮状丝孢酵母菌对酮康唑、伊曲康唑中度敏感;汉氏德巴利氏酵母菌对伊曲康唑中度敏感;链状假丝酵母菌对氟康唑中度敏感,对酮康唑、伊曲康唑耐药。研究结果表明,发情期大熊猫阴道可培养真菌种类主要为霉菌(83.33%),酵母菌较少(16.67%);两性霉素B和制霉菌素是临床治疗由本研究中5种酵母菌引起的大熊猫阴道疾病的首选药物。 | 马晓平 杨秋霞 李长城 张志和 侯蓉 沈富军 曹三杰 黄小波 凌珊珊 余树民 左之才 邓俊良 沈留红 伍锐 文翼平 任志华 曹随忠 王承东 彭广能 钟志军 文心田 古玉 | 2016 | 中国兽医科学2016，46，10： | 6 |
| 10 | 安哥拉山羊与建昌黑山羊及其杂种后代的DNA指纹分析显示文摘以 (CA/GATA/TCC) 5探针 ,HinfI酶切 ,研究安哥拉山羊和建昌黑山羊及安哥拉山羊与建昌黑山羊级进杂交的F2 、F3的DNA指纹图谱。结果 ,在供试山羊中 ,个体平均检出 1 8.2± 0 .4条谱带 ,安哥拉山羊、F2 、F3的鉴别机率分别为 1 .38× 1 0 - 12 ,1 .1 8× 1 0 - 13,0 .50× 1 0 - 10 ;群体内相似系数安哥拉山羊为0 .4 539,F2 为 0 .4 0 77,F3为 0 .61 1 1 ;亲子鉴定的父权概率W =0 .9889;安哥拉山羊与建昌黑山羊比较 ,2 .3kb和 8. | 王杰 沈富军 欧阳熙 王永 覃志红 | 2001 | 中国畜牧杂志2001，37，3： | 6 |
| 11 | 安哥拉山羊及其杂种羊父权认定的DNA指纹图分析显示文摘应用DNA指纹技术对安哥拉山羊作亲子鉴定 ,结果发现子代个体的DNA指纹图中 ,谱带均分别来自父亲和母亲 ,没有新带出现 .父权概率为 0 .9889,表明 (CA/GATA/TCC) 5探针能有效地应用于安哥拉山羊及其杂种后代的遗传分析 . | 王杰 沈富军 欧阳熙 王永 覃志红 王世斌 佘陆军 欧其拉一 马玉才 | 2000 | 西南民族学院学报(自然科学版)2000，26，2： | 5 |
| 12 | 安哥拉山羊及其杂种羊DNA指纹图谱分析显示文摘应用寡苷酸探针 (CA/GATA/TCC) 5 检测安哥拉山羊和安哥拉山羊级进杂交F2 、F3 的DNA指纹图谱 .结果表明 ,供试羊只个体平均检出 1 8.2± 0 .4条谱带 ;在安哥拉山羊、F2 、F3中 ,探针的鉴别机率分别为 1 .38× 1 0 -12 ,1 .1 8× 1 0 -13 ,0 .5 0× 1 0 -10 ;群体内DNA指纹平均相似系数安哥拉山羊F2 、F3 分别为 0 .45 39,0 .40 77和 0 .6 1 1 1 ;在安哥拉山羊DNA指纹图谱中 ,发现 2 .3Kb和 8.6Kb谱带为特异性谱带 . | 王杰 沈富军 欧阳熙 王永 覃志红 王世斌 佘陆军 欧其拉一 马玉材 | 2000 | 西南民族学院学报(自然科学版)2000，26，2： | 4 |
| 13 | DNA指纹技术及其在动物遗传育种上的应用显示文摘综述了DNA指纹技术发展和研究现状. | 沈富军 | 1999 | 西南民族学院学报(自然科学版)1999，25，1： | 4 |
| 14 | 东北虎促卵泡激素和促黄体激素基因的克隆及其序列分析显示文摘本研究首次从东北虎 (Pantheratigrisaltaica)脑垂体提取总RNA ,利用RT PCR技术扩增出东北虎垂体促性腺激素α亚基、促卵泡激素 (FSH) β亚基和促黄体激素 (LH) β亚基的编码区序列 ,并进行克隆、测序和比较分析。结果表明 ,其α亚基、FSHβ亚基、LHβ亚基基因的开放阅读框分别为 36 3bp、 390bp和 4 2 9bp ,分别编码 12 0、 12 9和 14 2氨基酸的前体蛋白。与已发表的人、牛、绵羊、猪、大鼠、小鼠等物种相应序列比较 ,无论在核苷酸水平 ,还是在氨基酸水平都显示出较高的同源性 (6 4 7%~ 96 6 %) ,其中与猪的同源性最高(86 %~ 96 6 %)。东北虎的基因序列还具有其明显的特异性 ,首次发现LHβ亚基cDNA编码的前体蛋白在信号肽部分比其它物种相应序列多一个亮氨酸残基 (Leu)。 | 廖鸣娟 朱睦元 叶丹 张志和 张安居 沈富军 | 2002 | 动物学报2002，48，6： | 4 |
| 15 | 大熊猫多态性微卫星标记筛选显示文摘选用前人分离得到的42对大熊猫微卫星引物,分别用圈养大熊猫的血液DNA和野生大熊猫的粪便DNA对其进行PCR扩增,并比较琼脂糖凝胶电泳和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的检测结果。结果表明,不同标记的多态性差异较大,筛选出13对能较好地应用于大熊猫遗传多样性研究的微卫星引物。 | 何蔚 沈富军 岳碧松 | 2007 | 四川动物2007，26，3： | 3 |
| 16 | 大熊猫伊维菌素中毒性休克显示文摘3只圈养大熊猫在按正常剂量口服伊维菌素(Ivermectin)进行常规体内外寄生虫病预防时突然发生中毒性休克反应,临床主要表现为:全身松软无力、可视粘膜苍白、四肢冰凉伴阵发性痉挛、呼吸微弱浅表、心率缓慢伴节律不齐、眼球深陷、瞳孔缩小至针尖样大小、四肢对疼痛刺激无应答。根据休克性疾病的发生发展机理采取了抗休克治疗措施,3只大熊猫在分别经过长达65 h、56 h和45 h连续不问断的综合抢救措施后最终得以康复。不仅对大熊猫伊维菌素中毒性休克的临床表现和抢救措施进行了简要描述,并对休克的发生原因进行了相关分析,最终认为:大熊猫口服伊维菌素后发生的中毒性休克与有机磷中毒无关,也与类似于柯利牧羊犬的多药拮抗蛋白(MDR)基因缺陷无关,但极可能与某种未知寄生虫感染相关。 | 王成东 兰景超 沈富军 罗娌 黄文俊 杨智 刘礼 黄详明 吴孔菊 李明喜 杨奎兴 袁博 谢意 | 2015 | 野生动物学报2015，36，3： | 2 |
| 17 | 通过二代测序技术开发25个小熊猫的微卫星位点显示文摘采用Roche 454基因组测序平台在小熊猫Ailurus fulgens的基因组中进行测序拼装,得到了大量含有微卫星片段的序列。本文选择了其中467条序列设计引物,筛选出了115个微卫星位点,最终选出25个微卫星位点,重复单元包含TAT、GATA、AAACA、AAAACA等,并应用到42只小熊猫个体上进行了分型。观察到的等位基因数为3~10;观察杂合度和期望杂合度分别为0. 143~0. 929和0. 136~0. 869;多态信息含量为0. 128~0. 843,经检测所有位点均未偏离哈迪-温伯格平衡。这些微卫星位点可应用于小熊猫圈养种群的遗传管理,在未来还可进一步作为小熊猫的种群遗传学等研究的有力工具。 | 杨艾琳 谢军金 沈富军 张文平 侯蓉 张志和 张亮 | 2019 | 四川动物2019，38，1： | 2 |
| 18 | 大熊猫IL-2基因的克隆与序列分析显示文摘本实验应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从ConA诱导培养的大熊猫外周血淋巴细胞总RNA中扩增得到大熊猫IL-2基因,并将其克隆到PGEM-T载体中.经菌落PCR鉴定、序列测定及序列分析,结果表明,经克隆得到的IL-2基因开放阅读框由465个核苷酸组成,编码一个由155个氨基酸组成的多肽,包括编码20个氨基酸的信号肽和135个氨基酸的成熟肽.该基因(已在Genbank中登录,序列号为:DQ852339)与已知的其他哺乳动物如犬、猫、人、猪、牛、羊、马、兔、鼠等的IL-2核苷酸同源性在66.5%(鼠)—91.5%(犬)之间;IL-2编码氨基酸同源性在54.8%(鼠)—85.2%(犬)之间;进化树构建结果表明大熊猫与犬亲缘关系最近. | 杨光友 黄道超 张志和 张安居 郭万柱 王成东 侯蓉 沈富军 袁欣 | 2006 | 西华师范大学学报(自然科学版)2006，27，4： | 1 |
| 19 | 大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化显示文摘微卫星作为重要的分子标记之一,已被证明在大熊猫种群规模评估、亲子鉴定和遗传多样性分析方面是有效的。目前微卫星标记在大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)染色体上物理定位方面的报道较少,而且缺乏微卫星基因分型系统的效能评估以及PCR扩增条件的优化。本研究基于大熊猫基因组参考序列(ASM200744v2),分析了34个大熊猫微卫星位点的染色体定位特征并评价了位点的应用价值。通过优化34个STR-PCR反应体系和扩增程序,结合微卫星的染色体定位数据确定了Ame-μ10标记的较低应用价值以及gpz-6重新筛选引物的必要性。本研究有助于提高基因分型结果的重复性和可靠性,对促进《大熊猫种群遗传档案建立技术规程》规范化应用和制定大熊猫保护策略具有重要意义。 | 寇洁 李严 王鹏 刘红 刘佳文 王涓 王也 张亮 沈富军 | 2022 | 遗传2022，44，3： | 1 |
| 20 | 安哥拉山羊改良建昌黑山羊生产马海毛横交方案的研究显示文摘以安哥拉山羊、建昌黑山羊、一代羊(F1)、二代羊(F2)、三代羊(F3)、二代与三代同质个体横交后代(H)为供试羊只,采用形态遗传标记、生化遗传标记和分子遗传标记确定安哥拉山羊改良建昌黑山羊生产马海毛的横交方案。结果:F2、F3 和H白色毛被分别为93 5%、100%和100%,毛被同质和基本同质个体分别为27 7%、70 2%和65 3%;成年羊产毛量随代数增加而增加,但F3 和H与F2,H 与F3 公、母羊分别对应比较,差异均不显著(P>0 05)。成年羊体重F1 和F2 增加,杂种优势明显,但F3 母羊则不显著(P>0 05),H还有下降(P>0 05)。平均基因杂合度和一致度安哥拉山羊、建昌黑山羊、F3、H分别为0 113 1 和0 886 9, 0 062 1 和0 937 9, 0 110 3 和0 889 7, 0 110 4和0 889 6。安哥拉山羊与F3 和H的遗传距离小,分别为0 003 9和0 004 0,遗传相似系数大,相应为0 996 1、0 996 0。群体内谱带相似系数,安哥拉山羊、F2、F3 和H分别为0 454 0,0 407 6,0 611 3 和0 610 9。且F3 和H均极显著大于安哥拉山羊(P<0 01)。综合研究表明,可在F2 和F3 代中选择理想同质个体进行横交。 | 王杰 徐金瑞 沈富军 潘爱銮 欧阳熙 王永 白文林 杨易 郭鹏燕 江昱 覃志红 王同军 欧其拉一 马玉才 | 2005 | 畜牧兽医学报2005，36，6： | 1 |
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